GrainGenes Marker Report: Xcdo346A
Locus
Xcdo346A
Type
RFLP
Chromosome
5B 5D
Map
Oat-1996-OT328xDumont_3 14.55
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QTL with Locus Marker
Qbgl.KxO-Bgl_3
Map Data
Oat, KxO
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Probe
CDO346
Homology
CAB64744.1 e-value: 0.77 (AJ270304) putative beta-galactosidase [Arabidopsis thaliana]
Image
CDO346 KO autoradiogram
Remark
Position of Xcdo346A on Oat-1996-OTxDu_3 was mapped to the interval only (LOD < 2)
Possible Orthologs
[ Hide all but 1 of 16 ] CDO346 CDO346a CDO346b Xcdo346 Xcdo346-1 Xcdo346-1B Xcdo346-2A Xcdo346-5D Xcdo346.2 Xcdo346B CDO346B CDO346A cdo346 cdo346-1B cdo346-5D cdo346a
Probe for Locus
CDO346
Locus
CDO346b
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Synonym
Synonym HAR35_17123
Reference
Heun M et al. (1991) Construction of a restriction fragment length polymorphism map for barley (Hordeum vulgare) Genome 34:437-447.
General Remarks
Uni-ZAP XR library
Type
cDNA
Sequence
BE439085 CDO346_WHE2E0021 CDO346_WHE2E0022 CDO346-5 CDO346-3
Polymorphism
CDO346 EcoRI CDO346 EcoRV CDO346 DraI CDO346 HindIII CDO346 XbaI
Source Species
Avena sativa
Source Germplasm
Brooks (oat)
Source Tissue
etiolated leaf
PCR size
1.4
GrainGenes Marker Report: Xcdo346A
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