Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA023952

[Submit comment/correction]

Sequence	AA023952
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA023952
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCACAATTAACCCTCTCACTAGATAATTAGGATCAGCTAGAAGATAAGTA TACACACATATGGAGCAGCTTCCTCTTCTTCCCTGTGGCTCCAAGCCCAA CACCTCCACACCTTTGTACCTCACCTTAGACAACACAACCTCCACATCCA ACTCACCGCCGGCGCTGCCGCCGCCGCCGCCTGAACCTTCCAGACACTCC GACCATGACAGGGGATCGGATACAGTGAAAGCAAAGATCATGTCGCACCC CCTCTATCCTGCTCTCCTGAGATCCTTCATAGAGTGCCAGAAGGTACTTA CGTTCCGGTTTCCGCAAACACATGTAATACTAATATATGATTCATGGTCG TTTCTAATTGAACGGTAGGACACTTGCCTTTATCTCGTGTAGTCGTTTCA TGGCATCACAACACCACCTTTTTTTGTTCTCTTTGTGTTGTATAATCTTC TGTCTATTTGACTATCTCCCTATATATATGAGCAAATTAGTGATCGTTGT TTTGCCTTATCCAAGGTCGGAGCACCGCCAGAGACTGTTGGTCGGCTATG CGCCCTCGCCGACGAGATAGAGTCGGATTCTGGCAGCCAACGGCAAGAAC CGTCAGACCCAGAACTTGACGAGTTTATGGTAATATACTGAAATTTCTGC AATAGGTTAGGCTCTCAACGATCCGTGGAGGTGCTCCAAGTGAATATATT ATTTTCCGCATGATATTAACCTTGACCTCATCGATCTGTACATACTTAGC AGGTTCAAATACCTGTTTTTTTTAGATAGAAAACATTATGTCTGCACATA AGATATATATGGAGCATGATGAGTTCTTTTTTGCCTGCACAGGCGACCTA TTGTGATGTGCTGGTGAGGTACAGGCAGGAGCTTAGAAGACCAATTCAAG AAGCCGACCAGTTCTTCAGGGACATGGAGGTGCAGATGGGCTCGTTTACA CTACGAGGTATAAATAAATACGCGCATATGCTCCCAGCTAACTTTTCTAT TCAGATTCAGAAAATGGAAACTGTGCTGACTATTGCAGAGCAGGATCCTA GAGCAATTGCAAACAGTCATTTGACTGCCACATGTCCCCGTGCACATAAT TCCAACCAATTTTAACAAATTATTACTACCAAGCGCACAAACGTTCTAAA TCACAACGCACGCACACACATTTTACCTTGCCTTTGGGCCTTCTTTTTCC ACCTCACTCCTACGTCCCTAGACCCTAGCTAGTTATCAAAAGTCTTAACT TTTTTCAACTAAAAGCATCTCTAGAACATTTAGGTGTCATGTGGCAGATA TTTAGAATTCATATAATAATTAAAAAAACGACAAGTCCATGTTTGAATAA TGCAACCGGGATACTATTCAGTCCATATATTTCCATATCTGACTCAGCTT TGTCTAGATATGCATGTACCTAGCATATGCGTATGTAGACAAAGTTGAGT CAGTTAATTTGAGTGGAGGGAATCGATTTTGTTGCTCTTCCCGTCCTTAG TTATCTATCTATGATGCTCTGAATCGATTTTGGATCTAAATTTTGTTGGC ATGGTAGATGTGTAATACCTTAATGATATGAATACCTTTTAGAAAATTTC ATATCTCTTGTAGACATGAATTTTGATGGCCTTATGCAATACATCCGAAG GGTGCTAGTAAATTATATATACCCCCGTTTCCTTGTACCCACTTATCTTC TACTGGTTCTTTTTAGTCCCCTTCTCTCTATGCCACTGCCTCCTCAGCAT CCTCTTCCTTCGACAACTCATCAGTATATGTAATTATTTGCATGATTGTC TAGTTAGAGCTCCATTGTGCCCCAATGAAGCATCTTCAATCCCTAGAAGA AGATTATTACAAGTAAGGGCACCTATGCACCACCTTCTCATCTTTGTAGT GGGTTGCCAATGTCGAGGTTAACTCCCCCTTCACTTAATCTTCCTCCTTC TCCTTCCAACCCCGATAGATCCACCAATCACGCTACTTAAACTTCCATAT ACAATGATGCTCGAACATACCATCGTCCCTAAGCTTAGGGATCAACATAC CAGATGAAGTTTTATATCTGATAATTCAAGGTCAACTGAGAATCTAGAAG AACAACCTCAGTCAATGCTACCATCAAGTATTTCGCATTGTGCTCCATAC AAGGGTCAATTAATGGTGGAGTTTTATCTCTTGTTTGTGGCTCACTAGAA CTGAAATAACCAGGCAGTAACCTTATATAAGTCCTAGGTACATATACCTC ATGTTGAGTTGAGTATCACACACTATGCATGCAAATACTCACATGTGCAT ATCAATATACCAAGTACGATTTCAAACCTATTGTTTGGCTTTGGACATCA TAGAAAAGGTGGAGTTGGAACTTGTTACTTGGGATAGGGGCAGGGACTCT AAGTCAAGGCAATGCCACTAGATGGTTGTGAGGAACGAAACATAGGTACA CATAATGAAAGAGAAAGCAATATGATTGGTGAAGGTCCTACAAGTGTGAT CTTAAATTTAAATATTTCCACGGCTATTGTTTTTTGTTGGAAAAACCAAC GCCGAGGTCAATATCAGTCTCCTTTCTCTTTTCGGGAGCAGAGCTGGAAA AGATGGGAAATTCCAATGATTCTCTGGTCTAGGGTGTAAAAACTTGACAA GTCGCCAATGATAAAAGTGATGACATAAAATAAAGTACTGAAATGATATT TTGGAATTATATGGTTATGTGCACCAATCGATCCAAAGCCCAGGGGATTC TTCGTTTTCAAATAAATAAATAAACAAATAAAATGAATAGACTACTGGAG TGAGGCTTCTCATTGCTAGTAGTCACCGTGGACGTGCTATGCATGTTAAC AGAATAGGTAGGAGAGCAAAGATCACTTCAGATTAACTTTGATATTAAAG GCCTCACAGGATTAAAAACACAGAAATGAGAAAATATAGGATTAAAATGT CATGCCCATCCAATTCCTAGCACGTTTGCAAAATTGTTTGTTTGATTTAA CCACTGGAAAAATAGGATTAAAATGTCATGCACATCCAATTCCTATAGTA CGTTTGCACAAAGGTTCGTTCGATTTTACCACTGGAAAAATAGAGGAGGA ACCTTTCCAAGAGGTTTAAGTTGATATTATAATTGTTGACAATTTCGATT CTCCGGAATTTCTGTGGAAAAACCTCTGGATCAAGGAGACCCATGTTTAT TTGTTCAAGATGTGGATTAAATTAAGTTTTGCTGCGTGAATTGCTAGCAT ACATCATCACTAACTTAGTATATGGATTACGAGCGGTGCTAGATTCAATA CATTTGGCTCCTCTATAAATGAGTGATAGATAGAGGTGTGATTTTGTGAC TATATAAACCCAGTGGCAATCAAGAACTGACGACACTCGCCTTGTGACTG TCCCTACAGCACTGCACAGATCTTAACTATACTAACTACTATATATATTC TTAAAGACGCAACCTTTACGTGTCTTTGCATTAAAGAAGAATAAAGGTTT ATCAGTTACAGTGTTGCAAGACTGAAGGGGTGGCCGTTCAAAAAAAAAAG TTTTGAATGGGTGTGACTTGGGAGTAGCTAGCTGCAGTAGCACTGGGTAT GCTGCCACCCATGAAGGGTTGGATATCGTGTGTGGTACAACTATCGGACT GTGGTGTGTAGACCAGGACAGGATTGATTGGTTAATTAAGCACAAGTCCA GCTAATATCTGTCTGAGCTAGCGTACACATGCATGCGAACCCCACAGCCC TAACGCAAAGTCCGAGGAACGTACAGCCATGCAGCAGGGAAAAGGGTGCA GTGCAGTGTGTAGATGCAACATTAGTTCACTAGGCCTTGTCTCCCAGTCG TCGTCCTCGCCGTCTCGACCCCCCTGACACCAGTCCACCCATCTGATGAT TTACTCCTACTTAGGTTGGTGGCTTGGCTATGGCTACGCCTACGACTGTG CTCTGCGCGTACGTTGCCAGGACAAGCTCTGTGTGGCGGTTTGTGCATGC GCATGTGGAGGCCTGGGTCGGATGTCTACTCGATCTGTGGCTCCTGGGTG AAAAGACCGGCGTTGGGTATGCAGTGACTGCGTGCAGGGTCACTGGTGGG GGAGTGCCGGGGTGTTGCTTTGTGTTGTGTGATACTGTGATTTGCTAGCA CGTCACCCCAAAAGGAAAGTGCTACCAAGTCAGCAACAAAGTTTCTGAAA TATTGAAGGGCTTGTTTGATTCATAGAAATTCTGGAGGATTTTGATCCTT AGGAATCACTGGCGGAGCTTCTTGGAGGCGAAAAGGGCCACCGCTCCCCC AGCCCATGAAGAAATGGGCTTTTATTTATAGATATTTAGCCCGTTTGTCT ATTACAATCAGCCCGCAGCTCACATTTTCGCCCCCCCAGCCCATTTGCCC CCCCAGAAATTCGGCCCAAGGTCCGCCAGTGTTAGGAATTTTTCCTTTAT ACATCTTTGATGTGAACCATAGGAAAAATTCCCATAGGACTTTATTGCAC TACAGTTTGGAGGAAAATTTCCATCCACCTAAACCTCATGTTACAATTCC TTTGCCTTTCCTGCGATTCAAACACTTAATTCAAGAAAAATTCCTGTAGG CTCCAAATCCTATAAGATTCAACCGGATAGGATATTATAATCCTACACTT TTCATATTCCTGTGTTTTTTATATCCTGCAAATCAAACAGGCCCGAAAGA GCACATTTCGGTTGTTCCCAGGGAATGGCTCCATTATTATGTTCATCATC CTTTAATCTTTCAGGATCTAGAGCTCGAAAAGAAATTTTAGAGCATATCT TGAACTTAATTTTGCAGGGAGGAGTATTCAGAATTAAGAACTATGCATCT TCACATAGATAGTTTTGGTGGAAATTTTGGTTCTTGATATGACATATGGT TAGCAAACTAAAGAAAATTCAAAGATTTCAATAGCATGTTGGTTTGAAAT AGATCCATCAAGGTGGACACGCCGGTTAAAGTTAAACACTGACTACAAGG TAGAGAATCTAGGGGAATCGTACCTAACCGACTTTCGGGTCACACTAAGG CATCACAGCCACATAAGTTTCAGCCCTTGTCATCGTCATTTACCTCGTCG CCTCAAAATGAAGACATATGATGGAGGACAATAGTTTTTGGGAGTCCAAC ATCCGGCTCCCCTAACACAATCCTCCTTCACCAACTAGACACTGTCTAGT CGTCTAATCGTGACCCTATCTCCAGCCTCCCACATCGCATGCCTCAATCC AGTTAAGTCGCCACTCTTCCCATGTACATTGGGTAGGTGTAAGGGACGAT ACATGTGTTTTGTCAGACCGGGATAACGCCTATGCACGTCGTGGCAAAGC ATGCCAGGTGTCGATGTGTCCAACACCCTTGTGGTTTGGTCGTTGTCGCA TACCTCCTGGGGTGCGCATTGGTGGTGAAACAACCTCCAAGCGTTGTCTC CGCCACCATGCAGTGTGCTCGGGGGCGTCTACTGCCAACTTGGAGCCTTT CCAACCCTCACCATATCCGATCTTGGACCTTGCCCAAAGGTTGGCTAGGG AGAGTCCATGGAGACCTCCAATGGCACGAGAATCTTTTTTTATCGACAAC ATCGGGCATGTCAACCATAGAAAGTTCACCGTCACGATTACCATGGTGCT TGTAGAGGTGGAAAATGCCAAAGGCGATTAGTGCATTGCAACAATGTTGA GTAAGTGGGCATGACAACATAGTGTAACTTTGTTTTTGGTGGTGCTCAAA GAGCACCAAGTTTTGATACCGAGGTGAGAATCCCAAGTGTGAACCTCATT GATTCTACCATACAATGGCATACTTTTAGTCATTTCCTTGTTGACCATTT TTGAAAGTGTGTGTGTTGTCTTGGTGGTTGTTGTTTCCAGCTGCTATGAC TCCCAATTTCTTTGACATGTCAAATTTTTTTTTTGGTTTGTGCTTCATTG ATGTCTCAACTAGCTCTGTATATTATGTTGTTACTGAGGTCAAGTATTAT TGTTATGTTATTCTATTGACATAGCTTTGTTAAAGGGAAGTTAGAGAATA TGCATCCCTAGGCCTATAATTTAGATGGTAAATTGGCATGTCGGTTTGTC TCTCAACTCTCTTTTGTAACAATCTATAGATGGTAAGATTTTGAATTATA CTATATAATTAATGAGAAATAATTGTGTTATCTTAGCCTTGAATGTTGAT CTTACCTGGGTGCTAGCTTTATGACCGTACGTCTATTTGCACATCTCCTA GCACCTACTCGATTTACCTCACCTCTAGCATAAGCATATTTCAAAGTATT CCTGAGCGCCTACCAAGCAGTTTGTATTATATCTAACCAATAATAAAAAA CAATAATTATTTAATTAGCTTAGAAATACTAGGTGTTCAGCTTCATGGTC TTAATTAGTGTCTATTCTCACATCTCTTAGAACTGGTGATAGTTATTTTT TTTTGCATCATTAGAGTGCTTAGCCCTAGATATGTAGTTGCTCTCTTATA TTCACTCCGGAACACTACAGGAAAACGGCATGTTGCCAGACGGTCGTTTG TCGGGGCATCGACATAGAGGGCTAAATGCGGTACATAAAGATCAAATATA GGAGAAAAATGATCAAATACAGTAGTGCTATCAGTAGTTATGAAACAAAT AGAGATAAAGATGATTGTTAGACCATCTGAAACAAAAACAACATACATAT GTGAAATTAACTATATTGTCAAGTATAAATGTGTATCGTGACATTATACA ACTCTCCATTGACAAGTTTAGCACTTGTTTCCACGGAACACATTATTCGA ATCTCTTGCTGAAAGGGAAATTTATGGGACCAGTTTAGTTATGGGACCGT TAGTGGGATGCCACATAGAGTGTAAGGTGCAATAGACTATATAGTTAGAT GTAGTCGATCATGTAGGAGCTTTGAGAAGATTATCAAGACATGTCCAAAC GGGATTTAGTTTTGAAGATCTCGAGAAGCAAAGATAATGGTGACAGAGGA TTTTGGTTCAGATGTTCCACTAATTATAGCAGGGTCTGGCCTTTTAAAGT TTCAAAACCATTTTTAAAAACATCATGTATTTTGGAGCTAACTCTTTCCA ACAGATAAACCTATAACTGCATGCATAAGAGTGTTAACTAATAAAACAGA AAAAATCAAAAATAATACTACAAGTCAATGAAGAGAAATGATAAATGATG CACGGTACCTAATTTATCTGCCATATTTGCTTCCTGGATCACCAATATGC ATGAAAAAGCAGATGAAAACAGCTTCGAGGGCGGTGGTTCCTCCGAAGAT GAGCAAGAAGCCGCCGACGTGGGCGGCCTGCCAGAGATCACGAGCCACTG CGCGGAGGACAAGGAGCTCAAGAGCCACCTCCTGAACAAGTACAGCGGCT ACCTGAGCAGCCTGTGGAAGGACCTCTCCAAGAAGAAGAAGAAGGGCAAG CTGCCGAGGGACGCGCGCCAGAAGCTCCTGCACTGGTGGCAGCTCCACTA CAGATGGCCCTACCCATCGGTACATACGCACGAACGCATGGCCACCATTC GGATAGATCGTGCATGTGTAAGAGCTTGCAACAATGGCGTTTTTCTCGGC ATGCATGCAGGAACTGGAGAAAGCGGCGTTGGTGGAGTCGACGGGGCTGG ACGGGAAGCAGATCAACAACTGGTTCATCAATCAGCGGAAGCGGCACTGG AAGCCCACGCCGCCGGCGATGGAGTTCAGGACGTCGCAACCCCACTACTA CGGCGCCTCGAGCAGCTCTTCTGCCGCCTTTCGGACGGAAGACCACTACT TCGCCGGAGGAAGCGCGTTTCCCCCGCGTGGCCCGTGACGATGGCACGCC GGCGTATGGTCTGGGCCGTCGTAGGTATGTTCGTGCACGTATACAGATAT CAGATACAAGGTGTGGGATGGTGTGGCCTGTGGCCTGTGGGTGTCACGTA CTGGCATGTATACAAAGCTACAGATTTGTGTGATCGTGAGTGTGAAACAG AACAACCCTGTGTGGAGATTTAAAGAGAGATCCGGATAGGTGGAGAAAGA GATATAGGGATATCCCATAGAATATACAGATTTGTCCTCAACTCCTGATA TAAGGTTTGTATTTGTGTAGCGTTGATTCTTTCAAGACCTGGCTTGCATA C

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.