GrainGenes Marker Report: Xcdo580-1R
Locus
Xcdo580-1R
Type
RFLP
Chromosome
1R
Map
Secale-PxP-2004-1R 34.6
[ Show Nearby Loci ]
Map Data
Rye, P87 x P105, 2004
Species
Secale cereale
Probe
CDO580
Homology
T47470 e-value: 1e-33 isovaleryl-CoA-dehydrogenase precursor (IVD) - Arabidopsis thaliana [Arabidopsis thaliana]
Reference
Khlestkina EK et al. (2004) Mapping of 99 new microsatellite-derived loci in rye (Secale cereale L.) including 39 expressed sequence tags Theoretical and Applied Genetics 109:725-732.
Possible Orthologs
CDO580
[ Show all 13 ]
Probe for Locus
CDO580
Locus
[ Hide all but 1 of 19 ] CDO580 CDO580a Xcdo580-1 Xcdo580-1A Xcdo580 RI027A10 HI014M4 RI049J21 D1.1_ctg7447 D1.1_ctg7447_1 cdo580.1 cdo580.2 CDO580B Xcdo580-1R CDO580(A) CDO580(B) cdo580 cdo580-1A cdo580x
Synonym
Synonym HAR35_15747 HAR35_15748 HAR35_38596
Reference
Heun M et al. (1991) Construction of a restriction fragment length polymorphism map for barley (Hordeum vulgare) Genome 34:437-447.
General Remarks
Uni-ZAP XR library OatUni-ZAPXR [c]
Type
cDNA
Sequence
BE439190
[ Show all 6 ]
Polymorphism
CDO580 EcoRV CDO580 XbaI
Linkage Group
1S
Insert Enzyme
EcoRI XhoI
Source Species
Avena sativa
Source Germplasm
Brooks (oat)
Source Tissue
etiolated leaf
Insert Size
1.3
PCR size
1.3
GrainGenes Marker Report: Xcdo580-1R
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