Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA023750

[Submit comment/correction]

Sequence	AA023750
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA023750
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CAGCACGTGAGTGTGGCACGTGAGGGTGACAAATATATATCGAAGAAAAA CGGAAAAGAATAGGGAGTGGGAAGAGAAAGAAAAAACTCCATGGCAGCCG AGGGTTCCAGCGGCAGCAGTGGCGGCGGCGGCGGCCGGAAAACGCCGTCG CCTCATAAGGCGAGAGAGCGTGTAGCGGCGAAATTCCTCGCCGGCTTGCC ATCCCGCGGCAACTTCTCCTCCAGCTCCATCTCTTCCAGCCTGGTATGGA CGCGCCCCCGCTATTCGCTAGATGTCCGATTCTCGTGTTGAGAGGCCTCT GAATCCACCTTTCTGCTGTGACCTGCGCAGGGAGGCCTTAGGGTTTACGT CTGCGAGCACGACACGGATCCTCCAGGTCAGTCAGACCTTGCGATTCTCC ATTTTGATTGGCTGATTAGGTTAAATTTCATTCATTTATGATGGCGAAAG GTATGGGGAAAATTTGATATACAATAGATTCTGTATGTTTGGTTCAGCAA GATATGTGAAATTAGAATTCGTTGGTCTCTTACCTAGTTTCAAGTGAGGC TTTTAGGTTAGGTTTAGTTTAGTATTTTCGGTGCGTGAAACGTGAGAGTG GTGTATACTGCTAATGTCAGAAAGGTGCATTGATAGAGAAGGTTTCTTAT GTATCCACTGTTCTTGGGTTACTGGTCAGCTTATATCAATGCTTTAGTGT AATGTAAGAGCCTAAGAGGTAATAGAAAATAAAGCTAATCCTGATATCTG GCAGAGTTGTAATGCGAATAGTCGGATGTAATTTTGCATCCACTCTAGGC CTTTGGGGGTTGAGAAAAACCCTCTTAAAGGCTGTATGCCTGATATGATG TTAGAGTTATGAACTTATAATATGCTATTGGACACTGGGCATGTATTGAT TACTGTAGTTATATTTTGTGTGTCTGGTGAGCATTTGCTCTAGAGACTGT TGTAGCCTGTAGGTATAACTTCAGATAATAGGACACTGGGAAGTTAGTTA AGGTATTCATTCCCAATGATAATGGTCTAGCATTTCTAGATTTGGAGGTA TTGCTGGGGGCACACATAGTGATTTAAGGCCTGCCTGTGTTATGAGGTAT AGGTACATGTGCATGGTGGCTCCCAAGTTCCATGAATTTGTGGTACTAAA GTAAATTAAATATATAGCATGTATGGTTTTAAAATCAATTGAAGTGTATT ATATCAGTAGTTTTATGAATGATGCACAGACATGGATGCATCAACGCAAC ACAAAAAATATCATTATTTTCCAAAAAAATGTTGATAACGTGATATATGG CATGCTTGGTTTGCTGCCAAAATTTGGATTGCTAATGTTTAGGCAAGCAA AAAAATTGGCTACTAACCGGTTGGCTACCAAATTCTCTAGCCTAACTCTA AAGCATTGTCAATTTTGTGCAAGTTTTGACATTGCCAAAAAAAAATTCTA GCCAAGTTTTGGTTGCAAACCAAGCACACACATATATAATGTGAAAAGAA TGTTCTTGCTCCTTCTCTGTATACATTGTGTGCCCTATCTTGTAAATATG TTTCCTTTCAATGAAGTTTAGTGTGGGGCCTTCCCTATTGTTTTTCTTAT GAAAAATTGTAGTGATACCTATGAAAAGAATGTCCTTGCATCGTTTAGTG TGGGGGCCTTCTCTAGATTTTATCATACTTTTTTCACCTGGCCATGGTGA ACTGGAACACATTTGCCACCTGTTGGCGATATTTTTTTGAGAAAGTGCAA AGCTTGTGTCTAGATGCATGTATAGGAAAGAACACATGGTCATGCATTCG AGGTGGTTAATTAAAATCTAGAGACCATGCTAGAGCTAACGAGGCTTGCA CGGCAATATGGAAGAGCCTGATTATGTCGGAAAGCGAGCAAAGCAGTGCT TCTGCCTTTTTCTTCTCTACCAGTTGTGAATACCCCCATTTACCCTCAAA GATGCAAGTGTTGGAAGTGATCCAGGCGGAGAGCATGATCAGAGAGTCCA CCCCTCCACTCGATGCAAGTGTCAGTGTCACCACAGAAACCATAGACTGC CACCTTTTGATAAGGCATGTGCCCGCCATCAGAACCGTGCTGGTGGACCG TCCCCAAGCTAAGGCCTCGTGCCAAACCTGTCTGGAGAGGGTGGATCGTT TTCTCCCAACTGCTGGTCACAGAGGAGGCAAGGGGTGCGTGGGGAAGGTG GAGCGTTTTCTCAACCAGCTGGTCACAGAGGAGGCAGGGGGGGCGCGGGG AAGGCAGTGACGTGCAAGAGAGTTGGCCGCCCAACATCGATCTTGGCATA GCCAAGTGAAGAAGCGTGTGTGATCGGGAACCCAATCTTCCAGATGAGCC TCAACGAACAGGATCTTGCAGCACACAGGAAGAAGGCTTTGTAGCCAAAA TGCACAGACTAGTTTCCATGCGGTGTCCAGCCCATCTAAGCGCGTCCATG TTGTTACCAAGCTGGAATGACTGCATCACACGCCACAGCCTCATGTATTG GACCCCAACCTATGGCGCTAAGAGCTCTGGTGATGTCCGCGAACCGTGGT CTACCGATCAGATCCTCCTCCATATTGCGCTGCTGGTGGCTCTTCACATA GAGGTCGTGGATAACTGGAGCAATCTCAACAATGTCCTGCCCACTGATCC TCCCAAAACAAGGCTGTCTTCTCATACCTGACAATCATGGATTTTGAGAT GAAGAAGACATCCCTCTCAATCGTTAAAGAATTGCATGGTTTTGATTCTT CTGTATGGAGCTGCCATGTCCGCGACAATATCAATGGCCACCCAGTGCGT GTAAAGCTGCGCACATCCAGTCCTCCTAGCCTGACAGTCGGCATACCATA TGTCCATATCCTAAATTGACGTGGCAATGAGCCCCCGTGCACACTGCTGC AATGAGGCAATAATTTGTTGCTTACTGTCTAGCTGAACTGTTACCTTGTT GATTGGGGACTTGTGACCAGCCTATCTTGAGCTGGTTAGTATATTTCTAA TCTATGATTGATGTGGAGGTTTACATGGTCCTATTTTTGCAGTTTGCTGG TCACACTGATTACCTGCTTATGTTAATTACGCCTTTCCCTCTGTAAATTT GACTAGTTGATATTTGTGCCATTTTAGAGGGACAAGTAATCGAGACAGAT ACCACAAATATCTTAATCAGACATCTCCAGCTGAAGAAAAAAGAGAGTGA GGCCAAAGACACAGGTTCTCGGATTCCGGGGGAGAGCAGCAAGGGAAAAA GGTAAGACTGCTTCGCACGTAAAACATGTTCTCTATGTTGTGTTATTTGG GCATCTCTTTTGTTAGTAAATATCTTCTTCCATTGCATAAAACCATGGAT CCCTGTATGAGATGGATCAGCCTTGTGGCATTTCCTGTTGCATTTAGCAG TTCGTTTGGCCTCTATGGTTAATATGCAGTGAATTTCTTCTCACATTCTC AGGATCAAGCTTATTCAAATCCATGAGCTCTGAATTTCTTGTGCCCAGTT ATTCATGTCTGTTAGTACGCCGAAACCTTTTTCTGCTTGTTTGTGATTCC ATGTTTGATGTTCCTAAGGGAATCTTCAATTCGATCCAGAGATGAGGTCA CAGGTTAATTTAAATTCCAATTTCTCATGAATTGCGAAAACTTTCTAAAT TTATATGAGTTATTCCTTTTTTATTTCCATTGGATTTACATCAATTTTAT TTACTCAATGAGAACATGTGTCGTGTCTTACAAGATTCCTTTGATGATAG GAGGGGTTGAGTATAGGATACCTACCTAGCTTTGGCTTGGGTCACTCTAT GGTGGATTCAGTATAGGCACAATTCAATCATACTTCACTTCTGTCTGCAG TAAAAATATCTAATTTACGATGCAACAGAGCTATTGTTACTCTGAGTACA TTGCTCCTGTGAGTGGATTTTTAGTATTTCTGGATGTATTGTTTCACATA GTTATTCATTTCAGATGCAATGTTCATGAATAGCTTTTCCATTGACAAAG GTCATCAGTATTTATCGATTGCTTAAAATTGACCTGGCTATTGTGAACTT GAAGCCAGGGCTTCAACGATTAGCCACAAAGTTGATAGCCTCACTATGCT CTGTAGTTCAATTGTAGCATGTAGATTTAAACTTGGACACCTGGGTTTGG AAGAACCGTTATTTTTAAAACTTGAAAGTGTAGGTTTAGAAGAATGGTTG AAGTGTATCATTCATGTTGCAGGTTCTTGACTTAAACCCGCCCACCACAG TTGATTTGTCTAGGCTATTGTATTTGTTTCCTAATAAAGCCTTTTTATAT ACTTCCTCCGTTTCAGGGCTTAAGGCGTCCTCGTTTTGCGTGTTTTTTCT TTGACCAAGAATTACTCTAAATACGTAAAGAGTTTTGGTATAAAACTAGT ATCACTGGAAAGTATTTTTCAATACGAATCCAATGGTACTAATTATGTAC AATATAATTAAGATTTTGTTACTCAATTCTTTTGGTCAAACTTTGCTTTG AAAAGCGTGTGCGCCTTAAGGCCTGAAACGGAGGTAGTATAGGTTAGTAT TTTTACCTTTGAGAAGAAGCAATGGGGCAAGTTGGCAGGTGTCTATCACG AATTTCTGTAGCTTTGCAATTAGGAACAGAAATTAATGTTAAGGGTGTAA CTACAGTAGCAATCTGGTATGATCTTGTGCATGAAGTTTGTGCAGTTACG GCAGAATGTGGATATTCTGTTAAAAACCATTTAATGCTCTTGATGCTGCA ACTTTAGTTGCTTCCACACTTTTTGTGTGTCTGATCATCACTAATCTTTG AGTGTTATTAACAACTCGAAGTATACCGAGCTACTTATCAAGATTTTATA AACTTTATATTCCATTCAAAAAGGCTTTTATTTATCTTCGCCCTCTTATC AGTGATTTAACTTCACAAAACTTAAATATCGAAGTAACTGTGTTTCTATT TCTCCAGATCGGCTGCCAGAAGTTTGGATGTGCAAAATTCATCAAAAAAG CCCAACTTGGGTAATTCTTCAGCTGGTAAGTGCCTTAATAATGTTCTTCA CCTCTGAGTCTTCTACTTTATCCATGTGTGGGTAAATGGAATGGATGTTG TGAAGTGCATAAGCTGTGAATCTTAGAGGTAGATAGAGCAAGGGATATCT GTCATACTCCCTCTGTCCAAAATATGACTTGGATCACCGAGACACATTTT AGTGTGTAGATACATACGAATGTAGACAACTCCAACTCAGTTATTTTGGG ACGGAAGGGAGTACAGTGTTCAGCAGAACCAAAAAAAATTTAATTTGATT GAAGTGGGTATAAGTTATTAGTTTCCATCCAACTTCCTACGACAAATTCC ATTCTGACTTATAAGTGAATCAAGTCTATCCAGGGTAGCTTGAGATTTAT TAGTAGTATATTTCTTAACCATGCATGCTTTAGCATTTTAACATGTGAAA TATACGTACTCTTGTCTGTTTTCCAAAATCCAATAGTTTGATGTTTCACC AATCTAATGGATAGTTTAACCTTGCAGAAGAAGCAATATCTGGCTTTTCA CAGCACACACTACAATCCTTCACTGTAGAGAGGTTGCGTGCACTTCTCCG ACAAAGAGGTTTCACAGCCAAAGGGAAAAAGGTAATATTCCATCTGCTTG AATATCTTATTCTTATTTTATATCCATTTGAATTCTTGGGCTAAAACTGT AGACTTTATTGAAGATAACTTCAGTGAAGATCAAGTACATGTTATACATT TAAAATCTTGGATAATTCTTAATATGCTCCACAACACTTAAAAAATACTT TTAATCGTGTTGATTATAGAATATGCAAGTGATATTCAAGTGTTCTGAGA AATCTACCTATGGTATATCATGGTAGTAAGTTTTACAATGACTTTGCAAA GTTTAGCCTTAAAGGTAAAATACATTTTAGAGCAAAATCCAAACATCTGC GATGCCAGTCATTGTGTTTGTTGAAATATGATGATGAAATAGTACTCCCT CCGATGCAAATTAATGTTCTCAGATTTGTCCAGATTCATATGTATTTAGA CATGTTTTAGTACTCCCTCCGTCCCAAAATAGACGTTGTAAATTTGTCTA AATTTGGATGTATCTAGAGTCTAGACGCGTTTTATTGTCTAGGTACATCC AAATCTAAACAAATTTATGACATCTATTTTAGGACGGAGGGAGTACTAAA TACATCCGAATCTAAACAAATCTGAGAACATTAATTTGAGAAACACAAAC CCATTTTCTTTAGGTGCTAGTGGTGTTGTTTGGATTGTTGCTTTTCGTAT GATGCACTTCGTGGTTTTGTGCTTATTCACGTTTATGTGTTAGAAAAGGT GGTATTATTGTAAAATGATGCTGAGGTAGTGTTTTTTCTTGTTGGCGCAT GCATCACCCAGTTTGGGATCACCATCTTATGGAAAAAAAATACTAACATT ATGGTGGCCTCATGTAGGATGAACTGATCACTCGCTTAAGAGAGTCGCAG AGTTGAAATCAATCTCCAGTTTCTGCTCTTTGTGTGGTTGAACTTGCAAT GTAAAACGTTGGTATGAACTGAATGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.