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GrainGenes Sequence Report: AA007993

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Sequence
AA007993
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA007993
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATTTCTGATTTCAAAATGCAGTTCTGCTTCATCGAGGCAATGCTTCGAGT
TTGACACCAGGACCGGAGTCGCAAGGCTTCTTGAAGGAGCATCTCGGATA
TTTCTCAACGATTAGATCACGCTTCAAGGGTAAAATTCATTCACGTCTCT
TGTAATTAATGTGGGTAGGTTTATTTCTGGTTAGATAACCAAGTCAGTCA
TGTTAACCTAGGCGTCTCCCATTCGTAAGGGTTACACAAATAAATATGCA
TTAAATTGCATATTTATAGCCGTAACTCTTTTGGATTGTCCACGTTTTTG
GACAACCCGAGGATGTGTAGATTGGTTATGTTTTCCATGCTTTGCTCTGC
TTCGAGACCGGATTTCGGTGGCGCCTCCCAGTTGTTCTCCGGATGCACAT
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GCATTATATGCTTGTTTTGGTACTTCTTAGAGGATGGAGAATCGTCGTGC
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ATAAATATAGTTATTATTATATCTTTGTGTTTATGATAAATGTTTACATT
CATGCTATAATAGTATTAACAAGGAAACATTAATACTTGTGTGATTTGTA
AACTAAATTAGAGTCCCTAGTAAAGACTCTTTATAATACTAGCTTGTTGG
TTAATAAATGATTGTGGTTTCCCTATCATGAACATTGAGATGTTATTAAC
AACAAGATCATATCGTTAGGAGAATGGTATGATGGACATACTCATATAGA
TAAGCGTAGCATAAAGATCCAGTCATTTTAATAGTTCAATTGCTATATGA
TTTCTGATACATAATAACCTAATTCCTTCGACCATGAGATCATGCATATC
ACCATCATCGGAAGGATGCTTTGATGACATCAAACACCACACCGTAACTG
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GGGCCCTCTCGGTGGAATGTCATCCAATTGGCTTGCAAGCATCTGACTGG
CTCACAAGGGATCACATATCACGGGAACGAGAAAAGAGTACTTATCAGTA
ACGAGGTTGAACTACGTATGCAGAGATACCGACGATCAAAACCTCGGATA
AGTAAACTATCGTGAGACAAAGGGAAATTGGTATCATATGTAAGTGGTTC
ATTCGATCGCAAAGTAATCATAGAAATATGTGGGAGCCATATGAATTTCC
AGATTCCTCTATTGGTTATTGTTCGGAGAAGTGTCTCGATCATGTCCGCA
TAATTCACGAACCGTAGGGAGACACACTTAAGGATTCGACGTTGTTGAGT
AGCTATGGAATGATAAGAGACTGAATGTTGTTCGGAGTCTCGGATGGGAT
CCGGGATATCACGAGGAGATCCGGAATGGTCCGGAGAATAAGATTCATAT
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ACGCCAATTTGAAAAGTCAAACGGCTATTTTGTTTGGTGGAGGGAGAGTA
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ATAAGGAGGGGCAAGGCTCCCCCTCCAAGACACACACCTTACCCCTCTAA
ACCCTAACCCTAACCGCCGCCCACCATAGCCGCCGCCTCCCTAGGATTTT
TCCCAAGCCGCCGAGTTGGGGCTTCTAGTTGTCCTAGCCACCGGCCTAGC
TCCTTCTACTTGGTGTGTCTAAACCCTAGATCACCGAGGCTCTCTCATAG
TCCACCACACTCGCTCCGGCTTAAAGCGAAGCCCTGCGAGATCTCCCCTC
TACTTCCGGTACCACGCCGTCGTGCTGCCGGAATCACGAGGAGAGTGCTA
CAACCTCCGCTCCCTGCTGGAACAAGGGAGAGGAAGGTCTTCGTCGGGTA
CCGAATGTGTGACCGACTGCAGAAGCGCTGCCGGAACGCAGCGCCAGAAG
GATCGTCTACACGATCTTGAGATCGGGAAGAGTACGACTACATCACCCAC
GAGAATCCGCTCTCGTTAAACACTTTGGAATCTTCGAGGGTGAGTTATTC
TATCGACTCGTTGCTACAATATAGTTGATAGATCTTGGCTTGTTTGTTTG
TATGTGGTAGAATTTTTTTGTTTTCCATGCTACGAACCCCTACAGTGGTA
TCAGAGCTGTATCTATATGTAGATCTGTTGCACGAGTAGAACACAATGGT
CATTGTGGGCGGTGGTGCTTTTATTATCAATTGCTTCTTGTGTACTTTGC
ATCTTGCGGTATGATGGGATGAAGAGGCCCGAGCTAACCTTACATGACAT
CGTTCATGAGACTTGCTCCACGCTCAACATGCAACTTGTATTGCATAAGT
GGCTATGTGGGTGTCTGTCTCTCCCATTATAGTATAGATCCAATTTACAA
CGGGCACTTGATAGTTCAAACATCAACGTTGTGGTTCTTGTTCGTAAGTT
AGATCGACACTTATTGAAAGCCCCAAACCACGTAAAATATGCAAAGAAAT
TAGAGGCGTCTAACTTTGTTTTGCAGGGGTGTGCTATGATGTGATATGGC
CATGATTGTGATTATATGTGATGTATGCAATGTTTCTTATTGTAAGTTGG
CAACCGGCAGGAGCCATATGGTTGTCTTTAATTTATGTTAAGACCCGCGT
GTCTATTCAAAGTAGTTGTAATAGTTGAAGCTGGTGGACGACAACCATGG
AGCAGCGTCATTGACCTTGATGCAATGCCGGTGATGATGGAGATCATGTT
CGTGCTTGAAGATGGAGATTGGAAGCACAAAGAAGAAAGGCCATATCATA
TCACATATTATGAATTACATGTGATGTTAATCCTTTATGCATCTTGTATT
GCTTAGTTAACGACGGTAGCATTATAAGATGATCCCTCAAGCACTCAAAT
TTCAAGTTCTAAAGTGTTCATCCTTAGTAAGCACCGTTGCTAAAGCTCGT
TGTTTCGAAGCACCACGTGATGATCGGGTGTGTTAGATTCCGCGAGTGTA
TACAACGTGAGCAAGCCAGATTTGCTCATGCGGAAGCTAGGGTTTGATCT
TGACGAGCCTAGCATGTACAGACATGGTCTCGGAACACGGATCACCGAAA
GGTAAAGCATGAATCATATAGTAGATATGATGAACATGTCGATTGTTCGC
CATTGAAGCAACATCAACTCTCGTGATGATCGGTTTTGATGTGGTGGATT
TGGTTCGTGTGATCACTAAAACAATGTGAGGGATATTGTTTTGAGTGGGA
GTTCACCTAGATTAATTTAACTATTAATTAGAACTCAATTTTTCATAAAC
TTAGTCTAAACTATTGCAATTATATTGTAGATCAATGGCGGCCCCTACCA
TCAATTTTAATGCGTTCCTAGGGAAAGAAAAGTTGAAAAACAATGGAAGA
AACTTCGCGGATTGGTTCCGCAATTTGAGGATTATCCTCAATGCTGGTAA
TTTGACCTATGTGCTGGATGCACCGCTGGGTGACCCGCCTGCAGCTGATG
CTACCGATGAAGTAAAGAACGTTTACCTCGCTCGGAAGAATTAGTACTCC
ACAGTTCAGTGTGCTATCTTGTATGGTTTGGAATCAGAGCTTCAGAAAAG
GTTTGAGAATTCAGACCCACATGATATTGTCCGTGAACTCAAATTGATTT
TTGAGACTCACGCGGCAGTTGAGAGCTATGAGGCTTCTGAAAAGTTCTTT
AACTGCAAGATGGAAGAGGGCAGCTCCGTCAGTGAGCATGTGCTTAAGAT
GTCTGGGCACGCAAACAAACTCCAAAGCTTGGGTATAGTGATTCCTAATG
CTTTGGGGATTTACCGTGTCCTCCAATCACTACCACCAAGTTACAAGAAC
TTTGTGATGAACTACAATATGCAAAGCATGAACAAGCAGTTGCTAGAACT
CTTCTCCATGTTAAAATCTGCAGAAGTGGAGATCAAGAAAGAGCACCAAG
TGTTGATGGTCAATAAGACCACCATATTCAAGAAAGGCAAGTATAAGCAA
AAGGGACACTTCAAGAAGGGTGGTAAGAAAGTTACCGCACCAACGAAGAA
GACCAAGACTGGACCCAAGCCTGATACAGAGTGCTTTTAATGCAAGGGAG
AAGGTCACTGGAAGCGGAATTGCCCAAAGTACTTGGCGGATTTGAAGAAC
GGCAACATCAAGAAGAAAGGTATATCCGATATACATGTTATTGACGTGTA
TCTCACTAGTACTCGTAGTAGTGCCTAGGTATTTGATACGGGTTCGGTTG
CTCATATTTGTAACTCGAAACAGGTGCTGCAGAATAAACGGAAGCTAGCA
AAGAACAAGGTGACGATGCGCGTTGGAAACGGATCAAAGGTTGATGTGAT
CGCGGTCGGCACGCTACGTCTTCATCTACCATTGGGATTAGTTTTATACT
TAAATAATTGTTATTTGGTGCCTACGTTGAGCATGAACATTATATTGGGA
TCTTGTTTATTGCGAGACGGTTACTTGTTTAAGTCCGAGAATAATGGTTG
TTCGATTTATATGAGTAATATGTTTTATGCACATGCACCTTTGATAGATG
GTCTATTCTTATTGAATCTCGATAGTGGAAATACACATATTAATAACATT
GAAGCTAAACGTTTGAAATCGAGCGATAACTCGACCTATATGTGGCACTG
TCGTCTTGGTCACATTGGAGTGAAGCGTATGAAGAAACTCCATTCCGATG
GACTTCTTGAATCACTTGATTTCGAATCACTTGAAAGATGCGAAGCATGT
CTAATGGGTAAAATGACTAAGACTCCATTTTCTGGTATGATGGAGCGAGC
TACGGACTTATTGGAAATCATACATACCGATGTGTGTGGTCCAATGAGTG
TAGCATCGCGTGGTGGTTATCGTTATGTTCTTACCTTCACGGATGACTTG
AGTAGATATGGGTATATCTATTTCATGAAACATAAGTCCGAAACTTTCGA
GAAGTTTAAGGAATTTCAAAGTGAGGTTGAGAATCAACGTAACAAGAAGA
TTAAATTTCTGCGTTCTGATCGTGGAGGTGAATATCTAAGTTACGAGTTT
GGCGAGCATTTGAAGAAATGCGGAATACTTTCACAATTGACACCGCCGGG
AACACCACAGTGTAATGGTGTGTCCGAACGTCGTAATTGAACTCTCTTAG
ATATGGTTCATTCTATGATGTCACTTACAGATTTACCGCTATCATTTTGG
GGTTATGCATTAGAAACAGCCGCATTCACTTTAAATAGGGCACCATCTAA
ATCCGTTGAAACGACACCGTATGAATTATGGTTTGGGAAGAAACCTAAAT
TGTCGTTCCTTAAAGTTTTGGGTTGCGAAGCCTATGTAAAGAAGTTACAG
CCGGACAAGCTTGAACCCAAAGCGGAAAAATGCGTCTTCATAGGATACCC
AAAGGAAACTATTGGGTATACCTTCTATCATAGATCCGAGGGCAAAATCT
TTGTTGCCATGAATGGATCCTTTCTAGAGAAGGAATTTCTCTCGAAAGAA
GTGACTGGAAGGAAGGTAGAACTTGACGAGGTTGTCGAACCTTCTCTCGA
AATTGCGAGTAGCGCAGCACCGGAAGAAGTTCCTGTGGTGCCTGCACCAA
TAAGAGAGGAAGCTAATGATGATGGTCATGAAACTTCGGTTGTAGTTGCT
ACAGAGCCTCGCAGGTCAACGAGAAATCGTACCACTCCTGATTGGTATGA
TCCCGTTATGAGTGTCATGTTGGTGGATAACACCGATGACCCTGCGACAT
ATGAGGAAGCGACGATGAGCCCAGATTCCAATAAATGGCAAGAAGCCATG
AAATCCGAGATTGGATCCATGTATGAAAACCAAGTATGGACTTTGGTGGA
CTTACCGGATGGCCAGAAGGCTGTCGAGAACAAATGGATTTTCAAGAAGA
AAACAAATGCTGATGGTAATGTTACTGTCTATAAAGCTCGACTTGTCGCA
AAAGGGTTTCGACAAATTCAAGGAGTTGACTACGATGAGACTTTCTCACC
AGTAGCGAAGCTAAAGTCTGTGAGGATTATGCTAGCAATCGCTGCATATT
ACGATTATGAGATATGGCAGATGGATGTCAAAACAGCGTTCCTCAATGGA
GACATTGATGAAGAGTTGTATATGATGCAACCCAAAGGTTTTGTCGATCC
TAAAGATGCTAACAAGGTATGCAAACTTCAACATTCCATATATGGATTGA
AGCAAGCATCCCGAAGTTGGAATCAACGTTTTGATAAGGTGATCAAAAGT
TTTGGTTTTATACAAACTTATGGAGAAGCTTGTATTTACAAGAAAGTGAG
TGGGAGCTCTGTAGCATTCTTAATACTATATGTAGATGACATATTGTTGA
TTGGGAATGATGTAGACCTTCTTAATAGTGTCAAGGAATATTTGAATAAT
AGTTTTTCAATGAAAGATCTTGGCGAAGCAGCTTACATATTAGGCATAAA
TATTTATAGAGATAGATCGAGACGCCTAATATCATTGTCACAAAGTACAT
ATTTGGACAAAGTTCTAAAGAGGTTTGGAATGGAAGATAGCAAGAAAGGG
TTCTTGCCCATGTTTCGCAATACGACCTTGAGTAAAACTCAAAGTCTGAC
AACGGCAGAAGATAGAGAAAGGATAAGTAAAACTCCCTATGCCTCAGCCA
TAAGACCTCTAATGTATGCCATGCTATGTACTAGACCCGACATTGTATAT
GCTGTTAGTTTGACTAGCAGATATCAAAGTGATCCAGGAGTGGATCATTG
GATAGCGGTAAAAAACATCCTGAAGTACTTGAGAAGAACTAAGGATATGG
TTCTTTCTTATGGAGGTGATGAACAGCTCGTTGTTAATGGTTACACCGAT
GCTAGTTGGAACACCGATCCAGATGATTCTAAATCACAATCTGGATACGT
ATTTACTTTGAATGGGGCAGCAATTAGCTGGAGGAGTGCAAAGCAAAGCG
TTGTGGCGAGATCTTCAACTGAATCGGAATACATGGCTTCTTCGGAGGCT
TCACAAGAAGCGATATGGATGAAAGAGTTCATTACAGAGCTCGGTGTGGT
TCCAAGTGCGCTGGACCCAATGTCTATCTATTGTGATAACATGGGTGCCA
TAGGCAATGCGCAAGAACCAAGGTCACACAAGAAGCTGAGGCATATCAAG
CTACGTTTTCACGCTATTCGAGAACTGTCCAAGATGGTGACATAAAAATT
TGCAAAGTACACACAAATCTGAATGTGGCGGATCCGTTAACTAAACCTCT
CCCGAGGGCAAAACATGACCAACACCAAACTGCCATGGGTGTTCGGTATA
TTACCATGTAATCTAGATTAGTTGACTCTAGTGCAAGTGGGAGACTGTTG
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ATTAATACTTGTGTGATTTGTAACCTAAATTAGAGTCCCTAGTAAAGCCT
CTTTATAATACTAGCTTGTTGGTTAATAAATGATTGTGGTTTCCCTATCA
TGAACATTGAGATGTTATTAACAACAAGATCATATCGTTAGGAGAATGGT
ATGATGGACATACTCCTATAGATAAGCGTAGCATAAAGATCCAGTCATTT
TAATAGTTCAATTGCTATATGCTTTCTGATACATAGTAACCTAATTCCTT
CGACCATGAGATCATGCATATCACCATCATCGGAAGGATGCTTTGATGAC
ATCAAACACCACACCGTAACTGGGTGGCTATAAAGGTGGCATTGAGTGTT
CGGAAAGTATTGGTTGAGACACATGGATCAAGAGTGGGATTTGTCCATCC
ATATGACGGATAGATATACTCTGGGCCCTCTCGGTGGAATGTCATCCAAT
TGGCTTGCAAGCATCTGACTGGCTCACAAGGGATCACATATCACGGGAAC
GAGAAAAGAGTACTTATCAGTAACGAGGTTGAACTACGTATGCAGAGATA
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TGGTATCATATGTAAGTGGTTCATTCGATCGCAAAGTAATCATAGAAATA
TGTGGGAGCCATATGAATTTCCAGATTCCTCTATTGGTTATTGTTCGGAG
AAGTGTCTCGATCATGTCCGCATAATTCACGAACCGTAGGGAGACACACT
TAAGGATTCGACGTTGTTGAGTAGTTATGGAATGATGAGTAAGAGACCGA
ATGTTGTTCGGAGTCTCGGATGGGATCTGGGATATCACGAGGAGATCCGG
AATGGTCCGGAGAATAAGATTCATATAAGGAAAGTCCTGTTTCGGGGTTG
GAGAATGGTTCCGGTGTTTTCATCAGGAATGTTCTAGAAGGTTCCGGAAT
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AATGGTTGCATCATGTACTAGGTGTCATCGCTGAACAAAATAAAGGGTTA
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CCTCTCCCTCCACCGCCGGCCTTGGAAGCCGAGTTGGGGAGGGACTCCCC
TTACCTTGGCGCGCCCCTCCACCTATATAAGGAGGGGCAAGGCTGCCCCT
CCAAGACACACACCTTACCCCTCTAAACCCTAACCCTAGGCGCCGCCCAC
CATAGCCGCCGTCTCCCTAGGGTTTCTCCCAAGCCGCCGAGTTGGGGCTT
CTAGTTGTCCTAGCCACCGGCCTAGCTCCCTCTACTTGGTGTGTCTAAAC
CCTAGATCACCGAGGCTCTCTCATAGTCCACCATACTCGCTCCGGCTTAA
AGCGAAGCCCTGCGAGATCTCCCCTCTACTTCCGGTACCACGCCGTCGTG
CTGCCGGAATCACGAGGAGAGTGCTACAACCTCCGCTGCCTGCTGGAACA
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GGGAAGAGTACGACTACATCACCCACGAGAATCCGCTCTCGTTAAACACT
TTGGAATCTTCGAGGGTGAGTTATTCTATCGACTCGTTGCTACAATCTAG
TAGATAGATCTTGGCTTGTTTGTTTGTATGCGGTAGAAATTTTTTGTTTT
CCATGCTACGAACCCCTACAGTTCTTCCTCCTTTGCCTTCGATGAACTTC
CAATTCGTAAGTCGTGTTGCATCTATTCAATAGTCCATCTTATTGTCACA
TGTTTACCGTCTCATAACGGTTTACCATGTTTTATAGGGAATGCCTTCGG
CCGGATCCAATAACAAGCCGACCCCTCCGGAGGATGAAAGCCCTGTGACG
CCTGCCACTACGAGTGTGCCCATGCCGACTCTGGACAATCCGAACATTAG
GAGACAACTTTGTGAGTTTCCACACTCTTCGTGAATTTCTTGTTTGTATA
CATCTTGTATCAAATTATACCAAGTCCTTACCATATAGCTACATAGATAC
CAAATTTTATGGTTGTTCCAAATATACCCTTGTTAGAATAAAATGTCAAT
ATTCTTCGGAGAATCATCTTACCATATACATACCAAGTCCATATAGCTAC
ATAGATAACAAATTTGAATTTGCTTGTGCAAAACTATACCTTGTTAGAAT
CATGTCAATATTCTTATCATATGCTACATAGATAATAAATTACAATTATG
CTAGTGCCAAATTTACCTTATTAGTATCATGTAAATATGTTTGTTAGAAT
CATCTTACCATATAGCTATATATATATACCTATTTTGAACTTTGTAAGAT
TGCATCATTTTTACTCATGCTTGTGTGTTTTGCACTTTGTAGGATTACAT
CAAGGAAGCCTATGTTATGGTGGAACATGGTCGCCGTTGATGGAGATATG
TACCACATGCTAGAGGACTTGTGTGCCACTTGGTTGTGTTGATGGATATG
TGAACTTGAATTCAAGTGTTTGTTGAACTTGTGAACTTTGTATGCATGTT
TGATGTACTAGTGCACTTGTGAACCTATTATGTGAGTTTTTGCTGTGATA
TATGTCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.