GrainGenes Marker Report: Xcdo412-5A
Locus
Xcdo412-5A
Type
RFLP
Chromosome
5A
Chromosome Arm
5AL 5AS
Map
5AL, q deletions 83.5
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QTL with Locus Marker
QEet.ocs-5A.2 QPro.mgb-5A
Breakpoint Interval
5AL-q35/5AL-q19
Map Data
5AL, CS q deletions, physical
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Probe
CDO412
Image
CDO412 SO autoradiogram
Possible Orthologs
CDO0412
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Probe for Locus
CDO412
Locus
[ Hide all but 1 of 19 ] CDO412a Xcdo412-5A Xcdo412-5B Xcdo412-5D Xcdo412A cdo412b Xcdo412 RI021J24 D1.1_ctg4076 CDO412 Xcdo412B CDO0412 Xcdo412.1 cdo412 CDO412A CDO412B cdo412-5A cdo412-5B cdo412-5D
Synonym
Synonym HAR35_21931
Reference
Heun M et al. (1991) Construction of a restriction fragment length polymorphism map for barley (Hordeum vulgare) Genome 34:437-447.
General Remarks
Uni-ZAP XR library OatUni-ZAPXR [c] OatUni-ZAPXR
Type
cDNA
Sequence
BE439072
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Polymorphism
CDO412 EcoRI CDO412 EcoRV CDO412 DraI
Linkage Group
5L
Insert Enzyme
EcoRI XhoI
Source Species
Avena sativa
Source Germplasm
Brooks (oat)
Source Tissue
etiolated leaf
Insert Size
1.4
PCR size
1.4
GrainGenes Marker Report: Xcdo412-5A
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