GrainGenes Marker Report: BCD1130
Locus
BCD1130
Type
RFLP
Chromosome
4H 5A 5B 5D
Chromosome Arm
5AS 5BS 5DS
Map
[ Hide all but 1 of 12 ] Barley-consensus-2003-4H 72.5 Barley-ConsensusFHB-4H 115.66 Hordeum-Consensus2006-DArT-4H 124 Hordeum-CxH-4H 109.46 Hordeum-CxS-4H 125.93 Hordeum-GxH-4H 143.46 Leymus_2012_con_LG5Xm 32.993 Leymus_2012_TTC2_LG5Xm 34.665 Oat-2009-KxO_5_30 107 Oat-2016-Consensus-6 104.5 Oat-2018-Consensus_Mrg06 104.5 Oat-KxO/2003-30 11.1
[ Show Nearby Loci ]
Map Data
Barley consensus 2003
[ Show all 13 ]
Species
Avena sativa
Probe
BCD1130
Homology
BAA95779.1 e-value: 2e-30 (AB028608) polygalacturonase-like protein [Arabidopsis thaliana] TALA_BFDV e-value: 7.7 LARGE T ANTIGEN
Reference
Wenzl P et al. (2006) A high-density consensus map of barley linking DArT markers to SSR, RFLP and STS loci and agricultural traits BMC Genomics 7:206.
Data Source
Langridge, Peter J.
Remark
Number of populations contributing to the placement of BCD1130 in the Barley, Consensus 2006 DArT maps = 1 Marker placement value = 1.82 cM on map Oat-KxO/2003-30 Marker is not a framework marker on map Oat-KxO/2003-30
Possible Orthologs
Xbcd1130
Probe
BCD1130
Locus
Xbcd1130 BCD1130
Synonym
Synonym HAR35_3715
Reference
Heun M et al. (1991) Construction of a restriction fragment length polymorphism map for barley (Hordeum vulgare) Genome 34:437-447.
Remarks
Lambda ZAP II library Bar.LambZAPII [c] Bar.LambZAPII
Type
cDNA
Sequence
BE438619 BE438745 BCD1130_WHE1H0021 BCD1130_WHE1H0022
Polymorphism
BCD1130 EcoRI BCD1130 EcoRV
Linkage Group
5S
Insert Enzyme
EcoRI
Source Species
Hordeum vulgare
Source Germplasm
Willis
Source Tissue
etiolated leaf
Insert Size
1.3
PCR size
1.3
GrainGenes Marker Report: BCD1130
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