GrainGenes Marker Report: Xcdo506-5D
Locus
Xcdo506-5D
Type
RFLP
Chromosome
5D
Chromosome Arm
5DL
Map
Ta-Synthetic/Opata-5D 191.4
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Map Data
Wheat, Synthetic x Opata [ GBrowser ]
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Probe
CDO506
Homology
A83106 e-value: 8.4 hypothetical protein PA4320 [imported] - Pseudomonas aeruginosa (strain PAO1) AAH04729 e-value: 8e-08 (BC004729) RIKEN cDNA 1810063P04 gene [Mus musculus]
Image
CDO506 SO autoradiogram
Possible Orthologs
[ Hide all but 1 of 12 ] CDO506 cdo506a cdo506b Xcdo506 Xcdo506-7A Xcdo506A Xcdo506B Xcnl.CDO506 CDO506A CDO506B cdo506 cdo506-5D
Probe for Locus
CDO506
Locus
CDO506
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Synonym
Synonym HAR35_17150 HAR35_41262
External Databases
DDBJ EMBL GenBank
Reference
Heun M et al. (1991) Construction of a restriction fragment length polymorphism map for barley (Hordeum vulgare) Genome 34:437-447.
General Remarks
Uni-ZAP XR library OatUni-ZAPXR [c] OatUni-ZAPXR
Type
cDNA STS
PCR primers
TCA TTC AGA GGA AGA ACT GC
ATA GTG GAG CAA AGA CTG TC
Sequence
BE439286 BE439294 CDO506_WHE04G12.s1 CDO506
Polymorphism
CDO506 EcoRI CDO506 EcoRV
Linkage Group
[b 7L]
Insert Enzyme
EcoRI XhoI
Source Species
Avena sativa
Source Germplasm
Brooks (oat)
Source Tissue
etiolated leaf
Insert Size
1.2 1.4 0.6
GrainGenes Marker Report: Xcdo506-5D
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