Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA025231

[Submit comment/correction]

Sequence	AA025231
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA025231
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ACTCCCCCTGGATCGGATATCGCGCAACAACTACTACAGGCCGCAGCGAC CGAGCCGAACCCAACCAACCACCAGCTCCGGCACGCACGCACGTCGCACG CTCCTTCGAGCCCATTGCCCGTCTTCCCCACCCCGCAGCTTCCTCTCGTC CCCCTTCGTATCCAGATCGAACCGAGAGAGAGAGAGAGACAGCCACCGCC CGCGCACGCCACCGCCGCGCCGGAAGCTTCCCGAAGCGCCGCCCCCCCGA GGAGGCCAGGCGATAGAAGAGGGATCCGGCTCCGGCGAGGAGGTTCGGTG AGATGGGAGTCCCGGCGTTCTACAGGTGGCTCGCGGACCGGTACCCGCAG ACGGTGTCGGACGCCGAGGAGGAGGAGCCGGTGGAGCTCGAGCCCGGGGC CTTCGTCCCCGTCGACCTCCGCCGCCCCAACCCCAACGGCCTCGAGTTCG ACAACCTCTACCTCGACATGAACGGCATCATCCACCCCTGCTTCCACCCC GACGGCCGCGTACGCCCCGATTCCACCCGCTCCCCCCTTAAACCCCCCAA AGCTCGTGTTATTAAGTGTTGTTGCTTCTCTGCTATTGTGCTGCTGGTCT CACGGCTCTGCCCCTCTCCTCTCCCTGCAGCCCGCCCCAACCACCTACGA CGAGGTGTTCAAGTCGATTTTTGATTACATCGACCACCTCTTCTGCCTCG TTCGCCCCAGGAAGGTCCTCTACATGGCGATCGGTGAGCTGCTAGCTGCT TGCCTCCCCGCTTTCTGCCAATGCCGTTTCCCGCTCTATGCTAAGCCAGC TTCACCCGCTGAATTGTGCAGATGGTGTTGCACCGAGGGCCAAGATGAAT CAGCAGCGGTCCAGGCGGTTCCGAGCTGCGAAAGATGCTGCTGATGCGGT AAGGTTACTGCTTGGGTGTGTGATGCCACTGGGCCTACCTGTGTTTGTTC TCATGCTTGTTGCTTTGTTCAGGCGGCTGAGGAGGAACGGCTGAGGCTGG AATTTGAGGCGGAGGGGAGGACTTTGGTCCAGAAGGAGAAGTCGGAAGCA ATCGACTCGAATGTCATTACACCCGGGACGCAGTTCATGTTTGTACTCTC TTCGGCGCTTCAGTACTACATACAGTTGAGATTGAATCACTCCCCTGGGT GGCAGTCGGTCAAGGTGTTGATACTATTGCATTCTGGGTTAATTAATCCG TTGGTTTTGTGTTGTATTTCACTAAACGGAAACTGCTTTTGGGTGCATTT TGCAAGGTATTATTGTCTGACTCGAATGTTCCTGGAGAGGGGGAACACAA GATCATGTCGTATATCCGACTGCAGCGCAATCTTCCAGGGTTTGACCCAA ATACACGCCATTGCTTATATGGCCTCGTAAGTTTACTTCCAAATTTCTAA CTAACTGTCTTTTTGTGCTCCCACCTTCTTATTACTCATTGACCACCACA TTTTTCAGGATGCTGATTTGATCATGCTTTCTCTGGCAACTCATGAGATC CACTTCTCGATTTTAAGAGAGGTAAATTTGTAACAATTCTTTGTTCAGAA ATGCACGCATGCATCTGTACTCTGGCCATTCATGAAAGTCAAATTTCGTG TTCTTTACGGTAATTTAGGAGTACTTCCATAACTACAGAATTCAACTGAC TTTACAGGTGATCACCATGCCAGGGCAACATGATAAATGCTTTCTGTGTG GTCAAGTTGGGCATTTAGCTGCCGAATGCAGAGGCCCTGGCCCGGCTGAC AATGTCGTGGAGCTCCCTCCAATTCATAAAAAGAAGTACCAGGTACTCAG AAGCATGCCATATTTGCTCTACTATTTTTTTTATTTTTCTTGTCGGTCTC GTATCTTTTGGGATATGCATCGGATATGCAATTTGCAACTCGATATCTTC TGCTGCCATTCATTCACTGTGTAACTGTTGACCTGTTAACAGTTTCTTAA CATCTGGGTGCTGCGGGAATACCTCGAGAAGGATTTGGAAATTGTAGACC CTCCCTTCAAGATAAACTTTGAACGCATCGTGGATGATTTTGTATTTATC TGTTTCTTTGTTGGGAATGACTTTTTGCCTCACATGCCGACTTTGGAAAT TCGCGAGGTCTGTTGATTTACTGACCCGTCTTTATTTTAATAGTTTCATT TGTCTCGTTAGATAATTTTTGTGTAGCTATTAAGTGATCAGTTTCTTGAT GTAAACTGTAGGGTGCCCTTAATCTTTTGATGAGTATTTATAGAGCAGAG TTCAAACCAATGGGCGGTTACCTCACTGATGGGGGCGAGGTACAGTTTCT TTGCGCTCTTATTCTTTCTATGGTTCAAGCAATACCGTTGCATCACTTTT GCTGTAAAAATTCTTATATAATGTATAACTGAGTTATACTGGATTATTAC CAGCTTTAGCTGTAACATTGTAATGTAATAAACTAATAACCATTGAGGTG TCTCCATGTTGTATCACTAGGATCCTCTAGGGAAACCAACTGAGAAGGAC ATCCCTGCACATGTTTTAATATTGTATCATTACTTTGTAAGTTACAATGT AAACGCTCATGAATATGAATGATAGCAGTCGTAACAACTAATTTGCAATG GTAGAATAAGGTGAACTAGAGATATTATAGTAATATTACTAAGGTGAATG CACTATAGATTGAACATGATTTCTATACGTACAGTTTGTTGAAGCATCAT GTCATGTCTAAATTCCTTTTGGACTCTTACAGTCTTACTTGATCATGATC AACTAACTGCATCAGGCTCAATTTCCGTGACACATTATTAAATTAACGTA CATTAATTAAATTAACGTTATGGAGTATGGACCACAGCATGTCAACACAA CAGCGGCAGCAGCAAGGAGATGCCGAATTGCCAACAGAATGTCACGTTTG TTATTTTCAGACAGATAGCTGTTAGTTTTTTTCTGTTTCGACCGGTTTAT TTCTGAATGAAATTTTGTCACGGTTAGCTTGCTAGCTTGTCCGTTAAAGG AACCTCGTGCCATTAGGTCGGCAAACAAGAAGCATTGAGCTCTTGCCCCT TATGACATCCATTTTTTCGCACATCTAGTCCACTCTCTCCCTCCTGCACA TCTATTTCTCCTTGTGTACATGCTGCTTCCCTTATAATACCACATCTCTA GGACCGCATCCACCCCATTCAAAATCAAACCGCTGTGCTACCGATGTGAC TGGCATTCTTAAATATGGTAGATAGTGCTAATTAGATGTGCCAGGGGATT TTTCATGGGGGTTACATACATCTTCTCGCTCATTACCTCTAAAAACGTAA TTCTGTTGACTTGAGAATGTAGGAACATCTGTTATTGTTGAAGAGGTTTT GGCTGTGTAACAGTCATTAGAACTCCCCTTGTTTAGCTTGTCTGCCTTAA TGTGCAAGGTGGTGGATGTCTTCTTCCCTGTAATCGGAAAAATAAATAAA TAAATAAATAGCTGTGCCTGACTTCAAGCATGATATATTGGCTTGGTGGT ATAACCTTATCTATAATGAAATCCCACTTCTAGTTCATTTGCTAGAATCT ATTTTAATTTGAGCAAAAATTTGAACTAGAATTTGACAAATGAACTAAAA GTGGGACTTTGGTGGGATCCCACTTGACACCCTAGTGGTGACATTCACAG TTGTCTGATAGCATGACATTTTCTCCTTTTCGGTGGAAGGTTTTATTGGA ACGAGTGGAGCATTTCATTCAGGCTGTTGCTATCCACGAAGAACAAATTT TCCGGAAGCGTACACGAATGCAGAAGGTACTTTCTAGCTACTCTTCTATC CATGCCTTCTTTACTTATGTAGTCCTATACAACTTATGCATGTAAACATG TACAGAAGCCTACATATGTCATTTCCTGTAATAACTATTTTATGCTGCAA ATATATGTCTGGGATGAAGATGCTGAGGTGTATTTTATGCTAATCACGTC AAGTTACTTGGCCCAGTTCTAAGGTGTAATTATATGATTTTAGTGCAATG TATCTGTATCCATACAATGTGAGTCGGGACTTGAGTTAAGTTGCATTGAA ATCGTGAAAGTGGATTGCAATAAGCTGCTGCTTTTGATTCTTACATGCTA ACACTTCTTGAACACCTCCACATGGACTGCAGTTGAACTGTCATGTGAAC ATACAAAAACAATTTGTTAACTTGCTTGATTCATGGTATCCTTAGTTTCA ACTAATGAAGGAAGTGTACAGAACCATGTTTCCTAAGTTTGTCTTTGCTA CTCTTATCCCAATTGAAAAGAAATTTTATGATTGCTATATTGCAGGCTTA CGAGAATAACGAGGAGAGACGTAGAGCGCAAGGAGAGAACTTGGAGGAGA ATAAATATGTGGACATGGTTTGTTTCTCTACTTGTGGTGGGAGAGTGGTA AACTGGTGGTACATTTATACAAGATGCTATGAAATCAATCCGGACAACCT TTCCAAACAGACTTCTAGTTTGCACTATTCTCATTTGTATCCCCTATCAA TACTTCAAATCTACTTTTGGGTTTCTTTGACACAATTTGCACATGCGTTG GCAGATGATATCTTTGCGTGATTCAGAGATGATCATCTGTCACTATGTGA AACAATGCCATCTGGTGATTGCTTTTCCTAGTCGGCACTGTTGGTTGTCT TTGTAGGCTTCATTTCTTAGTTTCTTATCTTTTGTAGGAGTAACAGTATG TGTAACACACGGTATTTCAGATTACAACACTTGGTTGCTCCAAAGTCTGA GAATTGTTGTATTTGGCAATTCACATATGCTTAAAATCCAAAGAATCTGT TCAGATAGTAATTTTTTGTGTTTTGGTTCTCTTATAGTAGATTAGGGAGT GTGGCAGTTTGTGTTATAATTTTTGCTTATCTTTTATTTTGCACTGACTG CGCTTCAGGTAAAACTAGGAGAGCCAGGATACAGGGAGAGGTACTATGCT GAGAAGTTTAGAGAAGAGGCAGAATCAAAACCTATTGAGCAAGTTCAGAG AGATGTTGTGAGTCTTGCTATTGACTATTAATCATTTAAAGTTGCACTTG TTCCTAATTTAATCATCAAGCACTACCATATGCTATTAGGCCTAGTGTGC CTCTTTATTTTAATTTGACACGTGGAATATGACTGGACCTCACATGCTAG AAAATTAGTGGCCCAGAGTAATGTTTTTATCTACAGTGACAACATGAATG TGTTGCTCTCCATGATTGCATTGCAGCTATAAAATTGGAATTTAACCATG ATGCATCTTGCATGACATTATGGATGATTTTTTGTGTTCAGCAATATTTA CATCACATTGCTGCCATGAAGACACCATATTTAGTCTTGCAAAACAAGTG ACATTACTTTCTGGCAATTTACTGACTGCAATAAACCTCCTGCTGTGTCC CAATGGTGGCTGCCATATTTCTGAACAGATTAATTTAAAAAAGATCACAC TTTCTTCTAAAATCAAAAGTATACTTCATATAAAGGGTTCCCAGATTGGG CTTTCAGTAATTATGCATATAGCCAAAGTGATTTTTGACTCTTAGATCTA CAAGTAAAGACTAGGCACACTCTCCATCCTACAGATTACATGTCATATTA ATGCTTGAGAAGTTGGTTCTGGATTAATTGAGAATATTATGATGCGTTGT TTTCATCAGCCCAATTCATATGTTATGTTAAAAGTTTGTTAGGTTACTGT TCAAAGCAAAATTTGTAGACTATCTAGTATGTATCGGCCTATTTGGCCAT ACCCGCTCTTAACTGATGTTATTTCTATCTACAATCCATGTTTTCAGGTT CAGAAATATGTGGAGGGTCTTTGCTGGGTTATGAGATACTACTATCAGGG TGTTTGTTCATGGCAATGGTAGGTAATTGTTGACCATCAGCTGTGAGGAT TTATGGCTACTGTTCTTTCTTTTGTTTGAGAAAACATCACTTGATCTTTC AGCAAGCATTTTTCACTAATCATGTCAATTGGTCTTGTTAAAGATTCTCA ACTCAACTCCACGATCATAGTCGAGTATGCATGAAATTATCAGTTGTCTT ATTATTTATAGCAACCCTAAGTCTAAATCTTAGAATGCGTATGTTGCCAT TTGTTGCACCATCATGCATTTTAACTTGGTAATAAAACAATCCAATACTG TTCAATTGCAAACCATGAAATCCAAGGTGATACTTCTTTGTGATGATGTC AGGAATGTCTGCAATTCGTCTAGAGTGTGACATTATGCTGCAGCTGTTGA AAACTGGAATCTGTCTTAATATTAAACCAGTCATGTTGCAGCATTATTAA ACTAGTCAATATTAAACCAGTCATGTTGCCAGAAACCGTTCACACCCTGT CATATCCACATGCACAGCTGATCAGCTGGATGTAGGCAGATAGCAGTTCT GCAGTTTGGTTGACAAAGCTCATAAGTAACCCTTTTGTTTGGTATCAAGT ATGAACTCTGGTTTTTTACTTCTCTTCACTGAAACAGGTTCTATCCATAC CATTATGCGCCTTTTGCATCTGACCTGAAAGGCTTGACTGAGTTTGAGAT AACCTTTTTCTTGGGTCAACCTTTCAAGCCGTTTGATCAACTAATGGGAA CACTGCCAGCTGCTAGGTTTGTCATTTCTCTGTGCTAACGAGTCTATCCA TATACCATACACATATCATGAATGGTAAGTTGAAAATCACCATATATTCT TCCATTTCTTCTGTAGCTCTAATGCATTGCCAAAGCACTATGGGGATTTG ATGTCTGATCCAAATTCACCATTGAAGTATTTCTATCCCAAAGGTACCAC CATCTCTTGTCTAACAGGGAGTAGAAATGCTTAAAAATTACAAAGATAAA GAACTAAGAATATTGTGTGTGCCCCATTCCTGAGGACCTCACCATACATA TAAGCTCTTACTCCATGCCATCTTCCTTATGCAACTGCAGATTTTGAGAT AGACATGAACGGGAAACGTTTTGCATGGCAGGTAATCAATCAATCGATAG ATCTGTTTTGCTTCAGGTGACTGGTTAATTGATGCTTGAAGATCCATTTC TGTTGTTTTTTCCAGGGTATTGCAAAATTACCTTTTATTGATGAAACGCG GCTGCTTGCGGAGACACATAAACTTGAAGATTCATTAACAGTAAGTAGTT TCTAGGATCCTTCTGTATCAATGCTCTAGGCTTCTTTTTTTTTGACTTTT ATTTTAGGATCCTTTTATGTGAACGTTGGCTTGTATTTATTTTTCTGTTG TTCAGTGTGCTTTGGTTGTTGCTGGCTTTTGCAGGAAGAAGAGAGATTCA GGAATACAACAATGTTTGACATAATTTATGTGCGGGAAACTCATCCAATG GCTGCCCAGATTGCCTTCCTGTATCAGATGTACTCCCAACATTCAATAAC AGATCCTTCCTATCTTATCCCTATTGACCCTGCCGCTAGGTTGGTATATA CTATATAGATTGATCTGGATTGTCTATTTCTTGGTGATACTGTTCCCCCA ATAATTACTTGCGCTGTTGGTATGTTGCCTCCTTGTGTCAGTGGCGGAAT GAATGGATTTCTTTGTTTATCACAAAGAAATTGGTACAGCATTTCTGTAG GATCTCCAGTTAAGGGGTTCAATAACATCACCCATAACAGAGTTCTGTAA GTATTATAAGATGAAAAAGCACATTGTAAGCCAAAAGTCATCATCAAGTC TTCAAGTGCTATATTGATCTTCTATTGTTTTCCAGGAATGGTACCTATCT TAACCCTCAGTATCACCAACACATCGCGGAGCCTCCACAGGGTGTCATTA TACCTCCAAAGGTATTTCCTAACCCTGTGCGCGCTTAGCTGGATAATCAA ATAACTCTTTTTCTGTAATCAAGCTTTCGTAAGCATTGTAATCCCACCTA CTCGGTGGATTGTACTCAATAACTCTTCTTTGCAATGAAAAGAAACACAA TGTCATTGCGTTTTCCCAAAGAAAGCTGGATAATCAAATACTTATTTGGG ATAGCTTTAGCATATTTGGCTTTATTGCTATTAGATCATAATCATTTCTA GTTCACCCTTTTGAACTTCTGCCCTCGTTAAATGGAGGAATTGTTGACTT GACTCAGCTAATAAACGAATGTAAGGAGTGGTATTGATCTTAATTAGTTC TCTTGGTGCCCTGCTGCGCCTCACCAGTTTCATGCTTTTGGTGTGTTTTT ATACTTTTCATTGTCTCGGATATATAAATCTGACCATTATTTTTCTACAA TACGATGATGTTTCCGAAAAGTATTGCCGTGACTATCTAATTATTTGGAT TGATTAACCACAGTTTAAATATATCGGCTCTTTTGTTAGAGATATAAATT CATGGGCTAACATAGGTCACCATTTTGTAGATATTGAAGCCTTATGATTT CAAACCTTTTCCCGTGTTGTGGCATGAAGATAATAGTCGGCGACAAACAA GAGACAGGTACGGTTACCGTTTCACACGCATCTTACCAGAAACCCGCTGA TACCACTTTTATATTAAAAATACTGTATAGTACATGATATTCTACCAGAT GCAGGATTAATACACATCTTTTTCATGGGAACAATACTTACCTAGTAGCA CATTCTTTCTGGAGTTTTAGGTTGACTAATTGGTAAACTGTTTTGCTTAC TGTAAATCATTTGATGATTCCAGGCCTCAGGTGCATGGAGCTCTGACAGG TTCTGTCTTGGGAGAGGCTGCACATCGTCTACTGAAAAATTCCCTGAAGA TGAAATCTGGCAGTGCTGCTGGGCTGCTTGATATGCCATATAGGGGTGCA CCATATGGCCATGGAAATGGACCAAGGCCCTTTGGACCTTCGGGGTACGA GAGGGGTTTCGTGGATAATCCCTACCATGCACACATGTCCAGAAGCGCTC CAAATCCTCGGCCTCAGTTCTTTAATGAAGCTCAAGCCAACAGAAAGAAT GTGCGGATACTAGAACGGCCAAACACTCAAAGCCACGATGGTGGCATCCA TTCAGCGATGTCAAAACTGACAGTCCAAGACGGGCCAAGGATGCATCAAA ATAACAGGATGCAGAATCCGGGATATATTCCAAATCAACCGTATCCGAAC CAGCATGCTGGGTTCCCACCTCAGCGGCCCTCCCAGAACAACAATTATGC ACCGCATCATCGACCTGTCCAGAATCCAGGATTCCCACAGCAGCGACCTG TCCAAAATCCAGGGTTCCCACAGCAGCGACCTGTTCAAAATGCAAGATTC CCACAGCAGCGACCTGCTCAAAATGCCGGATTCCCACAGCAGCGACCTGT TCAAAATGCAGGATTCATGCAGCAGCAACCAGTAAATGGGGTTCCTCCAC CATTACCTCCCAGTACTTGGATTGGCAAGCAAACAAGCGGAGGGGGCCAG AAGGGTATACCTGCCAAGCAGGATCCAAGGGCGAATAGACAGCCTAAGCA GGATAACCCAAGATCACAGCATGAGAACAGACAGCAGGCTGCCAAGGCAG TATACCGTGTCAAAAGTCAAGCTCCTAATGGCCTGCCAGAGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.