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GrainGenes Probe Report: BG313775-7A

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Note: Probe report page includes probe information, gene models, PCR Primers, and SNPs.


Probe
BG313775-7A
Data at Wheat_SNP
BG313775-7A
Reference
ReferenceAkhunov ED et al. (2010) Nucleotide diversity maps reveal variation in diversity among wheat genomes and chromosomes. BMC Genomics 11:702.
General Remarks
SNP DEL;INS;C>T;T>A at 9;29, 1;43;46
SNP A>T;G>C at 314;509
Reference sequence ATATGATTTATTGGTAGTTGGTGGTTTCCTGGAGAGCTTATACGCTAGGTATGTTGATGGCAAGTAGAGCCTTCTACTCTGCAATAGTCTGACAAGTAACAATTCTGACCTGATAATTTGCTTTGGTTTTTATTAGCGTCTGGAGGATGATGGGATAGTTTTCAGCACGAGAGTTACAGATGATGAGAATGCTATAACCAACTCTTTAGAGATATACCAGGATCCCAAGTAAGATTTGGTGCTTTCAGAGTTGATATACAATACTTTCAAGTTGTTGTTAACAATATTCTTAAAAAATGTATATTTTCAGTGGATCAAGACGGTTGGTGGTTGCTAATAATGACTGCTCTGTCAGAATTTTTGATACCAAGTATTTTGACCTACTTAATCACTATGTTTTCCCGTGGTCTGTGAATGTAAGTACCTTGTGTTTTTCACCGAGAGCTCAGACATGTTTATTCCGGACTGCTGTCTTGTTTATTTGCTAATATCTTGTTTTCAAACAGAGTGTTTCGGTTAACCCTGATGGAACACTTTTTGCTGTCCTTGGTGATCACGAGGATGGCTGGGTAG
Reference sequence CACAATCTGTCTCAATGGTCCAGTTCACAACTATGGCTGTAGATAATGATTTATTGGTAGTTGGTGGTTTCCATGGAGAGCTTATATGCAAGGTATGTTGATGGCAAGTAGAGCCTTCTACTCTGCAATAGTCTGACAAGTAACAATTCTGACCTGATAATTTGCTTTGGTTTTTATTAGCGTCTGGAGGATGATGGGATAGTTTTCAGCACGAGAGTTACAGATGATGAGAATGCTATAACCAACTCTTTAGAGATATACCAGGATCCCAAGTAAGATTTGGTGCTTTCAGAGTTGATATACAATACTTTCAAGTTGTTGTTAACAATATCTTAAAAAATGTATATTTTTAGTGGATCAAGACGGTTGGTGGTTGCTAATAATGACTGCTCTGTCAGAATTTTTGATACCAAGTATTTTGACCTACTTAATCACTATGTTTTCCCATGGTCTGTGAATGTAAGTACCTTGTGTTTTTCACCGAGAGCTCAGACATGTTTATTCCGGAGTGCTGTCTT
Type
EST
SNP
PCR primers
BG313775A_R1 TTAGCAAATAAACAAGACAG
BG313775_cpF1 GAGGGCATGGTTCACAATCT
Sequence
NSFT03P2_Contig8520
Linkage Group
7A
Source Species
Triticum aestivum