Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Marker Report: vrn-A1-5A

[Submit comment/correction]

Locus	vrn-A1-5A
Synonym	Other name Vrn-A1 Vrn1
Map	CS/SQ1-5A 117
	[ Show Nearby Loci ]
QTL with Locus Marker	QYld.saq-5A
Map Data	Wheat, Chinese Spring x SQ1
Associated Gene	Vrn1 (Triticum)
Gene Class	Response to vernalization (Triticum)
Gene Associated with Locus	Vrn1 (Triticum)
Synonym	Other name Vrn-A1 (Triticum) Synonym AP1 (Triticum)
Gene Class	Response to vernalization (Triticum)
Allele	Vrn1 (Triticum) vrn1 (Triticum)
Locus	vrn-A1-5A Vrn1
Candidate Locus	AP1
Reference	Santra DK et al. (2009) Genetic and Molecular Characterization of Vernalization Genes Vrn-A1, Vrn-B1, and Vrn-D1 in Spring Wheat Germplasm from the Pacific Northwest Region of the U.S.A. Plant Breeding 128:576-584. [ Show all 8 ]
URL	Vrn-1 gene at Komugi: Catalogue of Gene Symbols for Wheat
Gene Product	AP1 MADS box transcription factor MADS-box transcriptional factor VRN1 VRN1
Chromosome Arm	5AL Law CN et al. (1976) The genetic control of ear emergence time by chromosomes 5A and 5D of wheat. Heredity 36:49-58.
Germplasm	Hexaploid stock Borsum PBA-14-42 Plant Breeding Abstracts 14:42. [ Show all 28 ]
Comment	Kuspira et al. (1986) attributed single gene variation in T. monococcum to the Vrn1/vrn1 locus. Multiple recessive alleles were suggested. The Vrn-1 gene encodes a MADS-box transcription factor closely related to the Arabidopsis AP1/FRUITFULL family, responsible for the transition of the shoot apical meristem from the vegetative to reproductive stage in wheat (Yan et al., 2003). Deletions in the promoter (Vrn-A1a, Vrn-A1b) (Yan, Helguera, et al., 2004), or the first intron of this gene (Vrn-A1c, Vrn-B1a, Vrn-D1a) (Fu et al., 2005) are the most common sources of spring growth habit among landraces and commercial cultivars of polyploid wheat worldwide (Zhang et al., 2008; Santra et al., 2009; Iqbal et al., 2007).
Clone	AY244508/9
Sequence	[ Hide all but 1 of 275 ] DQ291016 DQ291016_1.cds DQ291017 DQ291017_1.cds DQ291018 DQ291018_1.cds DQ291019 DQ291019_1.cds DQ291020 DQ291020_1.cds DQ291021 DQ291021_1.cds DQ291022 DQ291022_1.cds DQ291023 DQ291023_1.cds DQ291024 DQ291024_1.cds DQ291025 DQ291025_1.cds DQ291026 DQ291026_1.cds DQ291027 DQ291027_1.cds DQ291028 DQ291028_1.cds DQ291029 DQ291029_1.cds DQ291030 DQ291030_1.cds DQ291031 DQ291031_1.cds DQ291032 DQ291032_1.cds DQ291033 DQ291033_1.cds DQ291034 DQ291034_1.cds DQ291035 DQ291035_1.cds DQ291036 DQ291036_1.cds DQ291037 DQ291037_1.cds DQ291038 DQ291038_1.cds DQ291039 DQ291039_1.cds DQ291040 DQ291040_1.cds DQ291041 DQ291041_1.cds DQ291042 DQ291042_1.cds DQ291043 DQ291043_1.cds DQ291044 DQ291044_1.cds DQ291045 DQ291045_1.cds DQ291046 DQ291046_1.cds DQ291047 DQ291047_1.cds DQ291048 DQ291048_1.cds DQ291049 DQ291049_1.cds DQ291050 DQ291050_1.cds DQ291051 DQ291051_1.cds DQ291052 DQ291052_1.cds DQ291053 DQ291053_1.cds DQ291054 DQ291054_1.cds DQ291055 DQ291055_1.cds DQ291056 DQ291056_1.cds DQ291057 DQ291057_1.cds DQ291058 DQ291058_1.cds DQ291059 DQ291059_1.cds DQ291060 DQ291060_1.cds DQ291061 DQ291061_1.cds DQ291062 DQ291062_1.cds DQ291063 DQ291063_1.cds DQ291064 DQ291064_1.cds DQ291065 DQ291065_1.cds DQ291066 DQ291066_1.cds DQ291067 DQ291067_1.cds DQ291068 DQ291068_1.cds DQ291069 DQ291069_1.cds DQ291070 DQ291070_1.cds DQ291071 DQ291071_1.cds DQ291072 DQ291072_1.cds DQ291073 DQ291073_1.cds DQ291074 DQ291074_1.cds DQ291075 DQ291075_1.cds DQ291076 DQ291076_1.cds DQ291077 DQ291077_1.cds DQ291078 DQ291078_1.cds DQ291079 DQ291079_1.cds DQ291080 DQ291080_1.cds DQ291081 DQ291081_1.cds DQ291082 DQ291082_1.cds DQ291083 DQ291083_1.cds DQ291084 DQ291085 DQ291085_1.cds DQ291086 DQ291086_1.cds DQ291087 DQ291087_1.cds DQ291088 DQ291088_1.cds DQ291089 DQ291089_1.cds DQ291090 DQ291090_1.cds DQ291091 DQ291091_1.cds DQ291092 DQ291092_1.cds DQ291093 DQ291093_1.cds DQ291094 DQ291094_1.cds DQ291095 DQ291095_1.cds DQ291096 DQ291096_1.cds DQ291097 DQ291097_1.cds DQ291098 DQ291098_1.cds DQ291099 DQ291099_1.cds DQ291100 DQ291100_1.cds DQ291101 DQ291101_1.cds DQ291102 DQ291102_1.cds DQ291103 DQ291103_1.cds DQ291104 DQ291104_1.cds DQ291105 DQ291105_1.cds DQ291106 DQ291106_1.cds DQ291107 DQ291107_1.cds DQ291108 DQ291108_1.cds DQ291109 DQ291109_1.cds DQ291110 DQ291110_1.cds DQ291111 DQ291111_1.cds DQ291112 DQ291112_1.cds DQ291115 DQ291115_1.cds DQ291116 DQ291116_1.cds DQ291117 DQ291117_1.cds DQ291118 DQ291118_1.cds DQ291119 DQ291119_1.cds DQ291120 DQ291120_1.cds DQ291121 DQ291121_1.cds DQ291122 DQ291122_1.cds DQ291123 DQ291123_1.cds DQ291124 DQ291124_1.cds DQ291125 DQ291125_1.cds DQ364935 DQ364935_1.cds DQ364936 DQ364936_1.cds DQ364937 DQ364937_1.cds DQ364938 DQ364938_1.cds DQ364939 DQ364939_1.cds DQ364940 DQ364940_1.cds DQ364941 DQ364941_1.cds DQ364942 DQ364942_1.cds DQ364943 DQ364943_1.cds DQ364944 DQ364944_1.cds DQ364945 DQ364945_1.cds DQ364946 DQ364946_1.cds DQ364947 DQ364947_1.cds DQ364948 DQ364948_1.cds DQ364949 DQ364949_1.cds DQ364950 DQ364950_1.cds DQ364951 DQ364951_1.cds DQ364952 DQ364952_1.cds DQ364953 DQ364953_1.cds DQ364954 DQ364954_1.cds DQ364955 DQ364955_1.cds DQ364956 DQ364956_1.cds EF382983 EF382983_1.cds EF382984 EF382984_1.cds EF382985 EF382985_1.cds EF382986 EF382986_1.cds EF382987 EF382987_1.cds EF382988 EF382988_1.cds EU875079 EU875079_1.cds EU875080 EU875080_1.cds
2 Point Data	Vrn1/AP1 Vrn1/Xbcd450
Data Source	Dubcovsky, Jorge 2003.04
Data Curator	Cooper, Laurel Oct-2020 Hart, Gary E. 96.03.24

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.