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GrainGenes Sequence Report: AA019496

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Sequence
AA019496
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019496
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTTCTCCGTAAAGCATAAAGACCCCAGATTCCAGTCCCGAAGAGCAAAGA
TGTCCAGGAAACAAGCACCCCCTTTCCAGCTCTAACCTCTTCTTCTTCCA
ACGGGAGGGAAGCGAGCGGATGGAGCGGCAGGACGATGGCAGCGGCGGCG
GAGGCAAGATCAGGATTGGTGTCTGCGTCATGGAGAAGAAGGTGCGCACG
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CAAAAATAGGCCTACTCTAACACAATATTTGTTATAATTATATAGCATAT
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CTTCGAATTTATTACTAGTATATTTTCCCATAATGCTGCTCTCCTGCGTA
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GCAAAGCTTTTGAACACTTCCTGGTCACACCAAGATTGCAATCATGCTTG
TACTATGTCGTCCCCTAATGTACTCCCTCCGACCCATACTAATTGACTTG
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ATCATTTGTCGTCTCTTTTCAGTTTAGCCCCTTGGTTATTGTGAAATAAG
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CTGCATCATCTGCTCCCTCATCGATGAGCCGATCTCGTCCTCCTACTCCG
GCGCGGCACGCCGCCGTCGCGGGAAACCACCGCAGGCCGCAGCCCCCAAA
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CAGGGAGAGCTCTAATCTCCATTTGAGAGGTCGTGGTCAAGAACATGACA
TGATCCCACGATTTAGCCAGCTTTTCCCTTGAGCAAGCCCAACAAAGTAC
TTGCTCACTTCACTATTTGAGAAACTTGAGGCATCTTCCAACTTTCATTG
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GATGAGCATCGCTTGTTATTTTTACCTCTCATAGTCGTGAAAGGCTTGAA
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AATTAACAACTTCTTGGCTCACTTTCTTGGGCGACTAGCTTCTTATCCTT
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TGGCGGTCCCAATCATGTTATGGGTGACAAACATGCCTAGAACATCGTTG
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GTTGAGGGATAGCCATTGCTTCGAGAAACTTGTCCACAACATCGGGATCT
TCCATCGCACTTACATATCCCTTCAATGCAACCGCAATCTTGTTGAGTCT
TGGGCGCACAGCTTGATGAGTCTCATCATCTTCACAAGCGAAACAATCAA
AGTTACTTCTCAAAAAATCTCGATTGGAATGCTTGATGTTTGGGTTTCCT
TCATGCATGACTTCAAGTGCATCCCAAATTTCTCTGGCACTGGTGCATGT
GGCAATCAAGGGGAAGATCTCCTGTGACATGGCCTTTTGAAGCATATCAA
ATGCCTGTGCATTGAGTTGGCCATATCCTTGTTCTTGGTTGGTGAGATCC
TTCTTATCTTTGAACTTGAAACCTTTTCTACAATTTCCCAAAGAAGGTGA
GCACATTTATAGTGAGACCTCGTAGACATTTTCCAATGTGCATGTGACAT
CAAGAGTAGGTGCATGGTTGGGATTGTGAATATGCAAGGTGGAGAATAGT
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CTCATAGCTTTGAAGTCTTTTTCCCCCAACATATCTAAGAACTCATTGAA
GAGAGCCTTCTTATCGGCCTCATCCAAAGGAGTCTTACTGATAGTGTCTC
ACATCCTTACTCTTTAGGCGCTAGGACGGGAAGCCCTAATAAAGAGTCCT
TGCCTCTTATACCAATTGAAGGATCATGGATGGTCGACTAAAGAGGGGTG
AATACGAGACTACATGAAAGATGCATAAACTTAAAACTTTCATGATCTTT
TTCCATTAGGAGTCTCCTCTAATCAATGTTTCCATTCCACGGGGCTAGAA
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GCACTGATACATGCTGCCAAGATGAAAATTCTGGACTTGGCCTCATTGGT
CGAATCTGGCAATGAAGATGCAAGTCGGATTCCTCGTTGGAGCTCATGTG
AATACTAGCATCCTCTGCACCTCATCGCTGCAAAGTTGATGTTGCGTGTG
GATGATCTCTTGGCTGCATCTGGCATAGAGGTTACAAGGGACTTGGCTTT
GGCTTTTATTGTGTTTGGCAACCTGCCATCCAGTGTCCTTTTTTTTGCCG
ATTTTATAGGATTTGTAACAATGTAGTTGTATGCATCATTTAGTTGGCGC
ACGGGCCAATGAAGCTTCCAATTTCTAAAGAACTTCTGTAGTTGTATGGC
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CTTTCGTTAACTGAAAATGGGTAAACATGAAGTCGTTGCCTTATGTTGTA
GGTTTATACAGTTGGGCCAGGATATGCGCATGCTGAAGCTCGTAAATCAC
CAGTTGTAGATGGGGTTGTCATGAGGAATTCTGATGGAAAGGAGGTAGGA
TTCACCTTATTCTATCATTTAGTCTTCAGTGTTTGACATGCTGAAGAGTT
TAGCTCCTTCTATGTAAAACGGTGAGTGTGTTCCTCTATTTGCTGTTTTG
CCTTAGTGTAACAGCATTTTAATGTATTTGGTATCTTGCCTGAAGGTGCG
TTATCCTGTTTTACTGACCCCCACTGAGAAGCAAATTGCATGGAATGTTT
GCCAAGCCTTCAGACAAGCGGTATATTCAAAAGTTTTCTAGCTATAACAT
CTTTTTGTTTTTTATTTCTATTTTCTGTCTAATATGATGGAAGTGTGCAC
TGCTTCAGAACTTATGGGCTGTTGGGTATCACTTGAGAAGTGGATACAAT
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AATGAGCAGAGTTTGAGCTCCAAGCTATCTGAATTTCCATGTACATTTAC
ACCATGCTACTCGTCCCTCTTTCTGTAGGTATGTGGCTTTGATCTCCTAA
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TATTGTAACTTTTTCATTCATTAGTATGACCAGAAGTCCTTAGCATGTCT
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TAAGATCATGTATAGCACATCACCATCAAATTTTGTACGATAATTGGGGT
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CGTATTTCTCAAAAATCACTTACAGGTAATATCATGTCAAAAGTGCATCC
AAAATGCCGTCAGTCACAAGCAGGGCCTGCACTATGTTCTCAGCATCTGA
TCGCCATAATGCTACTACCTTATTATTGCTCTAATGTTTGGAACATAAAT
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ATTGCTATGAACTTCAGATCTGGTCGTGAAAGTGATAGTGATGCTGAAGT
TGAGCATGCAGAGAAGCTACGACAAGTTAGAGCAGTTCTTGAAGAGGTAA
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CATGGCCTTGTATATCATGTTTACCTTCAACACAAGCATAAAAGGCATTC
TGCAAATTAACCTGTTTTATGAGAAGATACTAGCTTTTAATGCTGCCCAA
AACTCGAATGACATGCTTAGCCGCAGGTTCAGTGTGTTCATCACGATGCA
TTAGATGTCTATTTCCTTAATTTATGCTTGACGGCACGTACAAGTACACG
ATTTCTGCTAAGAAAAATGTTATTTATCCAAATTTATCGTATGAAACGCA
CTTGTGCTAAGTATATAGGAATATGATAGTATGTATGTATAATTTCCTAT
TACTACATGTATATACATTAATACATGTGTGATGTGTTGTGCACGTTTTT
AGGTCCTTGGGTATTATTTCCTTTGCAGATGCAATAATGTTTGCTTCCAT
TAAAAATTAGTTCCCTGTGGCCTTCAGGGTGGTTATTTTTCAGGTATTTA
TAGGAAAGTACAGCTAAAACCATCAAACTGGGTCCGCGTTCCTAAAAGTA
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AATGGGTACCTTGCCAATACAACTCACTTAGATGTTATGCATTGTTTGAT
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TCATAAACCTTGGTCCGTTTTCTACATGACATTGTCTACGTGCAACATCA
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ACTGAGTAACTAAACATTTTCCATAATGTATACCTCTTAGCCTAAACTTC
ACTGCAACAATTTTTCTTAATATTGCTGCTCCATGTGCGCCTTTGGCTAC
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CAGTTGTTCTGGTCTGGTTAGGTTCAGCTTGTTCAGTTCAGTTGGTTTAC
TGTACGGGAAATTGTATGTTGATGTGTTTTGCTTATCATCTCCTCAAAAC
AAATCTCCTTTCTTTTCTTATTTTTAGAGAACGGGTAAAAGCTTTTCAGA
TCTTAACATTAAGCAGAAAATCAGTCATAGACAAGACCATAAAATCAGTC
ATAGACAAGCCCACAGGAAAGACTCACAAAAGATGGCTGAAAGCAAGTGC
CCAACGCTCAGATTCCACTTTGAATCCAACTAATACAGATGTTATGCCAT
TGGATCCTGGTTAAAAGACCTTGCTGTTGCACTCTCGCCGTGTAAACCAA
ATTTTTTATCGCTCTCATTTCCATCTTGATCTTCAGTACCTTATGTCCTT
TTTTTTGGCTCTTTCAATTTGATTTTTATTTCAGTTCAGACTTCAGTAAA
ACAACTCCAGAGTTGTTTACCATCTGAAAGCACAAAATCAGCATAACGAT
CTTCATTTCCTTAAATGGCCAGAACCACTCGCTGTCATTCATTCCATTCC
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TCTGGGATTATCAAAGTTAAAAGACAAGGAATATTAGTATCAAAGTTAGA
AGACAACGAATATAAAACATAAACAGTTTCCCACTTCTATGTTATGTTTG
TATGGTATGTCATGGTGCATACCAGGTTTTACGATTTCGGAACGGGAACC
AAAACCGTCAGCAGGCCAGTTCAGATAAAGCAGCTTTTTTTGCCTGTTTC
CAGTAGAGAGTTTATTCTTTGCAAGATCGATTGCGTGCATAATCCGTTTG
AAAGGGTAAAAACAATGAACCAATGGAGATTCAGAACTGGTAGGAATTTC
TGAACCATGGTCCATATCAATTGATACTGACAAATAGATCGAAGAATTTC
CCTGTCATGTAATAACTAACTCTTATTCTGGGTTTCTGTGGATACAAGTA
CTCGTTGAACTGGTGGCAAATTTTACTTATATTTGCATTACAACATGGTA
CCACGTACATGATTTAGGCGAAAGGTATCTCCATTTATATTATTAACTAG
CAAGTCTTGTAGTTCCACTTTTGGTGAGTCCATATTGGGTTGTTTTAGTG
TTATATCTGTGGCCTCTATGACATGCCGTAGAATAGTCTAGCAACGAAAG
TAATTGAGTTCAAGTGGCTGTTTGGTAAATGTACCACATGGTAAGTGGTT
ATGATGTGACTCCTTGGTAGTATTTTGGATGCACATGTATCCAGAATGTA
ACTGGCATTGGTGACACTCAGTTGGCTAGAGGTGCGAGTGCCTTCCCAGC
CCAAACGGGTCCGATGCTTGACCTCTGTGGATGTACTCATGGTAGTTTCT
ACTAAAAAATCCACTAGTACTAGTGCCTGTTGGTCGAGTTAAAAAAATAG
TGATAAGATTGTTCTTTTGAACCCAACTGTAATTTTGGATTGGTTGCTTA
CATATTTGCTGTTTGATTTATTATAGATGTCTGCTGCAGCTTTTGCAAAA
GGTCTTCTTGATTTAGAGGGGGAGTTAACTCCAATCCTGGTCTGTTCCTC
TTCAATAATAGATGTCTGTTGAGCAAAGCAGAACCTTAATTCACTGGATT
TTGCTGTCTCCAGGTTTCACTTGTCAGTAAGGACTCGTCTATGCTTGATG
GACTTCAGGATGGTACTATTGAGATAAATGAAGCAAAGGTCTCCTTCAGC
TACCAATACCATAACTCATATGTAAATATTAGTTTGAACCTTCAAATTGG
CTTGCCGATGGAACCAAAATAGCCATGATTTGCGTCTCAGCCTCTCAGGC
TATGCAATATTACTCACAGTACCCACTAATCAGATGGCATCAACTAAAAA
AAATAGAGAGAAAATTATAAGTGTGACATGATTTTCAAAACTGAAAGAAG
TGGAACAACTAGATTGTTGGAGAAAAAAAATCGAACCAGTTGTGGGAAGT
TCTTCGCATGAACAAAGATAAGCCAGTGAAACTATCACTAGATCTTGGAT
ATATGTTGCTCATAGCATTCCATGTTGATATTTCCAGTATTTCTTAAAAG
CCCGTACCCTGCAGGCTCGGTTGCATGATATTATCATCTCTTCGAAAGTT
GCAAATGGTAGTGAACGTGCAGGATTTCCATGGATGGTTGATGGGGCTGG
AGTGTCTACAAATGCTGCTCAGCTTCTAACAGATTTGGTAAATGCATTAC
ATACCTTCTCTCATTTCCCTCGAATTCTAGATTTATACTGTATATTAACA
ATTTCATGGTTCTGTGAAAGTAATTACTATATGCTGACCTTGTTGGATTG
ATCCCTATTCCATGAAAATAAAAACTCCTGCTTGATCCGGGAACCAATCT
TTGACTCCAAATTGAGCTGTGGGCACCCTCATTGTCAATACCGGTGCATG
TTAACCTGGAAACTGGTTGCAATGCTTCTTCATCTCTATTTCCCTCCAGC
GAGTCAACCAGATAGTCCAGAGCATGCCAAAACTACCTCATTTCTTCTCG
CTGCACCACAAACATCCATCAATATCTTCAACATACTTTGGACCCATGTG
TTGACTAGCGTTGTGACTGGCCATCAGGCCATGGAAAATGTGAGGGAGGA
AGAGACATATATTCCTTAAATTATGTCCATTATAATGATGGTAACTAGGC
TGTCCTTGTCTGATCAGGCTAAGTTGACAAAAGAAATAACTGCACAAGTG
AAGCTGCTTTCTGATGACGAAAATGAGGAGGTTGCGACAGATAGTGACTC
ACCTAATCAACCTTATGATCAAGCGAAGGCACTATGGAGGACAGCAATTG
ACATGGACCGCATCGCTGCTGGTTTGCCTTGTGGCAGCGAAAGCTTTCTT
TTGATGTTTGCCCGTTGGAAGAAACTCGAGAGGGAGTTCTACAACGAAAG
GAAAAAGTATGTTACCCAGATTTAACATTCTTGACGAGTGCTTACCTGCT
TAGAAGTTCTTTGAAGAAAATACAGCCTACTTTAACCATTGTCAAAACTC
CCACTACAATGCAGGCGCTTTGACATTACGCAGATTCCTGATATATATGA
CTCTTGCAAGTAGGTAACAGTATCCTCATCAGATTAATAGTTCTGTTTGG
GTTTTCTTACTAAAAGAGCAGAATATGTGTTGTATCATACTCTTCCATAA
AATTATCGCCAACAGTTCCACTCTAAGTTGTTTTGTAGGGTGTGGGATTG
GAAGAGTAACACACATCTTTCCTGAAAGTTAGCTGTAACATAATTTCCAC
TGTTCCTCTTCCAACCAAAATTTGCAAACAGCTGCCACCTTTATTTTCTC
ATACAGATCAAATGAAAATGTTAGGAAATCTGTAGCCACCAGCCTTTTGG
TGTCTGGCCACTTAATTAATCTTTTGTCGCACTGTCTATATTTCCATACT
CAACTTCAGACCTACTTGAACAAGAAGAGTAGGTTAATGGCCTACTGTAG
AAGTCACTTGGTAGACCTTTAACTTCACTGAAGGGTCATAGGACAATAAA
TTTCTGATCCTCATACTCTAACTGTCGAATTCCCAAAGATGATCTAAGCT
CTCCTACAAGTCTTTTTAGCCTTTATTGGTGTTATATGCATGCTGGATCA
CTTAAAAGTTCATTTGGAGGCATTGCAAAGAGAAAAAGAAAGAAATATAC
TTCACCCTACTAACACTGCATTGCCTTCTTGTTTTTCCTGTTTGCTTTCC
GATGCATCTGCACCTGTCTCCATGCATGCTTTTGTAGAAGCTGGCAGTTC
TTCATTTCTGCACATCATCTTCATGACTTCACTTTATGCCGACGAGTCAT
TTTTGTCTAATAATATTGTATATGACAGGTATGACCTTCTGCATAACTCA
CACCTCAACCTTAATGGTTTGCATGATCTCTTCAAAGTAACTAAGGTAAA
CTGAAACAGAACTGATGCAATACCCACTATTGATCAGTTAAAAGTGGCAG
AACGGATGCAAACAGTGTAACACAAAAGGTGTGAATTGTGAAAAAAAAAT
ACTTATTAAAAATGTATTTCCTTGCTGGCTTAACAAAATTAAGTCTAGAT
AAGAAATGTACCTGTGAATTTGTTGCTTTCTTATTCCAATGCTATCTCTG
GGTCCACTTTCTTCCCTGCATTTCTAATTCTTTGTTATGTTACTATTCCA
CTCAGTTGCTAGCTGATGGTGTCATTCCAAACGAGTATGGGATAAATCCG
AAACAAAAACTCAAAATAGGTTCAAAGGTACTTTCTTGTGCATTAATTCG
GTAAATTGAGTTTGTTCTGTGTGCTGTATCTTTGTATAGTTGTATGTCCA
GTTGTTCATTATGCAATATTTATTGTGAGTAAGAAGATGGAGATGCTTAG
ATAGGGAGGATACTGAAAATAAAAAGATCGATAACGTCTGGATAATCTGC
AGACATTCTATTAATCGAGGCTAGATTTCTTTTTTACACTTTTGTTTTCT
GGTCGAGATCATCGCAATCTATTTCTTCTGTCCTTTTCTGCAGATAGCAC
GCCGTTTACTAGGCAAGATTCTGATTGACCTGCACAACACCAAACGAGAG
ATTACAGCATCTAGTACGTGTCATGAACCAAAAATAACATCTTCTACAGA
TCGGAAGGAAAGAAGTTACTATGATAGTGTTAGGAATAAAGGTTTTGAAA
GATCTAGCGCAGATGAGAAGTCAGTTGATCTAGATTCTCATAAAGAAACA
AAATACTGCTTAGATCCAAAGTAAGCATCTTACTACTAATTCTAGTAATT
TTGACTTTGAATGATACAAATAGATATGTTAATAATCTGCAGATATGCAA
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TGATGGAAAGTTGAGTTTTATAACTTGTTTATACAAAGCATCATAGAGCA
ATTTCGAAAATATTAATCATCTCATTTTTTACACTAAAAAAATTACATGT
GATACGTGTGTCGTGTCCTAGAGTAATTTCCATGTTACCATTTAACTCCC
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AGGTATTTAAAATAATTCTTAGCCATGCGTTTGGGTCCTTGTAGACTTTA
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AACTGTGAAACCTATCAGGAAATAGCTATGTAATTTCCGTTTCTTGGTAT
AAACAAGTTATAAAACTCAACTTGCCATCACCATACCTGGAAAATACAGA
AAGCATTCCCGACTGAAATGCCAATAAATTTTCTAAGTCAGTTCTTTAAG
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AATGATGGCATACAGATACATTGTGCTTGTGATGCTTCTCGGATTCATTC
TATGGTGATTGTGTAAGTGAATAATATTGCTGGTTCGGTCCTATAGCTTT
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