Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA023486

[Submit comment/correction]

Sequence	AA023486
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA023486
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCAGACGCGGTGGCGTGCGGGTGCCACAGGGAGGATGCCCGTGTAGG CGCTGGTGCTATGCACCATCCTCCTGCCCGTCGCCTTCCTCCTTGTCCTC CACAGGATCGTTCAGTTACCATCGTCCTCACCTGCCTCCCTTACTTTCCT GATTCGTCTTTGTCTTACTTTCCTGATTCGTCTCTGTCAGTCTGTGCAAT TTTTTGATTGCTCTATGGAAGATGGGAATGCGTCATCTAGGATGTAGTTA AGTTGAACAGAATTTCTTATATTTATGTGTTGGATCACATTCAGGGAATG GTATTTTGAGTACCACATGTCCAGTATTTTAATTCTTTCTCTGTTCTTTC CTCGTCCGGGCTGCCCATGTCCAGATTTTTATTCTTTCTCTGTTCTTTTC CTATGTCTGCAGAGCTATGTGGACATGAAGGTTCAGATGAGACCACAACA CTAAACAGAGAGACAAATTGACGACGGTGACCCTGATGACTCGTGGTGTT TTGTCAAGCTTCTTGACCATTTCAAGCACTCATGCCTAATGGGAGCGATG TTTGCATGGTGTTTGAGTTTCTTGGTGGTAATTTGCTCATCCGGATGAAG TACATGGGTTGTCATGGGATTCCACTTAAGCTGATATGCGGATACATGCT CATTATCCTTGACTACCTGCACAACGTGCTTTTTGACCCCTTCCAATTAT GGGAATTGCAGTGTGTGTGTGAGCAGGAGGGGCAGAGGTACCCTAAGATT TGTGGCATCCTTCATAAGTGGGTTTTTGAATTGGCAGCAGATAATAGGTG TGATATTCAAAAGTTCAGTGTAGTTTTACAGAAACAGTTAAGTGAATATA AAACTTGTCTTTGCTTGATTTTATTTTATTGTTCTTAGAACGTCGTTATA GTCTATGCCATTAGGATAAGTAGGAGTGTCATTATCATTGAAGACCATCA CTTTACCAGTAAGAGATATCCAAAAATTTGAGGGGTATGGGTATGGTATG TTTTGACATATTGTTGCATATAAGGAGAATAGTCAGAGAGTATCTCAAAA TTAATGTGTGTTTTTACATTTTCATGATGCAGATTATTTCAACTTATGTT CACCTGCACAGAAGTCCTTGCCATTTTATTCAAGAGGTATATGCAAGTCA GTACTGATCATGCAATAAAATATGGTGAGGGCAGGTCTTGGCCTTGCGAT TTGTAATCAGTTGGTATGTTTTCCATCAGTTCAAGTTACTAATTCATCCA AGAGACATAGTTAAGATATTAGTTATGTACGTATTAAATACTAATATCTA GAAATATGACAATAATTGTTTCAGTGTTAGCGATAACTAAACAGGTCCAC TGTAGTTTATAAAATTGTGCAACCATTTTACTGAATTTTCTCAATGATTT GGTGAAGTTGATGGGTGGTACTCAACTCTGGTTAGCTACGAGAATGAAGG ATCAAAATTTTACATTCTCAATAACTTGCAAAATTCCATAAAAGAGGACC ACATTGATGATTCCTCATGTATTTTATTATCTCCGCCTTAGCCTTGTTCC CATCTACTTCATCAATTTCCTGTTCATCGATTCCATGCAGCTCAGTCTGG GACTTGCCAGCGGCCAGAGAAGTCTCCTCTCCAAGACCCGTTACTTTTCC AAGTGAGCATATTATATTTAATACAGTGCATGCATATTGATCTTCTAATG TGTTTATTCAGTCAAGATTCCGCTATTCGACTGAGTTGTTATTGTATTGA TACGTTGGGAATTTTCAAATTGAGCAATGTAGATAAATATCTCCGCTATA AGTTACTCTTGTTCTTTGTAGCTTGTTCGGAGATTATTTATGTGGTGCTT GATGGCAAATGCTATTGTTCCTGGACTATATCAAGATGTGATACTCCATT CCACCCCCACTTCATCCTTCACTCCACCGTCAGATTCCTCTCGCCCAGCT GCTACGGCTATGACGTGCCCCAATCCAAGCAGAACAAACAGAAGTACGTC TCCTGCTCCCTCTCCCATTCATTCTTTTTCCTACTATCTCATGCATATTG TTTAAAAGTCTATTACTATAAATACCATCTCTAATTTGAATACTCTTTTC TTGTGTTGTACTATTGAGGATTTAATGTTTCTTGTCATTTTAGGATTTTG AAGGATTGGACCATCAGCGGCTGAAAGAGCTGGTGCTCTAATAAGATTTT AAAAAATATGGTGAGGACCTGTTTGTGGCATGAAACATGTGTGCCCAATT TCTGAAAACAGGGAAAGCAAGATGGCATGAAAGCAAGCCCAGGTAATCGT ATGAAGGTTGTGGTTTAGGGTACGCCAATTGAGCGAGTTCATGTAGCAGT CAGATCTATATAACCGTTTTTGTTACAGAGCATAAACACGACATTCCAGA GTCGGTGTTCGTTTTTATTTTCCATATAAACTTTCTGCATATTATTTTTC GAATTAGCGGATGCTTCTCTCGCTTGTTAAACAGAGGGAACAAAAATGGG CACGCCACGGGGAATGAAGGTGGCTGCCTCGGCGAGTCAACACCGCGCGC TTTAGAGTTGGAGGAGATCTGCAACAAGGAAAGGGGAGGAGTGGAGTGGC CGGCGGATGCATGTCGGAGGAAAATTAGGTGGATGAGAAAAATGGGAGAG GGTAGTGATCTTAACTATGTCTCTCTGCTACTTGTGTCAATTCATTCATT TATAGTTTCTTATATCCACGTGAAATTCATATGTTTATGTTGTTGGTGGT AAGCCTTATCAGTTTGCTTGATGAATTTTGCACATATATTAAATCACTAA CCAGTTTTATATACATATGCCCAGTGAAGCGCAAGGCCTATTTCCTATTA ATCAAAAAGATCACTATGGTTTAACTTCTAGAACCAGTATGTAGGCCATT TCCTAACAAATATATGTATTTATTTCGGCCTCCACTACTATCAACTATAC ATACTGAAATACTTTAAAGTGATCTTGATAAGGTATTATACCAGCTTGGG TGAGATATGACAGTAAGGAAATCTTCATTAGACAATAGGTTTTCTGGAAG GTAAATATATAGTAGTAATGCTTTTTCTTTTGCACTCCTCGGTTGAAGTT GGTGATCCAGAGCAGCTAGGTGATTATCCTGGGGTTGCACCCTCAGTGTA AAAACATTAATGCATTCATGGTTACTTCAATTCGTGGTTCGACCCTTCCA TGTATGTCTCATGGATCGATGCACCCATTACATATGCATTATATGCTTCT GGCATTTTTCAGCACCAGCTCATTACCCTCTTCATTCTCTCTAGAAGCAT GAACATGTCACTCCGACTTAGTATATTTTGGTCACCGTGTTCGATATAAT TGGAAATTTCTTTGTCAATTTCTATCTTATCAACTATCTGTTGTATAATG ATACTTTCATGAGACATATTTATTTTGTTTTCGTGTTACCCCACAGTATT TTTTGAAGCTAGAGGTTGCAAATGATTTGATGAAGTTGATGGGTGGTACT CAACTCTGGTTAGCTATGAGAATGAAGGATCAAAATTTTACATTCTCAAT AACTTGCAAAATTCCATAAAAGAGGACCACATTGATGATTCCTCATGTAT TTTATTATCTCCGCCTTAGCCTTGTTCCCATCTACTTCATCAATTTCCTG TTTATCGATTCCATGCAGCTCAGTCTGGGACTTGCCAGCGGCCAGAGAAG TCTCCTCTCCAAGACCCGTTACTTTTCCAAGTGAGCATATTATATTTAAT ACAGTGCATGCATATTGATCTTCTAATGTGTTTATTCAGTCAAGATTCCG CTATTCGACTGAGTTGTTATTGTATTGATACATTGGGAATTTTCAAATTG AGCAATGTAGATAAATATCTCCTCTACAAGTTACTCTTGTTCTTTGCAGC TTGTTCGGAGATTATTTATGTGGTGCTTGATGGCAAATGCTATTGTTCCT GAACTATATCAAGATGTGATACTCCATTCCACCCCCACCTTCATCCTTCA CTCCACCGTCAGATTCCTCTCGCCCAGCTGCTACGGCTATGACGTGCCCC AATCCAAGCAGAACAAACAGAAGTATGTCTCCTGCTCCCTCTCCAATTCA TTCTTTTTCCTACTATCTCATGCATATTGTTTAAAAGTCTATTACTATAA ATACCATCTCTAATTTGAATACTCTTTTCTTGTGTTGTACTATTGAGGAT TTAATGTTTCTTGTCATTTTAGGATTTTGAAGGATTGGACCATCAGTGGC TGAAAGAGCTGGTGCTCTAATAAGATTTTAAAAAATATGGTGAGGACATG TTTGTGGCATGAAACATGTGTGCCCAGTTTCTGAAAACAGGGAAAGCAAT ATGGCATGAAAGCAAGCCCATGTAATCGTATGAAGGTTGTGGTTTAGGGT ACGCCAATTGAGCGAGTTCATGTAGCAGTCAGATCTATATAACCATTTTT GTTACAGAGCATAAACACGACATTCCAGAGTCGGTGTTCGTTTTTATTTT CCACGTAAACTTTCTGCATATTATTTTTGGAATTAGCAGATGATTCTCTC GCTTGTTAAACAGAGGGAACAAAAATGGGCACGCCACGGGAATGAAGGTG GCTGCCTCGGCGAGTCAACACCGCGCGCTTTAGAGGTGGAGGAGATCTGC AACAAGGAAATGGGAGGAGTGGAGTGGCCAGCGGATGCATGTCGGAGGAA AATTAGTTGGATGAGAAAAATGGGAGAGGGTGGTTATCTTAACTATGTCT CTCTGCTACTTGTGTCAATTCATTCATTTATAGTTTCTTATATCCACGTG AAATTCATATGTTTATGTTGCTGGTGGTAAGCCTTATCAGTTTGCTTGAT GAATTTTGCATATACATTAAATCACTAACCAGTTTTATATATGTATGCCC AGTGGAGTGCAAGGCCTATTTCCTATTAATCAAAAAGATCACTATGGTTT AACTTCTAGAACCAGTATGTAGGCCATTTCCTAATAAATATATGTATTTA TTTCGGCCTCCACTACTATCAACTATACATACTGAAATACTTTAAAGTGA TCTTGATAAGGTATTTTACCAGCTTGGGTGAGATGTGACAATAAGGAAAT TTTCATTAGACAATAGGTTTTCTGGAAGGTAAATATATAGTAGTAATGCT TTTTCTTTTGCACTCCTCGGTTGAAGTTGGTGATCCAGAGCAGCTAGGTG ATTAGCCTGGGGTTGCACCCTCAGTGTAAAAACATTAATGCATTCATGGT TACTTCAATTCGTGGTTCGACCCTTCCATGTATGTCTCATGGATCGATGC ACCCATTACATATGCATTATATGCTTCTGGCATTTTTCAGCACCAGCTCA TTACCCTCTTCATTCTCTCTAAAAGCATGAACATGTCACTCCGACTTAGT ATATTTTGGTCACCGTGTTCGATATAATTGGAAATTTCTTTGTCAATTTC TATCTTATCAACTATCTGTTGTATAATGATACTTTCACGAGACATATTTA TTTTGTTGTCGTGTTACCCCACAGTATTTTTTGAAGCTAGAGGTTGCAAA TGAACCTTTTCCAGAATTGCTGAATCGAATTACAACCAATATTCTTGTAC CATTGCAAGTGACACTATGGGCATGTTTCTTGCGCTTATTCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.