GrainGenes Marker Report: D1.1_ctg4642
Locus
D1.1_ctg4642
Type
BAC_contig
Map
Chinese_Spring_Deletion_4D 0.435 Chinese_Spring_Deletion_6D 0.9 Ta-Gale-3D -42.1 Ta-Gale-4D -4 Ta-Physical-Gill-4D -2.13
[ Show Nearby Loci ]
Probe
BE445453
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Probe for Locus
PSR144
Locus
Xpsr144-4A
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Related Probe
PSR111 PSR198 PSR200 PSR201
Hybridization_homologue: The two clones were isolated independently but exhibit the same RFLP patterns when hybridized to DNA from test genotypes, and thus are closely related in sequence.
General Remarks
Polymorphism scores are given as the percent polymorphic pairwise comparisons, followed by the number of alleles found and number of varieties tested in parentheses.
Type
cDNA
Sequence
PSR144 Forward PSR144 Reverse
Copy Number
1
Background
0
Cross hybridizes to
Secale cereale good Hordeum vulgare good
Polymorphism
[ Hide all but 1 of 17 ] PSR144 H EcoRI 20.0 (2, 10) PSR144 H EcoRV 16.7 (2, 12) PSR144 H DraI 0.0 (1, 4) PSR144 H HindIII 22.2 (2, 9) PSR144 4D DraI 4D 15.4 (2, 13) PSR144 4A DraI 4A 0.0 (1, 13) PSR144 4B DraI 4B 0.0 (1, 13) PSR144 4A EcoRV 4A 0.0 (1, 13) PSR144 4D EcoRV 4D 0.0 (1, 13) PSR144 4B EcoRV 4B 0.0 (1, 13) PSR144 4D HindIII 4D 0.0 (1, 14) PSR144 4B HindIII 4B 47.6 (2, 15) PSR144 4A HindIII 4A 0.0 (1, 15) PSR144 4D EcoRI 4D 0.0 (1, 12) PSR144 4B EcoRI 4B 0.0 (1, 12) PSR144 4A EcoRI 4A 0.0 (1, 12) PSR144 R HindIII
Gel
PSR144 Gale
Linkage Group
4AL
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Insert Enzyme
SmaI
Source Species
Triticum aestivum
Source Germplasm
Chinese Spring
Source Tissue
Leaf
Insert Size
1.2
GrainGenes Marker Report: D1.1_ctg4642
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