GrainGenes Marker Report: Xpsr163
Locus
Xpsr163
Type
RFLP
Chromosome
4D 7R
Chromosome Arm
4DL 7RL
Map
Rye-2009-Consensus-7R 36.5
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Breakpoint Interval
4DL-1/4DL-3 4L-0.41-0.46
Map Data
Rye, Ds2 x RxL10 Rye, Ds2 x RxL10, RAPD Rye_2009_consensus T.tauschii, Appels Wheat, Physical
Species
Triticum aestivum
Probe
PSR163
Reference
Boyko EV et al. (1999) A high-density genetic linkage map of Aegilops tauschii, the D-genome progenitor of bread wheat. Theoretical and Applied Genetics 99:16-26.
Data Source
Gale, Michael D. 93.03
Possible Orthologs
PSR163 Xpsr163-4A Xpsr163-4B Xpsr163-4D
Probe for Locus
PSR163
Locus
Xpsr163 PSR163 Xpsr163-4A Xpsr163-4B Xpsr163-4D
Synonym
Synonym HAR35_47308
General Remarks
Polymorphism scores are given as the percent polymorphic pairwise comparisons, followed by the number of alleles found and number of varieties tested in parentheses.
Type
cDNA
Sequence
PSR163
Copy Number
1
Background
0
Cross hybridizes to
Secale cereale good Hordeum vulgare good
Polymorphism
[ Hide all but 1 of 19 ] PSR163 H EcoRI 0.0 (1, 11) PSR163 H EcoRV 0.0 (1, 12) PSR163 H DraI 0.0 (1, 4) PSR163 H HindIII 0.0 (1, 11) PSR163 4A HindIII 4A 0.0 (1, 15) PSR163 4D HindIII 4D 13.3 (2, 15) PSR163 4B HindIII 4B 0.0 (1, 15) PSR163 4B EcoRI 4B 14.3 (2, 14) PSR163 4A EcoRI 4A 0.0 (1, 14) PSR163 4D EcoRI 4D 0.0 (1, 14) PSR163 4D EcoRV 4D 13.3 (2, 15) PSR163 4B EcoRV 4B 0.0 (1, 15) PSR163 4A EcoRV 4A 0.0 (1, 15) PSR163 4B DraI 4B 0.0 (1, 9) PSR163 4A DraI 4A 0.0 (1, 9) PSR163 4D DraI 4D 0.0 (1, 9) PSR163 R EcoRI PSR163 R EcoRV PSR163 R HindIII
Gel
PSR163 Gale
Linkage Group
4AS
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Insert Enzyme
SmaI
Source Species
Triticum aestivum
Source Germplasm
Chinese Spring
Source Tissue
Leaf
Insert Size
0.5
GrainGenes Marker Report: Xpsr163
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