Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA030682

[Submit comment/correction]

Sequence
AA030682
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA030682
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGACAGCCTGAGGTTGAGGTCAATAGAAAAACCCATATAGACACTAAAAA
CATGGAGAGAGAAAGAACTGTAAGAAAAAACACTACGCGCACAAACATGA
GTGAGAAGGGATAAACAACTGAAAGCAAAGTAGGGAAGAAAGGTAAGAAA
ACGAGAGAAGCTTTTGCATTCGTAGCTATTCCTCTGTTGGCAGTAGCGCC
GAATCCACCCGACCCACCATTCCACCAATCCCTCCTCCCCATTTCGCCCT
GTTCTCCCCCATCCTCCCGGCGAGCACTGGCGCATCTTCCTCCCCGCGCC
TCGCCTCTGCACTCGAATCCGCGGGGGCGCCCCGCGCCGCGGGCCCGATT
GCTCCCTCGTCGTGGTGGGCGCCGCTCCGATCCGCCCGATCCGCTCTGCT
CCTGAGGCTCCGGCGCGCGGAGGCGAGCGGTGGTGGCGGAGGGGCGGCGA
TGGACTCCGAGGACGACATGCACGACGCCAACGACTCAGCGGAGGACGAC
TTTTACAGCGGCGGGGAGGCTGGCCTCGCCGCCAGCGATGACGGCGACGC
CGACTACGACTTCGCGGACCACGACTCCGACGACTCCGACGAGCTCCTCT
CCCACCGGCAGCAGGTGATCTCGGTTCCCCGCCCGCGGTGAGGTGTGTGT
GCTTGGAGTGGCGTAGCGACGTTGCTTGTGCTTTCAACCTTTTCTGATGT
GGGAACGCGGGAGCTGCCGGGTTGAAAATCTAGACGATCGACGAGATTGC
TGTTGCTATGCTACAGTTATAGCCTTAGTTAGCTATGGCTCGGGCGAATG
GCCTTGCCCTTGCATTGGCTGCCATCCTTCATAAATGGTTGGTGCAAGCT
AGGGCCGTCAGGGAATATTTATGCATTTTTTTGTATGAGAGCAGTGTGGA
TCAAGGATTATCAATAACAAGGGCATGATGAATAATATACAACTTGGCAA
CTAGACTACTGATACTTTGTCCTCGACAACTAAGTACTCGGTCTGTAAAT
AAAAACAGTAAACAGTGAGATGATGCAACACTGTGAATTATGACCACAGT
TTTGTTGGAGTGTAATTTTTTTTTACTTTACAACAACAACAACAACAACA
ACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAAAACAACAACAACAACCAA
GCCTTTTGTCCCAATCAAGTCAGGGTAGGCTAGATATGAAACCCAAACGG
AAACTAGAGAAAAGTGCAAGCCAAGCGTAAAACAGTGAAAAGTGCTAGAC
AAACAAAAACTAGTGAAAAAAAGCAAGTAAAAATGAACAAAAGAAGTAAA
TCAAGGTTCGGGCACATGGATTGCTGATTCACTCGCAAACAGTTAGTCGT
ATTTTTTCTTAAAGCCTCGATGGACTAAAACATGGAAGGCTCTATGGCTG
TTGTATGTGCCCTACTAGTTAGTATATGTCAAATCATAGAGTTTGAGCTA
AGTTATCCATGACAATCTGTAAGTTTTTGGATGCCCTACAGTCCTAAACA
ATGCCAGCCATTTTTTTTTTACCATTATTATGTCCATGTCCAAGACCTAC
TGAATTATGGTGCACTTAGAACTTGACAATGGCAAAAGAAAAATTGCTCA
ACTGCTGCACCACACTACGACCAAAATTTTGCGGGGATCTTTCCAGTTCC
GATGCAAAGTTTTTTTTTGGCTGGACATCAACAGAGATGATGACATTAGG
GTATCCAGGTTCATCTGCTAGTTTCCATCCTAAACCCTAAAATCCCTTAA
TGGACAAACTTTCTAACCTGGGTAGCTTCATTATCGAACAAACTTGAGTA
AGTTACATTGTTTCTAGTGTTTTACGACTTCTCTCCATCCACTACCTTCC
TTATTTACCCAGTAACACCGACCTTCTCATCGTCTGTCAGTTGTCATCAT
CGCCCCCGCTAAAACCTTTGTCTGTCTCCTTTCCAAGCTTCCAGCTATTG
AGGCAATCCATTCCCCTGGCCATTTTGACCACTAGTTGCTGGCACCTGCT
GTCTTTACTCTACCTGTGTACGTAGACGAAGGGCATTGCCATCTGCTGAT
CCATGACATCGAGGTTTCCTGTCATTAGGCTGGCCACATCCTGCCTTGCC
CACTCAACCAGGTTCTTGTGAAGTCTTATAAAAGGGAACAGAGGGAGTAG
TTTCAATTGCCTTTGGGTATCGGTCTCTGCTTTGATTGATATGTGCGTTG
GGGTATAAGGAATGGTTTATGGAAGGATAACCTGGTAATGTACCTTTTGT
TCCTTAAGTTTACTGTTACTTTGTGCTTTTCAAGCTTCCCAAACATGTGA
ACATACATATGTACTCTGAAGGCAAAATCCCTTGTAAATAGGTTTCTTAG
AGAAGCTACGTGTGGGCCATACTTGACCAACAATATTCAAAGTTCTGAGA
AGCTCTTTAGGCATCACATCAGAAAAGTAGGTTTGCCAAGTCGAATAGTC
TGTTTAACCTTCAAATAATGTGTTAGATTTTCTGATCATCGCATAGTTTT
GATTTATTTTACCTTTAAATAGCTTCTTTAATGTTTTTTATTACTTGTTC
TTATCATCATTCGCTTTTTTTGTGCCCCAGCAAAGTTACTGCATATTGAG
TGAAGCTGGTATAAAGCAGCGCCAAGGGGATGACATAAATAGGGTTTCAA
CTGTTCTTTCCATTTCGAAGTCGGAAGCATGTGCTCTCCTTCGCAGCTGT
AATTGGTAATACCCATCACCCGGCTGTTATTTATCTTTATTTTACTTATG
TTGCAAATACAAGATGTCCTGGAATCCGTGATTTTCAGCACTTCCCGCTA
TATATATGACCCCATAATTTAGATTCATCATGGAACATATTTCCCTAATA
TTTAGGTTTGTGATCACGTTTATACTTTGGAAACCGTGTCATTGTCGAAG
AGTTATCTTTGAAATAGTTCATCCATGGAAGTTTATTTTGTACTGCTTTT
GATTTTTCTGAAGTGGTCATAGTTGTCTGAAGTAGGGGTGTGCATACACA
GTTTCACGGTTTAAGACGGTTTGGGATAGTTCATTTTTTTGTACTAGATC
TGGGGCAAGGATTCAATTTGTGAAAGGAAATGAACTAGGTGATTGCTGGC
TGGTTTGGACGGTTTCCATGGTTTGGTATTTTGCCCACTCCTAGTCTGAA
GTCAAATGCTAGTTGCCCATATATTTGCACTTCATTTGTTCTTGCCATCT
GGATGCATATCACTGGTTGGTTATCTGCAATGTATGACGGTTGTTATTCC
ATGCTAATTTTATTCTTTTCCCCACAGGAGTGTTAGTAAGGTGCATGATG
AATGGTTCGCTGATGAAGAACGTGTTCGTAAGGTTGTTGGTTTTCCAGAG
AAGCGCATTGAAATGCCAAATGACAGAGAAGTACAGCACCGCCTCAATTA
CTTTTAACTCGTTCTTCCACTTGACTAAGCATATTACTTTTTTTTTGAAT
CATAAAGTAGTTGTTGGAAGTGACTATGGTACAATAATTTCTGAGCTACA
AAGAGTTCTCAATATTTCCACTCTCTCACCCCCATCTGTAGGATGAGTAG
TCAATGGTGGAAATGTGTATGTAAAGCACGTAAAATACAAACTTACCATA
GTGAGTCAGTTATTTGATACAGGCTTTCATATTTGATACTTGCCAGTATC
TTTAGCACCTAGTCTTATCAGTATGCATGACTACCAGCTCAGACTGTTTG
GAAAAGGGTGTTGGCCAGCATGCTTTTATTGTTGCAGGACTTGGTATGCA
TTTTTCAGCAGCATGTTCATTTACCATGTTTATGCCATCTCTCTTGCCTT
TTTTCAATGGCTTCTACAAAACCTCATCCACAACATTTGATGCTCTTAAA
TACTCAATGCTTATGCTTTTTGTTCACTTCATAACAGCTGACATGTGGAA
TTTGTTTCGAAACTTGCCCTCACGCGTCAATGAATGCTGCTGCATGTGGA
CATCCTTTCTGTAGTGCATGCTGGAGAGGTTGGTAAATCTGTACTTTAAA
TACTCTTCTGCATATGGGCCTCTGATTATTTGTTTTGTGGGATCACGCTT
CCGCTTTCATAGTCATAGCACATATTGTAACACTGCCATTTCTCTCTAGC
CTTATACTGGGCTGGTGATAGTCAACGGTACAGTATTTTATAAATACATC
TTTTCTTCTGCAACTATTTTTCTTGCTGGCACTCAGTTTGTGCACTCTGT
TTATTAAATATTGTTTTCACTGATGTCATGGTTACCCAAAAAGAGTGCTT
AAACAAAATGATCACTATGCTTAAGGTCTTTGAAGTGATTAGCATCAGTT
TACTTCTTTGTTATGCTGCAAATGAGTTACATCTTGTTGTGAGATATGTC
ATGCCTTTCCAAGGGAGAAGTCGCCTGCTTTTGGATGTAACAATATAGTC
CTAAATGAAGAAACTGATTACTTATACTAGAGACTCATCAGATAAACAAG
ATTTACTGTGATAGATTGTTCGTGTTTCTCTGTTTCTTGGTTGGCTGTTT
TACCCTTTTGCATTCTGATGTTATTCCAAGGTACCATGAGCACCTTACTG
TAAATAAAACTAGAATTGGCCTAGATGATATTATGATGTCACTGCTTAAA
CGTTCATACATATTGACAGGTTACATTAGCACTGCTATAAATGATGGTCC
AGGCTGTCTGATGCTGAGATGTCCTGATCCATCCTGTGCTGCCGCAGTTG
GGCTAGATATGATTAATTCTCTGGCTAATGAAGAGGATAAGGAAAAGTAT
GGGCGCTATCTTCGCAGATCTTACATCGAAGATAATCGGAAGGCAAGTTG
CTATAGTTTGATGTAGAGGCATTGTAATACCATTAACAATGAAAAAAGCT
GTAGAGCTGATATCCAGATTTTCCTTTTCCATCAAAAAATATATTTGCAA
TGTGAATGTTAAACTTTTATAGTGCTTTAAAAGGCTCTGTTAATTTGTAA
TTGTAGTGAGCGACACAACATAATGATAAACTGACATGTTTAGCCAACAC
TTGAGTTGATATTTAATATTTTATTCTAATACTCTGTTGATCAAAGGCAT
TTCTGTGTGGAACAGACAAAATGGTGCCCTGCTCCTGGATGTGAATATGC
AGTAGAATTTGTTGTGGGCAGTGGCAGTTATGATGTTAATTGCAACTGTT
CATATGGGTTCTGTTGGAATGTGAGTATTTGACTGATTAATTTTTGTCTA
TATCATAATAGGAAGAATATAAACTATGTGGAATAAACTTTGCAGTGCAC
TGAGGAAGCTCATCGTCCAGTAGACTGTGCCACTGTTTCAAAGTGGATTC
TCAAGAACAGCGCAGAGTCTGAGAATATGAACTGGTATAGTAGGATACCC
CTTCTACTACTTCGATTATTTCTTTGCTTATTGTTGATCTGGAGCTTTCA
ATGGTTGGCATGCTGACCAATGATAAAAAGGTCTATCCCACACCTTCAGC
AGTTCAGCAGATTGCATCCATTTGATCGCTTTAAAGTTTGTGCGTGTGCG
TACATGGTCTTATTATGATTATTGCTATGAGGTTGGGTGGGTTGCAGATG
TTACAACCTTTAGCTAGATAACATTGATTGTAATTTTTTATGGTAGTTGG
ACAAACGTCCTTGATCTCCTGGTTGGGACGCACTGCAGCCTGCTGTGGTG
ATCATGCTAGCCGATCAGGTAGGCGATAAGAGAGTTAGGGTCGAGAGAAA
CCTTTTAGTTTGGTTGTCCTTGTTTTATTAGCGTCATTATCTTCTAAAAC
CACCAATGGTTGGAGTTGTAAAAAAAATTAAGTATTTTGGCAAGTTGTTT
GATAAATCTGAAAAATATATGTTTTTTAATCTTGTTTCCATGAGGTGTGA
GTGTGAACTGTGTTGTGTCTTCCTAATTGCTGGTTATGGTTTCAGGATAC
TAGCTAATTCAAAGCCTTGCCCTAAGTGCAAGCGGCCTATTGAGAAAAAC
CAGGGATGCATGCACATTACATGCACACCACCATGTAAATTTGAGTTCTG
CTGGTATACAATCAGTCTCCTTTTCTGTGTTCTGTTTTATTACTTGGAAT
CTCGTATAGCTGATATGATACTTAAGATGTTGTGTTATTATAATGTAGGC
TGTGTCTTGGGTCATGGTCGGAGCATGGCGAGAGGACCGGTGGATTTTAT
GCTTGCAACCGTTATGAGGCAGCAAGACAAGAAGGAGCGGTAGTTATTCT
GATCCGAGATGTTTACTTCATTACCTAAATATATCATGTCATTTTCTGTC
TTTTTTGTTGTGGTTACAGTATGATGAATCTGAAAGGAGAAGAGAAATGG
CGAAAAACTCTCTTGAGAGATACACACATTATTACGAACGATGGGCAGCT
AATCAGTCAGTAAGTTATTCATTGTGAAAAAAGTGCCATGTATAGAATCT
TACTAGGATTCAGACTGGCAATTTATAATTTTTTCAAGTGGACAATTATA
CTGGTAGCTAGGGTTGGTCATTTTTCCTTTTGCTTTCGCATTGTGCCATC
ATTTTTTGTGATAAATCCGAGTTAAGAAACAAGGGAGATTTCAAAGTTGT
TTCGCACCAAATATCTTGGTTGTGGCATTGTGCTACAGTGCTCTCCTTAA
TTTCACTTATTTTCCCTATGCCAAACCTATTAAGAATCTATGATCAGTTG
TAGCAATGCTGTTTCTTGTAGAAAGGAATTTGCTGTTTGCTTTTAGTTGA
TGAAATCTTATGTTTCCACTCAATATGCTTGGTTCAGTATTTAGCTGCTG
TTTCATGTAGACAGGGTGACATGAATATTCCTGTTACAACGTCACCTGTT
AGAGCATGTAATCTGGTAACTCCGGTTGCTCTGACACTTTTCTTCATGAT
GTAGTCAAGGCACAAGGCATTAGGAGACCTTGAGAGTCTGCAGAATGACA
AGGTATATGAATATATGACTCTCACTGTTCATTTCACTGCTTTTATCATA
TCCTACCTCAGCCTGTCCAGAACTCCTAAGATAGTGACTTTTACAAATGT
TTCTCAGCTTGAAAAGTTAAGTGATATACAAAGCCAACCTGAGTCACAGC
TCAAGTTCATCATCGAGGCATGGCTACAGGTATTACTTCATGAGTGTATC
ATCCCCAGGTTTAGTTCTCAGTCTACTTGCTTTCTCATGACTGGGTTTAA
TTTTGAAATGTAGATTGTCGAATGTAGAAGGGTATTGAAGTGGACATATG
CCTATGGTTATTACCTCCCAGAGAACGAACATGCCAAAAGACAGTTCTTT
GAATATTTGCAAGGTTTGTAGTTCTACCATCATTAATACTCCCTCTGTTC
ACTAATGTAAGACATTTTAGCCTTTTTCAAAAACACATGTATGTAGACAT
GTTTTAGTGTAGGTTCACTGGAGTGTATCTAGTCCACTCTGAAATATCTA
AAAGGTCTTTACATTTGTGAACAGAGGGAATAGCATATATAAGCATATAC
TACCCATCTGATATCTGCTTTCTGTGTATGTATCTAGGTGAGGCGGAATC
AGGTTTGGAGAGGCTGCATCAGTGTGCAGAGAAAGAACTTCAAATATTCC
TTGAAGCAGACTCCCCCTCAAAAGATTTCAATGACTTCCGTACAAAGTTG
GCTGGATTAACTAGGTAACATGGATCACCTTTTGGATGTCTTATATCCTT
TGACCTTTGCTGTGATTCTTGCATTCTATGAAGTTGGCTTTTGGTTCTTC
TAGTAACGTCTTTATCATCCCAAAATTTGATGGGGTGTCAGTTAAGATCC
TCTTGCTAGTTGCTACTGCTCTCTTAACATTTTTTCGGCGGTATTTTACA
GCGTGACTCGCAATTATTTTGAGAATCTCGTCCGGGCTTTGGAGACTGGA
TTAAATGATGTTGGACCTTCTACTAGCCAAAGCACGACGGGCATGAAGAA
TACTACTTCTAAGAACGTTGGTGGTAAGAGTAAAAGTGGCAAGAACAAGG
CTGCAAGCTCCAAATCAGGCAGCTCGAGTCGTGGTGTGGATGATAGCAAC
ATTTGGACTTGTGATCAGTGTACATATGTAAACCCCAAATCTGCCAAGGC
TTGCCAGGCTTGTGACCACCAACATCGATAGCAGTAGTCAGTCATGTTAA
AATTTTCCGCTTCATCGACTGAGAAACCCTCTTCCGGCCATACACCTGTG
GTACCCACGTTTGCAAAACTGAAGTTAAGGATTCTGGGGCAATTAAGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.