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GrainGenes Sequence Report: AA050702

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Sequence
AA050702
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA050702
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCTCAGGTATGATCGCTATTGGACTATTTTAGGTTTCTTTGTTTGCAG
GTTCATAGTATACACTTCTAGAGACGGATTTTCTTGTATAGGTACCGCCT
TCGACTTCTAGGGTCAGATGGCACCGGTGAAGCAGAGTTCTGCATATCTG
GAAGGATTGCTCAAAATTTAGTTGGTGTCCCTATTCGCCAGGTCATACTC
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TCAGATTGTGCACACACCACCTGAGTTAGCTGTTGTTGCCAACGCTACCT
ACAGATTTTTTTACGTGTCAGCAACACTCATTTCCAAGGGATTGGGCTTC
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CCACAGATTATTGATGCTGCTATAACTCAGTCTCCCTTATGGAAAGTTGT
TGTGCCTTTAACCTTGTCCCAAAACATGCGTCTGTCCATGCCCAATGCGG
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AACTTGGATACAAATACCTGAAGACTTGCTAATTCGTACGGATGGTGATA
TGATTGCTGCTATAGTTTCCTCTACGTACGTGGACTTTGATATTAATTAC
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CGTGTGTGCTATGCAATGACAATTAATAAGAGTCAAGGCCAAACTCTTTC
TTTTGTCGGTATATATCTTAAACAACCTGTTTTTAGCCATGGTCAGTTAT
ACGTTGCTGTATCCCGAGTCACGTCTAGAGCTTGTTTGAAGATCCTTATT
GTAAATTCCGATGGGTCTTGTGGATCAGAAACTCGGAATATTGTGTTCCC
TGAGATATATGCTTCTGCTGGCATGTCCTGAGTTGCTTATTTGTTTTATA
TCTTGTCTACTATTTGTGGTTAGTTGAGATTGTTTTCTACTTTTTTAAAA
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TTCTATGCTTACCTTTCGTTTGCGAATTTGCTTAGACCTGCAATTGTTTG
CCTGGGTTATGGTTTAGTTAAGGGCTTCTCGGGTGTTTGCTAGAGATGGT
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GTTGAGGTTTCAATCTTCTAGAAGTCTTTTACATCTTTCTGGGGTGAGAC
TGTTTGTCATGCTTCACTGGAACTTCTTGGTTCTTGTGTCTGCTGGCCCC
TATGCTCGTGTGACCACTCTAATAATGTGTTGGTTCTAGGAGATCCGCCC
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TACTGACAATGGACCTATCAAGCACACGGACATGGTTCTCCTTGATGCTG
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TATTAACCTGATTGAAGAAGGGAAGATCTATGACATTCGGAAGTTCTTTG
TTTTTCCCAAGAAATATGTTTTCCGTCCAGTAGACGCAGAGGCAATGATC
AGGTTTACAAAATACACTACCGTGGTTGAGAGGCTAGGCTTGGAATCACT
ATTTCCTTTCTGTACCTATGAGCTTACTCCCTTTGCTCAGCTTCCTAAGC
CCTCGGACATGCCCGAGCAATTCACAGGTATTTGTTCTGCGGGGTTTTAC
AGCATTCATTTTTGCCTTGGCATTCACTTCTGCACTGATCATTTTCTTCT
TTTCAAATGTTAATAGATGTGCTTGGGGTTGTGTCTGGTGTCTCTGATGC
TGTGCATAACCATAGTGCAAGCAGGGCTGAGCCTTCCATGAAAAGGATAG
TTTACATCAAGGACCAGACGTTAGTGCTTTTCCAAGTTATTATGCACGTG
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ACCTGTGCAGTGGCAATCAGATCACTGTCAATTTGTGGGGAAGCAGGGCT
ACTGATTTTGATGGTGCTGAGATTATGGAACTTGGAAAGACTGAGCCAGT
CATAATCATATTTGTTGGGACGTTGGTTAAGACATTTGAAGGTATCTGTA
TCAGGACAATTAGTCTATTTGTGTGCTTTGCTGATTTCTTTGATTAGGTT
CTAAAAATTTTACCCCTGTGGGAAAATGACTGTGTTGTTTCTATTACAGG
CCGTAGGGGTGTAAGTGGCAGTGCCGCATGCCGTTGGTACATTAATGAAG
ATCTTCCTGATATCAACAACTTCCGCCGAGGGTATGTTCATTTGCTATTA
ACCATCTTAATAGGACATCAGCATTGTCTCTCGCATCGGGATATTGATGG
TGGATTGTCTGTTTTTTTTTTCAGATTGCATGGCCAGGTCCCTGTTATTG
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AATCTAGAGACGAAAACTGTAAAAGAGCTGACTGATCTTGACATATTTGA
TTATAGGGTAATTATCGGTACTGGGATAGTCTTTGTTTATCACGTAATTA
TAACTTTCTTATGGATTCTACCTGCGTTTTTTTAGGAGGCACGTTTCTAT
TGTACGGCTACCCTTGCCAGGTTAAGTCCTGGACAGCGTTGGTGGTTTTC
TTCTTGTACTCTCTGTCATAAAACTTCTGTTCCAGAAGGGGATGCCTATA
GATGCTCTGATCCTGCTTGTCTTGGTACAGATGCCCTTCCAAGGTACATG
TGCTTCTACTGGATCTTGGCTTTCCCTAATTTATTATGCTATTATCTTCC
TTAACTTTGTTATTTGGTTCCTTCAGGTACAAAATCTGTTTTGTGGCTGC
GGATGATGGTTCTGAAACCGAGTTTGTATTCTTTGATAGGGTTGGGAGAG
AGCTCCTTGAATTGCCCTTGCTGAGTCTCTTACGTCATGGACATCCACCT
GGTGTGGAACTTGCTCGGATCCTTGAGTCTGTACGTAGGGATAGTTCTGT
TCCCAAGGAACTAACCTCCGTTATCTCGCGGAGGTTTCGATTCGTTGTCT
CCATATCTAACAAGATTTATCAAAATACGAGCGAGGAGGGTGGCATGTCT
TTCCAGGTGCATAGAATTGATACGGTTGCTCCCAGACAGGCACAGTCCTC
TGTTTGTTATCGTGCCTCTGGTTCTACAAGTGGTTCTGCACTGGCCAACT
CTTATGGTGAGGGTGAATTGCCCATGGGGAGTTCTCCTGACCTCGCGTGC
AGCGAAACGCTCTCTCCGGAGGTACATTTTCCTCTTGCTCGTTAATTTAT
GATAGAGATTGCTTGTTTCTGTATGCTCGGTTAGAATGAAGTGCTCTGTC
TTTTACATGAGTAATATATTAAGATGGCTCTTATGCCGTATTTACCAGTC
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TATATATACTGACCAGGGCCGTCTGCCCATGGTCTTGCAGAACACTCCTC
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TGATTTGGCCTGGTTCTGTGAATATGTCTTTTTACTTGTGCTTTCCTCTT
ACTATACAGGCTGCTGGTGGTGGTTTAACTGCTCAGAACAGGCTGGTAGA
TGGAGAGGAGCATATGAATGCAGTTGTTGTTGATGAGCCTGCTGAGAGGT
GATTCATGCTTTAGATATCAGCTTGCTGCATTTATATACTTCAGACTTTT
TTCCATACGATATAAATATGGTCTTTACTATTTTTACGTGCTAATTGCCT
AGTGTGGAACCACCTACTAGCAAGGCTGGCAAAGAAAAATAAGTAATCCA
TCTTTATTTAGCACTTCTATATGTCCACTTTTTCATGTCTTTAATCACGA
TCGGTGATTAGTGTTTGTTTTTTTGGAAATTATTTGCAGGAGTCCACAGG
TCACTGCGGATGACCTTCCACTTTCACAGATCAAAAAGCATAGGAGGTAG
GACCCTTACAGGTACTGAGACTTACAGATGAGATCTTTGTTCTTCTGACC
ATGATATTATACCGTTGTTAAGCGATCTATTTTGTTCGTTGGGCAGGGTC
CTATAGGTCGGTGTACATATCTTTTGGAGAAGTCTATTACCTATTACTAT
TTGGACCATTGCTACGTCGAACAGCCAGGTGCTTGTAGCTTCGGCTCGCG
TTTCTACTACTGCAATCTTAATTGATTGCCACAATGTTAAGTGGTTGCTT
CTTAGCGGTCTTCACATGATATTTTGCCGGTTTCCGCTTACACACGCTCG
TGTGTGCTACGGATGATCGTTTACCAGGTTGGTATACAATTTCTGTTGTT
GTGGATGGTTCAGTTCTGTTGGCGTATACATGTTAACTTATGTTATCCTT
TTTTTATCTTGCTGTAGGCACGTGGCTGATTGATCCTGTTGCCTCGCTCT
GATTTAAAGCGAGTCGCAACCTCGGCTGTTTGGCTGGCCTTTAGTTTTAA
ATTATGCCTATTGCACTACTAAACTTATATCAGATTGGCATGAGTTAGTT
ATGTATGCTGATATTTCCCTATGGTATCGCTGAACTTCCTGAGACGATTA
ATATATATGTATGCCGTGTTCTTGCTCTGCGTTTCTGTCATGCATGTGCT
CTTGTTTAGACCACTGTTCTAGCCTGCCTGTTTGTTTTGTCAGTAGATTC
ATGTGATCTTTCCGTGATTACAGAGTAGACCCACATCCTGATCGAAACAC
CCCAGATCACTCGAGATCGGCATGAAGCGCAGACCTAGGCGGGAGATTCA
GTTGTGGTGCTTGATGATGTGCAAGTTCTTTGTTTAATTTTCATTGTTGG
AACTTGATGATCTGGAACATTCGGTTGTCCAGTTTCACGGACTTGACGGG
GATGTATTTTCGGAGAATGGAGAACAAAGAAAGTCATTTCCTTTTTCAAT
TTTTCTTCCTTGACTGAATCTCCAAGTTCGCTAGAGGATGCCAAATCCCT
TGATTGAATCTACAAGAGAGTTTGTTTAACTGTCATTGCTGGGACATCTA
GCGGAGATTAATTCTCTTTAGGAGTTCGTAATCGAACTTTTTATTGATCC
CAGGTCCCTTGAGGACTAACAGTTCAGGGCAGATGGTCTTTTCAGAGAAT
GCATGTGGTGGTCTAAATAAAAGAGTTGATGTTTCTGAGGCCATAGTCAA
CTGCAAATTGTGTCTATGGTATGGTTATCTGAATTCTTAAAAAACAAATG
ACCGGAATTGTGGTTGCTTGCAGGAGAAAAACAAATCAGGTCACGTTAGT
CGGTAAGTGTCTCTTTGGGTGACGCAATAAACGAGGTGTAATCTCTGGTC
ATTTTGATACAGAGGAGCCAACAAAAGATAGATGACATTTACTAAATCAG
AACACATGATCTGCGTTTGTTTTGGACAACTCCAGACATGCTTTATGACT
ATCACATTCTGCTTTTAGGCTCTATTTAGATCGCGGCAGGTGTCAGAATT
CAGGTTGTTTGTAATAGGGTGATTCTGGGTTGTTATATGATAAAAACTAT
TGGGTACAAAAAAACGATTTGAAGGAATTTTATTTATCTATAGGTACTGG
CCGGCGGCTTCAGATCCGGTCATGGAGGGATCGTTACCTGGGAGTGTGAA
ACCTGGAGGGTCTAATTATAAAAATGAGGCCAGTTGAAATTTTTTGTTCT
CCACGTCAATTATTTCTGGATGGGAAGGAGTACATCGATCCGTGGGAGGT
CGAAATTCACCACCGTGTTCTCCTGGGTCTCGCGCTGAAGCCATTGAAAA
GAAGGGAGGTTCCCCCCGTATACGTGCGTGTCGCGCGAGGGTTCGTCCGC
GGGTACGGGATTCTTCCCGTCGGCAGCCATGGCTGCTCCCACCTTTTTTT
CGGGAAGGGCAGCAAGGAACGATTTTGCCATGCAGTGTGAATTTCTGCTT
CTCCAAAGGGTAGGTGCGAGATTTCACAAGCTCCTCTACACGGATGTAGC
GAGGTGGTGCAGCATGGTTCGTCGCCAGGTACGGCCAGACAGTACCCTCC
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CTTTTATTTGAACGGTGACTAGATCTGCTGCACCTTGCTACTGATACATC
GATGGTGTCCGCCTGGACCGGATCTGACTGAGGTATTGTGTTCACTTCTC
ATTCTCCGTTCGCAAAGTGCTTACATATGTGTGCCTCCTACTTTCGCTTG
GCCTGTCGATTCCTGACATTTTATTTGTTACTTCGCAAATGCTCGTGGCT
GATATTACTGCTTCCGGCGCCGTACAGTTGTCCGACCTAAAGTCCAGTCC
AGCTTGTTTATTTTGAAATGTTAGTTGCTTTCTCCGGTTCAGATTAATTG
ACTTGGATTTGTCTAGATTCGGTTGTATCTAGGTTTATTTTAATACTAGC
TATATCCAAATCTAGACAAATCCAGGTCAATTAATTTGGATGGGAGTGAG
TGATACTAACTGTATTTGTAGATCTTATTATTCTCTTTACGGTCAGTGAA
AATCTATGTTACTTGTTGTTCTTTTTCTCTCTAGATTGGTTTGTTATTCC
TTATTTCAACGGGCCTCCTGAAATCAGATACTCCAGTCTATGTGTATGGA
TATATTATTGTCTTGAATAAACACTCTACTTATATAGTTCTCTCTGCCTA
CGATTTGTATACTGTCTACGGTCATAGCACGTTGTACATTGTTGGTACTG
TGTTCAGTCACTATGTTGTGCTGCACAAATGGAGATTTCTTCGTTTTTAA
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TGCAGTTGAATACGGTGCTGATGGAGTGCATTCCGGTTCAGGCTTTGCAT
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CTACCGTGGTGGCCTTGGTACCGGTGCAGTAAAAGACATACGCATGGTTC
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TCATGAAGCCTCTGTGTATGAGCTTGGTCTCTTCAGGGTATCTGATCGCC
CGCAGATTATGAACCCAGTTGAAAACCCTTTGACCATATTCTTCACGGAG
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TAGGTACAGCCTGACACCTCTTGCTGAACTACCTGCACCACACGACACTC
CTCAACGGCTTATAGGTATGTAGACACATATGCTCTTTTTGCTTTCTCGC
ATGCCTTACATGCCTATTAAATGATTCCTTGTTACATATTGGTAGATGTC
CTTGGAATTATCCGGTCTGTCTCCTATATTGGCACTCATGATACGCCTAC
AAGAAGCGTTTCTACTCACAGGCGCTGTATAGTCCTTGCTGATATAAGGT
TTCTTTTGGATACTTTTTCCGTATCATGATTTTGCATTCTTCATGTCGTT
TTTCAAACTCCTTCAGTGTATATTCATTTCCCTTCTTCTTGTAGTGGCCG
TGAAATCCAGATCAATCTATGGGGTGAGGCTGCATTCCGGTTCAATGCAA
CTGTCATAGAATATCTTGCTCGAGATGAATCCGCTGTTGTTGTTTTCGTT
GGCATGACTGTACACTTACATCAAGGCATGTTCTTTGTTTTAACTCAGAC
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GATGGTACATCAATGTAGATACACCCGAAGTTAATGTGCTTCGTGTCGAG
TGCGTGTCACTTACATAGGTCCCTAATTCTCTTCCATACGTTTTCTATCA
CAATTACATCTGTTTGTTGTTTGTGAGCAGGTCTTCACACTTGTTTAGAC
CTATTGACTGGTTGCCTGCGCCGCCTCGAATTCACCTGCGGACGCAAGCC
AATGGTCTCTATCCAACTAGACGTCTCTCAACACTGCTGAACCATGAATT
TTTCCAAAATGAGGTATTCTTTCTGCGTTTTCCTTAGTGACGGACTGTAC
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TTAGGTTTCTTTGTTTGCAGGTTCATAGTATACACTTCTAGAGACGGATT
TTCTTGTATAGGTACCGCCTTCGACTTCTAGGGTCAGATGGCACCGGTGA
AGCAGAGTTCTGCATATCTGGAAGGATTGCTCAAAATTTAGTTGGTGTCC
CTATTCGCCAGGTCATACTCAACAACTATCATGGCGATGTGCCGATTGCA
AACCTGGCGGGTGCAGCTTCTCAGATTGTGCACACACCACCTGAGTTAGC
TGTTGTTGCCAACGCTACCTACAGATTTTTTTTACGTGTCAGCAACACTC
ATTTCCAAGGGGATTGGGCTTCCTTCAACGTACTAGCTGTTGAAGGCCGC
TTGCCAAACGAATGATCAATGGTTCTACAGATCTGGTGCTCCTTTCGCCA
CGTCTGTTCCTCTGTGCTGGTAACTTCTAATAAGTAGGGGAGAAGACCGT
CTTCTTATGTGACAAAAAAATATTAATTGGCTCATTTGGTAGTATGTAGG
GTCCGGATATCACCATGGTTCCTCTCAGTTTAGTATATGTTCTTCCAAAC
TTATGTATAATAGGCTATGTATGTCATTTCCCGCGTTCTATGATACCCAA
CCTATATTTCGAGCTTTGATGTTTCGGTTTTCTCTTGATGGGAAACAGTA
ATAGTCTCTGCTCTCGTTTTCATCCAGGCATATCACTGTTGGGAGTGATG
GGTATTTTACTAATTCATGTTACCACAAATATATTCTTGCAAAATATTTT
GATGGCACCATACTCCTGTGTTGTGCACTTTATAAAACGAGATAAACGCG
GTATATTTGCAGCGACATGACGGCTATGCCGTAACAGTGACACGATCCTT
GTTTTTCAACATGCGTACCTTGTGCTTTCCAATGGTTCAGAACTTCAAAT
ATTTTGAATTCCTGATTATTTTTTATTTTCTTACTTTGACCTATATGTGA
ATTTGAGACATTGTAAATCGCCAGCTGTAAACTTTGCATCTAAACGCTAA
TAAAGGGCACATACCGGATTCTGCGTCGTCACTGTGTCCCTAGGGGTTTC
CCCTAATCTACCTAGGATGTCCATTCCCCAAGATGCTTCTGCTCACCCTC
AACATCTGTCGGCCGTCTCCTCTCCCCATTTGCAGAAAAAACACATAGGT
TTACTTCAGACACGCAACAGTTGTTAACGGCGTAAAGAGAACACATAGAT
TTACTTCTGAATCAAGGCCACAACAGAAGGTATCTAACACATAGTTTCAC
TCTCCTAATATGGATTTGGGGGGGCTGGCAAAACTTTCCTATGGAATACT
ATCGTTGCTTTTCTTAGAGGACAGAAAAAAATTGTGCTGACTGTTGCGTC
GTCTGGTGTTGCGACGCTATTGCTTGCTGGTGGACGAACTGCACATTCGC
GGTTCAAGATACCTCTTCAGATTGAGGATAATAGTTTCTGTGATATAAAG
AGAGGTACCAATCTAGCAAAATTGCTAAAAGAAACCGTGCTTATAATATG
GGATGAGGCGCTTATGACGAGTAGAAAATGCTTTGAAGCATTGGATAGGT
CATTGCGTGATGTTCTTTCTGTAGATGATCCTTTGCTTGCTGATGTCCCG
TTTGGTGGTAAGGTTGTTGTGCTAGGTGGTGACCTGAGGCAGATACTTCC
TGTCATTGAAGGTGGATCTAGGCCACAGATTATTGATGCTGCTATAACTC
AGTCTCCCTTATGGAAAGCTGTTGTGCCTTTAACCTTGTCCCAAAACATG
CGTCTGTCCATGCCCAATGCGGATTCCTCTATCCAGGAAGGTATAGCTAT
CTTTAGTAAATGGGTTTTAGACCTTGGAGATGGAAAGTTGCCAATGACTG
CAAGAGAAGGCGAGACCGAACGAACTTGGATACAAATACCTGAAGACTTG
CTAATTCGTACGGATGGTGATATGATTGCTGCTATAGTTTCCTCTACGTA
CGTGGACTTTGATATTAATTACAAGAAAATGTCGCATCTATGTGAGCGAG
CCATTTTAGCGCCGACAAATGATTTTGCCTTCGAAATCAATGATCATATG
TTGTCTCTGGTACCTGAAACTGGTAGGGAGTACTTGAGTTTCGATTCCAT
AGCCAATGATTCTGATGTTGTGCATGAGGCTGATTTGTTTTATCCCGCTG
AGGTTCTGAATGGTATTGAACTAATCAATTATCCACAGCATAGGCTTGTA
TTGAAAGTTGGTGTTCCTATAATGCTGTTAAGAAACTTGAGTCAGGCAGA
TGGTTTGTGTAATGGTACGCGTCTAATTGTTAAGGACCTTGCTGATCGAG
TTATACAAGCCGTTATCATGACGGGTTCCCATGTAGGACATGTTGTATAT
ATTCCAAGGATTGAATTGATCTCTAATAAAACAAGATATCCTTTTCTGTT
GAAAAGGCGGCAGTTCCCTGTTCGTGTGTGCTATGCAATGACAATTAATA
AGAGTCAAGGCCAAACTCTTTCTTTTGTCGGTATATATCTTAAACAACCT
GTTTTTAGCCATGGTCAGTTATATGTTGCTGTATCCCGAGTCACGTCTAG
AGCTTGTTTGAAGATCCTTATTGTAAATTCCGATGGGTCTTGTGGATCAG
AAACTCGGAATATTGTGTTCCCTGAGATATATGCTTCTGCTGGCATGTCC
TGAGTTGCTTATTTGTTTTATATCTTGTCTACTATTTGTGTTTAGTTGAG
ATTGTTTTCTACTTTTTTAAAACCAAGGTTTATACATTGTCAGCTTTGTC
TCCGTGTACATTAATAATGTTGTTCTATGCTTACCTTTCGTTTGCGAATT
TGCTTAGACCTGCAATTGTTTGCCTGGGTTATGGTTTAGTTAAGGGCTTC
TCGGGTGTTTGCTAGAGATGGTCGATTAAACTCTGCTTGCTTTTGCATGT
TCGCTTTTCGTTTTTATGTTTGGTTGAGGTTTCAATCTTCTAGAAGTCTT
TTACATCTTTCCGGGGTGAGACTGTGTGTCATGCTTCACTGGAACTTCTT
GGTTCTTGTGTCTGCTGGCCCCTATGCTCGTGTGACCACTCTAATAATGT
GTTGGTTCTAGGAGATCCGCCCTATGTCTCTTCTTTATTTCTGATTTGTG
TGAGTGATTTAGTCATTCCCCTTTTATATGTATCTACTATCATGATGTTG
CTTTACTTGTATATGGTTTTTTTAATGTCTTCGATATGTTATGATGTTTT
TCTCTGGGCAGCTCCTCACCGATGTCGATGCCTTCCAGGCTGATGACACG
AAGGAAGGTGGAGTGCATGAGCAGCTGGGGGAAGATTTCCTTGAATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.