Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040354

Sequence
AA040354
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040354
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATCGACGGTACCTTGCCGTCGATCGGCGCGGCCGACTGTGTTGCGGCGCC
GTCGGTTTGCCTCCGACGAACGGGCATCCCTCGCCTCCGGTAACGCCTCA
AGAGTCAAGCCAAGCAGTCCCCTCTTCCACAAGAAACCCTAGCCGCCGAA
CCACGATCTCCTCCCCCTCCGTCCTCACGAATCCACCCAACCTGGCATCG
TCGATCCGATGCCTCCTCGCCGCGAAGGATCCTCCCGCTGGCGCCGTGGT
AAAGAGGGCGAACCCTTCTCTGAATCCCTTGTCGAATCGTATAGCAACAG
CAGCAGCAGCACGAATTCCGGTGATGATTGTGGCGCGTCGTTGCCGAGGT
ACCAGTCACTCCTCGCCTCACGGCTCGCCTATCTGCAGCCACCGCCCAGC
GCCGACGGCGACGACCCGGGTTCAGTCGACCCCCGAGATCTTACTCCCGG
TGAAATCGTCCTAGCCCTTACCCGTCGTCCCTTCCTAGACGACGAGATGC
TGGATGCTCTGGTGGAATATCAAGTCCAGAAGTGCTTGAGCGACGAAACC
CAGGGACGAGATTCCGGAGAATTTCATTCGGCCGATGTTGCCATGGCCTC
GGCAGACCTGGGTGATGATATCCGCGACGAGGACTTCCACAAAGATTGTG
AGAAGCTGTGGTCTCGTAAAACTCCAGTTGATGAACATACTAAACTTGAC
GGACAGCAGCACGACGAGCTCTATCTGAGGCATGCCTATTTTCGCATCAA
AGCATTCCTGGTACCCAATGCTCCTCCTACCTGTCTATCCATGTCCATCA
ATCACCTACATAATTTCACCCTCTTATGCACTTACCTTACCTGCCTATGT
ATCTCTGCAGTTATTGAAAGGAAAGGCAATTGACAAGCTGGACAATGCTG
CTTTGGAACGCAAGTACCCTCCAAATCTTGTTGCAAAGCACTCTTACTTT
CTGGACTACGAGCGTGACGATGCGTTTGGTTGGTATTTCGACTCCGACCT
CTGTAAACTTGCTTCCTTGACCGACTACCAGCGGCTAGTCCTTTTTAATG
GTGTAAGTACTCACCACTTTCAGTTAAGTTATGCATCTAGATTTAACATG
TCTGCTTCAGTTCCCGTCCCCTGCAGTTGTCTTTCCAGTCTCGAGCAGTT
TAGCTGTTTAGTTTGTCTGCGCCCTCATCGAGCGGCTGTTCGTCTCTCAC
TCCTGTGGTTTGTGTTTCCGGTTTGTTCCAGCATACTCTGTACACTGTAC
CAGCTGCTGCTAGTGATCTCGATTTTTTTTAAACAATACATTTTTTTAAT
ATTTTCTAGATCTATTACACGTTTTTAACATTTTATAAAAATAGTACTTT
GTCGGCCTAGAGGAGGCCGATTGGGCCAGTCGACCTGGAGCAAACCGACT
GAGCGTCGGCGCGTGAGACAGCTGGGGTCCGCGTTGGCCAATCGGCCTGG
AGCAGCAGGCCGACTGCCCAATCGTCCTGGGCCAAGCCGACTGCCCCTAC
TCTGCATGCATGTGTTGGCCATGCATGCTTGGGGCAGTCGGCCTGCCCAG
GCCGATTGGCCGACGCAGCCCAGCGGCCCCACGCGTCGACGTCCAGTCGG
CTTGCTCCAGGCCGATTGGCCCAATCGGCCTTCTCCAGACCGACAAAGTA
CTACGTTTGTAAAATCCAAAAAACGTGTAATAGATCTGAAAAATATTAAA
AAAGTGTATTATTTAAAAAAAAATCGCCTAGTGATCCCTATTTGTTGTAC
TCGTTTCAGTCCTTTGGGACTTTATTTAAAAAGCCGGGTTGTATGCCTTT
TATTAAAAAAATGTACTCCCTCCGTCCCAAAATAGGTGTCGTAGATTTGT
TAAAATTTGGATGAACCTATATACTAAATAGTGTCTAGATTTATCCAAAT
TTTGACAAATCTAAGACATCTATTTTAGGACGGAGGGAGTACTCACTCAT
CTCGTAACCTGTTTCCTCTTCTTTTTCCCATTTGAGTGGATGATGGGCAA
ATATTTTCTTAATCTGTCTTTGAAAACCTTGACTTCTTTTAGCATGTCCT
TATGTGAGTAACTTTGAGTTCTACATGGTAAGGAAAATATAATAAACTTA
TGAACATTACAGCTTGTGGAGATTAAGCACATTTAGAATGTGTGTTTTCA
AAGAATTTTTTATAATTTGTGTGATGCACAAGAGAACAAAAAATAATGAT
ATACCTTTTTAACCATACTTCTGGGTGTACAACTTTTCAATGAGAAAACA
ATTTAATATACAGAGGCAGTTTTTGAAAGAGCAACACCTATAAACCCCAA
GAGGTCCACAAGCAGACTGCTCCAGAAATAGAGTACTATCCATTTTTGTA
GATTGCATGTACAAACTGATTTGCCTGATTTTTTGAGATTACCTATAGTC
TGACATAATCTAGTACTATGTGTTTTCTTTTTGGAATGTCTTGAAGTGCA
GAAGTACTCAAATCAATAAATTGCTTCTTGCATATAATCCTAAGAGATAA
AAAAAAATCCACGTACATGATTTGTTATTTGCAGGAGAGGTATAATATGG
TGTTTCCTTTCTTTTTCGTGCAGTGTGGCGATGAGTACGACAATTGGAGC
CGTTACCGGTTGTTTTATAATACCCCTGAAACTGATAGGAATTATCTACT
GTACTGGAAAGCACTTACAGAGCAAATTAAAGTATGCATGTTACCGCAAC
AGCTAATCCAATTTTAAAACTTTGTTTAATATTTCTCTTAGTTTTGGACT
GACAGCCTTTTGTTCTTCACAGTGGATTGAAGCTTACATTCATAGAGGAA
AGATTTCTGATGAGGTAAGTATATATTGACCCCACGAATGAATTCTTGCT
CTGTTATTTCGGTTGACTCCACAAAACGATGGAATGGCAACAAATCTGTA
CAAACACGGCAGCCTCACAGTAACTTTTCTGTTTTACTATTTAGTGGGAG
AACATGTGGATGAAAGCCAAGTACCAAGCAATTAGGATCGCAACTGACTT
TGACAATATTCATCTAGATCTAGCTTCTCTTGGTTTCCTGGTATGATTCC
TCTGTCCCTTGCTAATTTAGATGGTCAGCTTTGGTTATGGCTGTATTTAA
CAAGTGTATTCATTTGATTTAATTTAGGAGTTTATATGGAGCACACGTAT
TAATGTCTTGTTACAGAAGGATCTTGATGGTGTCTTTTTTGAGATTTGGA
AGCTGGTCATCAGGGATCAGGTTAGCATTATTGTACATCCGTCTTTATTC
AGACCTGAGAACAAATGGTTCCATACACTCCTGAGAGCCATACTCCTACT
CGTCATATACCACATAGATGAATCAATCATACCTCTTTATAATTTTCAGT
ATATATGTATGTATATATAGGCTTAGCGAATGTTGTTATCTCCCTTGTGG
AATGTGCAGGTGTGTTTCAAAGAGGCTCTGAAACAAGTTTATGACCTGAG
GAAGTTTCCTTCACAAGAACTATTTATGAAGGCCGAGCTGGATGGCAAGT
TCAGTATGGCGAAGCAAGTGGGTTACTGTTGTGCACATGCGATCATTATT
AATTGATATATATCTCTGTTATAGTTTTGATCTTTCCATCTTTTGTAGTT
TCGCCGGTGCACAGTTGACATTACTGAGGAAGTAAGTACAGTACGGTGTT
GTCTTCATTAATTCCAGTGGTGGAATTCTATACATGCTTTTGAATTTGAT
GGCACAATGATTTCTATTCTAGGTTCCAGAATATAGAGCTCGTGAGTTGA
TTGCGCAGCAGGTTCAAAACAAGGTATGTATGTATGCCTGACGATGTAGA
TGGATCGGCACAGTTTGATTGTTAGTTTTTTCATGTACTTATACTATACT
GTTTTATTTTTAGTTGGTGCTGAGGCACGGTTATGAGCACTACGCAGAGA
AGAAGCTAAAGGTCGCGGAGTACATTGGACTGATTCGCAAGACATCAACA
TAGTTTCTTTTGTGGCTGCATGCCTTTCGTAGTGTGTGGTTCTTGTTCTA
ATTTTATTAAGAGGAGTTTGGACGATGTGACTCTGATTATCTTTGCATTA
GGATTCTACTGAAACAAAACTGCAATATATCCAAAGCAAAACTAGGGTTC
ACAGTGCCAGTGGATGTATGGGGAAATGCTGTGCATTTACCCGATAAGTG
GACTCCTGAAATGTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.