GrainGenes Marker Report: PSR161
Locus
psr161
Type
RFLP
Synonym
Synonym POPA1_0177
Chromosome
5H
Map
Barley-consensus-2003-5H 28.5 Hordeum-CxH-5H 45.33 Oat-2002-OxT-QTL_12 31.5 Oat-OxT-12 32.7 Tt-Gill-1D 118.2
[ Show Nearby Loci ]
QTL with Locus Marker
QVERN.2002-OxT_12
Map Data
Barley consensus 2003 Barley, CxH Oat, OxT Oat-2002-OxT-QTL T.tauschii
Probe
PSR161
Data Source
Langridge, Peter J.
Possible Orthologs
IPSR161
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Probe
PSR161
Locus
Xpsr161
[ Show all 8 ]
Synonym
Synonym HAR35_15223 HAR35_15224 HAR35_1834
Remarks
Polymorphism scores are given as the percent polymorphic pairwise comparisons, followed by the number of alleles found and number of varieties tested in parentheses.
Type
cDNA
Sequence
PSR161 Forward PSR161 Reverse
Copy Number
1
Background
0
Cross hybridizes to
Secale cereale good Hordeum vulgare good
Polymorphism
[ Hide all but 1 of 29 ] PSR161 H EcoRI 0.0 (1, 10) PSR161 H EcoRV ***** (0, 0) PSR161 H BglII ***** (1, 1) PSR161 H XbaI 0.0 (1, 2) PSR161 1B DraI 1B 16.7 (2, 12) PSR161 1A DraI 1A 48.5 (2, 12) PSR161 1D DraI 1D 0.0 (1, 12) PSR161 1B EcoRI 1B 0.0 (1, 12) PSR161 1D EcoRI 1D 0.0 (1, 12) PSR161 1A EcoRI 1A 0.0 (1, 12) PSR161 1A EcoRV 1A 0.0 (1, 12) PSR161 1B EcoRV 1B 0.0 (1, 12) PSR161 1D EcoRV 1D 0.0 (1, 12) PSR161 1A HindIII 1A 0.0 (1, 11) PSR161 1B HindIII 1B 0.0 (1, 11) PSR161 1D HindIII 1D 0.0 (1, 11) PSR161 1B SstI 1B 0.0 (1, 12) PSR161 1D SstI 1D 0.0 (1, 11) PSR161 1A SstI 1A 48.5 (2, 12) PSR161 1A BamHI 1A 48.5 (2, 12) PSR161 1D BamHI 1D 0.0 (1, 12) PSR161 1B BamHI 1B 0.0 (1, 12) PSR161 1B BglII 1B 0.0 (1, 12) PSR161 1D BglII 1D 0.0 (1, 12) PSR161 1A BglII 1A 48.5 (2, 12) PSR161 R EcoRI PSR161 R EcoRV PSR161 R BglII PSR161 R XbaI
Gel
PSR161 Gale
Linkage Group
1AS
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Insert Enzyme
SmaI
Source Species
Triticum aestivum
Source Germplasm
Chinese Spring
Source Tissue
Leaf
Insert Size
1.35
GrainGenes Marker Report: PSR161
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