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GrainGenes Sequence Report: AA022038

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Sequence
AA022038
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA022038
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCAAAGGTGGTGGAGACATCAGCCACAACTCGGTAGCAAAGAGGAACCG
CAAGACAAATCAAACGGTCCTGATCGAATTCTATCAGAAAACCCAAAGGG
TAAAAGTGGGAAATCACCCATAGGCCGTAAGATTCCAAATTCCAAACCTC
TTCTCACCTTTGCTTCGCTTCCCATCCGGAAGCTCCTCTCGCTATATCTC
CTCCTTCACCCGGATTCCGAGGCTGGCGGCCGTCTAACCAGCCGTAGTCT
TCTCCCCGTGGCCGCCGGAATCTGGCAAAGGCAGAAAAGGTTTGCAGCTC
GGGCTCTCGCGCCCCGCCGCCTCCGGGATTCGATGTCCGTTTGTACCCGA
TGGATCCGCACCGCCTGAACTACCCTGCCGCTGCCGACAACGCCGAACCG
GAAGACTGGGGTAACATCACGACTTAATGTTCTCGCAGCTTCGATTTTCT
ATATCCATGTTTTGCTTTTTCAAAAATAAAATAAAATTGTATGGCTTGTG
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ACTAGCAATGCTAGCTTGCAGAGATAGGCAATGAAGTACTCACATTACTG
GGAGTGGGTGCTCGTTGAGAAATAAATCAACTTACAAATCTCTATTTATA
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TATCTTTATATTGTATTTTTCCCATATGTTAGGGGGCTTCCTGCATATTT
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TCCACCGGTCCTCTGCTTGTGATTGCCGCCGTCAGCTCGCCTTGGCCACC
CGCCGGTTCCCGTTCTGACCGATTTGCGTGAGGTCCTTTCGTTCTTGTCC
TCTGCTTTCCCATATTCGTTCTTGTCCTTTCGTTCAGATCGGATCTATAC
CCTCATCCGCCCTTACCCTCCTACAATCCTTCCACTGTCGATCGGCCCCC
ACCACCACCGATTGGGCACCGCTACCTCCTGCGCGCACCCGCCGATCCTC
GTTGCGTGCACCCGCCGATCTGCCCGCGTCTGCCCGCGACCACCTGCCCG
CGTCTGCACGTGCGTGCGAGGGCCCCGCCACCTGCTCCACCCCGCCTGCG
TCACCCTAACGCCGCCTACCTGCCCGACGACCCGCCTGCTACCGCTCTGC
ACACATACACCCGTCGTCCTTTGCATCGCCGTCCTCACGCGGTTGATCTC
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CCTGCTGGCCTGTCGTCTGCCTGTTGCTGCTTGGGCCCCCCCTCACCTGC
CGCCTGCCCGTCCACACGCGGCCCCTCACCTGCCGCCCGCCAGTCTCTGA
CTGGCCGAGGCCACCTCCTGCTTGTGCGGGCCTTCACTCCGGCCGGATTT
CGTCTGCTGACGTCTGCTTGCGTCAGGTTTGGTCAGATCTGATCTGTGTC
AAAAAAAAAAGCGATATGTCTTCTTTCTCGGGTTATATTGCGATTCCTCG
CTGCCTGGTGATCTTCGATGGCACGAATTACCATGATTTCGCTGCCTTTA
TACGCGTTTATATGCGCGGTCTCCGTCTTTGGGGTGTGCTCTCCGGCGAG
GTCTCCTGTCCGCCGTGCCCCCTGCTCCTGTGGCTCCTCTTCCGCCGACG
CCGATTGTTCTCGGTGCTGATGCTTCTCAGGAGGCCAAGGATGCTGCTCA
GAGTGCTGATGATAGTGCTGTTGCTGCTTATGATCTGAAGTTCAAGCAGT
ACTCTTTTGATCTTGAGGCCTAACGACACGCTCTGACTGCTTACACTCAG
TGGGTTGATGAGGATGCTCGTACTGTTGCTGTTCTCACCTCCAGTGTTCT
GCCCCAGTATGCTGCTGAGTTCATGAGTCTCCCTACTGTTGCCGCTCAGT
GGACCCATCTTCGTCAGTGCTATCAGCCATCTGGGGATGCTCTTTACCTG
TCTGTGGTTCGCCAGAAGCATGCTCTCCAGCAGGGTGATTCTACTATTGA
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GTACTGCTGTTTGTGGCACATGCTCGTGTTGCCAGATTGTGCGCTCGGAT
TTGGACTTTCACCGCATCTATGAGTTTCTGTCTCGGCTTCGCCAGGAGTT
TGTGCCCCAGCGTGCTCAGCTGAATGCTCGTGGTCGTGTTCCGCTCTCTG
AGGTGTTTTCTGAGCTTCGGGCTGAGGAGACCCGTCTCCGTGCTGCTGGT
CTTCTTGCGGTTCCATCTGTGCTTGCTACTCGTGGTCCTTCTATGCCGTC
TGTTCCCTCGACTCAGCCGCGGTCCTCTGTGCCACCGCCGATACTACCCA
CTCCTCCAGGTCAGGGTCAGAGTCAGCACCAACAGTTTCAGGGTTAGAGT
CAGCACCAGCAGTATCAGGGCCAGAGTCAGCACCAGCAGGCTCGTGGTCA
GGATCGCCGTGGTTCTCTTCGTCACTGCTCTTACTGTAACAAGGATGGCC
ACACCTGGGCCGCCTGTTATACACGGGATCCCAACTTACGTCAGCAGCAC
CAGGCTCGTGGGCAGTCGGCTCCTTCTGGATCTTCAGCAGTTGCTCTCTC
CGATCAGGACTTTATCATGAGTCTTCGCGGTCTACTTGCTGCTACAGGCT
CTTCTTCGACAGGCACTGCTGGTTCTGTGACTGATTCTTCAGACACTGTG
CGACCACCACCTTCTACACAGTCAGGTACATCCCCATGGTATCTGGATTC
TGGAGCTTCTTTTCATATGACCTCTGAGTCTTCTTTTCTGTCCGCTCTTC
GTTCTCTCCCTTCTCTTTTCCGTGTTTTCACAGCTGATGGTACCTCTCTC
CCTGTTTCTAGTCGGGGAACCCTTTCTACTTCTTCATTTTCTGTTCCTGA
TATTTATCATGTCCCTCTTCTTACGATGAATGTGTTCTCTGCTAGCCAGC
TTACTGACTTTGGTTGTCGCGTCATTCTTGATGCTGATTCTTGTGTTGTC
CAGGACCGTCGCACGCAGGCTCTGGTTGGAGCTGGCCCTCGCAGTCGTGA
CTCTTCAGGACTTTGGGAGTTAGACTGGCTTCGTGTTCCTTCCGCTGCCA
CTTCATCTGCCAGTTCTTCTTCGGTCGTCGCCTCTGCTACCAGCTCCTTT
CAGCAGTGGCATCATCGTCTTGGTCATCTTTGTGACTCTCGCCTGTAGTC
CTTAGTTCATCGTGGTCTTCTGGGGTCTGTCTCAGAAGATGGGTCTTTGC
ATTGTCAGGGCTGTAGGTTGGGTAAACAGATTCAGCTTCCATATCCTACT
AGCGCGTCTGTATCTCAGCGACCTTTTGATTTAGTTTATTCTGATGTTTG
GGGTTCGGCTCCTTTCGCTTCGAAAGGGGCCATCGCTACTATATTTTATT
CATCGATAATTTTTCTCGGTACACTTGGTTGTATTTTATGCGCTCTCGCA
GTGAAGTGCTCTCCATATATCAGCGTTTTGCGGCCATGGTCCGTACTCAG
TATTCTACCCCCATTCGTGTATTTCGTGCTGATTCTGCTGGTGAGTATAT
ATCCCCGATGTTGCGAGGTGTTCTTGCTGAGCAGGGCACCCTTGCTCAGT
TCTCTTGTCCTGGCGCATATGCCCAGAATGGCGTTGCTGAGCGTAAGCAT
CGCCATCTTCTTGATACCACTCGCGCTATGATGATTGCTTCTTCTCTCCC
GCCGCATTTCTGGGTTGAGGCTGTCGCTACGTCGGCTTACCTCATCAATA
TTCAGCCTTCTGCTGCCTTGCAGGGTGGTATCCCTCTTGAGCGCCTATCT
GGACAGTCTCCAGACTACTCCATGCTTCACTTGTTTGGTTGTGTTTTCTA
TGTTCTCCTTGCTCCTCGCGAACGCACCAAACTGACCGCTCAGTCTGTTG
AGTGTGTCTTCCTTGGATACAGTGATGAGCATAAGGGCTATCGCTGTTGG
GACCCTGTTGGTCGTCGGATGCGTATCTTTCGTGATGTTACTTTTGATGA
GACGCGTCCTTTCTATCCTCGTCCCACCGCTGGTACTGACCCAGTGGAAG
ATATCTCTTTTCTTCTCTTTCCTGACACACCTTCTTCTACACCTATTGTG
TCTTCTTCAGGATCTCCTCCCCCTGATGTCTCTTCTTCGACATTGTCCTC
CTCTGCTCCGTCTAGTTCTCCTAGTTCTCCTCGTTCTTCGGAGTCTTCCT
CTACTATTCCCTCTTCTTCATCGTCGTCTCCTGCGTCGTCTTCCTCTAAT
GATCTTCCCTCTACTTGTCCTGTTCGTCAGCGTCGTGCCCCCAACCGTTA
CTCTCCTAGTCAGTATGGTCTTTCTGTTGCCTCCGAGCCGACTTTTTATT
GGGATGCTGAGCATCATCCTGAATGGCAGCTGGCCATGGCTGAGGAGATT
GCTGCGCTTGAGCGCACTGGCACCTGAGATCTTGTTTCTCCCCCTCCCGG
TGATCGTCCTATCATGTTTAAGTGAGTCTATAAGATTAAGACTCGCTCTG
ATGGATCTCTTGAGCGCTATAAAGCGCGTCTTGTGGCTCGTGGTTTTCAG
CAGGAGCATGGTCGTGACTATGATGAGACCTTTGCTCCTGTGGCTCATAT
GACTACTGTGCGTACTCTTCTTGTTGTTGCTTCTGTTCGTCACTGGTCTG
TGTCCCAGCTTGATGTTCAGAACGTCTTTCTCAATGGTGAGTTGAGTGAG
GAGGTTTATATGCAGCCTCCTCCTGGGTATTCTGTTCCCGAGGGGATGGT
TTGTCGTCTTCGACGTTCTCTTTATAGCCTCAAACAGGCCCCTCGTGCCT
GGTTTGAGCGCTTTGTTTCTGTAGTGACTGCTGCTGGTTTCTCCCCTAGT
GCTCATGATCCAGCGCTGTTTGTTCACACTTCTCCTCGTGGACGCACTCT
TCTTCTCTATGTTGATGATATGATCATTACTGGTGATGATCCTGAGTATA
TCGCCTTTGTTAAAGCTCATCTTCGTGATCAGTTTCTTATGACTGATCTT
GGTCCTCTTCGATACTTTCTTGGGATTGAGGTTTCCTCCACTTCTGATGG
CTTTTACATCTCTCAGGAAAAGTATATTCAGGATCTTCTTGCCCGTGCTG
TTCTTGGGGATGAGCGCACTATTGAGACCCCTATGGAGCTTAATGTTAAG
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TCGCCTTTTCTTTCCTCGTTCCAGCTCCCTCCAGCTCTAGTGCTATTCGG
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TGACTGCTGAGGTGACCTGGTTACGGTGGTTACTTGCGGATTTTGGAGTC
TATTACCACACCCAGTCTGGTTTTGTCTGACAGTACAGGTGCTATTAGTG
TTGCACGTGATCCGGTCAAGCATGAGCTTACCAAGCATATTGGTGTTGAT
GCTTTCTATATACGTGCTCAGGTGCAGGCTCAGGTTGTTGCGCTTCAGTA
TGTGCCTTCAGATTTACAGTTGGCGGATTTCTTCACGAAGGCACAGACCA
GAGCGCAGCATAATTTCTTACTCCCCAAACTCAGTGTTGTGGATCCAGCA
TGAGTTTGAGGGGGGAGGGTGTTAGATGTATATATCTGTATATTGTATTT
CCCCCATATGTTAGGGGGCTTCCTGCATATTTGCCCTCTACCTGTACTAT
ATATTGTGACCTTTGGCCCCCAGAGAAATATAACTTTGTCTATTCCTAAC
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TATTAAAATCGCAGGTACAGATCAGACTGAAAGACACTGAAAGACGCAAG
CTGTGGCTGTTGCATAGTGCCAACTTTGGTGTTTTGTAGTATACGTGACT
TGTCTATTCAAGCCAATTAGTTATTCAAAAGTTTGCTCACATATTCTCTA
CTCAAACCATGCAATACTATGTGATATATTTGCCATAGACAGGTGTCCTT
GCTTACCCCCTGTAACACCCTGTTATTACAGTCCCATCAAATGGACCAGA
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CTCCTTTGCATAGTCAGCCACCACTCCTCCGGGGAGTCTGCCGCAGTGGA
GAGGCACAGCCATGGCCAGCCCAACTGAGTGCGAGACCCCAAAGTGGTCG
TGACCATGGGCAGCGGATGAAGAGGTACTCTGCTGTTTTTGATTCCTGGG
AGGTGGGAACCTATGGGGCAGGTGCCATGGCTGGGGAGACCATTACGCTC
AAGCTTATCAGCGGTCCATCACCGGTGCTTCAGGGCAAGCCAATATAAGA
AGCGGCAGGAAGCAAAATAAACAGCTCTGTTTCGAAAATATAGAACAAAT
AGATAAGTAGATGGGTGCACATGTTAGATCCTCTGACCCAGTAAATTTTT
TAGTTTACTAGATGAGAATGACATGCACAATGGAGACCTCATACAAAGGA
CTGTGGAGGTAACTGGATTTATCAATTTGAGATAGCCTACCTATCTATTG
AACTGCGGCCATGTTTTAGAAGCCTTAGTAAAGAGCGGTGGACAGTTGAC
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TCCAGTTACCAATATTTAGATGCGTACAGCTGGTTGTTGATTCCCTGGTG
CCTAATCATCAGAAGAAACAGAAACATTTCTTTTTATGGAGAAACAAGTT
GATAGCACTTGACATTATCCTACTTTCTGAATATTGCATAGCTAGGCTTA
CTACACAAACATATATCTTTAAAGGTGAACATCTACAATCACATTGAAAA
CCTGAACCTTTAAGAAGGAAAAACAATCATCTTTAGTATGCCCTCTTCGT
GTTCTATCTCCCTCCGAGAAGAGCACACAGATATGGTGTACCTTTCATCG
CCCTCTGACTTTGTTGTTAAGTGGTTGTTGGTGGAGGACCCTATATTCAC
TCTAGTATCCTTATAATGATATATCTTGGATCACTTGGGGGTGCAAGATC
TCACTAGCTTCTCTAGCACTTTGCTCCCTATGTTATTCTGTTAAAGAATC
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AAATGTCTCCTCGATGTTAAGAAATTGCTAATGCAACCAACAATGGTCAA
CACCATGTTTCAGGCTCCAATTCCTTTATGCAGTTGATTTACTCTAACTA
GCTTGGTCGAATTATAGGGACTCTAAATAGTATTGGCTTGGTCTTGAGGA
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CTTAACATCGGGGAGATGTTTTGATTTTAGTTTGGCGTCAAAAGGTTTAT
TTTAGATAGACACCCATCCACTCCATGGGTCTGGATTTTTTCACAAGGGC
CTTCAGGGTGTTTTTCCTTAATTTTTCTGCGGGGCTTTTCTGTATTTTTT
CTTCTTTGGGTGTGTCTGGACCATTTTGGTTGTGTACGTGTCATGTAACT
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ATTTCACCAAAGAGAATTATTATAGGTAGCAAAGTGCTAGAGGAGACGTT
TTCATATTGTGCCCTTAATTTTCCCAACATTCCATTATAAGGACATCAGA
GTGATTATAAGAGTCATCCACCAGCAAGCATGTAACAGGAAAGCCCGAGA
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CGAAAGGTGTTCTCATTCATTATGAAAACGATCACGCCAAACATGGAAAG
TAACTCTTCCATTATTTTTGATTGAGCTGATAAAATTCTTCTAAAAGATT
GGCAGGAAGTTGGGGAATAGAAGGATCGAACTTATTTTATCAACGAAACA
TATTCCTCGTATGGATGATCTCCAAATAAAATAAGGCCTGGGATATTAGA
AGCATGTCAAGCAAGGTCACAATGTTTTCACCACAAAAAAGTATTAGTCT
CCGGATCCCATCTTTCCAACAATGACCTTAGTAATGCAGGACAAACTTCA
TATTCACGAAGAGAGCAATAAAAGGCCTCATATTATAGTGTGGTTTCCCC
TTCTCCTTACAAACAAGAGGAATGATGATTTAGGATCCAAGTGCCCACCA
CGCAACATGGCCTTTACGTCGAGTACCTTATTCAACCACATAATCTTCCC
AACCTAGATCTTTTGCTACCAAATGAGGTTTTCAGCAGCCCTATGCCGTG
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GGAGCTGAAAGCCGTGAAAATTCGCTTGGATGACCATATCTTTGACATAT
GTAACTGGTGCTGACCTATAGTCAGGTTTGGTTAAAATTTCAGGATGCGA
TCATTTTTCCCTAAAGTTCCTGAGAAGGATCAGAATTCTCAAATTTCATG
CCCGTTTCGGAATTTTGAAGTCTGCTAAGTGTGTGCTAGGATGCTGCAAG
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AAAAAATAGGAATGTGGCAGCTGCTTCTCTCTGATATCTACTCATCAGCT
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CAGTCTTCCCTTGGAATTGATTTACATGTTCTCACGTGCAACTTGTTACA
TGTCACAGATAATGACGACTTTGTGATCCCAAGCTTGAGCATTGAAGAAT
CTGATCACGGTGACTGGGAAGTTTCACAGGCTTCTGCACCTCAACCACCT
CCAAAGGTTTCTTTCCAATCACGCTATTCTGTTCTGGTACTCTTTACCAA
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TAGTGCCCTTCTTTAAGAAACATAATTGCCCTAACATAAGGTGAAATTTA
ATTGCACAAAACAAGTAACTTGTATTGTGCAGTAGGAAAGCTGGGGGATC
TGGTTGCCGCTTGGTAGATAATTGTCATCTTCCCTTTTCCTCACTTTTTT
CCTGATGTTTTCAGCAACAGCCTACCAAGGACACGGAGAACATCTATCTC
GGTCCTCACGGCGCAGCACCATCTCGAGGAAAGAAGCAAGAGGAAAGTTC
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ACAAGGTGTCTGCAACCTGGCGGGATAACAAAGGAAGCTTCACGAGGGAC
TTCCACCGCTACAACAATGCTGGTCACCATGTCAAGTAACCTTACAGAAG
ATCCACTGGTCAACAGCTTGACTAAGTTAATAGTTTAGTTATCTACCATT
AGTGTTATGGAAATTCTCTGTAGTCATTTGTCTTACTATTCAGCCAGTGG
CATTTATATATACCTCAATCATATGTACTGTGCTTCTGCCGCCATGGAAA
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TGTGGTTCCTGGCGTTTGATTATCCCCGGTACGCTTAGGTTAACTGGGTG
AAAATGGATAACGCTCATCGGCCAAAAGGCTGTTGAAGCATTGCTTGGTG
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CCATCATCACATCTCACTTGGTGTTTCATGTTGTGATGATTAGATTTCAT
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GACACATCTGGATTTAGACAAATTTGAGTTAACTAATATAGATCGAAGAG
AGCAGTACTAATGTATATGGGCCACGCCTGAACATGCTCCTGAACATCAT
CAGGATGTAATCGATTGATCATCGTGGCAGTAAAGTTCCATGGAAAGTCT
GAGTCCATGCATCTCGGTTGGCGCACGTCGCCCTTTCGTTGCCAATGCAC
GAGCAGATACGCAACCAAGAACGGCAACTAGGAAAATGGATCCGGAGGCT
GCTCACTTCATTTGCTTGCAAGTAAAGCCTGAGCTGGTAGCATGGTACAT
GCGGTTCGGGTTGTTGCCTCCCAGAAGAAACGACATTATCACATTATAGC
ACATTATAGGACTAGCTCCGTTTTCTTTCGAGCGGATGGGAGAACGAAAC
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ATCAAGTTCTGATCTTTACCATGGTGAGGCTTAGTTGTCCTAGGCCTGCT
TTTGGCAACTGGCACCACGCTGCAAAGATGGAATTTGGTTAACCATTTAT
CTTTAGGATCCGAACCTATTTAACCATTTTGTGCAAAGGGATAATATAGG
GAAACCATTAGGGTATTAGGGTCTAAATGGTTAACCGTTGGTTATTAAGG
TTTAACCTGTTTTTTATATTATGCAATATGCTAGCACAACTAGTGAGGAT
ATAATAAAATATATTATAGCATATATTTCCAAATAGTTGCAAAGCTAGCC
GGGATGGAAGGCTCGTCTGTTATAATCCCGACTGTTTCACACCAAAATTC
TTGTCTTATGCTATTCTATTTTGCTAACGCTAGAATCTATGAACTATGTT
CAGAAATCAGAATGATGCAGAACTAGCTAATACTGTAGCATGCTAAAATC
CTGCATTTTTAGGATTACAGCAACTTGAGAGTCCTCCCGAGACAACGAAT
CAGGTGTTTAGACTCTATAATTATACCATTAAACTAAGTGCCTAGGTTGT
GCCGGTAAACAACAGGATCTTGAGAGATCAAAGAACTCAGTTCACGACCA
CTTCAAAGGACATGATCTTGAGAGATTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.