GrainGenes Marker Report: Xbcd1235-5B
Locus
Xbcd1235-5B
Type
RFLP
Chromosome
5B
Chromosome Arm
5BL
Map
5BL, CS, 0.75-0.79 interval 40 Tturgidum-JKxC-5B 151.8 Tturgidum-JKxC2-5B 238.9
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Breakpoint Interval
5BL9-0.76-0.79
Map Data
5BL, CS, 0.75-0.79 interval T. turgidum, JK x Cham1 T. turgidum, JK x Cham1, 2
Species
Triticum aestivum
Probe
BCD1235
Homology
T01197 e-value: 9e-21 pectin acetylesterase homolog F21E10.11 - Arabidopsis thaliana (GB:X99348) [Arabidopsis thaliana]
Reference
Faris JD et al. (2000) Saturation mapping of a gene-rich recombination hot spot region in wheat. Genetics 154:823-835.
Possible Orthologs
bcd1235
[ Show all 17 ]
Probe for Locus
BCD1235
Locus
[ Hide all but 1 of 18 ] Xbcd1235-5A Xbcd1235 bcd1235a bcd1235b bcd1235c bcd1235d Xbcd1235-5A.1 Xbcd1235-5A.2 Xbcd1235-5B Xbcd1235.1 Xbcd1235a Xbcd1235b Xbcd1235.2 bcd1235 BCD1235 BCD1235A BCD1235C BCD1235D
Reference
Heun M et al. (1991) Construction of a restriction fragment length polymorphism map for barley (Hordeum vulgare) Genome 34:437-447.
General Remarks
Lambda ZAP II library
Type
cDNA
Sequence
BE438907 BCD1235_WHE04B03.s1
Polymorphism
BCD1235 DraI BCD1235 EcoRI BCD1235 EcoRV BCD1235 XbaI
Source Species
Hordeum vulgare
Source Germplasm
Willis
Source Tissue
etiolated leaf
PCR size
0.7
GrainGenes Marker Report: Xbcd1235-5B
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