Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA000080

[Submit comment/correction]

Sequence	AA000080
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA000080
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGCGCACTCTGTAGCATAGCCCAAAAATATCGCAGACCACGCCCCACATC CGCTGCCTCCTCTCCTCCCCAATCGTCCTTCTCCTCTCCTCCTCCCCGGT CGTCCACTGCTTCCTCTCCTCCTTACCGATGCGCCACCGCCTCTTCTCCT CCCCTTTGTTTCTTTCCTTCTCCTATGCTCTTCAGATCTTGGAGAGGCTG AGGGCGCAGAAAAGAAGCAGCGTAGGATGGTGTAGCCAAGAAGGAGCATG GCGGCGCTCCTCCGCTTTTTTAGGTGGTGGGGCGGATCTGCAGGGGAGAG GAAAGAGGGCGGCAATAGGAGGGAAGATCAGGCTTTCCCTCCTCCTACTC CGCTCTCGCTCAAGAAGGAGGACACGAGCGACGGCAGCATCTTGGTAACG GATAGTGAAGGCGGACGGCGGAGCATATCTCCCCTCGTCTAGCAGATTGT CTCCTATCTAGAGGGGCACACAAATCTGCAGCTACCACCGGCCGCGGGGT GCATGCCTTCAGGCAGGCATACGTACTCCAATGGCTGCCCAGTACTCCAC CTCTCGTTCTCCTCCCAGCCAAAATAACACCAAAAGGTCAGTACTTTAGA TCCCCAAAATAACACCAAAAGGTCAGTACTTGAAGTCTCCTTGAACCCTA TCTTGATCCCCTTTTCTAGGGAAAATTTATCTCACGCTTGGCCTTTTTAG TTGGTGATGTGCTTGCATGTTAGTAATATTTGCTAGATCTGTCTTAATCT TCTAGAAAAAGCAACCTTTTGGGGCAGTATGCAGTGGAATGGCCAATCAT AAATCCTACAACTGAAATTGATTTTGCTACATACAGCCAAGTGCTCTCAT TTTTCTGACGAATGTGTTTCTTTGGAGTCCAGAAACATGCCTGTAGAGTG TACCAAAACGTTCTAGGTATGCAATTTGATAATGTGTATCCATCGGTAAG ATAGTTGGTAGTTTAGTGTAGAGTAGCCTTATTCAATGCTGCAGTGTCAA TAATCTGATTTTCTATATATTTGCATCGCTTTGTATTCACTTTGGTATTT AATTATTTGGTTTTTTTTCATTGCAGGGGCTAGAAAAGAATAGGCAAGTC GAGTGACTGATTTTTGTAGCAGGGAGGTTCACGAGGCTGATGGTATTTGC GGGTTAGGCCAGGAACACCCTTAGTCGAGGCATTACTCCATAAATATAAA GGTAAATGATCAGCTTCCAGTGCCTTACGTCTAGATTTTAGGGTCGGACC ATTGTGAAAATTGCCCATGGTCCCTTACACTTCAGTAGTATGGTTCTCAT CTCATATTTAACAGCTATGGTTGCACATGGAGGACCATTCTTCTTTGCAA AAGATCAAGATCAGGTGTCCGTTGTTTCTGGTGTTTAGGCCTTGGATGTA TCCTACAATATATGTTTTAACAAAGCCTTCTATTTTTACATCGACTTCTT ATATGTACCTTTGCTCCATTCTTTGAGCGTGGTAGCAGGTTGATGTGATT GTTTCGATTTGATGTTTCAGTTCATTTTCTATTTTAAATCGATCTAATAA TTTTTTTCTCCCCTTTGGATTGGCTCTATCTGCTTGGTGGAACATGAAGA GAGCCCCTTTTTTCAGTTCCATATGGTTTAATGTCTTATTGAACAAAATC TGAGAACACTTTCTTATTTAGTAGGAATTTCTTGCCTTTGCCTAGAGCTT GAAATTTGTACCTAATGTTCATTTCATATTATTAGGTGGTTGTGTCAAAA TTTCATCTGATTATGGTCTTAATATCTAGGTAATGAACCAATGATCAATA TGGTCGATACCTATGATTAGCATGCGAGAACAGACCTGAGTGCTATATGG TGTGGTTTGCTACCATATCTAACTTCAAAGGCAAAATCAAGGTACTGCTA TATTAAGTGCATATGTACAGTCATGATTGTTAGTGTTGATTGTTTCTTTC TTAGTGCCTAGGCCATGGAATAAGAGGAAGGTATTGTTTCTTTCGGTTTT GTGCTTCCTTGCATCTTGGTTGCAATTTCCTTGCCGGTTCCCTTTGGTGC AGACTTAATGGATCGTGCCCCTCTGTTTGGCTATTTCAGATGAGCCCTTC TAATCCCTCCATTATTAATTAAGCCATGCAATCAAACCTGGACCTTCCAT GATTAGTCAATTGAGTGGGTTCATGTAAGTTGTAATTTTCAGCTTCCGAC TTCATAATTTTGTAGAACTAATGGCAGACCAACTGGCTACTAGCATTTTT TTCAGTGTGTACAGATTTATTTCAATAACCTGCTAGCTAGGTTTGCATGA ACTAACTTATGTCTTCTTATATTTGACATGATGAAGGCCTGAAACTATAA TGTCTGTATCGTGGCAGATGTCTCGCAATTCATGAAGCTAACGTGTAATA CCTTCTCCGTCTGCATAATTTATTCTTGTGCTGGAGCTATTATGATATAG CTAGGCCTGCCACTTCGTATTATTTTTCTGTACTTGTATGTGCAATCGGT TGAGAACTATTAAATAAATTCAATCGATATTTCCTAATAATAATGACCTA ACAACCATTATCAAGGGTGGTGAACTTTTTTAGAGAAACAAGCCCGTGAA TATTAGTTGACCAACTTCATGTGTGTCCAATGGACTTGTATGCTCCATGG AAATGTATATATGATGCATATCTTGCTGCCACTGAAGCTCACTGCCCCCC AAATCAGTCTTTGTATGATAGGTTTAAGCTAAAGAATGGAAACCATGTAA TAGAGAAGGATGTGTATCTTACATGAAGGCATACTCAGCTTATCCACTCC TGTTTCTATGCATTTTAGATCATAGTGAAAAAAGAACTTGGCACATCGGT CCACATGGCTGCTTATTTATTATGGACAATTGATTAGTGAAATTGTTGGT GATGCTTAGTGTGTAGGTACTCAAGACTCTCTTCATATAGTTGGATTTTG GCTTCTTACAACGCTTTGAACTTGTACCATCTTAAATAGTTAAAACTATA TATATTTGCATCTCAAATTAGTTTGATGGATAGATCAAGCCAAGATTCCA GAGATCCTTAGTGAAGTATTTGTAGATCTTATGATATTCTTAACCAATGA CTTTGTTAAAAATCTCTTTGCATTTATACAGGAAGAAATATTGCCTATTT ATATTGTGATATACTTAGTGTGTGCTCAAGTAAAGCAAAAAAGTCTGCAT TTATACCAGAAAGGAAGAACCGAGATCTGTATGAAATTAAAACTGGGTGG GAAGGGATACACTTACACACATGTGAAGTCTGTATTTTGTTGAGATACGT TAATGCATGGTGTTTATGTTGGTATGTTTCATCTTTTATTTTCGGGCTAT ATGGGCTCCTGGGAATGTCGCTGGAAAGTGTCATCACCAGGTGCTTGGAA GTGGTGAACTGTTCCCATTGTTGCAGCAGTTCAATGAGCATGCCAGGCTG CTGATATTCAGACAACTGCTTTCAACATGAGGACAGTTATGCTGATGGAC CTGCTGTAGGCGTGATGGTTGTTGCTTGTTTTCCTTTAGGCCCCTTATCT GTGTTAGTGGTTCGTGTACCTGATTATTCTCCTGCATTTGACTGTAGAGG CCATGAGATGAGGCTTGTTCTTTGGGGTGATCGTGCGGTTGAGTTTGATG CAGAGGTGATTCGTGCTATGGGATATAAAGAGCAGGTTGCTGCTATCTCT TGAGAACATTGCCTAAGAGACGGCTCGTGGTAACCGCTTTGATCATAATT TTCTTTAGTCACTATATTATTGGTTCCGTGGCTTTGCTAATATGTTCTTC TGTACCTTTTATAATGTGTTTTCGATAGAATTTTTCCCTTATATTGATCT GTAGGTTTTCCTTCTGTTCCGTGTCTCAGATCTTATAGGTTTGTTGTTTC CCGTCACATTGTTCTACTACAGGTATTATAGAGGGCTGAGTGGTAGTTCT GCGTGTCGCTGATATATTGATCAGGACATCACTGATAGTAACTCCTTCCA GCAAGGTCTATTTTCCAGAGCTACTTCCTTACCACTGCGAAAATGTGGTT GGTTTGCAATGGATTGGGCTGTTGATCATACCCATAGGATTTAACAGATT ACCGAATAAGATTGGTTCGTGCCTTTAACCAGAAATAATAGTTATGGTGC CATCATCTGTGTTTGGGTACTAAATTGTGAACACGTACAGGGACTCGCTT AGCCTGTACAGAGTGTGTCCTGCTACATGTATATATATATCTAGACAGTT GCTTCTTTTCCATATTGTTATCCTTTAGTTTTCGTCCATTTCTTCTGTCA GCTAAACTTTCTTCTACGATGTTGTGTTCCTGGTCTAAAAATACTCCTAC ATAAAATTGAGGCTACTGTCTCTCGCAGTCTTTTCTGAACCAAAAAACTA TGTACTTTAGCATAGTGCATAATGGTTATTTTATTTGAGAAAAAAGTGCA TAATGGTTATAGTCTCTGTAAAGTCGCTACTTCCATTAAATATGTTTTGT ATCCTATGTTATGCATGTGCACATATGCCCTTACAATCTAAGGCTGTAGC CTCTATTCCTTTCCATGCGCTTCTTGCTAAGACAGCCATTAGTATTTCCT TTTTAAGAATTACATTTAGTTATGTGTTCATAATTGCCTTGTAATACTCC GTGTTTACTTCAGCCTTTAGCATTTGCAGCTTTAACTTTATTCTCTTTAT AGATACTAGCACCACTGCCTCATCGTTCGTGAAGATAACCAGAAGTTTCA TTGGATATGCCGAAGATAAAACTGACTGCCGTGTTGGTCGCTCTTGTTAA CAACACACCGTGCAACATAGGTCGTGTGCCTTGCCCCCATGCCTACTTTT TACGATGAGATGCTGAATGAAGATATTCCTCGGTGCTTCTTGCAAGACAC GGAGGTTGATGCTGAGCAGTTTGAGGTGTGTTGATGCAGTCTTTGATTCT TTCATGGCTTAGCCCATGTAGGCACAGGCACTATTGGTTGTAATACGGTG GCACTGTACTTCCCTCAAGGTGTATGTGTGACTGTCCATAGGATAGCTTT TGATGCCTTCATCTTGCATGGTTATAACTCATCGTTTGCATCCTTCAGGC ATAATACTATCAGCGAACGTCGTATCAAGGTAGGATCAGCTATTTGACAC ATCTGCTTGGTGCACCACATACGGCAGCACAGAGATTCATATTGGCAGGT TTGTCTATATAACTGTACCGCTATAACAGGGCTTCCACGGAGAGATGTAG CACACCACATGCTCAGCTCTTTTGTTTTGCTTGAGGATGGATATGTGGCT GGGCAGGTGATTGGTTTACCTCTTAGTCTAGATTGATTGTGCTATTTGTA TTCCTGAGTTTATAAATATCAACATACCTTTCAGCAAGACGCCAGACTGA TCATGTTTGGCATAGTGCTATGGAGGAAATTGCATGCCTCTATATGCACT TCATGGCTAATCATGGTTGAGCAAGCTTACCCGTGCGGAAGTTAGGATAT GTGCTTGCCACTGTATTGCTTATTTAACATTCAGAAAACTGTATTGCTTA TTTTTATAGTTAGTACTCTGGTTAAAATCCCTCTATTTAGTATGCCTCGG ATGCTATCAAAGCTATGTAATATTCGGACTTAGTCTGTCTGTCTTAAGTG CAGAAGGATTTGTGTCGTTTGTGTCTACCCTGCCCCATTGATCCACTGGT CCAGTTAAGGCATGTGAGATAGTTGTAAAGTTTCAACCATTCTGGCTACT ATTGATGTAAGTTATTTTTATCTAACTCAGCTCCATCAGTGCCACGAGTT TATTGTCCTTCAGATCCTTTTATATGCGGTATGTGTTTTTGGCTTCGAAA GAAAGATTTCAGTGATAATTATGTTACAGTAACATAGCATGTGTATTAAA GTTGTATGGAAAGAACAAAAAGAATAGACATTCATGAGTATACGATAGTG TATTTGCTTACTGCTTATTATCATGTTATCATTGGCCGAGTTAATAGCAT AAAACTACCACATTTCGGCTGAAATTTCGAATAACCACCACTTTATAATT TTTTTACCAAAAACCACCATTTTATGGCAGATTTGTTGCAAATCGCGCTA AAACAGAATTGATAGTCAATTGACATCAAAACTGACAGTAGGACCCACCT GTCGGGCTGACGTGGCGACACGGGTCAACCGCGCGCTGACTACTATTTTG CATGCAGGTCCTCGAGTTCCGTAAAAAAATTATTCAAGGCCCCTGGAACC TCGCGTTTTTAAAACCTGTTTATTTGAAACGTTCATAACTTTTGAATACG GATTCAAATGAAAAAACTTTTAATATGAAAATTGCTCAGAAATGTTTGAA TATTTTGAATATAAAATTGGTTCACTATTTCAGATAAATAAAATATGCAA ACAATTAAAAAAATGCTTCTATTAATAATGCAAACTTTAAAAATTCATAA CTTTAGTTATATGACTCCGAATAATATAAATAATATGTCTAAATTTATTA TAAAAATCCAACCTATCCATTTCTGACATCCTTCATGCATGTATCAGATC CGTTTCTCTTTGATGTTATAATCGATTGATATTGATATATATATATATAT ATATGTACGTTTACCGTTATAAATTTTAAATATTCATAACTTTTATTATA TAACTCTAAATAATATAAATAATATATCTAAATTTATTAGAAAAAACCAA CCAATCCATTTCTGACATCCATTATGCATGAATTACATCCGTTTATTTTC TAATAACATCATCGCCTCTTGCCGCAGCGCTGTCACCGCCATTCCAGACG CTCTCGTTTAAGATCATGTCGTTGCAGAAGCCATGATGATCCATCTCGCA AACTAGGGAGGAAAATCTGATGAAGAAGCACATGCATGCATATATTGCAA TTAGCTAGCTAGGCAAGAAAACGACAAAGGAGAGTACCGCAGATTTAATT AGCAAGAACATGCATGCATGTGCACACCACACACACACGGACATGGATGA GTATGCTGAATCGACGATGGATGGATCAAATGAGTGACGAGCGTACCCTC AATGCGACGCGCACGAGTAAGCTGAGCCCGAGCGCACACGTGATCTGTGC TGCTGCTGGTGATTGTATGCTAGCTAGCTAGTGACGATGGTGTGGAGCAA CAGAGAAGGAGCATTCGCGCATTAAACGCTCGAGGCAGGGGAGAGGAGGA AGGAAGATGCTAATGGCGAGGAGCCAAATATATATGTATATATCTAAAAT AAACAGATGTGATTCATGCATAATGAATGTCAGAAATGGATTGGTTGATT TTTTCTAATAAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.