GrainGenes Marker Report: Xpsr107
Locus
Xpsr107
Type
RFLP
Chromosome
2A 2D 2R
Chromosome Arm
2DS 2RL 2RS
Map
Rye-2009-Consensus-2R 2.9
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Breakpoint Interval
2DS-3/2DS-1 2S-0.33-0.36
Map Data
Rye, Ds2 x RxL10
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Species
Triticum aestivum
Probe
PSR107
Reference
Boyko EV et al. (1999) A high-density genetic linkage map of Aegilops tauschii, the D-genome progenitor of bread wheat. Theoretical and Applied Genetics 99:16-26.
Data Source
Gale, Michael D. 93.03
Possible Orthologs
Xpsr107(Lhcb4) Xpsr107-2A Xpsr107-2B Xpsr107-2D
Probe for Locus
PSR107
Locus
Xpsr107-2A Xpsr107-2B Xpsr107-2D Xpsr107(Lhcb4) Xpsr107
Synonym
Synonym HAR35_14280 HAR35_14281 HAR35_43709
General Remarks
Polymorphism scores are given as the percent polymorphic pairwise comparisons, followed by the number of alleles found and number of varieties tested in parentheses.
Type
cDNA
Sequence
PSR107
Copy Number
1
Background
2
Cross hybridizes to
Secale cereale good Hordeum vulgare good
Polymorphism
[ Hide all but 1 of 19 ] PSR107 H EcoRI 33.3 (2, 6) PSR107 H EcoRV 18.2 (2, 11) PSR107 H DraI 100.0 (2, 2) PSR107 H HindIII 0.0 (1, 11) PSR107 2D EcoRI 2D 0.0 (1, 14) PSR107 2A EcoRI 2A 26.4 (2, 14) PSR107 2B EcoRI 2B 0.0 (1, 14) PSR107 2D EcoRV 2D 0.0 (1, 15) PSR107 2B EcoRV 2B 13.3 (2, 15) PSR107 2A EcoRV 2A 0.0 (1, 15) PSR107 2A DraI 2A 0.0 (1, 14) PSR107 2B DraI 2B 14.3 (2, 14) PSR107 2D DraI 2D 0.0 (1, 14) PSR107 2D HindIII 2D 0.0 (1, 15) PSR107 2A HindIII 2A 0.0 (1, 15) PSR107 2B HindIII 2B 13.3 (2, 15) PSR107 R EcoRI PSR107 R EcoRV PSR107 R HindIII
Gel
PSR107 Gale
Linkage Group
2AS 2BS 2DS 2H 2RS
Source Species
Triticum aestivum
Source Germplasm
Chinese Spring
Source Tissue
Leaf
Insert Size
0.9
GrainGenes Marker Report: Xpsr107
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