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GrainGenes Sequence Report: AA023175

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Sequence
AA023175
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA023175
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCGCCCAGCCGCCGGCGACCTCGCCTCCGCTCGCACACCACTCCCTC
CTCCCCCTACAATCTCTGCCCAAGGCCTGGTAGGGTAGTTGATCCTACCA
GAAGATGGGAACAATTTGCCCTCCTGATGATATGCCTTGCAACCTTGTCA
ATCATATCACTCCTGTTATTCATGAAACATTATTCCTGTGCACTTACTGT
TATCTGGAGTTATTGTGTGATGATGGAGATGGACTATTAATTTATAATTT
GTTGGTGACGAAATTCACTTGCTTTCTCCTATCTATGTACAGGTTAATGG
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ACAGCGAACGATGTTCAATGCTTTCCCACCTGGGCATTATGGTTCGTACT
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TCGCACGGACGGCGCGGCGGCACAGATCACAGCCGAAAATCACCAGCGAC
TGGCGCCTACAGGCAGACTCTGGAAAGGAGCGGCCAGCGTTCATGATCTC
ACAGATGTCGACTCCTCAATTTCTTTATCGATTCTTACTGAGTTGCAATC
TAAATATCTACATATCAGGTAATTTACTAACTTCAAGTTTTCTAAATCAA
TTGACTTGTTTGTAGAGTAAATGATAAATTGATGATCTGCGGTAGCATAG
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TTACTGATGCTGACATAGTTGCCCCAGTTGTGAGAAATTTTCTAAACCCC
GACACTAATGATGGCAATAAGAGTACAATTACAAATTCCCCTATCAAAGA
GAGCACTATTCTTATTATGTTAGTGACTTAGAAGGGTACCTTATTTTATA
AAAAAAATCTTGTTTAGTTGTCGACTTTACACTGTCATACATTGACATAG
GAACCTGATGTGCTTCTTTTGGTGGAGTCTTTTTGCTGAGTGATCTATTA
TTGCTGGCCAGTGACTGTTGCGAGCCTACCCTACAATTTCGTTTCAGAAT
CGCCACTGGACATGATGCACTTCAATCTTGAATTGAAAAACAATTCTATG
CTGAGCAGCCAGAGGCTAAGCCTAGGCCACCTTGCGTCTCTGTCCGTGCT
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GTACTTTGTACAGAATGTTTGATGTCCTCAATATAGTTGGTACCTAGGAT
GTCTTGGCTGTAACATTAGCTTGCTCTAAAAAGTGCAATATTGTCCCTTA
TGATGGTCTTGCCATTTCAACACAATAGTAGATCTTGTCGCTTATGTGCT
GATATGTCAGTTACTATTCAATTAGCACTTGTGAGATGTATTATGTATAC
AGTCTTTGAGCATTAAGTTTTTACTTACCTACTTGGCCATGTGTCGTTGT
TGAGCTATCCTTTTTAAGATGACTTGTATTCAAGGATTATGAGTCGCTCG
ACAAGTCGAGGCTCCTGTCGCAAACTCGTTGACGATAACCTGGAGCGACA
CGACAAGTTGAACTTGTCGATCGAAAAGTTGACTTGTTGATGAAAAATCA
CGACTTGTCTATGTTTTTTAGTCGAGCGACTAGTTGTGGGCTGGGAAATA
AAATCCTTCCCTGCAGCAGTTTCCTGAACTATCTTCCTACACTGTCTTCT
GCAGCAGTTTCCTGTAACCATTGTTCTCCCTTACTCTTGCTCTTGCTCTT
GCTCTTGATCTCCGGTACTGTCCTCTGCAGCAGTTTCCTTCCCCCTGTCT
TGATTTCCTTTTCCCCTGTCTTGTTTGCTGCAGCATATCACCATGTCACC
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GACAAGTTGCGACTCAGCGACTCGTAATCCTTGCTTGTATTTGAGTTATG
ATTTCCAAGAGAGAGATCTGCTGTATATCGTACTGGTTTGTTAGATGACT
TGTATGTTTTTGCTAATTGTTATTTGGTTAAGCATGTCCTCTTCACTATT
ATGGTAGTCATAGACTTCTTTATCTTTAATAATTGTTAATTCATTGTGTC
TTTTAATGATTAGCAATGCTAGCCTGCACATTAATTTAATGAGAATGAAA
TTTAAGTCTTTAGGGGATTGCCTTTTTCTCTTATCTTTGTTTGATGTATA
ATACTCCCTCCTCCTCAAATTACTTGTCTGAGATTTGTCCAGATATGGAT
GTATCTAGACATGTTTTATAACTAGATACACCTGTATCTTACAAATCTAA
TACAACTAATTTGAGACGGAGGGAGTACCATTTTTGTTACAGTGACATCG
ATGGTATCCCACTGCAGATTAGTTTTGAGACACGAGGGGGTAATTGTTTT
CAAAGAGCTTCTCTTCTCTACCAGCGTGATTCGAGGCCGCCAACGTGTGT
GGCGAGTTCACTGAACCGCAACCACGGTGGCGGTGATGCTCAGCTTCGGC
TACACCCTCCGGTGAGCTACTGGTTTATCCCTTGTTAGCACCAATCTTGA
TTCTACTATCTGCATGTTTATGCTGTATTGCATGTAGTTGGGTGATACGA
GTATTTATGTAGCTTGTCACACAGCTCGTACATGCATGGTTTTTAAAGCG
TCGCGTAGGCGTCGCCTAGGTGATGCTTGGGAAGGCGTCGTGCCCGCTTC
ATATTTTTTTACAAAAGCGTTCAGATTCCTGCTTTGAGGCGTCCAGGTCG
TGGCCTACACGGGTAAGTCGTCGCTTCGATCGACTTTGGACGCCATGGTC
AGGTCGAGTGGGAACTGTGAGCTCGTGAGCGGGAAAACAGAAATCGGGCG
GGATTGGAGGGAAGCTGGGGGCTGATTGAGAGGGGGAAGAGAAGGGAACA
GACCCTTGACCTAATCCAGTCGATTGTGAGAGAGAGAGGAGCTCTCTCCT
CTCTGGCGGCCAGCTCCTCCTCCGCCTGATCTCCTCCTCCTCCGGCCAAT
TCCTCCCTCCTCCACCGGCCTACTCCTCTCCGGCCAAGCTTCAGGGTCTC
TCCTCCACCTGGCGCAGCCATTCCCCAGCAGGGCAACAAGGCACTGCTTC
CCCTCCCTCTTCCTGGTTTCTTTTCTCTCCTGCCTCAACTGCTACTGTTT
TCGGTGGAGACCTTTCCTCTGTTCTGTAACTGAGTAGGCGCTTCAGTAAC
TAACTAAGGCGTCGCCTCGCTTCGCGCTTTGAGCGCCTAGGCGCCCCCAG
CGCCTTAAAGCGCCTGGACGCCTTAAAAACCATGCGTACATGAGAAGCTG
ATGGGTATGGTTTCAGCAGGGGATGCACGGCGAGATGCCAGAGATAGTCG
TGGGATGCGACTCATGGCGATATGCCGAAGGCCGTGTGAGACGGTGTTGT
ATGTAAGTCCCAGGTTGTGCTCGTGTGTGGATGTGCATGGTAGGCCTGAA
TCGTGTGCCACTACTAGAGAAAAGCCTATCCGAGGCGCACCAAAAATACT
ATCCGAGGCGCATATCACATGTGCCTCTAGCTTCAAGCCTCGGGTATTTC
TTATGCGAGGCGCATCTGATATGCGCCTCCTATACTTCACATATGCGAGA
CGCATATCGATATGCGCCTCGCATAATAATATGCGAGGCGCATATCGATA
TGCGCCTCGCATATGTGAAGTATAGGAGGCGCATATCAGATGCGCCTCGC
ATATGTTTCAGAATGCGCCTCGGGTATTTATAGTATATGCGCCTCGCATA
TGTTTCAGAATGCGCCTCGGGTATTTATAGTATATGCGCCTCTAATAGTA
TCCTATATGCGCCTCCGGTAATATTTTCGAAATTCAAGTTTTACAGACCA
CTATAAATAATAATATACAGATATTCAAATATACAATATAGTCCACAGAA
TTTTTCAGAAACTTGCATTTTGCCAAAGCATAATAGAACCAACATGAATA
CAATACATTACACATCAATCATGACATACAAGTTCATACATCAAGTGTTT
GTGCCACAAGTTCACAACTCCGAGTACAAGTTCACAATCACACCTTCGAG
TACAAGTTCACAATTCACATTACAACTCCAACGACGTAGCTCTACCTAGA
TGAAGTAGAACACAACCTACAATGAAGAGCAACAAGGTGGTGATCACGAG
GAAGTTCCTCCACAACATCGTCGATTCACAACCGGTCAACCAAGAGGTCG
CTGATTCCAGCGAGAGCACAGAGCCCACCAGCCGGTTGGCTGTCCCTCAT
GTATTTCTGAAACTAACAAATGTGGAACTCTAGGTTCACAGAGATGCAAT
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AGCAGGACAGCTACAACATGAACGCAAGCGCTCACCTCAGGCGACAACAG
GACAGCTACAACATGAACACAAGCACTGAAATTTTCTCGTCTGCGAAACA
TTGCCTATTTCTCTTCGTCTCCATGTCCCTTGCATACATCTTCTTACATC
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CAAGCTTCTGAAAATGGCAGAAGGAAGAATTCTTTCCAGAACTAGTGAAT
GATTTCAAACCTACATCTTCCAATTTTACTGCTTTTCATAGGAAGTATGT
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GATCACTACGAGTCCACCTAATTGTAATTGTAACTAAAATAAATCCATCT
CGAGTTTTTAGATCCGTGAATATTTGGGTAATATAAATTTAAAAAGGAAA
ATTATGTGAAATAAATCTAGCATCTGGAGTGAGCAGTGATTTGGGAGAGG
TACCAAAGATTGCACATGGTTTGAACAAATACACACCGCGGCAAGGACTG
AGATCTGAGTGTGCCCACCGTTCACCGGGATGCCGATGCCGCCCTCAACC
ACCACAAGCCGTGATTACCGACGACGATGCCGATTCTGCTCGCAGCCTGT
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ATGGGCTTCTACTAGTGTACTCCTGTAGATCTACACGTTCTAGTCATACA
CGTGACACCTTATGCGAGGCGCATATTGCACAATATGCGCCTCCTATAAT
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TGCGCCTCGCATATTGTCCAATATAGGAGGCGCATATTGCCATATGCGCC
TCGCATATTCGTGCACCTACCAACACGCGGGCCCACACAGAATATGCGAG
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ATACTAGAGGCGCATATCTTAAAGTGCGCCTCGCCTATTTTTATAGGAGG
CGCATATGCTAAATGTGCCTCGCATAAGCATGTCTCCTATAGCCTTTTCT
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GTTAGTTCGATTGTTTAGTTAGTGCAATGTGCATGCAGTGAGTCTGTTAG
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TTTGCTGGTGTGAGTGCATGCAGATAGTGGGAGTGTGGTGCCCTGAGTGT
GGAGCGTGGACTGTTTGAGTCTATTTAAGGCGTTGTAATCAGCATGTTTC
ATGACAATAAGAGAATAGCCAGATAGAAAAGGTCATGAGCTGTGTAGGAC
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ATGTGTAGGGACTCAGCTTCCGAGTCCGCGCCACCGTCCAGAGCAAGGAG
CAGATGTCGCCTAGACCGGCTCAGCTGGGCCAAGCGCTGCTGGTTCAAGG
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TGGGCATGGTCTCGCTCATACTTTGGTATGAACAGAACAGTGGATTACAC
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TAATGGTGCATTTTTTGGTTACTGTTAGTGATACGGTCATTTCATGACAT
AATTTCACTATCATGCTCTTTCTTAGTAGGTTGTATTCTCTAGTATATTA
AAGCTAAAATATTGTGCATAATCTCAATATTGTGTCATCGTTGTACCATG
CTTCATTATGCATTCTGAAATTACCTTGGACTGTACATGTTTAAGTCACA
AAGAGTAAATACTTTCAGTTGTTCCAAGAGGTTAAATATTTACATGACAA
TGATCTCCAATCAATAATGATTCTCATTGTCTAGTTTCCACTTATGTTTG
TCTCAGCTCAAGTATTGATCACAACTGATATGGTTTCTAATTTTACATAG
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GATTAATGTCAACAAAAAACTAACTTGTTGATATATATCACTGTATGGTT
GATCTAGAAAATGGGTGGTGTCTTTATCCTTTGATTGATCCAGATCACTG
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TTATACTCGCTCTAGCAGTCTAGCTTACACATTTTTTCCTGGTGTGTCCA
GAAGGCTTTGCAAGCTATGAAGTACTCGCTTTCTTACACAAGTTTTGTTC
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GTCTGGCTTATCGTTTGTTTAACTGCTGGTGTGTTCAATTTAGATGCTTA
AATGGTTGATTGTAGGTAAGGGAAAGCTGCATTCGTTTATCTTGATACAC
TATTTGTGACTCTAGCTCAACAATACTATGTAGAAAATTTGATCATGTGT
AGCAATATATTATGTTCTTAGTGTGACAACTATGCATGGTGCTAAAATAT
TGTTCAAGACAAACTGCAGTTTTGAAAAGCAGTCCATTATCTTACTAGTG
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CCCTGGTGCCAGCGATGCAAGCGAGGATTACCGGCCGGCCGGTGGCCATC
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AAAAAACACCTATTCTTGCTAAAAGTTGTATCTTTTCTACTTGAATGTGT
GGAGAATTATGCATGTATGGATATAAATTTAATGTGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.