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GrainGenes Sequence Report: AA035437

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Sequence
AA035437
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA035437
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCAGCGGCTCGGGGGCCGCAGCTCACTGCGTCATCTGCTCCGGCGAGGAT
CACCGCGCGCCTCCGCCGTCTTCTCACCCACCCCCAGGTTCCCATTTCTG
GCTGCCCACGTCTGGTACAAGCTCCGCGGACCTGCTCCACGACTCGTATC
CGCGGCCGACCTCGACGCTCCGCCATCACCCCTTTCCCTCCGGCGGCTCC
ACATCTAACTTGCTTGCCCATCCCCGGAGATACGGAGGGAGGAAGAAGGA
GGCGCGCCAATGGGCCCGCCCGCCAGCGCCTGTGGGTGAGCGATGCGGGA
GTCCCAACCGCGCGTGAGGTACAGGGAGGGATCACATGTGGAAGGCATGT
CAGTTACGCCGAGCAATCCATCTATGGTGCCGTCCAAGGTGCGTGAGAGA
AAGCTTCTAGCTCCAGAACTGCATTGAGGTTACACATGAACACTAATATT
TTTTTCCAACCAATTCCAGCGCGAACGTGTGGAGAGAGCCCAGGATTGCA
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CTCTCTGCAACTTAGCCGTCGCTGGAGCTTCAGAGGAAGCCGGATTTCAT
GTCGACCCTGAACCTGAAACTGGGGAAAAGTGCGAAGCCTATGTCCTTTC
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CAAGATGTTCTTAAGCATGGTCTCTGCCTCTCACCAGAGACCCTCCGCAG
GTTCTGGCGCGCTTCGCAGCTGAAGCCTTGGGACTTTCTTGACATTTTGA
CCGGTTTTGGACAAGCTGCAGCAGAAGTTAGAAACGCCAGATTTCTATGG
AATTTGTACAGGTGGGCTTCGTGTCAGAGCATGGATTTCAAACATCTTCC
AAGGTCCAATGGCATGATGGTGTCAGTACTTGCGGATGCTCAGATGCTAA
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CTACCTAGACAAATCAGTGGCACTTTTTGATCATGCAAGGTATAAGTGTT
TGATTCCTTCAGCCTCATGCTATCAAGTACTTCTAAATCTTCTGGTCCGA
AGGAGAAAACATGAGTTAGTTGTAAGAGTATATGTGGACATGCTTGGAGT
CGGATTAGGTTCTTTCACAGAAGGAGATATTCTTGATTTTGTTATCAGTG
CTTTAGTCAAGAGAGACAAATTCTTACAAGCTATTGGTATAATTCGGCAG
TTAAAGAGTTTGAACATTGAAATAAGCAAGGGATCCTTGTTAACTGTTGC
AAAAGAATTTTGCAAGAAGAAGGACATTGGAGATATGATGAATTTCTTGG
AAGAGTGGAGGTATTTACCTGAGCTGCGTCTTTGCAATAGAATGCTTGCA
TCTTCGTGCAAACATCTTGGTACTGACGAGGCATGGTTTGTCTTCCAAAG
GTTAGAAGCCTTAGGATTTGCCCCAGATGCTACAACCTTTGGAATTTTCG
TATGTCATAGCTGTAGAGAAATGAAACTCAAAGCTGCATTTCTCTATTTA
TCTGAGTGCTTTTCTAGACATATTGAACCTAAAGTTTGTGCTTATAATGC
TATCATAGGTGGTGTTTTCACAGAGGGACTTTACAGACATGCAAAGTATA
TCCTTGAAGACATGATCGAAAGAAAAATAATGCCCGAACTTTTAACATAT
AAGATACTTCTCGCAGGATATTGCAAGTATAGGCAGTTCGATGATATCGA
ACAAATCTTGAGAACTATGAAAAACAATGGTGTAAATGATCTCCCCTCTG
GAAACTGTGCCCTCTCTAAGGCCTTATCCTTCCTGGGGCTTGACCACTTA
GGCGTGAAGGTCAAGAGAGATAATGCCATTGGCTTCCCGAAAGCTGAGTT
TTTTGATTCAGTGGGCAATGGCCTGTATTTGGACACTGACTCCAAAAGGT
TCGAGACTTCTTTGGTACAGATTCTTGATAATGCTTTTTACTCAGATATT
AGCCCAGAGATAGTCAGTGCATGTCAACAAGGCGATGTTGCAAGTGCTCT
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GCTGCTCAGAACTAATCAAGTCCTTGAGCATTAGCCCTGCACATGTTATG
GATTTTATTGAACTATTGGAGGAAATGCCATATATGTTTGATAAATTGGA
TGCCCAAACTCTAAATTCCGTCATCCAGACACTGAGTAAGAATGGGACGT
CATCTCGTGCGAGATTGGTTTTGGACAGGTTGTTCAGAAGAGGCTTGCCA
GTTAATCAAGATACCTATACTTATTTGCTTGAAGGCTTCTGTGCAGAAAG
GAACATAGTGGGGTTCTGGGAATGTTGGAATGTTGCAACAAAGTTTTATT
GGTCACCTGACATCAAGGATGTGATGCCCCTCCTCAGCCACTTGTGCAAA
TGGGGAGTTATTGAGGAAGCTTTGAAGCTTATGAGCTTCTTGCTCGACTG
CTATCCTAATCTGTTCCTGAGTGCATATCGTGCACTTCTCAAAGAGTTAT
GCAGAACTGGTTACACTACCATTGGATGTGCGATGTTGGAGGTTCTCCTA
GAAAAGGATGTGGTTGTGGGTCGCTCACTAATATTTAGTGTGACAGAGGG
CTTCCTAAAGGAGCAGAAGACTGTCGAGTCGGTTGGACTGTATGACATGT
GCCTTAACAAAATCAAAGTATCAGACGTGTATAACCACCAATTTCCATTC
TCTTCACTAGCATGTTTTGATGCAGAACAATGCATGGCCTTGGTACAATC
TGTGATGAAAATGGAACTTTCTGATGTCTCAGCATGCAGTTGCATTGTGA
ACGAATTACTGCAAACAGGAAAAGTAAGTCAGGCACTGTCGGTTGTTCAA
GCCTCCACTTTGGGGGAGAAATTAAGTGACACATTGCTAAATTCCACCCT
TCAATCATATTGTTGTCTAAACAGTTGGAGAAAGGTTGATGCAGTTCTTT
GTATAATGCTAAAGATACATGCTAGCATTTCTATTTCTAGCTACCGCTTT
CTTGTCTGCAGAATGTGTGAGCAAAGTCAATTTTCTAGTGCATTATGCCT
TAAGGAGCTAATCCAACACAGTGACAAGTCAACAGAACTTATTTTATACA
ACATTCTGATGTTCTGTCTTTTTCAGAGAAAAAACATCATGCAGGTTCAT
GATTTATTGAAGGATATGAAAGGTAATGGTATTTCACCAGATAAAATCAC
ATATGACTTTCTTGTCTATGGGTTTAACAAGTGTGGAGATACCGATCGCT
CAGTCAATATGCTTGATGCTTGCATTGCGCAAGGATTAACACCAAGCAAC
CGCAGTCTCAGAATAGTATTGAGTCACTATTGCAAGCTAGGGAACCTTGA
TAAATCACTAGAATTATTTCATCTGATTGAGGACAGGGGATGGAAGCATG
GTTTAGTGATTGAGATGACTCTCATTTCAGCTCTTCTTTCGTTTGGAAGA
TACTCTGAAGCAAAATCATATCTGAACAACCTGAGCAGAAGTGCACTAAT
TATATCTGACATCACTTTTGATGCCCTAATCAACGAATTCTGTGGACAGG
GAGACTTGGAAATGTCTGTTAATCTGATAAATACAATGTTAAAGAATGGC
AGACTTCCAAGTGAAGCTAGTTACAGCTCTGTTATATACAGGCTATGTGT
ATTGAGAGAATTTGATCAGGCTCTTGATTTCCTTGCCGAGATGCAGTTGG
AAAATCTAAAACCAAGTGAGATCTCATGTGATGTGCTCATGCGTGGCCTG
TGTGCCATGGGAAGAACCAGTGATGCTAAGAACATCTTGGAAATACTAAT
GACTTTTGGTTCCGCACCATCCTTTGGCATGTATAGAACTGTTTTTGACA
ACTACTCTAGGTGTAACAATACACTGGAAGCCGCAAAACTTCTGCATGAC
ATGCAGCAAGCAGGACACACGCCCAAGTTTGAGATGCAATGGTCTGTGAT
AAGCAATTTAAGCAGCACTGGTAGGAAGACTGAAGGATATGACCGACCTA
TTTTGTCGAACCTTATTTCTTCCAGTGAGTTCCCCATGAAGAACAATAGG
AGGAAATGATTTTTTGTGCAATATATAGTCAATGTTGATGGCAGCCATTC
TATGAAGAACCGCAACGCGACGGTGGCACTGCTCCTGTGACAAGACAGTG
CCTACCAGCTCGTGCTGCTCCTGCGGCCTGGCATGGCCGCTGCTTCTTGC
AGTGGTAACCACTGGCCCCCACGCTTCCATCTCTTGCAGAAAATTTCTAC
TCTATTGATGAGATGTGTACTATCACCTTGTTGGCTTCCTAAATGATAAA
TGATTAGATTATCCAAGTCTTACAGTTCCACTTGTGCAGTAAAGCTACAG
GGACGGCCTTCTGCACCTCTGTACAAGTGGAACAGCGACAATAAATAGAC
ATTGAGTCTGCACCAAATGTCACAAATCTCTTTCTGTTCATCACAGTTGA
CCATAAGGAATTGAGTCCTGGATGCACCCTGACCAGGTGACATTACCTTT
GAGGACATTACACAGAAAGGTAATACTTGTTTATGTTTACGTACAACATT
CTTTTGGCTCTATTGATTCATGCAGCACGTTATTGAAAGAATATGCATCC
TTGTGTTCTTTTAACTTGCAGTGTAGGGTCTGACAAGCTCTGCATTAGAG
GGAAAGACCTTTATCTTCATCCATATGAAGATGTTTGTCAAAATCTTGCT
GTGATTTGACATTTCTCATGACAGCATTCATTTTCTTCTGCCACCACTTC
TGCTTATATGGAGGTGCGCATCCTAACACCACCACATTAGCATCCCATTG
CTTTTTTCTTGTGTTGTTGATCACACATTGTCAATGTGTTCTTGTTTGAG
TGAAGTTAAAGATTTATTTGTCTAAATGTTTTGCAGTAGTTCTGGATATG
GATATACAAATTATGCTAGTTTCTTTATTGATAATATGGCTAACCAAGCA
ACAATTTATGTTAAACAAATCTGCCTCATGAAATAATCTCCCTCTTTCTA
AAATAGTGTGGTCCTGTAGCTTATTCATTATTAAGCTAGAAATGATCGAC
ACTGAGTAACTTAACCAAAATGAATACTCATGTAAGTGTGTTATCAATCA
GAAAACAAATGAAATTGGTGTCTCCCTTGGAATTTAAATAACAAAATCGA
ACATGGGATCTTTCAGACACTCGGCAATCTAGAAACATCTAGCTAGTGGG
TGTTGATCTGCACACCTTGAAATAATGTCCTTTGTCCTCGACGAACTGCT
CTGGATTACTTGACATCAAAAGCACCTTGTCGTTTTACTTTACAGGGTAG
TCTTTCATGAAATCATTGTAGTTTAACCATCTCAAAGCAAGTAAAAGTTC
CACTGTTTTATCTTGCAATTTCTTCTAAGATAAGAACAAAAAAACTCACA
TGCTAATCAATTACTGAGTGGTAAATTACATTGATTGATTGCCTTCTCTG
GTACAGCTTCGGTGATCTGCTGACTGGTTGAAGGCTTGAAGCAACCCTTT
CTTGGAGGAAGTGTTTTCCTTTGATCACATTCTGGTTCCACGCACGTGGC
CTGGAGCCTGCAAGATCCGGTGGTTGTAATTTCGTCCAAGCAGAATCAGA
TTCTTTTGAAGTCATTCAAATGTGTCCCAGCGAAGATCGTGTGTGGACAG
GAGCGATGACAGGAAAGGTTGTTTTGCTACAGCAGCGATGACAGGAAAGG
TTGTTTTCAACCATATTGTCCACGAGAGGGAAATGAAGCAGCACGTGGAA
TAGCTAGGTTAGTTTTTGTTTTGATTCGAATGATGCAAGTACTTTTGTTT
TGATTCGAATGATGCAAGTACCTTTTTTTTGCAAACTATTTGAGTTTAAT
AAAGCTAGCCATAATTTTTTTTCCTTAAAAAATATTGGTTCCGGTAGTGT
TTGGTTTCTCATGATCGTGTCCTGGACGTGTAAAATTCTAGCTGCAGAGC
TTGTAAGACCCTATCTGTCAGAGTAATAATAAATTTAGGAGCCGTGAGCT
CCTTTCCTCGGAAAAATAGAAGCCCCCAAATCCGATCTGCGCTCCGAGCA
ACTATCATGGAGCCGATGGAGGGTTCCTTCCAGCGCCTCACCGTTGATGC
CGAAGCAACCAGCGCCGCCACCCCAACCGCAACTACCGTTGATACCGCCG
CAACTACCGCCCCCGCCAACCCCACCCCCAACCCCACCGTCGATACCGCC
GCCCCCCTCTATCCCGGCTGGGTTCTCCTCGATGAGGAGGCCTACTACGA
CGACTGCGAGAACGCCACCACCGCTGAAGCCAGGCTGACCAGCGGCCACA
CCGTCAAAGTGACCTTCTTCCTCGCGGACCCGCCGGCCGTGTCCAACTTT
TGCGTCCACTGCCCTGAACTCGAGCACGCGGACTTTCGCCTCGTGTCACG
CGTCGTTTTCTCGGAGAAACATCTCCTCCTCCTCCACTTCAAATTCACCT
ACCGCCCCTTTAGCGCCGCCGCCGACCGCGAGCCTCCTCCCCCACGTCTT
GCCGCTCGAGGACGGCTACGGGAACTTCCTTGTGGCTGATCTCGCCATCA
CGCCGACCCGCGGGCACTACGACCTCCACATCTTCTCGTCCAAGACGAAC
AAGTGGACCGCCAGGTCCTTGCAGCTGCAGGCGTCTCCTGCCGTGTCAGA
CGACCTGCCCAGCCTATCCGACAAGGTGATCGCGCTCGGAGCAGGCACCA
TAGGCTGGATCGACCTCTGGCGTGGCATCGTCGTCTGCAACGTGTTTGAG
CCGGATCCCGTTCTCCGTTTCATCCCGCTCCCAAAGCCTGAATTCAACCT
GCGCCGGAGAGACAGCCCGCGGCCAGTCCGTGATGTCACCTGCTGCTGCT
GCAACGGTTTTATAAAGTTCGTTGAGATGGAGCACTATCCCAGGCAGGCT
CGATAGCCGTATCAAGAGGAATTTCAAGACGACCAGGGATCTCGACGACA
CCGCATGCAGTGTCCTCTACGATTCGGAGCTCTTCCTCCACAGCTTCGAG
GATCTAACAAAGGGACCCAGTTCTCCCCCTGATGCCTGGAAGATCCGGAC
AATGTTTAGGCATACGTCCTGGAACCTTTGGTGCAAGGGCCACGCTACTC
TCCATGTCGACGACATCTTGGTCAACGACCGGAGCTACTATATGACCCTG
CCTGAGCTCTGGGATTTCAGCGCTGCAAAATTCACGCTGAGGAATCTGAT
AGCATCTTGGCCCACGCTCGGCGTTCATGGTGGGGATCTTGTCTACCTTG
TTTTGAAGGTAGGGGTTCGTGATTATGAGGCGTGGGTGGTTGGTGTTGAC
CTTCGAAAGAAGACGGTGGAGATGCTCAAACCATGTAATGCTGGGAGACC
GTTCCTTGCCTCTACGTTCTCCGGATATCTGAATACAACTCCAAGGTAGT
ACCTGCAAAATGACATTAATCTGTCAAGTGAACCATATGTATGTACGTTT
TTCGCCAATTATTATTTTACCTAATGGCATTTCACATCGATCCTTGCTTT
CTCATTGTTTCCTTAAGGTCATGTGTGCCAGAAGATGGCTACCGTTATCT
TAGCCCGGGGAATATTATTCAAAACAACGTGGTATGCGGTAGTCATCATC
TTTATGTGACAATTTTGTCATCTGTATTCTAAATCATTTAATTAATTTAA
CTATGTCTTTATGGCGATCCCAGCAGAACATGCAGATCGCGGGTGGCTTC
TCTAGGAGTTCCACTGAACATGGCAATGACGGGCACCCAGTCAACAACTA
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TGCAACACAATTTCACTCCATCAGGACCCGGTAAGAACATTTTCCACGCT
TGTGAAATGGTGCTGTCCGTTTCTTTGTCCCTTTCTATTTTACTAAAGAT
ATTTAACCCTATAATATGTGAGGTTATTAAACATTGGTCTTTGATAGTTT
GATGTCATCATTTTAAAAACTTTGGAGAAGCTTCTCCCACCGCAGGCATG
CTTTACATAGATTACGGCTGCCAATATTACCCATTAAGATACTAAGCTGG
TCACAATTTCATGTACATATAATGTTTCACAATCTTGTTGTTGAGGCCTG
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TTATCAAAAGGAATAGAACTGAAGCAATTATATGCGTTAGAAACTGCATC
CTGCTTTTGGCATGCCCAATAAATAAGAGAAACTGACCTACGAACCAAAA
AGAACATTGGGTGAATTAGGGAAATTATTGAACTTATTAAAAATATAGCT
GACCAAAAGTTAGTTTCAGCTCCTCTTGGAAGGGGGAGATATATGTTGAA
GGAGAGAGTAGAAATTGTAGATAAAGTTCTTGGGGGTAAAGCTGAGTTTA
ACCTTCCTAAAAAATGAGGGACTTGAACAGGTCACCAACTGACGATTTAA
AATTTAGATATTCCAAAGCATTACTTCCTTCATGAACAGTGTGTGTATTT
TTTTTTTGTTCTGCTGGATGCAACATACATTCTGGATTAATTAGATTGCT
TTGCTGAAGGATATGTTGGCCAACAATGGCTCTTTATGCCGATGGACAGC
CACTTCCAGCCGTATATACTTCCGGTGCCAGCGTCTCCGGCTGTGCCCTT
CAATACACTGATGCCTCGGGTGCTGATGGATGAGCGCTTCCTGTCACAGA
TGCCTCCGGTGCCAGCTTACCCGGCTGTGCCCTTCAACAGACTGATGCCT
TGGGTGCCGATGGATGCCCGCTTCGTGTCACAGATGCCTCCGGTGCCAGC
TTATCCAGGTATTCATCATAGTTGACCATAAGACTTGAGTCCTGGATGCA
TCCTAGCCAATTGACATCAAATTTTTGGACATTACACAAAAAGGTACATA
TGCTTTTATGTTTGCTTACAATTTATTTTTGCATTGATTCATGGAGCAAG
TAAAATAATATGCATGCCTGTCCTCTTTTACCTTGCAGGGGTAGGGTCTT
ACAAGCTCTGCGGCCATGTGAAGCCGTTTTTCAAAATCTTGTGATTTAAG
GTGGGCTGGTGGAGGTGCTCTGATAACCTGTACATTCAGATTTTGCATTT
GAACTGGCTTGTACTCCCTCCGTTTCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.