Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA038101

[Submit comment/correction]

Sequence
AA038101
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA038101
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACAGACCAAACGCATCCATTATTTGGCAAATTTTGGTAACCAGTTTTGC
CATTGCTAAAAAAATCAATTCGTGATGATCTGGACGAAGATGATCGAGAT
GATCTGGCCGTGATGAGGGTCCATGGATCCGACGGTCACGAAGCCTCGTC
CGTCTGTCTGGAAGGTTCCACGAAACCCCCAGGGCCATCATCACAATTCA
TCACAGCGAAAAGGCCAGAGCTAGCCCTCCCCACGTTTGGACTCCGCGTC
GGCCACGACTCGCTGTCCAGCGGAGCCCACTGCTCAGTGTCTGTCACCCT
CCTCTCTACCTCCCTCGACTCCATTGGCTTTGGCGGCTGGCTACAAAGAC
GAGGCGAGCACGGCGGAACCGCCTACCAAAACCCGCACCCGTTAAGCGCC
TCCTCCCTTCGCCACCCATGTCGGGCCCGCGACCCGCCGCCGCGCCGAAC
CCTAGCTCCCCGTCGCGCCCCCAGCCCCCTCCCCCGCCGCCGGCGTCGGC
GCCCGCCAGGATGGCGGCCAGGGTGCGCGAGGAGGGCGAGGTCTCCTCCG
GCCCCTCCGACGATGAGGTGAGACCCCAGTCCACGTCGCTGCTCCGATCT
AGCTGCTGGTGGCGCTCCGCGTGTCGGTGGAGCCGTGGGGAAGTAGAAGT
ATCACATCAGCATTTTGACTTGCCTCGCGTAGGGTTTGACCTCCACTGGA
TTGGAGTAGCCGAGATGTTTACGCTGCGTGCTTAGTTGTACTACTAGGAC
TGATGGCCGCGTGCGGTGCTGTTGATTGGGGGCGCTGAGATATATCCACA
GTTGTTTGGGGTGAGGTGGGTGCTGCTCACGACCTTATCACTTGGTTGTT
GGAACTAGAGTACAGTTTTGACACGAGCTTGATGTGATGTGATATGCCTC
TGGGGTTATGGTTGGAGCGGTCCTAAGGTCTACTTAGTTGGAGCTGTACA
AGCAAATAATTAGTACGAATTATGTGTTGACTTCCTACCGAGTACCGGCA
ACCCTTCTGCCGCTACGCTTACACCTGCCTAGATTCTGGTACTTAGTTGA
AGCTGTACGGGTGAACAATCATTGTGATCCGCTGTTATTACTAAGTTTGT
GTTGGTAGATTTGGTCAGGATTGTACCGTAAACTGTGGCTCTCGTGAAGT
TTATTGTCTGGGGTTATGGTTGGAGCTCTTCTAAGTTTTACTGCTACTTA
ACTGGAGCTGTACACGCAAATAATTAGTACGCATTATACGTTACTTTGCT
ACCGAGTACTGACAACGCTTCTGCTGTTACGCTTACACCTGCCTAGGTTT
TGGTACTTAATTGATCCTGTATGAGTAAATACTCGTTGTTGATTGTGTGT
TCTGTTGCTATTACCAAGTGGTTGTTGCTGTACACGCAAATAATTAGTAC
GCATTATGCGTTACGTTGCTACCGAGTACTGACAGCGCTTCTGCCGTTAC
ACTTACACCTACCTAGGTTTTGGTACTTAATTGATCCTGTACGAGTAAAT
ACTCCTTGTGAATTGTGTGTTCTGTTGCTATTACCAAGTGGTTGTTGATG
AACACACAAATAATTAGTACTCATTATGCGTTACTTTGCTACTGAGTACC
GACAACACTTCTGCCGTTACGCTTACACCTGCCTAGGTTTTGGTACTTAA
TTGATCCTGTACGAGTAAATACTCGTTGTGAATTGTGTGTTTTGTTGCTA
TTACCAAGTGGTTGTTGATAGATTTGGTCAGGATTGTACCATGAATTGAT
GGTACCGTGGCTCTTGAGAAGTTTATCCTCTCTATTTATGTACATATTTG
CGGACTAATTGCCTTTTTCGTGTTACATACTTTGTGCCTGATAGCGCATT
TATCACCTTTGCATGTAGCTTTGCGGCAGGCATTTATAGCTTATCATATT
TATCCAATTGCTTTGAGCAGGCTCTGCAATCTAAGCTGACAGCTCTATCC
AATGCTGCGAAATTTGCGCATGCTGCTGCTCAAGGGGCATCGGCAACTTT
CCCTGGTAAAGGTAAGATCTAATACAATTGTTTTGCACCTTTTTTCATGG
CTCATCTTGTGCCATTGTTGCTCTTTGATGGTCCTGTCGTTTCCTTTCCT
AGAAGGATTCTCTTAACTTGACCCACTGTCGTCTTGGCTTCTACTTTTGA
TTTACCAGGCGGTAGCAGTTTGAGTTTCTCATATATTGCTCCTCAGAAAT
CAGTTGCTCCAAGCTATAAGAAGACCTTGAGGGGAAGCCAAGGGCAATTC
AAACTTGGGACCAATCGTAATCTTGCTTGGCTGAAGCCTGTCTCAAGTGA
TAACCTTGTGATTAGTTTTTCTGATGATGATAGTGAGACTGACTCTGGAA
TGGCAAAGCAATATAGAAGTAAAAGCACGAAAGCCAGCTCACAAGTTACA
TACAAAACAGGGATTACTATGCAAACTAGAATCATGAGAGAGGAAGCACC
CCAACAAAAGACCCATGCTGCAAGTGTAGGATCCACAAAATGGTCTGCTA
ATCCACACACGCTCAGAAGTTCAGGGGCTGGTAGGGGCTCAGGTGCTACC
TTTTCTAGAAGAGAGCCACCGAGTCGTCAAGTTACTCATCTGAAGTCTAC
GCAGAAGGATGGAAATGGTGCAGGAGTAAATTCAGCAGATGAAAAGTTGG
AAAGTTTGCGCCACAAAATCGCTGCTAGAGAAAATGAGTTAAAAGTTCAG
AAAAGACCCATGTCACCTGGTGTTATGAAGGATGCCAACTTCTCCAGTGA
TCAGATAAGGCCACCCTCGGAGAAGATAGGCTTTGAAGCTTCCAACAGTG
GTGGACGTGTTCACCCTGATGGCCTGCTTGTACATGATGACAGACCAGTT
AAAAGGCTTAAGCCCAATCATCAATGCATCAGCAACCAAGCAAGCGGTGA
TTTGGTAATACTGGTACCAACTGGAAGTTCATTGGGAAATGAAAATTTAA
TATCTTCTGGAAGAAGGGATCACATTGAAAATGAAATTACCATGAACTGT
AATGTTACCGAAACAGAACAGGCAGCCACTACAGAAGTCTCAGACCAAAC
GCATCCTAGTGCTACTGCTAAGAACCTTCTGTCATCCCAAAGTCACCAGA
TGGTTATACAGGATGGTGGCCATGCCACGGCTGAATATCATGGCAAGCCT
GCAGCGCTACCATTTACTAGCGACCAATCTATGGCTGAAGATACTAGTGC
TTTGGTTCCTGTTACTTCTGTCCGAACAGGGGTCAATTTAGAAAGGTCAT
CTAATCATGCCGAGGATCATATGGTTTCTGCGTGGGATGGCCAACATGTA
AATCCTGTTGACACTTCAACCGTGTCAAATGAGAGGCCACACTTGCAGCC
TGGAATGAAGGTTGATTCAGCATTACTTTGTCCTTGCTATGGTCTCTTCT
ATTGTTGTTTCTTATTATATGACACTTTAAAATGTACTACTCCCCCGTCC
AGAAAAGGATGTCGCAGATTTGTCTATACACTAAAACACATCTAGATACA
TGCGAATCTAGACAATTCTGTGATATCCTTTTTCGGACGGAGGGAGTATA
AGAATCTGAATCCATTCAACTCTAGTCCCAAAATCAGCCATCAGGAATTT
CGCAGGCTCCACAATTAGGAATTTTGGAGAGTTGGTGTTTGCAGATTCCT
CTATTTTCAGAGTACTATGGTCGAGTAATGCGTTACATGAGATAGATACA
ATGACACTGAACCTATAACTCTGCATATTATTTTCCTTTTGGAACCAGTG
GTAGTTAGCTTGTACTCCCTCCGTTTCAAAATATACGATGTTTTAGGTTT
GTGAAGAAAATGTATCTAGACTTGTTTTAGTGTCTAGATTTACTCCAAAA
CTTAGTGAACCTACATACTAAAAGTAGTCTAGATACATTTGCTTCACAAA
TCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTAGATATAAGTAGTACC
CAATATCTATTTCTCTTATAAATGATCAAAGTGAAGAAAATATATGCAGC
ATCTTTGAGCTAGCTTGGTCACTCTTACTATGTGAAACTGTGGTAGTTTT
TTTCCGTTCCATTGGACATACATCTAATCAGTTGATGAAGTTCAGTAAAT
GTTTGTACAAGTAGGTTAGCAAATGCTTGGGCTTGTCTCTCTTGTTCAAA
ATTGATGTCTGCATGGTGCAGTTAGAATAAAACAAAAATACTATCTGAAT
CTGTATAGAAGGTTCCATGCTGTCACTGAAAATTTATTGCATTGTAGTTT
CAGTTGCTATTATTTGTTTGACAATCACCTGAAAAATTTCTTCTAAACAT
TGAATTTCATTTTATGTTTAATTCCCATATGTTGACGTGTCAATGTGCCG
TTCTTATTTTGCCAGAATGCCGATCTCTTGAACAATGTTGGCCAGATAGG
TAAAGGAGGTCAGAACACAACTTTGGTTTCTCTGTTTGAGATGGAGGAAC
TCCAAGAGAGGGAATTGGATGATGCTCAGGAGCAAAGGCGGAAATGCGAA
GTTGAGGAAAGAGAAGCTCTCAGAGCGTATCGCAAAGCACAACGAAATTT
AATTGAGGCCAATGAAAGATGCGCCGTTCTTCGTAGAAAAAGAGAGATTT
GCTCTGCACAAGTCCATGGTTTAATTGCAGAAAATTCTTCTTTGGTGCAG
TGTTTAAATATTCAGAATTCTGGACATGACCTTGTAATGCCATCAGTACT
CAATTCTCAGTTCCCCGTAGATTGTCAAATGCCTGAGATTCAGGGCGGTA
GGTCTAGCAGTCCATACCTGGACGAATTTCCTCAGCAGCCAGTAGATAAG
CACGAGGCTCGTTCACGCTATTGTGATGAGCATGGCGTCAACATTGCTGA
TCCAAAATTTGTGAGTACTGTCCATGATAATAGTACACCTTCAGATTATA
GGGAGGATGATCTTATGTTCCGTTCTAAGCGGGCTAGATCAGAGTGCACT
TCTAATCTGGAGAATCACATGGAGGAAACTATACAAGTATATTCGGAGAA
CAGGCAGCCTTCTGGTGATAGCACACATGACTATGAGCTTTTAGAGGCTT
CTTTGAGGTCCAGATTGGTGAAAAGATTGGGAATGAAATCATGTCTGAAT
AACTCTTGCGAAGTCCCTGAAGAACTTGCTGTTGGAAAAGCAGCGGAGAT
TGAACAAGACAAGCAATCTGCCCATGTTGAACTTCAGTTACAGGAAGCAG
ACGATATTGTTATGCCGAATCCTGAAGGTTCATATTTCTACCCAAGTCAT
TCATATTCCTATTTTCTATTATTGCCATATGCTCTCCTCTTAATGATGTC
CTACACATGTGTTGAAAGATTGTCATCATGCAATGACAGACCTTGCCAAT
ATTTGTTGTTATAAGTTAATCAAGCACCAGTTTTCTTTGTGTTAACTATG
GCCAGGCACTGAGGCTCTTCAAATACCCACATGATATGAATATGTTTGAG
TACGTTGTTACAACAATGAGTTCAGTAAAGATCACTTTTCTGTTCTTTTC
TCCATGTTGAACTTCTAGGAGTGCCGAGTAAGATCTAAATTCCATACATT
TTGGGTGTGCATGCAATGAAGTAACTAACTGCTAGGCATTTTATTAAGTA
ACCACTATACTGTCCAGTTTACATGGCAATGCTTTTCTACACTGCATGTA
TACTTTCTGCATAATTAATTGATGATACTCTATTCCATAGGTACAGTGGA
GCTTGCAAATGATGGGGCTGATTGTGTTGAAAAGATGGCTGGACTATCTA
ATTCTAGTAATGCTCCTTCCATGGGCAACTGTGAACCTGAAGACAATGTT
TCTTCTCTTAGAGAGTTATGTGTGCCATCAAGTGTGGATTATCTCATTTG
TCCTTCAGCTCCCCAAAATGCTGCTAGACACATCAAGTGGACATTTCACA
CCTTACATAAGGAAGCTTCAGATTATAAAAATGACTCTGCAACCAGTGAT
GTCGCATCTGCAAGAGCAGTAAGTTTGCCATATATGATACAAGACCGTGC
TGGGGAGAATTTGAAGATGATCTCAGCAGCTCCAAAGGATAAGGAAGTGA
CGTGCAGTGGGATTGATCCCTTCTGGCCCTTCTGCATGTTTGAGCTTCGA
GGAAAATGCAATGACGAAGAGTGCCAATGGCAGCATGTTGAGAAGCAGGC
TTGGAGAAAGCCAAAGCACACAAACCATGCTGTGCCCTCTGTTTCAGGTT
GTTTTATGTGCAATTTATATCATCTTAATAGTTAATTTAAAGTTCATCTA
CTCCCCCCATTCTAAAATTTAAGATGTTTTAGCCTTATTCTGAAACACAT
GTATCTCGATGCCTTTTAGTGCGTAGGTTCATTCATTTCGTTCCGAACAT
ACACACTAAAAGGCGTCTAGATACATGCGTTTCAGAAAAAGGCTAGAACA
TCTTATAATTTGGAACGGAGTATGTGCCTTTCATAACATTTTGCTTGGTG
AAAATTCATCATTAATACCTGGAGTAAATATATATGCAGGCCGGAGTCCT
TATGATCTGTTTCAGCATATTCTGCCCGTACCAACATATCGTGTTGGTTC
CAATCTTATTAGAGCTGATCTGAACTTGATGCAGTCGGTCTTAGCCAGCA
GTATTTGGCAGTATTGGCAAAGGGGGTTTTGTGCTTCCTTTACTTTACCC
TTATCAATCCAGAGAGTACTTCCATCAGATGCACCATTCTTACAAGCTGG
TGATGGTTCGCTTGCAGATTTTGATAGGAATAGACAGCTATCAAATCTTC
GGATGCTGGATAGTAGGAAGGTGGGTAATGGGTAAAGTCCATCTGTATCA
CCATCACCATTATGATCACATCCGTGGAAGCGGCATATATATCAGTATCT
GGTTCCGAACGCTAAACTTACTCCTTAGAAGTTTGCCGCTTAGCATGTTT
TTGTGTTCCCAGCTTCCCATGTAGAATATTGAATTAGCTCTTCTTTTGTA
CTCGTTTGCTCATATAACAGCCTTTTCATGCTACCTCCTACAAAAATATT
GACATTTAGAATGCTTTGGACAGTTACTCCACAGTTGACATAAAACATTC
AACCTTCTATCGACAATGTTTAGTCTTATTCTCTTGCATTTCTTTTCACA
TTTAATGACTTGACACTTACCTTTGAATCTTATTACTAGTTCATTGCTCT
CTGATCTGCTTATATTTTGATTAGTTTTTATTTAACCTTTTGTTCTGTAG
AATAAGATTGTACAGGGATCTGTTGATGTTGAACTATTCTTAGAGGCTGC
ACTTGGTTTATATTGTGGGAAAGTAAACAAACCCGACAGGCTCAAGGTGA
TCTTTGTATTGCTTACTTCTTAGGGGCATGTTACAGTTACACAGTCAAAC
TTGGATTTATTGTCTATCAGCTATTCAGCCTAGCTCTAATTCTATACATG
ATCCTGTAGGCTCTTTTACTTCTTGCACGCTCCATTGAGGCAGATCCAAG
CACAGTTATCCTGTGGGTGTTTTATCTTCATATTTACTATCAAAAGGATG
AAGGACTTGGGAAAGATGACATGTTTTCCCATGCGGTACACCATTTATCA
ATATCTTGCCACTTAAATTCATTATGCTGGACTGATTTCTCATAGTAGGA
TGCATGGACTACGACCTAGATGTGTTTTGGGGTACTTTGGTTTTGAGCCA
AAGCTAGGCCTTGCCAAAAAGTTGGCATGCCTGTGACCTTTGGTTGCTGT
TTGGTTGGGTTCAATTTTTTTGGCTAGCCCAGCCTAGTCCATGCACGGCA
GTGCATTTTTCACCAATGCGTGTGAGCTGAGAGTGGTCAAATCCTTGCCA
AAAGATTGGTCGCGCCAAAGGCCTGTTGGCTTAAACCAAACGTACCCTTT
TTCTTTTGGCTGCGTGGATTCACCTTACCGATGCCTTTTCATTTTGTTTC
CATCATTTGTTTAAATTTTTTTAGCTCGAGTTACTTATAATTTGTTGACC
AGACCAAAACATGATATCCACATTTATTCTGCATCCAATCTATCCATGTT
TGCTTAATTTGTTTTTGTTGTTGATACCTAATGTTATGCGTTTTTCCTTT
TAGGTGCAACACAATGTTAACTCCTATGAATTATGGCTTATGTATATTAA
TAGTAGGTTGCGTTTTGATGACCGATTGGATGCATATAATGATGCTCTGA
GCATGCTCTGCCAGATGACAGCTGACACTGATAACGAATTGAAAGATAGA
AGTGCTTTCATCCTAGATATCTTCTTACAGATGATTTACTTCCTGTGCAT
GTCTGGAAACGTAGAGAAGGCTATTTATAGGATTTATGGGATTCTGCCTA
CAGCAAGTCCTGACTGCCCTGGTGACAGGTTGCTGGCGGATGCCATTTCT
TGCTTGACCGTGTCTGATCGATGCATATTTTGGATTTCATGCCTATATGT
CTCAATTTATAGGAAGCTTCCAGAGGAAATTTGTGATCAGCTAGAATTTC
CAAAAGATCTACCTCGTGTGTTAGTATGGCATCCTGTTGAGCTTAGGGTA
GATAACAGACGTAAGGTTGCAGAACTATTGAAATGTGCTGTTGATAAGAT
GGCTGTAGATATTAATGAGACCGTTAAAAATGGGGATCCATCTTACCTGA
AATTGGCACAATTCCTCGCTGTTAGCCACATTAGTTGTCTAGCTGCTATC
GAAGGCTTCCAATCTTCTGTTGATATGCTGGTGAAGTATATGAAGGAGTA
CCCAAGATGTCCTAATATTCTTCTTATCTCAGCTCGGCTATATCGAAAGT
ATGGTATGTGTCCTGGTCTGAAAGGGTTTGATGAGCTGCTCATGGATTGG
CCTAAAGATGTGCAAGGAGTTCAGTTTCTGTGGAATCAATATGCTGAGCA
TGCTTTGGCAGACAGTATTGAGTTGGCTGAAAAGGTGCTCACTCGCTGGT
TTGAAGAATATGGAAAAGAAGGTGATATCCACAGTAGAGCTACTGCTGCT
ACAAAAGAAGTCAGTAATGAAGTGTCTGAAGAATCATTGCTTGCCTGTAA
CCTAGAAGTTAGTTCTGGTCTATCTGCATCAGAAGATCAAGTCTATTGGT
TGTTAAACCTCTCACTGTACAGGATGCTAGAGAGCAACCTACAGGAAGCA
CAAGTTGCTGTGGACAAGGCATTGAAGTTGGCCCAAGGGGAGAGCTATGA
GCACTGTTTAAGGGAACATGCCGCAGTTCACACTCTAGAGGGACCATCGT
CTTTTAAAGACATCCCAACTCGAGCTACGTTTAGCCTGATCAGTGGTTAT
ATTGCAGACCGTCAGAACTTACCGACGAGGGAACTGTTGTCGAGAAGGTT
TATTCAGGATGTGAAGAAGCATAAGCTTAGGCTGTTGATAGATGACACTA
TAGGTCCAGCTTCTGCAGATCCTTCTCTGATAAACTCAGTCCTCGAGGTG
TGCTATGGCCCGTGCCTCCTTCCAGAACAAATAGAAGTGAAGTACTTGGT
TGATTTTGTTGAATCAGTGATGGAGACCCTTCCTGCAAACTACCGCCTAG
CCCTGGCAGTTGGTACATTTGTGGTTAAGCATTGCACTGGTGCCAACCCT
ACCTCCATGGGCACTAGGTTCTGGGCAAGTTCTATTCTGATAAATGCCAT
CTTCCGTGCTGTACCTGTTGCACCAGAATCAGTATGGATAGAGGGTGCCA
ATCTCCTGGAGAAACTACAGGCCTCAGAGATTGTGAAGCGGTTCCACCAG
CAGGCAACATCAGTGTACCCCTTCTCCTTCAAGCTATGGCATGCTTACTT
GACAGCCTGCAAGGCCAGTGGAAGCAACACAGAGAGCATTGCTGAAGCTG
CGAGGCAACGAGGGATTGAGCTGAATGTGATGCCACCCTAGTTTTGCTGC
AACGATCTGAAGCTCAGGGATTTGTCAGGTGGAGCTGTAGTTAGTGTTGT
GTTTTACTGGAAGTGACATAGATACATGGAATCGGTGGAGCTGGATATAC
CAGGTTGAGGCTGTAGTTTAGAATGTTGTGTGTACTGCAAGTGACATAGT
TACCTGGAAGCAATGGTGGTGGTGTGGTGATGACGACGACGACAACGACG
ACTGGGTGGTTCTTGTTTAGGCACAGTTTTAGGATCAGATAGTCGTGGAT
AGCATACAGCATCTGTTGTTACTGATGGGCAGCTGATGGTGATGGATAGA
TGACAGGCATATATGGTGAATGGTTCGCATCCCACCTTCCCTTCTTTTTG
GCCACTTGAGAACAATGGTGGAGCCAGTTCTGTTTATCTGTTCCAGTTTT
AATCTTTGTTGTAGTGTATGTATGACATGCATAACTGTTGTCTTAAATCA
CCATCTTCGGTGAAATATGAATGAGAATGTTTTGTTATTGTTGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.