Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA045808

[Submit comment/correction]

Sequence	AA045808
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA045808
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CACGCTCCGGTCCCCGACACCTGTTCCATTAAAAACCCTAGCCGCTGACG TGGCCGCGTGCACAGCCACTAATCCTCCCCGTATGCCGCAATTAATTAAT CACTAAACACGGATCACCCTCCTAATCTCTCGCCTAGCCGTTGTTCCGTC CCCCCTCGCCGTCGCCGAAAGCCATTTCTCCTCTCCACTGCGTCATTCCC CGGATTTTTCTATCTTCCACTTGCGGGTTCTAGAGCGATCCGGATCCTTC CAGACCCTTCGGCGTCTCCGCCTTTAAATACCGGTGAGGGTCACACGCCC ACCACAGCAGCGCTCGGACGCACCCAGCCGGCCGCCATTGGCCCTGGATG GTGCCTGGAGCTCACGGAGGATCCGAGGTAGCCTCTTGACCCCTACTCTA TTGCTGCTGCTAGATCTCGCTTCCGATCGATTAGGTTTCTGTGTTATAAA TGGTTGCGTTGCGGCGGTTGCGGTGATGGTAGATCTGGGGTTTAGTTTGC TGTTGTTTTTCGATTTTCGCCGGTGGGGTTCGATCTTGAAAAATGGCGGA TACGTAGCAGATATGATAGATTCCTGTGAGTAATTAGAGGAGGCTGCAAT GCAGATTCTTTTTTTAGTCGAAATTTCCAAGTAATAATAGGTTGAACTGT GGTGTGCTACTGCTTTAAAAAAAACCATGGTGTGCTACAGTGTCTTTTTA GAGCAACAGGGATACTATCCCGGTCCCATGTCGGCAATGGAACCTGCAGG TCTGATAAATCCGCACAGAGCGTCATTCTGAAAAGGAGACCAAAAGACTG AAAACTACAGCTAGAAGTAGTAGATACAGGTAAATTTCACATAAGCCAAG GCGCAACAGAATCAGACCCTAGCTGTGTTTCATGCTGGGAGAATAGGCTT CACTATCTGTGTTCTGAGAAAATCTACCAGTTATTTGATGATAAATATCT CCATTTTTCAACTCCTATTTGATGAAAAGGTCTCATTTTCCATATCGTTA TTTTTAGTAGCAGTGATGCTGTGTTCCATTTGTCACTGTACTGCTCGTTA TTCAGTAAATTGATAGAGGTTGAGTACTTAAGTTGCGGTTTGCCTTAGTG TGTACCCTGGAAAGCTAAACTGTGTCCCTGTTGTCATTTTGACAAAGCAG CTAAAATGTGTCCCTTCTCGTTAGCATTTTCTGTGCGGTAGCAGTTTCCC AATTTTCCTTTTCGTTGGACGCTACGTTAGTATGCTCCCCTTTTGCAACT GTACTTCACTTAGCTGAGATCGCTTACTGAATATTCTGACGTTGATGGTC CTTTGCTAGGCTAGTAATTGCAGGTGGCGGCACCAAGCATGAGGTAGTAA CTGCATTACTTGCTGGGAAGCCGCAAGTAAGACACTGAAGCTGCATAACT TGTGGGAAAGGCGCAAGTAAGACACCGGAACATGTTATATTTCTTCATCT CAGTATGCATTACTCCAGTGGTTTTGATCCTGAGAAGGAGCTATTGTTCT CCAACTGGCCTTTTTGGCATGTAGTATTGAGAGCTGGGAAATCTTTTTAA GTTAATTTTCATTGGGAGACATATTTGGTGCTATAATACACCTTGTTGGA GCCTATCTTTCTTATCATATTTGTCCATGTTCGTAGATCTCGACTTGCCA GCACCAACTTGAAGTATTTACCAGCATGACTATTGCTTTATAACAAGAAC TAGACAAATCAATGACGATTATATTCATTTATGAACTACATAACAACTTC AGTGTCATATGGGAGCAGAGACAAGCATTCCTAGGCTCCTAGCTATGAAG GGACTGCAACTTTGTTGTTTGTCTCTGAATGTAGTTACGAGTACTTCGAT ACTTGTTTCATCCATGTACCTCTGTTAAGTGATTTTACAAGTACCCCAGT GTCTCAAAAAGTTTTGAGCACTACAACAACTTAAGCACCTCTGTTAACCG CAACCACCATACATGTGAACCAATGAGGTATCATCTCGAACTTACCAACC CACAGAACCTTCCAAGCAAGCTCCTTACTTTCGTGTAGGACAATAATGAT CTACAGGTGACAACATCGTGTGACCCTGAGAACACGATCATGTTCTCAGG GCTGTTTGTTAGGTTGGACATGCAGGGTGACGGAATCAACAGATGTTAAA TCAAAATGGTATGGCATTCACTTGTCATTGCCAGGTATTTTGTGTTTCAA TAACATATAAGATTAAGATGCACACAGACAAACTTCGCAACGCAAAATAT ACCCTTTTAACTATGTATAACCGTAGCTAAACTTCAGTCAGCAAGAGAGG GTTGACTATGGGTCTGGTAGACAGGTCACTTGGCAGCCAGCACGGAAGGT GTACTCACTAATTATGTAAAATAACAAAGTAACAAACCCTGCTACTTCCT CCCACCTCTTATTGCTAGAGCATCTAAAATACTATTTCAGCACTAATTAA CCTTTGGGCTAATGATGTTACAGCCAGTATCATTACAACAACCATTAAGA TGCATGTTCAATACAGTAGAAACTCTGATAACATAACATGTCTGGTTTGT AGTCTGTACAATAAAGCATCTTGTTTTGAAAATGTGGAATGCCATGGCAA TGTCCAGCTCGTACCAGATCGTCTTAGGTCAGTTGAAGTCTGCTACATTT CAAGGTTCTTGATTAAGTATACACTTCTTGGAATATTGCAATTTTGGATT CTAGAAAAAGAATATTTACCCCAATTCAGGAACACCTGCTTTGTTGTGCT CGTGTTCCTTTTGTTGTGATTGACTCGGTTCAGAATCAGCAGGAATATTT GCAGCTTGTAAAAAGCTGTAGGGAGTGCTAGAGCTTTTACATGTCGCTTG ACACCTCTGAAGCTGAAATTTTTAAGCTGTTAGTTTCACTTGTTTCTAAT AATGTGGCATTGTTTGGTACAAGCTTCTGAGAAAATGTCGTTCATTAAAC CTTTCTACACAGTTCCATTTTTTGTTGTGACATGACGTTCAAACTTCGAC ATAGTTCCATGTTTTCCTGTTGGATTAGACCTCCCTGTTGCACAGTTAGT TTAAAATTGGATTGTTAGTAGTTAGTGCAAAGTACACGCTTTCTACTGTA CTGATTTCATTGAAATATCTAAGGGCATTGGTTATAGACTGTAGTGACAA ACCTTCCTGTGTAACTCTTCAATTTCACTTGTCATAATGTGGTCCTGTTT GGTAGATGTTTGCTGCATCATTAGATTGAAGCAAACAGGGGAACACTAAA TTACAGATAATGAAGAACACTTGTAATGACCTTCCTTGTTTTGATGCTGC GTAGACTCATTTCAAGCCGATTTTCTAAACCCTGGAGGCCTGTCACACCT AGGCCAGAAAGCTCCTCTCCCATTAACTGCCTATAACAATGCAAACAATT TTGTCACAGTAATTCATGAATACACTTGAGAACATTCCCTAACTAAATGT CACCATGCTACAACCCTGTTCTGCTGACATGGGTTAAAGTAGAACAGCTC ATCTTGTTTTCTGAAGAGAGTCACTGTCAGTTTCCATTTCAGAACAGTTA TTACTCTGTGTGTTATAGTTTATAGTTTTTTTTCTTTGTCCTGACTGGTG AAGTATTCTCTTCTGTTTGGGCAGTTCTTGCAGAGTTTTCCGTGTGACTT CTAAAATTATGTATAAAATCTCCTTCTGCACTGATGGTTGTTTTTTTCAC TGCAGAATCAATAAAAGATTATCATACCTGTGACTTTCTTGCAAGTTGTG CAGTTGCTGCCTCAAGCTTGCTGCCTCCCTTTGCCAGAGCTATCAGCAAA ATAGGAACATTTGTCAGTTTCCTTAACTATAAATTTTATATCATAAACTT AATGTACAAATAAACGGCACAATATGTTAATGATAGTATATAAATACCCA GTAACTGATATGTAATTGTCATGGCATTAGGCCAGTTTGATCTACTTGCA GTACATACAAGTCTAGCCTTCTCATTTGAGTTATGGAGCAGACATTGACC ACTGATCACCTTGTTAGTGCAGATTCAGCCTCTCAAATTACATTATTCAT TTACATAAGTACATATACTCTTTAGTATTTCAGGGTTTCAGATTCCCATA ATTTGCTGAAAACAATATTGGTACTGTAATAGTTGCAGAAAACCTCTACG CAGATGAGAACCTTTGCCCTGAACAACAACAAAACAGCACATCATGTGAC TGCACACTTGTCAGCTTCCACCCTGCATCTTGTCCTCTCTTCCATCCATT TGAATAATCCTAATTAATTCAGGGGCACTACTATGCATACATGTGGTCCC GCTAAGTCTCTGCACACTTCCTTTGAAACAAAGGCTATAATTTCCATCTT GGCTCCTAAATAGCTCAAGGTAAAAAAGGAATTGTATCTCCAGCAAGTTA AGGTGATGATGGGCCTGGATTGCATGCACCTGAAGGTATGGCTTTTCCTT TTGGTGATTATTGTGTTGTGTTTTGGGTATCTTTTGGCTGTGCAACAGAT CAGCTGAGTCAGATATTGGCTCACTTTTTTGCGTATTTTCATGTTGCAAA ATACGATCATGAAACAAGTGGATCCATGATTCTGCCCTTCTCTTACATAT AGCAAACTGGTCACTAAACAATGGCAGTATAGGGTAATGTTTTAGAATGC ACAAAACTTATCAATTTATTCAAACAGCTCTCCTGGTCCGTGATTTCGTA ACATAAGCACATAATCATCATATGCAAGATTTTGCTGGTGGATGGTTGTT TCAAACATAGTAATCACTATTCATCATTGTTTCTTCAGTTGCCGATATTT GTACCAGATCCGATTAATTTGCGAAGGATCCTGGTGTTCTACACTTCACT AGTTTGCAAAATGTCTGCTCATACTACTGATGGTATCATTTGAATTCTTA GAAGCATTCTATTGTACGACGTAAAGGAATATCTGGTGTCTACTCTAAAC TTCTAAGCTGGCACAACAGGTATGAATGTGTGGTCAGTTGGCTTCACTGT AAAAATATGCTGTGTGATAACTTTTGATTGCACATTTGTATTATAGGATC TGTTACAGAGTAGCAAGGTGCAGTGCAATCAGTCTAGTTCTTCAACAAGG GGTGCTGCGTCAAATACACTGTATGTATAAAGTCAAAATATCTCATATTG ATCATTTTGATCTACTCATGTACTGTGTGTTAATGTATTGTGTGATATGC CTCCCCAGGGCCCAGATTTTGACCCTGTTTCCAAACAAGATGGTGGGTCA TTGGCCGTTCTCATATGCTGAGCTGCTGAAGTGGGGCTTCATGATGAAGA TGCATGCAACGGTGGCAGCGGATGAGTTTATGAAGGCTACAGGGCATATG ATCAAGTGCCAACTGCCAAAGGACATGCCCCTCAATCTTCGCCAAAAGCC TGTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.