Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA037622

[Submit comment/correction]

Sequence	AA037622
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA037622
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CACTCACCCACCCGACCACGCGGACCAGCGGCGGAAACACGCGACACAAT TTTAGTCGCAGTGGTAGTAGTATATCTAGCTTAGGTCGAATGGAGCGCAC GGCCCAGTAAAAAACCATCATCAGCGCAGCGGTGGTGGCGTTGCTACTCA TCACTCGTCGTCACTACCAGTAGGGTAGGCAGAGAGTAGGGTAGAGAGAG AGAGGAGAGCGAGGGGCGGATGCGGGAGATCCCAAGGGGGGTCGCCGCCG CCGCCGCCGCCTGAGGAGGAGGAGGAAGACGCGATGGACACGCCCGATAG GCCCCGCGCCGGCGGCGCCGCCGCCGCCGGATTCGAGGTCAGAGTCTCAG CCAGGGCCCTGATTTTTTAAGGGGGACGAATCGTGAGGGGTAGGGCTTGG GGGGAATGGGGGGTCGGCGGCTGGTTTGGTCCTGAGGTGCGGGGATTCAT GTGCGCGGATTTGGTATTGCGAGGAATCGATCCCCCCTTGTTAATGGGTG TATTGGGGGCCTGAATTCGTTGGGTGTGCTAGGTATAAGGGGATGCATTT GGTGGCGCCGCTAGGGTTTCCATTCAGCCTGCATTTAGCTTTCTGCGATG CTTGATGTGGGAGATTCAGGGGCTTAGGTTGGGGTTTGACTTCATTCAGA ATAATCAAATCGTCTCCCGAGATGCTATTGGCATTCTCCCGGGGGATTGG GGCCATTATTGTCGGATCAACTGATTCGAGGTTGCTGATTCTGGGAGGGG AGATCGTCTGCCTGCTTAGATTGTCCTCTTTGTTTCATTGAGGTATTAAG ATGATATATGCTGTGTGCCATACAGCAATGCCTGCCGATTTGGTCCTGTC GTTGGTCACGTGTCCATGGGGAATTCAGGTTAATGTGTCTGTTCATGCTT GCTGCAAACGATCTACTGCCTTCAGCTTGGACACGACAGTTTGATTAGCC TTGCTACTTGATCATGGAGAAATTGTTGTGCTAATTAGGACGGATACGAT TGCAGTATGGTTGCCTTCGCTCTAGAAACCTGGTTGTCTGCACTCTTTTG GTTGTGATTGTAGAACTCTGTTAACCGTGGCCTTTCTTAAATCTGGTCAA CAAAATCCTATCTGAAGTCTACAAATTAAGGATCTGATTGTGTCATGCTC CACACTACGCAATTTTCTCCTGAATTGACCAGCTACTTGATATAGTCTAT TTGAAGTACTTGAGTGATACTTTGCGTGGGGCCTGCAGTTGTGGGGAGGG GACATGTTTGTGAACCACTGGGTGTTAGATGGTCTACAAACAACACAGTG TTATGCCTATTTACATGTGTATTTGCTTGGTAGAACCTATGGTTGATCCA TCTAAGCATTCACCTACTGTTCTTTCATTTGTTGATTTTGTAACCTAATT ATGCCTGTATACCATCTAATCTTTTGCATCTAAGCTCACTTTTATACATG TGACATGGAGATATGCACTTTAATTCCTCCAATAAAAAATTCCAATAGTT TGTTTTCTGATTAGATTTCTCCTACCTGCAGGACTCCCCTGTCTTCAATT TTATCAATAACCTTTCTCCTATACCAACTTATAAACCTCAAGATTCAGCA CTTAACGGGCAGCTATTCAAGACTTTGGACTTAGCTCCTATTTCTTCAAT CTTTGCATCACCACATGTCAATCCTCCAAAGGAATCTAAACTCCCGCCAA GGTAAATTTGCGTGACTTGTAACCTGTGTTGTTAAATCCATTTAGGCTTA AGCCTTACTGTCTCTTGTCATATTTACCAGGGATGATTCTGTTCAAGTTT CTGAAGATTCGAATTCTCCTAATAGTGTCAGAACTCGATTAGGGAGTACA ATTAGGATGATTAAATGCAAAAACATTGTTCCAGAGAACTGCAGTTTCAC TTGTCACCTAAATGAGGGACCTATTGATCCTTCTGTCGACAGATCAAACT CTACAAGTGAATTGCCTCAAACCATCCAATTCGTTGGTGGCCCTGCAGAA TGTGATAAGAATCAAAATGCTGATGGTAAAGATCTTGCTAGGGATCAGGA GTGCACAGAACTAGAAGACGTCCTCCTTGATCAGACTGGTTCAGATCAAA TGGATTCATCACAACCTGGGACAATTGTTCATCAAAACCAACTACCTGAA CAACATGGGGATGGATTTGTGGCATATGATGGGGATTACTTGATTACACA CGAATCAAGTATTGATATGTTGAGATTAGCCCCACCATTTGCGGCAGAGA CACAGTTAGCGAATGAGACATTAAATGCTGAGAATGCATTCTCTGGTAAA TCTTTGTCGACTGATGGGTCAAGTGTCTCTTATATCAACAATGCTGCAGA TGATCCTAATCTTTACTGGGATGGAGCAGTTGAAGGGTCTGCAACAGATT ATACCCCCCAATTGCTCCCTGGTGCTTGTCAAAGTCAGTTGGTACCAAAT GATCAAATCTGTAATGCTCTTGAGGAACCTTGTGAATATTTGCCAATGGA CCAAAATGTATGTATACTTCTAACCTCTTGCTGTTGTGCAAATTTTGTCA AGAAAAACACAACAGACTTTTGCGATTGCATTAAAATGGCAGGGTTTCAG TTTACAATTCTCCTAGGAGAAGATACATAGAAGTATTGTGCAAAAATTTG CACCTGTTCACATATCGGATTACAATAAATAATGGTTGGGTGCTTATTTA TCTAACTAGATATAACAGTGGTTATGTATATGAAATGTTACAAGTTACAA CTCACAAGCTTGAGAAATCGTAACAAAACCATTTAGGAGATCCTGATTCC ATTTTGACAATCTATTATTAATATATTAACAACTTATGATTAGGGTTTAA CTCTCTGCACTCTAGCAGCTATTTTCTAATATTATATGAAATGAAACCGC TCTTTGCATATATTGCCTAGTGTTTGTTTGCTTTTACTACCTATAAGGCT ATAATTAATCCGACTGAAGTGTCACATCAAAGTAACTTGTTTTTTTTTTC TGGCAGGCCTTGTCACAGCATATGCGTGTTATGCGCAGGCGTTGCCTTTT CAACGAAAAGACTGGAGTTGTCAATAAAGCTGTGAAGAAGACCTCAGGTC AAAGTTTTGCAAACACAACCCCCAGATGCAAAACTGGTTCTGGTGATAAC AACTCAAAGCCTATGAGAACCCCTCCGTGCGCATTGCCTGGTATTGGTTT GCATCTGAATGCCCTTGCCACAATACCAAAAGAGAAAATAGTCCCCCATG CTGCTGAGTCTTCTGTAAATCAAGCCAGCAACTTCCCATGTGTTGTCAGT TCTTCTCCACCAACATCAGAACCAAATACTGCAGATGAAGATTCCTCTCA GCCAATAGTTGTTGCAAATGCTGACGAGCCTGGTCAGGCTGGTCCCAAGA AAAAAAGGTACGATGTCTATGCCCATTATTTTAGGTCACCAGCATCAGTT TATTGGACAAATCATGGAAATACAATAGTACTGTACAGATACAAGATCGA TGATGGCGATGGGACTTCATGCAAGCGCTGTAGTTGCAAGAAGTCAAAAT GCTTGAAACTGTAAGGTCTCTTGTACCATTTCCTCTGATTTCATCAACTA CTATGCCACAGCATTAATGCAGACATGAAAGCAACTTTGAATACTATTAG TTATCTAAATGTGCTGGTGCCGTTTATTAGCACTCTAGGTCTAAGATGAA GGTGTACAGAGTTATCATGCTGATGAGGTGCTCCTAATTTTGCACTAAAT AGTTTAGATAAATTCGTTGCTCTAAGCCTCTAATTACACATGATTCTCTA AACTTCTAGTTGACTCATTGTAATGCCCCAGGTTCGAAACTGGCTTAGAC TTAACCCTGTACTGGGTTGGCCATGCACACGTAGAAGCTCTTTTGTGTTT TTGTCCTCGTTTCACACAAAAGGCCATCCAGAGTTGCCACCTATGGAACC TATGAGTTCATATGTTGGTGTTGCTCGTTGCTGCTCTTTTCATAACCCAG TTACAAATGTATACATTGTTGTGCTAATAAAATGTAAGAAGACAGTTGGA TAACATAATTTTCAACTTTTTTTTAGAGGAAAACATAATTTTCAACTTCA ATCTGCTCTACTGCTGAGTAATAGGCTTTTCACAATAGCCTGAAAGTTAA GCACAATAACTCAAATGGAGCCTCACTGTTGCTGAACTGTTTGACATGGA ATGGTGGCATACTGACATGAGAATGACTGGCAATTTTATAAGGCATATTT CCATCATTTCCAAAGGATTACGAGTTGATAAGTCGAGCCGAGTCGTTGGG GTACCTACTCATAGACTATTCAAGACTAGTCTAGACTACTGCTCGACTAG TCGACATGTACTTCGGCAGTAGCTAGTACACAATACTATCATGTATGGCA ACCAGATGGGAGATTTAATAACTAAAACTGAGATAAGTTCGACACAAGTT ACATATAACATAATAATGCTAGAATCTAGAACTTCATGTAGCGAGTCTAG AATAGCTAGGGTTCTCAATTTTCTTCCTGAGCACCTCACTTATCCGGTTA AAATTGAGTCGATCGACTCAAACAGCAGGACTAGTCCAGAATTAGTCATT CGACTCAATCGAGTTGAGGAAATACGAGTCGACCAACCGAGTCGACAGTC AGTTTAGGACTTGTAGACTAGTCGTTGGACTAGTCTAGACTAGTTGTTGG ACTCATATTCCCCAATGACATAATAATGAGCATAATTCAATATGAGCAAG CCTAAAATAGAAAGCTGTGGTGTGCTTGAAAAATATACAGCTGCAGATCC GGTGTTACCAAATATGGTGTTCTAGTCACCCAACTATATACACATATCTT AATGTGTTACCACATCTGGTCTTCTAGTCACCCAACTATATACAGATATC CTAATGCAGGGCACTTTAACGGAGAGATTGCACTGTGGGTCACTAAACTT TAGTCCCAAGTTTTTCTTCAGGCGGTGCAGCAGGGAAAATTGTGCCTCCG AGGAGTGATTTAGATTAAGAGTGAACCCGATGCCAAGTTTAGGGATCTGC TTTTCGATTTGATGGTTTTTAGGCTAGGGTGTAAAATTTTGTAAGGGTAC AATGCAACTGAATTCAGATTTGGATGAATTAAAATCTAGATACCCAATAT GGAGTGTGTGTTTCTTCTGAATATTGTTACGGGTATCTCTATTTTTTACC CTTTTCCCCGATGGTCTTCTCTTGTGAGAGAACAATGCTTGATAAAATAA GGAACATGTGCTTGATTCCAGAGAAGTTCTTTCTTTGAACCAAGCGGGCA TGCAAATGAATGAGGGATACTTGAAGTATACTAAACTAGGCAACTGTGAT CTTAAATAGCAGTATTCTGGATGACTATATTTGTTATGCCAGAAAAATGA AATTATCTTTGTAGGATATCTGATTACATTCTAGCCTCACATCTTGATGC CTTCATTTTTGCTTGTTTTCTAGTACACTGTAAACAGTATTTCTCCACAA GTTCTGTTGAATTATTATGTTAACATCAAGCATTTTGGCCTCTGAGTTTT TCAGTGAAATTAATATATTCTTGTGCCTACTGCTATCCATGTTTGCTTTG AATCTCTATCCTGCAGTACCTTGAGCTAGCATCAGAATTTGGAGATAATA CACATGCTGTTCCGTACTTCTGATGTTCCTCTAGAATTGAATGGCATAGC ATAGCACTACATATATGTAGATTTTGACAAAAATATGTTTGTGGAATAAT CAAGTGATAGAAATAACACAACCTTGCACTGTAACATACAAATGGAAAGC CAGAAATTTAGAGTGGTAGCAAATGCCACGAACCTAGAGTTTATAGTAGC CAGGTTCTCAAGTGTACAAGGATGTGTGCGCTGTGTTGTGGCAAATTACA CTTAAGAGTGTTTTATGCAAAGCCAGAAATCTGGAGTGATAGCAAATGCC ATGCATCTAGAGTGTATTGTAGCCAGTTTTACCCTTTTTTATTACTCCTC TTGAGTAGTTCACACTTGTTTTGGCACCCAACTTACTTTTGTTTGCCCAT TTTAAGAGTTACGAAGAGCAGCTCTTGTTCTTTAGAATGTACTTTCGGCA AAAAGAAATCTTCATCCTGTGATCCTTCTATCTAACGTATTGGCTAATTC TCATGCAGTTACTGTGAGTGTTTTCATGCTGGAGTATTTTGTTCAGAACC CTGTTCATGTCAAGGCTGTCTAAATAAGCCTACCAACATGGAAATAGTTC TATCTACTCGAGAGCAGATTGAATCTCGTAATCCACTCGCATTTGCTCCT AAAGTAATTCGCACATCTGAGCCTGGTCAGGAGTTAGGGGTAAGAGCCTT CCTTCATATTTTTCTTCCTTTTTTTTTTCCTTTATTACTATCACTCATTA CGATTGTTCAAACACTGTAGGAGTATTCTAACAAAACTCCTGCTTCGGCC CGTCACAAAAGAGGCTGCAACTGCAAGAAGTCATCGTGTCTGAAAAAATA TTGTGAATGCTATCAGGTTCTTACTCTTACATGATTCAATTTTTTTTACT TAGCTGGTTAGCCTGCCTGCATCTGTCTTACTGCGCTCTTCATCAAGGGT GGCGTGGGATGCTCCATAAGTTGCAGATGCGAAGGATGTAAGAATGCTTT TGGAAGAAGGGAAGGTGTGCCTTTTATATTTATTATATAGGCTTCTCTTA TAAATCTGCAAACTTCTGAATGCACCAGAGTATAGTTTCATCTGTGTGCT TTTTATTCGACACACGGTTAGGCGAATAAAAAGAGGTTTCTAGAGGTTTA GGTTGACATATTAGAATAATGTGCTCAATTAGTTGTCTGGAGCTGAGGAT TAATATTTCAGCTTGAAAATCTTGGACCAGGATCCAAGAGTGTGCTAGTA TTTCCTAATCTTGTTTCTGTATGAAATGTGCTCCCCTGACAGTATTTTGT AACTTTCATCATTGTACAATGTGACGAATTTAGAAGGCCTGGCTACACTG CTTCACTTTGAGTTTGTACAATTGCTTGCTTTTAAGTACTCCCTCTGACC CATATTAGTTGACTCCAATTTGAATGTATCTATCATAAAAACTTGTCTAG ATACATCCAAATTGAAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTACATATTT TTCTATAACTGCTGGCAAGACATTCAAAGATTATCTTGTGAACTGATGAC GTTTTTGTTTTGTTTTAGTAAGATGTTGCAGTACACTATAAACTACATCT GTATATCTTTTTCTAAGTGCAGTAGCACCAAATAGAACAACAAGAAAAGG AAAACATATAATCATCTTGGTGGAACCTTGTTTATATATGACCATGATAT AACTTTCTTGTATAGTTTTCTGAAACTTCTGTTCCAGCCATTACTGTTAA GTAGAGAAAGTTGAAACGTTTTTAGTCTTGTTCAAATTTTCTTACCAGTC ATAAGTAGCTACCAACATTTGATGGCCCATTTTTCCATTGAAGGAGTTGC ACTGTTGAGCTTAGACGAAGTTAAGCTGGGAGATGAGGAAAATAGTGCTT GTGTGAAGGAAGAAAAAAAAGAGAATGATAATCCGCTCATTATCATCCAA GCTGCTAATCCAGCTCCTGCTGAGAATGTACTGACTACACCTTCAGTTAT GGATATCAGGTTTGTGTATCACACCTTTGCACATATGTTACATCAAATGT GAATAGTGGTACTGAAATTTGTGGCAATTTTCTCTTCTTTGCAGACCCTT GGCTTCTATTCCGCCTTCAAGCTCCAAGAGGCCACGATCTTCGACAAAGC TCATTGGACATTCTCCTCGACTACGCAACCCCAAAGCTCCTTCTAAGGCT GACATACTGCTCTCCCCATTTGAAAACTATTCTGCAGAAATGGTTTGGGG TGGTGGTACATCAGATAGCCTGAAAGGAGGTTTATCTCCTCAAACTTCTG TCAAGATCGTGTCGCCGAATAAAAAGAGGGTATCTCCCCCGCGCATTGGT ACTGGATTGTCTCCGATCTGCAAGAGTGGCAGGAAGTTGATCCTGAAATC TATCCCTTCATTCCCTTCTCTTTGTGGTGATGTAAATAACGTGGATCCCA AGACCTCCTTGCCTCCTTGAACTCATCAGCATTTGTCACTTTGAGGTAAA CCTTAATCTTTTCTTCATCGAGATGTGAATTTTCTTTCCAGTCTGTACTC ACCCAAGTAACACCTATTCATGTGCAGGTCATTTCATTATTCACTTGTTG ATTCCCCAAATGGCCAATGCCTCATGTTCTGCGTCGGTTCTTTCGTCCTT TGGAGTTTGATGAACAGCCAAGGGAGTTTTGTTTCGCCAGTTCGATTTAG AGCCTTATAGTACTCCGTAGAATGTTGAATAATAATGTACCAAAGTATCC CTTGAGAGCCTTCTGCCTGCTAGTAACTATGTCTACACTTTGTGGAGACA GATCCTTGTTGAGTTGCACATCCCTCTTCATCTGTATAATTAATTATATA TTTATTTTATCCATGAAGCTGAAACAAACCATCAAGCCTTGGATTTGTAC TTGGATCAAAATCAGTAAAATGTAAGAACTCTACTTTTGACCTTTGAGCA CACGTTTGCCTATGAACTTCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.