GrainGenes Marker Report: Xpsr109(RbcS)
Locus
Xpsr109(RbcS)
Type
RFLP
Chromosome
2A 2D
Chromosome Arm
2DS
Map
Ta-Physical-Gill-2ABD -92 Tm-Dubcovsky2-2A -27.6 Wheat-Composite2004-2A 28
[ Show Nearby Loci ]
Breakpoint Interval
2S-0.84-1.00
Map Data
T. monococcum, DV92 x G3116 Wheat, Composite, 2004 Wheat, Physical
Species
Triticum aestivum
Probe
PSR109
Candidate Gene
rbcS
Reference
Boyko EV et al. (1999) A high-density genetic linkage map of Aegilops tauschii, the D-genome progenitor of bread wheat. Theoretical and Applied Genetics 99:16-26.
Possible Orthologs
Xpsr109
[ Show all 19 ]
Probe for Locus
PSR109
Locus
Xpsr109(Rbcs)-2A
[ Show all 22 ]
Related Probe
PSR133
[ Show all 17 ]
Hybridization_homologue: The two clones were isolated independently but exhibit the same RFLP patterns when hybridized to DNA from test genotypes, and thus are closely related in sequence.
General Remarks
Polymorphism scores are given as the percent polymorphic pairwise comparisons, followed by the number of alleles found and number of varieties tested in parentheses.
Type
cDNA
Sequence
PSR109
Copy Number
3
Background
2
Cross hybridizes to
Secale cereale good Hordeum vulgare good
Polymorphism
[ Hide all but 1 of 16 ] PSR109 H EcoRI 80.3 (4, 12) PSR109 H EcoRV 81.8 (6, 11) PSR109 H DraI 83.3 (3, 4) PSR109 H HindIII 85.9 (6, 13) PSR109 2B EcoRV 2B 60.0 (3, 15) PSR109 2D EcoRV 2D 24.8 (2, 15) PSR109 2A EcoRV 2A 51.4 (2, 15) PSR109 2B HindIII 2B 60.0 (3, 15) PSR109 2D HindIII 2D 13.3 (2, 15) PSR109 2A HindIII 2A 51.4 (2, 15) PSR109 2B DraI 2B 59.1 (3, 12) PSR109 2D DraI 2D 15.4 (2, 13) PSR109 2A DraI 2A 48.5 (2, 12) PSR109 R EcoRI PSR109 R EcoRV PSR109 R HindIII
Gel
PSR109 Gale
Linkage Group
2AS
[ Show all 9 ]
Source Species
Triticum aestivum
Source Germplasm
Chinese Spring
Source Tissue
Leaf
Insert Size
0.65
GrainGenes Marker Report: Xpsr109(RbcS)
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