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GrainGenes Sequence Report: AA002672

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Sequence
AA002672
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002672
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGGAATTAGATTTTGCGAACTAATAGACCCGGTTAAACGAGAACCAATCT
CAGATTTACACTCAGCTAGCTGCTCCGTTCCGATCCACGCTATATAGCCC
CCTCACGCCGCCGTCCACACTCCCCCTCCGTCTCCACGGCCGAGCTCACG
TCATCACGCCACCGTCGACCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCAACCC
CATGGCGGCACCCGCAGACGTCGTCCCGCCAGCGTCAGGTATGTATACTT
CCATCCCGCCTGCCTCTCCATCAGGCTAGGGTTACGAGCCGGCCGTACCT
GCATAGCTAGGGCCCGGTGCCGGGGCGCAGGAGATGGACGCCATCTCCGT
CGCATCTGACGCCGCTCGCTAGACTCGTTGTTTGCTCGTCGTGGACGTCG
TTGTCGGTTTTCAGGCCTAGATCACACACACACACACACGCACGCACGCG
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CTGCGTCTTTTCTCGTTTTTTCCTTGTATTCAGTGTCCGGGGAAGGACTA
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TCTGGATCATGAGTTCATGACGTGTTTCTTGGCGGTGCATATCTTAGTCT
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TGCGGCCATAGCAGCCTCAACATCCTGAGGGTAAGGGTAGCTACGGAGCC
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CGTGCTACTACTTATTACTCAGGTGGTTAATTTGTTCATTTCTGTATGCA
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GTTACCAGCAGTCCACCACCTACCATGGTAGGCGGCGCAGAAGGTATCTG
TGCTCAACAAAAACTAAGCTTTCATCAAGAACAACGGCAAAATCACCAAC
AAGTAAGATCAGCAAACCTTTATATTACTAGCTACACGCTATATTACACT
TCACCAGCTACTCGTGCACTACATATATACATGCATATGTTTAATCTATA
TATCAACAAGTAACATCAGATTTTCTTGACATGTCTTGGTGGATGAAGAA
AACTACCCTAGAACTTATGAAGCTACTAAAGCACGAAATAGATTTCAAGC
TTCTCCACATAAAAGAGACATTGGCACACATTAAAAAAGGAGGTTCTGTT
GACGACCAGGCGGCTGATGCAGAGGCCAAGTTTGCTCAATTACAAACGGA
TTTCAAGGTATGTACCTACCCATACAACGTTGATTTTACTTACGACCTCC
TTCACAGACAGTATATAATATGCGCTTCCTTTTTTTTTGTCTAACATCAC
AACAGGAGCTTAACCCCCAAACTCAGATTTACACACAGTCAGCACCAAAG
GCTCCATTATTGGTACGTCTTCTTTTGTAAACTTTCTCAGTTCAAAGTCA
AACTCCATTTCTGCAATTGGTTGGCATGATGGTTGTCTCTCCACTTCCGC
GAGAGATCTTTGAAGTAGGGATCGGCCAATGCCTGATTTATATATAGGAC
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AAGATCATAGAAACCGGATCCGCCAACTCAACTCTGAATGTTCAATGGCA
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TCCAGTTGGAAGATTACTATTGTGTGATTTATGCATTTCTTCATCTATAA
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AATATGTTCATGGGTATGCACGTACAGTGCAGACGTTAAGAGCAGACGCT
AGGCTGATTTTCCTGGCCTTTAGGCCCAAATCCCGTCCGATCCTGGGATT
TCCCCTAGCGTCGAGGCGAAACGAAGCTGTGGTTGCTAGGACTCTTTTCT
ATCGGCTCACCAGTGTTTGATTAGCCCTCACAGTTGTCCCTAGCGACCAG
ACTTAGTGTTGCGCGTTGGGAGCCCAGACGCTTAGCCATAATCTAATTTT
CTGGTATTTATTTTTCTGCACTTGAACGTCTATGCAAGCTTCTAGCATAG
TACATGGCTGTGTGCATCGCTCGATGCAGCTGGGGCTTCGCTCTGATGGA
TGCAGCCCCTCTTTCTTCTACCTCTTAATCTCTCAAACTGCCCACTCTCT
CTCTTTCTGTATTACCTAAGAACACACGCACACACACAACCATGCACCAA
GGAAGAACACAAGCTTTGCCGTGAGACTCCCTTGGCTGCCACAAATACTA
CATCTTTCCTCTCTTTCTAATTCCTTTGGTCACCTTAAATACACGTACAG
GACTAGGCTGCATGCAGCCACTACTGCCGCTATTCACTCCATGATCCACA
TGACCCGGCCACTACATGACTCGGCTAAACAACTAGATAAGCTTGTATCT
AACTAACTAACTAACGGACCCACTACTAGCTTGCATGTACGCACATGATC
TCAACTAAATGTGAGTACTTGCCGCAACCTGTTGTGCTATCTTGGACCCA
ATACATACATGAACGAAAATCAACACTAACTAACAAGATTAGTTACAACA
ATCACCTCCCTAATCTTGTTGTCACTTATTCCTCTCTTGAAGCCCCTTGT
TGTCGATGTCGTCGGTGCCACACGCAGACGGCCGCCAATGCCATCTTGCC
GCACCGATTGCCGCCGTCGCCGCTGGCCTCTACGAGAGGCACACCTCCCA
CGCCTTCACCATGAGCGCGCCGCCGAGACACGCTCGCTGCCGCATGTTCG
CCACCGGTGCCGCAACTCGCCGGTGAACCACCTCCTTGTTCGTCACCAGT
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TCGCCGGTGACTTTCCTCCATGTTGTCGTCGATGACGCCGACATGGATGA
TGAAATCTTCATGGCAATGGCCTCCACACCATGGCCATCACCTCCTTGCC
ACCGGTGACACAACTTACCGGGCAGCATACCTTTCTCCTCGCTCGTGACG
CAGCTAGACGACGATGGATACTCGGGCCTCGAACGCACGAGGCTCTGATA
CCAAATGATGGGGCTGCATCTGGCAGCCCCTCTTTCTTCTACCTCTTAAT
CTCTCAAACTGCCCACTCTCTCTCTTTCTGTATTACCTAAGAACACACGC
ACACACACAACCATGCACCAAGGAAGAACACAAGCTTTGCCGTGAGACTC
CCTTGGCTGCCACAAATACTACATCTTTCCTCTCTTTCTAATTCCTTTGG
TCACCTTAAATACACGTACAGGACTAGGCTGCATGCAGCCACTACTGCCG
CTATTCACTCCATGATCCACATGACCCGGCAACTACATGACTCGGCTAAA
CAACTAGATAAGCTTGTATCTAACTAACTAACTAACGGACCCACTACTAG
CTTGCATGTACGCACATGATCTCAACTAAATGTGAGTACTTGCCGCAACC
TGTTGTGCTATCTTGGACCCAATACATACATGAACGAAAATCAACACTAA
CTAACAAGATTAGTTACAACAATCACCTCCCTAATCTTGTTGTCACTTAT
TCCTCTCTTGAAGCCCCTTGTTGTCGATGTCGTCGGTGCCACACGCAGAC
GGCCGCCAATGCCTTCTGTAACTTGTTGTTTCCCAGTCATTTTCTTTTTG
AACTTGTGTGTTCCTTTTCTTTTTGGAGAAAAAAGCCGTGAGCTTTATTA
GTTCAAAGATACCGAGTAAGAATCAGCCAACAGGCTGTGTTCTAAGAAAG
GAGGACTCGCTGCCAGCCAAACCTGCGACGTCACGTTATTATAAGCAAAT
TTTGCACAATTGTGGGCCGTTTGGTTGGCTGTTCGGTGGACTAGACTAAT
ACTAAAACTTTCAAAAGATAAGCCTAGCTCACGGACATCATCTAGGATTG
GACAAATAATAGACCGATCATTTCCCCCTTCCTTCCAGATAGGAACCAAC
TCGGCGCAGTCCACTTCACAGACTACCCGACTGTAATTTCTGTCCACTGC
GAAAACAACGGCATCACGCAGGGCCAACGCTTCGATATTCAGCGGATCAG
ATAGTCCCCGGTACAGCTTGCACCATGCCCCTAGAAATCCAGAGCTGTCC
CGAGCCACACCACAGCTTCCTGCTACACCCTCATCAAACGACAAAGCACC
ATCTGAGGTGATCTTGACAGTCCCCATCGATGGTAATTTCCACTTACACT
CCGGCCTTCTAGAAACTGAAGCTTTTTGGGCCGTTGGCAACTCTAGAGAT
AGCAATGTATCCCTAATGAACTTCAAAGCTTTTTTTTTCGAAATGGGGGT
AACCCCGGCCTCTGCATCAATTGATGCACACGGCCATATTTATTGCAACA
TTCCAGACCAAATTCAAGTTATTACACTCATGGATCGGAAAGGGTTGAAA
CATGTATGAACCATCTAAACAGAAGCAACAAAAAGCTATCCATTTTGAAT
TCTACTAATGTGCCGTCACCTAGTAGCCTGGAAGTAGAAATCCTGTGTAA
CCATAAGAAGATGGCTGCATCCAGCCTCCATAGGTTCCCGCTGATCCGCC
GGGAGCAGGTTGGACCATAGCTGTATCCAGTGCACCGCCAATCGTATAAC
CTGCAAAAAATTAGTTCCCGTTTGTTTATTAAATACAATATTATTTCTAG
TTATCCAAATGGACCAACCAAGGCCTCTACTCCAATGCGTAATCTAGCCT
TATCAACTTTTCCAACACCATTAAGCCAATTACCAAACATATTTGTAATA
TTTGATGGTGGGGGGACGTTATATGTAAAATAAACAATTCTCGAAATAAT
ACGGGCAAAAGGGCATGAAAGAAACAAATGATCTATAGATTCCACTGAAT
CACAAAAACAACATTTCTGACAACCCGTCCAATTGCGCCTAGCCAGATTA
TCCTTCGTGAGAAGGACTTTATTTTTGAGAAACCACATAAAGATTTTAAC
TTTCAGGGGTATTTTTAATTTCCATAGGTATATTTATGTAAAAATCTTGT
ATGCCCATTCATCTGATCCAAGTACAAAGATTTAACCGTAAAAATACCTG
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GACATTAACCTTTGACACAAATGCAACCAAAGTGTCCACTTATTACCAGT
TAAACCCCTCCTAAAACCAATGTTAAGAGGTGTTTGAGCAAGTACAGATG
ATACCCTAATATTTTTCCTATTAGCAATATTATATAAGGACGGGTACTGC
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CACGCATCAGGCCTTTCCAAAAGGGAGAGTCCGTTGGTTTTATGTCTACT
TGAGATAAAGTTTTTTCCCCAAGGTATTTATTGTGCAAAATTTGCTGCCA
CATACCCTCTTCGGTTAGGAGTTTGAATAGCCATTTGCTAAGTAAACATT
TATTTTTTAACTCAAGCACCTCTATACCTAAACCCCCTTGATCCTTTGGC
CGACACACAATATTCCATTTAGAGAGCCTATACTTCTTCTTATTTTCTGT
ACTTTGCCAAAAGAACCTTGATCTATAGAAGTCTAGACATTTTTTAACTC
CCTTAGGAATTTCCAGAAAAGAGAGCATAAACATTGGGAGGCTAGTTAAG
ACAGAGTTAATAAGGACAAGTCTATCCCCATAGGATAACGATTTCCCTTG
CCAACACCCAAGTTTAGATGATAATCGGCTCTCAATTGGATTCCACTCTG
AATTTTTCAATTTTCTGTAGTGAATGAGTACACCGAGATGTTTGAAAGGT
AATGAACCAGACTCACACCAAAAATTTCTTCTGTATTCCGATTCCACCTC
TTTTGCCTTTCCAAAACAAAAAATATCACTCTTATGGAAATTAATTTTTA
AGCCAGACAACTGTTCAAAAATGCAAAGGATTAATTTCATATTAACAGCT
TTTTCCAAGTCGTGTTCCATGAAAAGTATCATATCATCAGCATATTGAAG
TATAGAAACCCCTCCGTCTACCAGATGTGGGATAAGGCTTCCTACTTGAC
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TTGAAAAGGATTGGAGATAGTGGATCACTCTGTCGTAACCCTTTTCGAGT
TTGAAAATAATGACCAATGTCGTCATTAACTCTTATTCCGACACTCCCCC
TTGCACAAAATGTTTAATCCACTCACACCATTGTGAATCAAAACCTTTCA
TGCGTAAAACTTGTTGTAAAAAGGGCCACTTCACTTTGTCATATGCTTTT
TCGAAGTCAATTTTAAAAAGCACTCCATCCAATTTTTTACGATGTAATTC
ATGTATAGTCTCATGCAATACGACCACACCCTCAAGGATATGTCGTCCAG
GCATGAAAGCTGTTTGAGTGGGTTTAATAACTTTTCTATTAGTTGCCACC
TTGGTAAATTTTTTGAAACTGACATTCAGTAAACATATGGGACGATATTG
TTGTATTTGTGTGGCATTTTATTTTTTAGGCAGAAGAGAAATGGTCCCCA
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GCCAGAAGGCCCTTCTTAATAACTTCCCAAAAAGTTTGATAAAATTCTTC
GGGTAACCCATCTGGCCCTGGTGCTTTATTATGCTCCATTTGAGATATAG
CTTCAAAAATTTCCTTTTCTGTAAATTCAGCAGTAAGAATGGCATTTTCT
TCTGCTGACAATTGAGGGATATCATCAATCCTGTCTTCCATTAAAACAGT
GCCATTATGATCCGGCTCCCCAATTTTTTTTATAGTATTCAGTAATAAAA
ACTTTTAAATTATCCTCCCCAAAAATAGTTCCTTCTTGTTGCTCAAGCTC
AATTTTTTTCTTTTTTTCTATGTTTGCCATTTGCAATCAGGTGAAAATAC
TTGGTGTTATTTCCACCTTGGACATGTTTAACCTTAACACGTTGGGCCCA
TTTAGTTTCTTCATCACGCCTAAGTTTATTAATGCTTTCATTTGAATTCT
TAAGAGTATTCTTCTCTTGATCAGTCAAAGGAGAAGTCTCGGCCTTAATA
TCCAATTTATCAATAATGGCTAACAGACGCTCTTTTTCCTTCCTTGTATT
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ATTTTTTCTGCCATGTAAGAATAGGAGTCTTGCCCTCAGTCACAGATATG
AGTCCATTTGATCCTTGAATCCCATATGGAATACATGATAGTAATTATCT
TTGGTCTATCATCCTCCAGAATATTCTTCTTTGCCAGAATATCCTTTGCC
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TGCTATCCAGAACAGCTGAGCATGAGAGCACTCAATCAGAGCATGCTGTA
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TGGCGTCGGGTAAGGGTCGAGAAACGTGCATAATGCCTTTTAAAACCCTC
CACCAAAATATTCGTACCTTGGGGACTACTCTAATCTTCCACAATTCCCC
ATCACCGACTGATGAGGATGCATCAATGTTATACTCCTCTTCGTTCATCA
TCAAAGCTACGCCGATCGGACTGTGTACAGACCCGATTTCTCCTTTGCCC
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GCATCAGCATCAGGGGCTAGAAAAATCGAACGGACCTTCTTTTCATTCCA
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CCAAACGTCCCATAGGACGCATAATGTGGGAGTTGGGAATCCATTTGTCC
TCCCAAACTGAAACCGTATGGCCAGTGCCTATTCTCTTTATAAGGCCAAG
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CCCGTGGCGCCTTCGCCTCCATGAAATCACGATCTGGGTAGTAACGTCCC
TTAAGAACTTGTGCAGTTAAGGAATTCGGGGCTGTCATCAATCTCCAGCC
CTGCTTTCCAGGAGCGCTAGATTAAACGCGAAACCCATGCCTCCTCTCCC
TTTTGGTATTGCCAATTTGTCCCATGCCAACCAATGCATAGATCGTTTGT
CAAGATTGCCACTCCACCAAAATTTTGCCATCAGTGATGTGTATTTCTTG
CACGAGCCTTTGGTCAGATCAAAGCAACTCATACTGAATATCGGTTTTGC
CTGAATAACCGATTTAAGAAGAACTTCCTTCGCTGCATAGGATAGGAGTC
TCTCCGCCCAGGCAAACATACCACTTTTTGTACTGTCGGTGATGTACTTC
TTACAGAAAGCTTCAACGTTGATATTGAGCTCCTGTTTCATTGCTTCTCG
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TAACCAACTGGCCTGACGCCGCATTGTAAATATCTAGAATCTCGTTCAAC
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AAATAAAAGATGGGTAATCCACGGTGATCTATTGCAAACCCTCATACCTC
TGTCAATATAGCCGGGATTATAATGATTCAGAAAAGCCGTCAAACCTTCT
CCGCACAGGAGAAATAGATATGGAGACATCGGATCGCCTTGTCGAAGGCC
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AAACCAAGCTTGTGCATAATCGCTTGAAGAAAAGGCCACTCTACACGATC
GTAAGCCTTCATCATGGCAAGCTTAATCGCACATTGTCCTTCTTCCCCTT
TTTCTTTCTTTTCATGGATTGTATGCACTCAAAAGCCACAAGAGCGTTAT
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TCCTCTAACACCGGTCTCATCCGGTTTGCAATTGTCTTTGAACAAATCTT
GTATAATACTGAGCAAAGAGAGATCGGTCAGAATTGGGAGATGGACTGGG
GGTTCCGTACCTTTGGAATGAGCACAATGGCTGTGTTATTTAGCGAAGTT
GGAAGCTCCCCTCCATTAAGAAAACCCAGCACCGCTGCCACTAGATCCTC
ACGAATAAGATCCCAGTGACGTTGATAGAAACCAGCCAATATCTATAAAT
GAGACATTGTCTGTTTTTATTTGCAGCCAATATTGTTAGCCTGAAGGTAA
ATTGCTAGTAAATCATAGATCCTAAGCCAACTAAAATAATTCAACCACAC
AACTGCAAGCAATTGTGAGGCTGTTCTAGTGTTTCAAGGATTATTTCCAA
AAGTTGGAGTGGCATATTTCCAAGTTTGGTTTTTGTAATGGAATATTTCC
AAATGGTGAAAATTGTAATGGCATAAATCCAATTAACTATATTTTTTATG
CTCACATGTCAACTTCTAGAGAACTGGCAGTGTCAAGCCACAAAAAGTTC
AGTTACTGACTTCTACATTTCCTGCTTGCTTACCAATAGAGCAATTAAGC
TGATATCTATATAATAAGCAAGGTGCTAGAAAATTATACTACAGTTGTTT
CTAACAATGCTAAAAATGGGCTTATCGACATTCCAAAGTAGAGCAGTAAA
TGGATACTACACAGTAATTGTTTCCCCTGTTGTTGTATTGTACTATAACT
GCCAATGTAGTTGTTTCTATACTACACAGTAATGATTGCTCAAATGGATG
TTTAATTAGACATGACAAGTTGCTTACAGACTTCTCCTTAACTTGGATTC
TTGCAGCATTGTTATTTTTTCTTTATGAACCCATTGTATCTTGTTAGGCT
GAGGGACTAAGCAGATACAGACATTGTATCATTAGGAAGTTCTTCTGGTA
CAAAAGTTTAAGAGTCTGTACTAGTAATTGTGTATAATGAAGATCTGTTC
ATTGAACTTACTGATCTTACTGTAACATGCCTCAGCAACTCCACTTCACT
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TTGATAAATTAATGGCTATTTTTTAAAAATATTTATGATCAAAGGGATTA
TCCTGTAGCCATCTTTTCAGTAAAGATCACTGCTTCAAACATCAGTTATA
GTACCAGTGTCTTCCTTTACCACATAATAATTAGATTAAACCATCTACAG
TACCGGGAGAGAATGCAACGCTTTGGTGACGGATGGTACTATCGTGAAGC
AATAGGAGAGCGTAAATTTCTTGAGCTTTCTTTAAACATATCGTATCTAT
TTGTTGATCAATTTCAGTTTGGTCAACTTATTTCTTGCTACAGTGCAATC
TACTTAGCAGTTACTAGCTATGCAGAGCTCTCTCTTTCAGAACACACAGC
TTTTAAAAGGGAGATACGATCCGTTTCAGCACCCCCCAAAAACAGGGGAG
GATAAGATTGATGCATCGTTCTGAAAGTATTTGGGGATAGTACCCGTGGA
TTTCACAATGTCATTAACACTAGAAAGTGGAAAGAGGAAAAGGGTACTTC
ATGTGTTAGCTTCCGAATACGAAAGCTGCTTGTGACAGAAAACAAGCATA
AATGTTACTCCTTTTGAAGAAATGTTATTCCACTGTTTGATGCTAAATGT
CTGTATTCAGGAGGAGGGTGGACCTTTTGATACTTTAACGAATGAAGATG
AGTGCAGAGTTCGTCATGCTCTTGATGGCGGGAATAGGTGTTGCCCTCTT
TTACCCTTGTTAAGACACAGTAGGCTGCAACCACATTTCTTGTGCAAAGG
TCTATCTTAATTAGCACTGTCTGAAGTCTGCCTTTTTTCCTTCCAGTTCT
GATGAGGTGTTATTGGTGCATAAAGCTTCAAATATTGAATTAAAAAGAGT
GACCTTGCAGTGCTTGAAAGATAAAGGCTTGCTAAATGATGAGGTATTCT
AATTTTTTTGCTATATGTTTAGATGATCTCTCTTATCGGACTCCAGAGTA
AGCATATAGAATTTGACATTAGTATATAACTGTTCCTGATTATTTTCAGG
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CCACTGCTATGTCCAATGACTTGTAACATCATTTTGGCATGGCTCTGCTT
TTGCTTGCAATCGTCTTTACTTGAGTCCCCGTAGAGTTGCATTCAAGTAT
TTCCTTGTGTGGTTGCGTAGTGTGTGCATCGTACCTAGCTGATCTCACTG
CATTTTCTGGCAGGAAGTTATCGATATTGATGCATCGTACCTAGCTCACT
TTATCACTAAAATAACTCATAATAGGTTGTTTATGCCACCAGAACAATTT
AGTCAACCTCATAATTTTTCTCATGTTTCTGTTAACAGCTGAATGGTAAG
AATGGTGGGTATCATTATGAGGCCGTTAGGAGCTGGACAAAAAAAAAGTT
AGGGTACAACATAATTGATTGTGATAAGGTAAATGCTCTCATGCATGGTC
CTTAATTTTCAAGCTTTAATCGTCATGTGATTTGACTATCCTTCTAACTG
GAACTAGTTACCATGCCCAGATTTTTGTTCCCATACACAAGAAATTCATA
CACAAGGAATCCCATTGGTGTTTAGCGGTCATCAACATAAGGGACAAAAA
GTTCCAATATCTGGATTCACTTGGCTTCGAGGATATGAAAGCCCTGGAAA
TCTTAGTAAGTGATATCTCCCTCCCTCCCTAAGCTGTTTTTTCCTTTGTT
TTCTGTTCAGGACATCAGCCTAATGTTAGCTTTTTCCACCTCTACCAGGC
TAGGTATCTTGTGGATGAGATAAAAGACAAAAATAACAAGCAGATCGATG
TTCTTTCATGGGAGCAGGAAGTAGTCAAAGAACGTCCTTCCCAGGATAAT
AAGTATTTCCCTTATCTTTGGCAATAAAGTGCTTTCATGGTTTTTCTGCT
TGAACTTATATACACTATAATACATGACATGCTCCTCGAAGTTAGAGAAA
ATTATAATTTCCCACGTACTGTACTAGTATTTGATGAGGTGTTTGTTTTC
TTAGCACAGACTGTGGCATGTTCATGCTCAAATACATTGACTTCTACAGC
AGAGATATGGGTCTTATTTTTGAACAGGTACTAATGAGCTCTGCTTTACC
TTTTCTGTATTCACTATTTAGCAGAAGAAATTAAACAAGATTTGATGGTT
CATTATATATTACATGCTAAAATAATACACTAAAGTGGTGTTTTGAATGT
GTTATCTTTTCATAGAAACACATGCCTTATTTCCGGAGGAGGACTGCCAA
GGAAATATTGGATTTGAGGGCTGGATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.