GrainGenes Marker Report: CDO534
Locus
cdo534
Type
RFLP
Synonym
Synonym cdo534 POPA3_0021
Chromosome
1B 6H
Chromosome Arm
1BS
Map
Hordeum-Bins-6H 65
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Map Data
Barley, Abiotic QTL Consensus
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Probe
CDO534
Homology
AF302906_1 e-value: 1e-29 (AF302906) citrate synthase [Oryza sativa] BAA82390.1 e-value: 7e-21 (AP000367) ESTs C96653(C10531),C96654(C10531),C28571(C61641) correspond to a region of the predicted gene.; Similar to citrate synthetase. (AC004521) [Oryza sativa]
Reference
Rostoks N et al. (2005) Genome-wide SNP discovery and linkage analysis in barley based on genes responsive to abiotic stress. Molecular Genetics and Genomics 274:515-527.
Possible Orthologs
CDO534a
[ Show all 15 ]
Probe
CDO534
Locus
[ Hide all but 1 of 16 ] CDO534a Xcdo534-6B Xcdo534-6D cdo534 CDO534B CDO534C CDO534D CDO534E CDO534X Xcdo534 Xcdo534-3A Xcdo534a Xcdo534b cdo534di CDO534 CDO534DI
Synonym
Synonym HAR35_1124
Reference
Heun M et al. (1991) Construction of a restriction fragment length polymorphism map for barley (Hordeum vulgare) Genome 34:437-447.
Remarks
Uni-ZAP XR library OatUni-ZAPXR [c]
Type
cDNA
Sequence
BE439046
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Linkage Group
1S,3LS,6S,7S
Insert Enzyme
EcoRI XhoI
Source Species
Avena sativa
Source Germplasm
Brooks (oat)
Source Tissue
etiolated leaf
Insert Size
1
PCR size
1
GrainGenes Marker Report: CDO534
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