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GrainGenes Probe Report: BG274853-7D

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Note: Probe report page includes probe information, gene models, PCR Primers, and SNPs.


Probe
BG274853-7D
Data at Wheat_SNP
BG274853-7D
Reference
ReferenceAkhunov ED et al. (2010) Nucleotide diversity maps reveal variation in diversity among wheat genomes and chromosomes. BMC Genomics 11:702.
General Remarks
SNP C>T;DEL;DEL;INS;C>T;C>A;A>T at 226;389;412;617, 6;624;710;732
SNP DEL;DEL;INS at 112;134;340, 3
SNP DEL;DEL;INS;G>A at 112;134;340, 6;469
Reference sequence CTCCTTGCATAGTGTTTGTTGATGAAATTGATGCTGTTGGGAGGCAAAGAGGAACAGGTATCGGTGGTGGGAACGATGAAAGGGAGCAGACTCTCAATCAGCTACTGACTGAGATGGATGGTTTTGAGGGAAACACTGGCATCATTGTTGTTGCTGCCACCAACAGGGCTGACATTTTGGATTCCGCTTTACTTAGACCTGGACGCTTTGACAGACAGGTTAGTTCCTATCCAGCTTTTTTAAGGTTAATAACATCAGTCTGGAATTTAATTTGCATGGTCTAAACCCTATTTGCATATTCTTATCATTGCAAATCTTCCTGCAAAAGTGTTTACCTTACTTTGTTCTTTCTTACTAAGATCCTCAGGTTCTTTCTATCCGGCTTTTTTAAAGGTTAATAACATCAGTCTGGAATTTAATTTGCATGTCCCTATTTCCATAAGGTTAATAACATCAGTCTGGAATTTAATTTGCATGTCCCTATTTCCATATTCAGGGGTGCATGGAAGCTTTGCTATCCATGTGCCAGAGCCATGAGTTGGTCGCGAGATCTTATGGATTTCACCTCTAGCCTACCCCAACTTGTTTGGGATTAAAGGCTTTGTTGTTGTTGTTGTCCCTATCTCCATATTCTTATCATTGCAGTTATTCCTGCAACAGATTTTAGAAAAAAAATCTTAGTGAGGTTCTCATGTGCTTGTAAACCTCTCGTCCAATTCTAGTTCAGAGCTAGAACTAT
Reference sequence GGTCTAAACCCTATTTGCATATTCTTATCATTGCAAATCTTCCTGCAAAAGTGTTTACCTTACTTTGTTCTTTCTTACTAAGATCCTCAGGTTCTTTCTATCCAGCTTTTTTAAAGGTTAATAACATCAGTCTGGAATTTAATTTGCATGTCCCTATTTCCATAAGGTTAATAACATCAGTCTGGAATTTAATTTGCATGTCCCTATTTCCATATTCAGGGGTGCATGGAAGCTTTGCTATCCATGTGCCAGAGCCATGAGTTGGTCGCGAGATCTTATGGATTTCACCTCTAGCCTACCCCAACTTGTTTGGGATTAAAGGCTTTGTTGTTGTTGTTGTCCCTATTTCCATATTCTTATCATTGCAGTTATTCCTGCAACAGATTTTAGAAAAAAAATCTTAGTGAGGTTCTCATGTGCTTGTAAACCTCTAGTCCAATTCTAGTTCAGAGCTTGAACTATCTTTGAGTATCTTAAAACTTGGAACCTGTTAGAACCTATTTTTAAATATTCTGGATCTTGCTTAACATTTGGATATACCTTGTAACTTGTTTCACAGGTGAGTGTTGATGTTCCTGATGTACGTGGAAGGACAGAGATTCTCA
Type
EST
SNP
PCR primers
BG274853_cpR1 GTTGCTACCGTGCACTTTGA
BG274853D_F3 CTGGAATTTAATTTGCATGGTC
Sequence
NSFT03P2_Contig18207
Linkage Group
7D
Source Species
Triticum aestivum