Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA003109

[Submit comment/correction]

Sequence	AA003109
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA003109
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCGGCCCCAAAAAACCAAAAGCAGAGCAGAAAAATAAAGGCGAGAGACTG GTTTTGGAGAGAGAAAGCGAAGGTGGAGAGAGAGAGATAAGAAAAGAGAA ACCCGGCGGCTAGAGCCAAGGGGAGAAGGAAGCAGACGGAGGCGGCGGCG GCGGCCAAACCCTAGCCGACGGGCCCTTGCGCACGGTCGGCTCGTGTGCG GTGCCCTTGCGCCGCCGGATTCGACTGGTCGGCGCCGGCAGCTGCAGATC GGCGGTCGCGCCGCCGGAATCGTGGGAGATCCCGCCGGGATGGGTCCGCG CTGGCTGTGAGCTACGTCTCCGGTTTGCTCTCTCGGGTTTCGCCTCGCTA GGGTTTTGGGCCGCTCGTTGCGGCTTTTCTGGGGGCGGTTGGGGTGTTTT TACGCGGAGATTTGGGAGGGGATCTGCCGCGTAGGCGGGAGTTCTCCCTG GTCGTGAACGCTGGAGACGCAGGGCGGGATCGGGGGAGCCATGTCGTCGC TGAGCAGGGAGCTGGTCTTCCTTATCCTGCAGTTCCTCGATGAGGAAAAG TTCAAGGAGACGGTGCACAAGTAAGCGTGCTCTACTTGATCAGGACAAGC TTTTGGAGCTATCTGGAGTTGTTGAAGCTCGGGTTTTTTATTTTTATTTT TATTTTGGTCGCGCAGGCTGGAGCAGGAGTCGGGCTTCTACTTCAACATG AAGCACTTCGAGGACCTGGTGCAGGGCGGGGAGTGGGACGAGGTGGAGAG GTACCTCAGCGGCTTCACCAAGGTGGAGGACAACCGCTACTCCATGAAGA TATTCTTCGAGATCCGCAAGCAGAAATATCTCGAAGCGCTTGACAGGTAA CAACCATATAATGAAGCTGCTCCTCGTGGTCATTGGTTGGGATAAAATGC GATTCGTGCTGAACTCGATCGGTTTTTGCAGGCATGATCGGGCCAAGGCA GTGGAGATACTCGTCAAGGATCTGAAGGTGTTTGCCTCCTTCAACGAGGA GCTATTCAAGGAGATAACACAGCTGCTGACTTTGGATAATTTCAGGTATG GCGTTTGTTCAGAGCCTTTTTGGTATAGCAAAATGTTTGCGCATTGGGCC AATGTGGTCTAATTGTGCCCTCAATCATGAACAGACAAAATGAGCAGCTG TCCAAGTATGGAGACACAAAGTCAGCCCGCAATATCATGCTCATGGAGCT TAAGAAGCTTATCGAGGCAAACCCTCTGTTCCGGGACAAGCTTAATTTCC CTCCATTTAAAGCCTCAAGACTGCGCACATTGATCAATCAAAGGTGCTTT GTTGATTTATTATATGATATGCTTTTAATTCCATGTTGCTATTTTAATTT TTCCCAAGGGTTGCAATCTGCTCAAACAGTGTTTTTATAGTATTTTGAGA GCAATATGATTCACAATGATTAAGACTCCGTGTAGATACAGCAGGCAGCT CATGTTTTTTCTCCAGTAACACATAAGTTGGAAAAAGAGCGGTCACAAAG CTGCTATACTGGGGAGGGTTTCTGTTTGTATTTGTTTTCTTCTAGTTGTG TTTCCATGTTTCCTTAAATTGGTGGATGAATAAGACAAAGGGGTCTGCAG TGCTTATATGGAAACAAACTAGAAGTTTAACACCTTCACGATGCAAGGGA TATTTAAGATTATTGGTTGTCAATGTCATACCCAGACCAATTAGTTCGGA AATTAAGTGTGACGGTTGCCTAAAAGGCTAAAGGAATTAGCATCGTTTAG TGCTTTACTAATTCCTGGTTGTAGTTGTGAAGAGGGAGTTGCCCTGTCCA TTTCGTAAATGTTGTCCATGTAAACTTCAGACATTTGATCACTTGCATTT TAGTGGTTATCTATTCATAACTTGCTTTAATATTTTCTGCTTCTCAGATG CATTTTAGACCCTTGGATCAACATCCAACCACTGTTGTCTATAGCACTTC ATCAGAAAGGACAAAAACTGCACAGTTTACAAAAATTGCACACTTCAAAA TTGTGAACTGTAACTTTAGGCCAACAAATGTGAAGTTTTAGGTGTCTTGA AATTTGCAAAAATTTAGGCCACTGAGAATTTGCAAAAGTGTGCAAGTTCT CATTCGTTCAGCAGCTTAACTTGGTATCTATTTGATTTTTTCCTTTCAAG ATATTTTTGTAATCAGTTGGGTAGTCTCTATGGGGTTCCTAGTTAGCAGA TTCTTATGGAATATAACAAAGATACACAATCTTGTGACGTGCCAATTTTT TATAGTGCCTGTTTTTTTCTGCCTAGTATTTTTCTGGAATGTTTTTCTGC CTAGTATCAACATGCAATGTTTGGTCTTTACTGTTTGCCATAATGAAGAC CTACTAGGGTTTCAGTATGCCTTCTCTTGCTTTAGTTTCTTGTAAAGGTT GATGCTAACTGGACTGCTTTGATTTCTTATGTCATGCAGTCTTAACTGGC AACATCAGCTCTGCAAGAATCCCAGACCAAATCCTGACATCAAGACACTC TTCACCGATCACTCCTGTGCTGCTCCTACCAATGGGGCAAGAGCTCCTCC ACCTGCCAATGGTCCTATTGTTGGACCAATCCCCAAGACAGCTGGATTTC CGCCAATGGGTGCTCATGCCGTACGTATTTTGCAGTAGTGGAACATTTCG ACTTATTTCTGTCATCCTATCATTTACCATATTCTCAATCTTGCAGCCGT TTCAACCCGTGGTTTCACCATCTCCAAATGCAATCGCGGGTTGGATGACA AATCCCAATCCATCCTTACCACACCCTGTTGTTGCACAAGGGCCACCTGG TCTTGTTCAGCCTCCAAACACAGGTAAGATAAAACTGCAATTCAGAAAAA AATGATGCCTCTCATTCTTGCAGTTTTGATTGTTTTTTTCTTTGGATGCT CAATTTGTTTGCAGCGGCCTTTCTAAAGCATCCAAGGACTCCTACAAGTG CACCTGGCATTGACTATCAATCTGCAGATTCTGAACATCTGATGAAAAGA ATGCGTGTGGGCCAGCCAGATGAGGTATTTGGGACTTAGACTTAACTGGG TTTCTGCTCTTTACTCATATCTGTAACATCTTATGATGAAACAAAATTTG ATAACCTAATTAAACTATGTTAGGTGTCATTCTCTGGTGCAAGCCATCCT CCCAATGTGTACAGTCAAGAAGACCTCCCCAAACAAGTTGTTCGCACACT CAATCAGGGATCTAATGTAATGAGCCTCGATTTTCATCCTGTTCAACAAA CCATTCTTCTAGGTACATGCTTCAGACACATCGCTTTGTTCTTGAAAAGC ATATTCTGCTGTATTTCTGATGTTTCTGCTGTAACACAGTTGGAACAAAT GTTGGTGACATTGGGATATGGGAAGTTGGTTCACGAGAAAGGATAGCGCA CAAAACATTCAAAGTTTGGGATATTAGCTCATGCACCTTGCCTTTGCAGG TCATTACTTCAGTGATCCATACTTGCTCAATTTTGTTCCGTGCTGTTTTA CCAACTTTTGGTGTGCTGTAAGCCTGTAATTAGCAAGCCTGTAATTAGCA TCACTATGACTTCCATTGCCATGTTCTGATGCACAATCCGTGTTGTTACT TGCTCAATTTTGTTCCGTGCTGTTTTACCAACTTTTGGTGTGCTGTAAGC CTGTAATTAGCAAGCCTGTAATTAGCATCACTATGACTTCCATTGCCATG TTCTGATGCACAATCCGTGTTGTTCTGTGTTCAGGCTGCACTCATGAAAG ATGCTGCAATATGTGTCAATAGGTGTCTCTGGAGCCCTGATGGAAATATT CTAGGTATGAAAAAAGGCCACTTAAGTGCTATTGTTCACATACAAGCCAT TAAAAAAAGGATTTTGGTATTGCTGTACTCAAGAGTGTTCCATTCATTGT AACCTTTCTTGCTTGTCTGCAAAATTGATTCTGTATGCTGGATTTGATTT TTCAGGTGTGGCATTTTCAAAGCATATTGTTCAGACTTACACATTCATTC CTAATGGGGAGTTAAGGCAGCAAGCAGAGGTACATGCATAGTGATGAGAG TAGATATCGAAGTAGTTTTCATTGTACCTTTCAGCCTGTTTGGTTAGGAT GGAGCTTGGATTCAAGTCCTTAGCTGGACTATGTCCTCAACCCCCTGTTA TTCCCAAACTAATTCTCCGCATCCAAACACCCTCATAAACGTTCTAACTA TTTAACCCTTTGTAAATTTCACAGATTGATGCTCACATTGGCGGGGTTAA TGACATTGCTTTCTCTCACCCCAACAAGTCCCTATCAATTATTACATGTG GTGATGACAAACTCATTAAGGTGAGTTTACTCATATGATGTATCACTGTT TTAGAATGAAGCAACACATCCTTAGCATGTTTGTGTTCTATATGCAGGTA TGGGATGCTCAAACTGGACAAAAGCAATACACATTTGAAGGTCACGAGGC TTCAGTATACTCTGTTTGCCCTCACTACAAAGAGAACATTCAGGTACTTT CTGGATGATTTCATGTCTGTTATTCTAAAGATATGCTCCATTTTGTACTG GCAGTGTACTCATTATTCTGGCTGTTGTCCATTTTAGTGTAATTTTCGTG ATAAAAGGCTTCTCTTTGCCGTTTTGAGCTATCTTAGATTAATTTTGATA TCCCAGTGTTTTACTTCAAACTACTTCATTTTTATCATCTGTCCTATGGG TTTCTACAACTTTAGCTTGTCTGCAGTTTATCTTTTCTACTGCCATCGAT GGAAAAATCAAGGCATGGCTATATGACTGTTTGGGCTCACGGGTCGACTA CGATGCTCCTGGACATTGGTGTACTACCATGTCTTACAGTGCTGATGGTA CAAGGTGAGAATGTGAAAAATTCAGTCAGCATGTTGATGGATGAAAGATC TACATTTTTCCACTTGCTTCTCATGTGCCGATTTTTCAATCTTTATGCTT TTTATTTATTTCAGACTCATATATTTGTTTGTTTGAATTTTCCTTTCAGA CTCTTCTCTTGTGGAACCAGCAAAGACGGTGATTCCCACTTGGTTGAGTG GAACGAGACTGAAGGGGCTATTAAGAGGACATATAATGGCTTCCGGAAAC GGTCACTAGGTGTCGTCCAGTTTGACACTACGAGAAACCATTTTTTGGCT GCTGGAGATGAATTTGTTGTAAAATTCTGGGATATGGACAACACCAGCAT ACTAACAACAACAGATTGTGAGGGTGGACTGCCTGTAAGTATATTTCTGT GCTTTTTATAAAAGATGTGCATACCGAGGGTCTTGCTTAACTTACTAATT TATGCAGGCAAGCCCACGCTTGAGATTCAATAGAGAAGGGTCATTGCTTG CTGTTACAGCAAATGATAATGGAATAAAAATATTAGCAAACACCGATGGG CAGCGTTTGTTGAGGATGCTAGAGAGCAGGGTTTTTGAAGGCTCTCGTGG ACCTCCTCAACAAATTAATACCAAGGTAATGCCGCATATATTTTTCATTA ATGTTGTTTTGTGCCTAGGGTTGTTTAGGGTACATTACATCAATTTCTTG TTCCCTGGTGTTTGTTTTTCTTTGCTCTATGCTGAAATTTGTTCAAGCCT ACAACTGTTGCCTATTGTCTAAACGACATTTCATGTCTTGTGTATCCTTA AGGTGCACTCAAGATGAGTTCCAATGAAGGATTTTTTTAAACAACTGATT TATTTAACTACAAATAATTCCATTGAAGCATCTGTATGTTCTTTTTTGTT TTGACTTAGCAATTACCGACGATCCTGTTAATAAGTACCATGTTTTCACA TTTGTTTCTTAATGCAGCCTCCAATGATCAACACCCTTGGTTCTGCTTCA AATGTATCTAGTCCTATAGCAGTGAACTCAGAGCGGCCTGATAGGATGTT GCCTGCGGTATCAATGAGTGGATTGGTTAGTTCTGACAGCCTTTCATGTT CTTCAATATGCTGGCTTGCTAAATGTCCCAAACAAATTTGCAGGCATCTA TGGATGTTAGCAGAACTCCAGATGTTAAACCAAGAATAATAGATGAGTCT GAAAAGATGAAGACCTGGAAGTTGTCTGACATTGTTGATTCAGGACATCT TCGGGCACGGCGTTGTCCAGATACATCAGCTTCTCCAACCAAAGTATGTT AGCGATGCTGCATGTTTATCTCTTGATCTTTCTATGCTTTGTTGATGTAT AAATATTCACCATGCAATTTCAACTTGAACATCTGATCCAGTCTTTTTTA ATTTAATGTATAAATGGACGGTAGTCATATTTATCTGTTCGTTGTGTTTA TTCAGAAACCATGATGCGACTTAAGGTATAAGTAGTAGTAAACATACTAT GTTGGCAATGGGAAATTTCTTTTTTGAGAGAAAAGCTAGCATCTCAATGT ATTGAAAACGTAGGAAAACAATGTAAAATTTATGAAGAGTGACATCTTCT GTTTGTTTTCTCAACAGGTTGTCCGTTTGTTATATACAAATAATGGGATT GCACTTTTGTCTCTTGGCTCGAATGCTGTTCATAAGCTGTGGAAATGGCA ACGCAGTGACAGGAATCCGAATGGCAAGGTAGACTGAAGAATTTTACTTA TTTGGATTTCAGTTCAATCCTTTTTGCTTACCTTCTGAATTATCTCTACT CTCTTTTGTTAGTCTACTGCATCTGTTCCGCCTCAACTGTGGCAACCAGC AAATGGGATTCTAATGACAAATGACACCAGTGATGGCAACCCGGAAGAAG CAACTGCTTGCATTGCATTGTCCAAAAATGACTCCTATGTAATGTCTGCA TCTGGTGGCAAAGTCTCATTATTCAATATGATGACGTTCAAGGTAAATGG CTTCTTCCGCACATAGAAAACTAAGCTAGTGCAATCCTGTCACTAATATG CACTTTATGATATCATATCTTCCTGACAAGGCATAACTTTTAGGGTAGCA ATCATCTTAATTGAAAATCCTCTTGTCACCAGTTCAAATCTGGTTGGGTC TCTGACTTTCCTGATCAAATCTGTGGAACCTTAGGTGATGACTACGTTCA TGGCACCTCCCCCTGCTGCAACTTTCCTTGCGTTCCACCCACAAGACAAT AATATCATTGCTATTGGGATGGAAGACTCTACCATTCAAATCTACAATGT CCGTGTTGATGAGGTGTGTGCCATTAGTTTGTGATCCTCACTTGAATTGT ACAGTAGTATAGTTGCTGTTAAATAATGTATTCCTTGTTTCACATTTTGT ATCTACTCTTGCTTCCAACGATCCTATTTGATGATCAGAGCTTATTACTC TATGAATGCCATTTAGTATGTCTTTTGACATACAATTTCTAACGCTCAGA ATTCCTTTTTTTGGACTTGGTATGAATAATAATTGAATTCTTTCATGTCG AATTGTTCTTAACATTGAGTAATTTTCCATCAAATGATTTAAGAGCCATG TACTAATGTTGACTTAAAAAAATTACGTAGGTCAAAAGCAAGCTCAAGGG CCACCAGAAAAAGATTACTGGACTGGCATTTTCTCAATCAATGAATGTCC TCGTATCTTCAGGTGCCGATGCGCAGGTATGAATTTTACTAGATCTCTAT GCATGTACAATTCAATTCAGTCACATGGCAGCCCATCATTTACTCTATTT ATTTTATTTGTGTTTGCGCAAACAACTGTCATATATTTGTTTACGAATCA TTGATTGAACAAAATTTTGCAGCTATGCGTTTGGAGCATTGATGGTTGGG AGAAGAAAAAATCAAAATACATCCAACCCCCAGCAAATCGTTCTGGTGCT TTAGTTGGTGATACAAGAGTGCAGTTTCACAATGACCAAACACATCTTCT CGTCGTTCATGAGAGCCAATTGGCCATCTACGATGGAAATCTTGAATGCT CACGCTCGGTTAGTCATCACGGAAATTCCTTCCTTTTTGTATCTGCTCGT TATATTCACATTGTGTCTTAGACTAGGTTTACATTGTAACACTGCTTGGT ATTGCTGAAAAATTTCAGTTATACAATTGTTTTTCTCTGTGAATGTGTCA TGGGGTGTTGTGATCGATTTCATTGATTTCTCCTGTTGTTACTTTGATAT TGCAGTGGTACCCAAGAGATGCACTTCCAGCTCCGGTTTCGAGTGCAATA TACTCTTGTGATGGTCTTCTGGTTTATGCTGGATTCTGTGATGGCGCTAT TGGCGTATTTGAAGCAGAGTCTCTTAGGTTACGTTGCAGGATTGCACTTT CTGCTTATGTTCCTCCTTCAATATCAAGGTATGTCTGATTGTAACAGCTT GTTTCTATTTTCATACTTGTTGTTTTGCTAGTCTTATTCCAAGTGACTAT TATCTTATTACTGTTTGCCCCTGTTGCATACAGCGGGGGAAGTGTGTACC CCATGGTTGTGGCCGCACATCCCTTGGAGCCTAACCAGATAGCAGTTGGC ATGAGTGACGGGGCAGTTCATGTGGTGGAGCCATTGGATACGGACCCAAA GTGGGGAGTTGCCCCTCCCCAGGACAACGGAGCCCACCCGGCGATGTCAT CAGCTCCAGCCGCATCTAACAACCAGGCATCTGATCAGCCGACGAGGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.