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GrainGenes Sequence Report: AA040625

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Sequence
AA040625
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040625
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCGTCGTCATCCATCCACCTCGCATCCGCGAGGCCGAATAGTCTGACTT
GTCCATCTTCCTTGTTTGATCTGCTTTGCTGCCGTCCTAATTCTATTTAC
TGCCCGTCGGCGGTGAGCGCCGGAGGAGGGGCGCTCGAGACTCGAGAGCC
ACCGGCCGCTCTGCGGAGGGGATTCGCCCCTGAGCCTTGCTGTAGCTCTC
TCACCCAATCCTGTCTCCCCTCTTGGGTAGATTTCCTCTCTTTTATGTTT
GCATCTTGTCCATTCTGCGCCTGTACAAATAAAGTGGTAGGCGACGCACT
TGTCTTGTTTTTTTGGTGGCAGGGTGAGCGAAATGGAGGCGAGTCGTCCA
ATCAGTGCGTCGCTGGGTGCCATGGGCTCCATTCTGCGGAAGCTCGACGA
GCTCCTGGCGACCGGACACCGGGCTCTGCGGGGGGCTGTGGTGGACGATA
TCGGGCAACTGACCACCGATCTTCACAATCTGCAGAACCTCCTGCTGAAA
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TACTATTAGTGCCAGTTTCTTAGGATACTCCTTCACAATGCAAGTCCATA
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TATGAATGTCCATTGTTAGCTTTAGGAGCACAAGTTGAAGCTGAAGTTAG
CTTACTCTAAGCCCTTGCCGCATTTGTCAGGCTCCACATGACACGTGTAC
TGTCATTATATTGAAATCCCAGCAGTGATATTTCTATTCTATCATGGTGT
CAGCTCTCTACTAGAACTACCTGAATTCCTTGTATGCCATTCTATACCAT
CTTTCTGTTTTGGCTGACGAATCATGTTTACTAAAACTATTTGCCAGGTA
CTTCGTTATAATTGACGACTTATGGGCTACATCAGTGTGGGATGTTCTTA
GTCGTGCTTTTCCAGAGGGTAAATGTTGCAGTAGAATAATAACTACGACA
GAAATTATGGAAGTAGCTCGGGCATGCTGTGGTTATTGCCCTGACTACAT
TTTTCAGATGGAGTTTCTTAGTGACGACGACTCACAAAAATTATTGCTCC
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AGCCAGTCTTATAGCAAGCCGACCTGAAAAACTAGACCAGCTGGGCTTTG
TGCAGAATTCTTTTGGTTCCAATTCGGGTGTGCGGGCGCATCCTACCATT
GAAGGGTTTATGGGACAATTATTGAACATTAGCTTTGCTACTCTTCCACA
TTATTTGAAGACATGTCTGCTTTATCTTAGTACATGTCCAGAGGGCTACA
TATTCTTGAAGGATGATTTGGTGAACCAATGGATAGCTGAGGATTTTATA
TGTGCACATTTAGGGGGAGACAAGGAGGAAGTTGCTAGAACCTATTTTGA
CGAGCTTGTCACTATGGGCCTGATCCAAGTTATGGGTACCAACTACAGTT
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AGCAATGCTACTTCCTGATAAAGTTCGTCGATTGTCACTCCACTTCGGCA
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TAAGCTTCTTCGAGTTTTAAACCTTCATCTTTGGGGTGATGTTGGAAACA
CGAGTTTTGATCTTACAGGAATTTGTGAACTGCTTCGGTTGAGGTATTTG
CAGGTCACATGTAATGTCACTGTGAAGTTACCAGTTCAAATTGAAGCAAT
GAAACACTTGGAAACACTGGAAATAAATTCAAGAGTGTATGCTATTCCAC
CAGGCATTGTTCGCCTTCCGAGCTTGCTGCATCTCTGTCTTCGAGGTGGG
ACAAATCTACCCAATGGGATTGGCTGCATAAAATCTCTCCGTACACTAAC
CTATTTTGACCGTGGCAATAACTCTAAATTCACTTTATCGGGCCTTGCGA
AGCTGACAAACCTGCGTGATCTTCATTTCACCTATTCTGAATTAATGTCT
AGTGAACATTTGAAGAGAAATCTGATAGCTCTGGCCTCTTCAATTGGGAA
ACTTTGTAACCTGAAATCTGTCACTCTGGCTCCTGGTACTGCACGCATGG
TTGTTCTCTTTGATGGATCGAGTGGCATGTCTTCTGCTCCAGTCTTCCTT
GAGAGACTTGAGTTGTTGCCTCCCATATGCATATTTTCCAGACTTCCCAA
GTGGATTGGACAACTCCGCAAACTCTGCATTGTGAAAGTTGCTGTTAAAG
AACTGCTGACTGATGATATTGATATCCTCGCAGGATTACCTTTCCTTAAA
CTCCTCTCATTGTGTGTCCAGATATCTCCCGAGGGAAGGACCATATTCAA
CGAAGGGACATTCCTAGTTCTCAGGTATTTCGAGTTTAGGTGTGGTGTAC
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CTAGCTTTCAATACCCATATCAGCGATAAATACAACAATATGCTTGCTGG
AATCGAGCACCTTTTAAACCTCCAGGACATCACTGGACGAATTGGGGCAG
CTACGGAATCTGACAGAAGGGTTGCGGAATCAGTGTTCAAGGAAGCCATT
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GCTCATCAGGTGAAAAACATGGGGTTCTAGAGAAAGCTGTAGATACGACC
AAAGATGCTAAGCGCGGGTATGAATCTTCCTTACACTAGGAGTAATTCTA
TGCGACTTCGCCCTTTTCATTCATTTCTTGTCCTCTGGTATTACCATTAA
CTTCTAAACAATATTATTATCACCCAAAGACCCTACTGCTATAGCAAATC
TTTGTTCGCAAAAAAGCTGCACCAAATCAAAGCTTAACATTACTTTATAG
CACGTCTCTCTTCTTCTCTCATTGTGCTCTAACAGTAAATTATTTGTTAT
CATCAGTAAAACTTCTTTCGCTAGGCTGGACAAGTTCCGCACTGTTGAGG
CCTACAGAAACTCTTGTTCAACTGTTTTTGTCCCTCAAAAGCGTGTCAGA
ACACGCTTCTTCTGTATTAGAAGAATGGCCACCAAAATTTGGCAAAGCCA
CACAACCACCAAGGGTGGTGCCGACCGAACTGAAAACAAGAAACAACAGC
AAAAACTACGGACCCGGCTGAACTATGTACAAAGGAAAAACCAACAGCAA
AGCTCTTATTCAAGTGATTCGGCCGGGAATAAGGCGGAGGATCCAAGTTT
CTTCAGTACTACTTCTTCGCCACCAACTTCACAAATCACTCTAACTATTC
ATCAGAATTTAGCTTCTGAACGTGGAGAGCAGATGGTTCCGGACGCGATG
AAACAAGAGTATCTGGATAGTAACCAGTCTAATGTTATCTTCAGAACAAT
ATCGGGTGAGAAGATTGCTGCTGAGACTGGTGTGCAATCTCAGATCTCTA
CTCAATCGTCTCCTTCCCTCTTGTCCGCTAGGTACCTCCACGAGTTAACA
TCGATGTTTGCGACCACTGTATGTTTGAAGTACTATGATACAGAAAAAAA
GTGTATTTCCTTCCAGGTACCACAAAGGAGTATATGATTCTACGCCCAAC
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GAGGAGATTGTAAATTTAAAATGGCATCTTGCTAACTACTCAGTGAAGGT
GATTATGCACACAAAGAACCATTACCATTTTTTCCTTTCATTTCGTCTGT
TTTTGGTATCTAATATAACATCCTGCTTTCTTGATAGGAAACCCAAATAC
TTGATGACAAACTTGATTTAGAAAAACGCATTGCACATATGCGAAAGGCA
AGTATCTTTATCTTATCAGGTCAAATTACGATCTTGGTGTACAACAGACT
ATTCTATAACTCACTGTTTTCAGGAATTCGATGAGAAGCAACTAGACATT
GTTGATTCTGCATCAAAAGATTTATCCTACAGGCAAAAACAAATTGAAGA
AAATATGAATCTGGCATTCGCATTACGGGTAACTTTGTTGTCATACTTTC
TGTAAAAGTTCAGAGTCAATTAATATTTTCGATGGTCAATTGATGATGTA
CTGATGTGCTTTGTTTAACCTTACCGTGCATTTGGATCCATCAGAGGAAT
TTTGTTTTGAATGCTCTAGTTTTCTTAAGTTAACTGAAATAATTATGAAA
CTGCACTCCCTTTCTTCTCCGGAAAGCATCAAAACAAGTGAAGGCGACTA
CATGTGACCTCTGTATGAACACAACAATATTGGAATCTATGTCGGAAATA
GGAGAAGTGGTGCTTTATTTTCTTACTCTCTTAGTTATTTTTTAGAAGCC
TATTCTATATGGTTCAGTGTGTTTACTTATCTTGCTTTGTTCTTTGTCAA
GTTTTGGTGATGTAACACAGAATTTTACCTTTTGTACTCCATAGGACGCA
CATGCAAGGAGATCAACTTTTATATGTTCTTTGCTACCTCTTCTATCAGA
GCATAACCTTCAGCCTTCTGTTTTGGATGCTCAGTCCATTGTTAGCAGTC
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TTGATTAATCTGCAAGTTTTCACTAATTGTTAGAGGGATTGCGACTTGAT
CTATTCCGAAGGATTTAGGACCAACATGTACGAGATGGAGTAGGATTAAA
AAATAGAAATGCAAAATACCCAGAGTCCTACTATAGTACAATTTTACCCT
ACCCCCAACTCATTTAACAAACACCTATGATTTCTAATGGAGGCTAATGA
CTTGGCTTAAGAAAAAATGTGGAGCTGCTCCAACCGAACGTAATGGAATA
TGAACTAAATTTCCTTTATGTTTCCTTCTCTTTATTGTCGGTATAATCGA
ATTGATTTACTTTTGCTCACTGTGTCATTGTCTTAGGAATAATCAATCAA
AAGAAGCAGAAGCAGATTTACTTTTGCAAACAACTTCTTTAGCTCTTTTG
TTCCTTGCTTGGTTGAGCTAACCCTATATATTACATAACTTTATATCGAG
ACTGTATTTTCTTTGTAGGTTTTGTTTACGCATTTGCAAACGAAACTCAC
TATTACTGAGGTGAGTCACATTAAGCTTTGGGTTGGAGTCCGATCAGGAT
AAAGTAACCATTCTTATGCTTTACAACTTAGTGCTTCTGCTTTCTCACAT
AACTTTGAATTTTCCTTGGATTGTGTAGGATAAACTGAAGGAATCACAGA
ACAAGATTACTCCTTGGAGTGTTAAATCTTCAACTAATACAAGTGGTCAT
GCACAGTCATCATCTCATCCTCCTGCAAATGCTTATGTTTCTTCATTTTC
GCAAGGTGTTAGATATTGGGATTTATGCAATTTCCTTCTCCTTATTTCTT
CAGTTCTGATGGAAACACCTTTTTTGATGAATATGCAGCTGCAAAGGATG
ACCCACTGCCAGCCATAGATGGGCTAAGAATCACAGGTGAAGCTTTTCCC
GGAAGAGAACTTCGAGCAAGTGGGTATTCCATCAACGGGACCACAGGGTG
TAATTTTGAGGTGGGGTTTATAATTGTGGTTCAACACGTTTCTGATATTC
CATCAAAATCCTGTCTTTTTGAACTTATTCTCAGTTCACTACAATTTAAA
TGTTTGCACATCATTTTTACATGTTTGTAAAAATATTGTGCATGCAGTGG
GTACGCCATCTGGAAGATGGATCAGTAAATTTCATAAAAGGTATTATTTT
TTCACCTTCTTATATGAGGCTTTTATTGGATTTTATTTGGTGTACTATGA
GAAAATAGAAATTAACACTGCCGTCGCCTGATGTAGGCGCGAACGAGCCC
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TCATAATAAGTGGAACTTTGTGTTCTTTTGCATACTGGAACCAATAGAAT
TAGGGAAGGGGCTGGGCGTCCCCGGGGACCCCACCCCCCATCCCCTGGGA
AATACAGAGCGCAACACGTGTTCTAGTTAGCCTCCCTAATTCACCTTTTG
CTTCCTAAAGCACAAATGATGCAAAACAAAAGTTTCGTTTGAAGCGATCG
TAGCGAAAAAATGATACCCACATAAATCCCGCAAAACCCACTTTTACTTC
TATGTAGCAAAAAAATTCCTTTTGCTTCTATGTAGCAAAAAAAAAAAATT
GCCCACAAAATAAAACAAAAGAAAGACATCACCGGAGACACTACCGAGAT
CTCGTAGCAAAAAACAATCTTGTCAAAAACATCGCTGGAAACCTCAACAG
TGACCTCAACGTAGACCTAATTGAGGCACAATCCTTCCATTGTTTCCACG
AAATAAGAGTTACCAGGCACAATCCTTTCCAACTCGGTGACCATTTGCTG
AACTTGCGACTTTGAGAGCCTATCAGCAGTATAACCTTCCAGACTAAGTC
GCCGAATTGGAAATCCTTGAGTCGGACTTTCTTGTTGTAAGCTCTAGAAA
CCTGTAACTTTCGCTTCTCGATGTCCTTTAAAGCCACCACAAGTTTGTTG
GCCGCTTCATCGATGATGTCCATCATTAAATTCTAGTAATCATTGGCCGA
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GCAAGACGGATTTCTATCCACAAATCAACTCGAAAGGAGTAACCTTAGTA
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ACGCCATCTCCTAGGATGATCTTGTATCTTTTTCTTGATCAATTTAATTA
AGATTTTGTTAGTCGATTCAGCTTGTCCAGTGGTTTGAGCATAATAAGGA
GAAAAATTAAGTATCTTGACCCCTCATGACTCCGCAAATTGCTTCACCTC
CTCTGCTGATGTGCCTTGATAGGTGGTAAGACTTTATGGTATGCCGAATC
GATGGACAATGTGCTGAGTAATGAATTGGATCACCACATTGTGGGTCATA
TTCTTGTGAGGTACTACTTCAGACCAGTTGGTGAAATAATCAGTAGCGAC
CAACACAAACCGATGCCGTTTTGATGAAGCCAGGTGTATCATGCCGACAA
AGTCAAGCGCCCACCCCCAGAAAGACCACAATTTCATGATAGGATGTAGC
ATGGAAGCCAGAGCGAACTGAATATCTCCAAACTTCTGGCAGGCCTCACA
TCCCTTGTAGTACCTTACGCAGTCTTTGATCATTGTCGGCCAATAGAATT
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TAAGCACTTCAAAATAAGACCATCAACTATTTGGTGATATAGGTCATGGT
CAACCAATGTGTACTTAAAAGCTAGTCGTCAAACCGTTTTATCCGATTTC
TGACTTGAATACTGCAGATATGCGATGATAGGCTTTCTTTAGTCAGGTTC
TTGATTGTCTCTAGACATGCTCTATTTCTCAATTTCCACAAAGCCCAACA
AAGAGCAGCTACTCCTACCACATGCAGATTCTTTAACCCTCTAACATAAC
AAGCTATCCATCTAAAATACTGGTAAAATTACCCGGTCTATCAGGATCCC
CAATTGTTTAATTTACTACACTCCACATGTATTTAGCTGCAGGGCATGCA
AAAAATAGATGATTGATGATTTCATTCTCATCACAGAACCGACACTTGAT
ATCTCCTCTCCAGCCTCTGCTATACATGTCTTTTTGTGGCAATGGAATTA
TGCAAGATTAACCAAAGCCAAAATTTTATTTTAGGTGGAATCTTAGTCTG
TTTTTCCTCCCCTTGCCAGCAGTCTAATTTCTTAGTCTGTTTTTCCTCAA
TGAATTGTAAGTCTTTGATCCTCATTTAGGATCTCACTCCTAAATATTTG
ATTGGCCAAAACCCCATTTGGCAACTAAAAAGATCTGCATACAGTTCTAA
CTTTATACCATCTTCTAAAACTATTAGGATCTCACTCTTGTTGGCCTTTG
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TAGTTCTTTGTTTGGAAGCTATATAAAAATGTTGATCATTGTAAGCTTTT
CAGTAGGACACTCATGATATTTAACTCTATCTGAATCATTTTTTTTTCGT
TTTGTAGGGGGAGATCGTGAAGGTTTATGCTAATGAACAGAGAAAAATTA
CTTGCGGTGAGTTTGATGAAAAGATATGTATCTTCGTAGATAGTGTAAAC
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TTACTGAGTACATAATCATTACCGGTATCCGTGCAGATCCTGAAACAAAG
GAGCTTATCAAGAATACTCTTTCCATCGGGCATGTGTTGTGTGAAGTTCT
ACTACCGGTATGCTCTCTTTCTCTAGTGGCCTGCAAAAGGCTCAAAGCAT
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GTTTTTATAGATCTGTGGGAACCTGCCCTATTGGCAATAAAGAGGGCAGG
CTACATGATTAAGTATAAGGGAAAAGGTGGTGTTGTTATTGCAGAGAAAT
TCCAGCAATATACGGCTGTATGATTTCGAAAATCATTGTCCTCAAAATTA
CTTTGTTCTTGCTTTTGCTATACTCCAGGTCACAAAGAAGTGTGATTTGT
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TAGACAGATTGGCTGCATGGACTTTATGTTTGCATATTTTCATAAAAATA
TACTTGTGTAATGGTATAATTTTAGACATTTAGTAGGTTTTGCAAATTTA
ATAAAATAACGGATTTAATTTACAGGACTAGAACAGCAAAACATAACAGT
TGTTGTGGTCGGGATAGTAACGTCCGTGTTGGTTTTGCTTTATGCCTTTT
GTTCTCAAACATTGAACTAAATTTTCATTGCATTCCTTGTTGAGCATTTA
TTAATTTACAGGCGACAACTAATCTTGTTCAATGTTTGCAGATCAATATC
TCATATGACCGTCCTAATGAATTTTCGATCCAGTCTGCCGATGGTGCTGA
GTATTATCTCAAGCCTGCAGAAAGCTCCCTGTGAGTTTCACTGCTTTGAA
TTCTGGTGCATTTCTGTAGATTGGTCCGTTGTACTATTACATTTAGTGGT
TTTGCATCATGTAGACATGAAACCTTGGTATCAGAAGAATAACAGTGTCA
GTTTGTTGTGGTTGTCTTTGCACAATTTTTTAAGAACAATGAACTAAGGG
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AGAATATTTTCCTAAGGTGGATGCTTGATTTGTAGGATTAAATTTTATAG
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AAGAGTTTTGAGATGTAAAATTATGTTCGGTTTAGGTATTAAGTGATTGT
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TTCCGAATGAAGGTATGGACATGGTTTGGTTTATGTCTTCTATCTTAGAT
TAAGGAAGGCTCCCGGGAGCGACTGGGACCCTCCTTCAGCCGCCGTCTCT
TGCCATCTCCTCCCCACCCCCTCCTCCTCCTCCTTGCTGCCGCTGGAGGA
TGTCCGCGGGCGACGTCGACAGCGGCAGGGTCACCTCTCCTTCTCGGCCA
GTGGGTGGCGACATGGGACGGGACACATCTGCCGGTGAAGACGTGGCGCT
TGGAGAGGGGCGCGGCCTCGCAACAGAGGCGCGGTGATGACCTTTCCTTG
ACAGCGTGCTCGAGGTGATTGCTTCCGGCGGCGCGGGCGGTTCTCCTCTG
TCACCGAGCGAAGCCTGCCTGAGGGCTTCGGTTTTAGTGGAGGAGATCGG
AGCGGCCTGGTCCATGGGGTGGAGGCATGGGGGCTGCTGTCCTGGGTCAA
CAAAGATGGCGGCCCTAGAGTTCTTCCGGCTGAAAGGTCGTCTATCTACC
CATGGTAGGTCCTCCTCGATCCGGCAGCCGATGAGTGCCAGAATTCTTTG
CCAAGGATCTACTCGGATTGGCATAGGATGCTCCTGGATCTCTGGGTCGG
ATGGGATCTGATAGTGCACGTCCTTACATCAGCCTGTGTGGTTTTAGAGG
GCGCGGCGTGAAGCTTCGTCTTGTCTATTTTTGGATTTTCATGGTTGTGA
TAGAGGCAGAGAATGTCATGGCGACTGCAACTAAAGGACCGGAATATGGT
GGTGAGTGGCCTTGGATGCGATGAAGATATTGCTTGGTGTTCGGTGGCTT
GTAGTAGCGGTCTCGGCAAGTGAGGGTGGTAGCACTGGAGGACTTCTTTG
TTGATGGTGCTCTTTGAGTACCTAGACTCGATTTTTAAGGGCGAAATCCC
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CGGGCCATGAAAACGCCTTATTCTTTTGTAGTCCGAATGATGTCTTTGGT
GGTGGTTTGTGTGCCGTGGCTACAAGTGATTGATCACTATGGCGAGCCTT
TTTCTTCTTTTCTTTCTGTGCTGTGTGCATCCTCAATGGCTATTTAAACT
GTTGGCACAGAGGCTAGGTGTAATTAATATTATATCCTTTGTTAATCGAT
GGCATGCTTTTTTCCGTACAGTCTCATGATGCTTTTTTTGCAGGCTGTTG
AGAGGAGTAAAAGAAGGAAAGAGAGAATGTCAGTATAGTAGAGTAGAGTG
AGTCCAACACGTTGTACAGAATAATTCGCAAAATAAAGAAGACGTTGTAC
AGAATTTCCGTAGAAAAGAAGTCGTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.