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GrainGenes Sequence Report: AA028837

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Sequence
AA028837
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA028837
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATCGACAGATTCATCATTCGGGCATAAGTTTCCACAAAAACTCCAATCAG
GTCAAATGAGGTCATTTATTGAATCTTGGTATAAGAGGTTTGATTGGTTA
GAGTATTCTGTGGAGAAAGATGCGGCCTTTTGCTTTTATTGTTATCTCTT
TAAGCCACCAAGGATAGGAAACTATGGGAATGATACATTCACCAAAAAGG
TTTTGTTAATTGGAGAAATGGCTTAGAAACTTTCAATGCTCATGTTGGCA
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AATCAAAGACAAAGTGTGGCACATGTATGGTCCGAGAAAGGCACAGAGAA
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AGCTTCTCCAAGATCACCATGACAAGCTTGTAGCCCAATTGGAAAGTGGT
GAAATATTTCCAGGAAGAGGAAAAAACCAAGAAACTAGTCTTGCAAGACC
CGGTGATACAAGGTGGGGCACACATCATAAGACCTTGGTTCGTCTTCAAC
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GAGAGTGAGCAAAGAACTAAAGCATCAGGTTTGATAGAAAGAATGGAGAA
CTTTGAATTTATACTTGTCTTGCATCTTATGATCAGAGTTCTTGGGAAAA
CTCAAGAATTGTCACAGTGTTTGCAAAGGAAGAATCAAAATATTGTTCGT
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GAAACATACTTGTGCCAAATATGAAAGATACAATACCAATCAGGGGTCGC
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TAATATCTTTATTGTTGTGATTGATCAAATTCTAGTTGAGTTGAACAATC
GGTTTGCTGAAAGATCGACACAATTGTTGAGATGTATTGCTTGCCTTGAT
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TAAGATATATGCTTTAGACTTCTCCGAATATGATTGTGTAGTTCTGAAAA
CACAACTTGAAACCTTCATTATTGATGTGAGAAGTGATGAAGATTTCTCA
AGTTGTAATGATCTTGGAAATCTTGCGGTGAAGATGGTTCAAAGTGATAG
GCACACATGCTACCCGTTGGTGTATCGTCTGATTGAACTTGCTTTGATTT
TGCCCGTGGCAACGACAACAGTTGAAAGAGCTTTCTCTGCTATGAATATC
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AAAACCATTGTTAGATCTTAGTGGTACGTTCTATTGTTAGTACTTTACCC
TTCATGTAATCTTTCATATCCATTTATAATATATATACTACTTTATATGC
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ATCTTGCGAGAATCCATTTGACCATGTTCTTTCATTATTTTAAGAGTTAT
TTGGAGACCACTATCCTTTGTGTAATTTATTGTGAACTATTTTTATCGTA
CTTTTTTTATTATCTACCAAAAATTTAGACATGTCATAAGTTAGCCCCCT
CCTTTGTCCATTCCTAGGTCCGCCACTGTTAGGATTGATTATCCTCATAC
TGAGTATGGTGAATTCAGGATTTGCTCCTGACGGATGTATCGAATGTTGT
GGTGAAAGTGTACAATCTCTGCAGAGTGTCAAACTATTCGAATAGCCGCG
TCCGCGGTTATGGACAGTTGGAGTGGCCGTACTGTTCCCCCGTCAGACTT
TTTTTTAAATGACTTGTGAAATGAATTGAAACTTTGACTTGACCACAACA
GGGTTGTGATATGAAATACTAGTTCCCACTTAGATGTTATAAACTTCAAC
TAGCAATTGTTGCCCTAAACTTAGTAGAGATAAATCTGGCTTTTTGCAAA
ATAACCCTAGAGCCTAGTGTCCTATTATCAAAACCCCCTTTCACTTGTTA
GTATTAGTTTGCGAGAACTTAAAGAGTACTCATGGCTTTGTCCCTGGCTA
TTCCCATGGCCAGACTATGAAGAGGAGTACCTGGAGGATGGACCCCAGGA
AGGTTACGACAACTAGGATCATCTCCCATCGTCAGCATTGCATGTGACCC
CGAATATGGAGCTTCGCCTACGCTACCGTTATTATGACGTATTCCGCTGC
TTGATGTTGTATTAAGAACTGTATCATGATATCCCTATTTGTGTAAGAAC
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GTCTCGCAAAAATGGTAATCCTAGGATTGCGATGTATGGCATAACAGGCA
TCTAGGATTAAAAATCCGGGTGTTGACAGAGATTCACCGGAGAATAAGGG
AGGCCTTTTGTGGCATTGGTCGTTTGATACCACCCCCTCTCCAAACGAGA
CGTACTCCATGTTGGGAGGAACTCGGTAAAATATCGGTGTCCCCGCGTGC
CTCGGTTATCTCTATACCCAAGCCCTTTACTTATGCACTTTACATTGTGA
TAGCCTTCGTGCTTGCAGTAATATATATCTTGCTATCACTTTGTTGCTTG
CATTGCTTAGCATAAGTTGTTGGTGCACATAGGTGAACCTTAGTTGTTCT
AGGTTGTGCTTAACAAAGTAAACACTAGTTTTATTCCGCCTTTGTTGAGC
CACTCTAGGAAAAGTTTTAATCGCCTATTCACCCCCCCCTCTAGGCGACA
TCTGTATCCTTTCAATTGGTATCAGAGCCCGGTCTCTCATTTTAGGCTTC
ACCGCCTTGAGAGTAAAGATGTCGGCTAGGGGATTAGTGCACAAGGACAC
GCTCACGTTCGATGGCACAAATTATGATGTTTGGAAAATTCGCATGCTTA
ATTTATTTCGGGAAATTCACCCAATTATCGAGGGATATCTATATGTGGGT
CTCTCTTCTTGTATGGGTACCCAAAATGAATCTTTAGAGGAGAAGTTGAA
CTCTCATATAGATGCTCTAGCTACTAAAATTCTTTTGCATGTTGTGAGCA
ATGTAGTTCTTTCTTCTATCATGCCTTATTCAAGCGCTCGTGAGATATGG
ACCAAGCTTCAAGATAAATATAGCAAGTCCAACATTATTAAGGATGATTG
TGTTGCTTCCACTTCCGGTCGAGATGAGTTCTCATCGTCTACCACTTCAC
CAACATGTGATTTTTCACAAGGTAATGATATTGTGAGTGGTGATAGAAAT
TGCAATATGGATAGTGATATTACTACTTGTAATCCTTCATCCCTATCTAG
TTGCAATGATCTATCTTTGGACCTTAACACTTCTAGCACTCAAAACTCCT
TACATGCTTGTGTTAATAGTCGTTGCATATCATGTAGAAATGACTTGAAT
AAATATCATGATGATATGCTTGTGTTATCTTGTTTCCATGATAAAAATGC
TTCCATTTCCTCTAGTGCTTGTGTTGCTAACCATGTAGAGGAAAATGAAG
ATTCTATGGGCCAAGACAAGGTCTTGAAGAGAGCTACAAGTGCAATCTCA
TCATCACCTTCCTCCGGTTCTCACATGTGCCTTATGGCTAAGGGAACAAA
GGTAACCTCTTTGAATCCCATTGTATCTCATGATGATGATGATGAGGTTG
AGAATGATAATGATGATTATAGAAGTAAGTATGATATTACCTCTATTAAG
AAAAAAATGGGAGAGGTTGTCTATAGCGCTCTCTTCGAAAATAAAATTGC
TTCCTCCAACTTTCTTGAAATCTTGAATTGTGCCATAGAAGGCAATGATC
TTATTGAGGAGCAAGAATTAATTGATGAAAAGTTTGCACTTGAGCGTGAG
TATGCTAATGAAGTTGCACAACTAAATGACTCCCTTGAAGAAGAACAAAC
CACCAAAGAATCTCTTGAGGAGACTTTTACTCTAGAATTATCTAGAGTAA
AGGAATACCATGATAGAGAACTTGCGGTGGCTAACTTATTCAAGATTAAA
AATGATGAACTTGAAGTTTCTTATTCTAAACTTGTTGAGGATTTTAAGCA
CCTCGAAAATGGCTCTCGGGTCGTTAAGAGGGAGCTCATCAAACTCACTG
AGTCACATGAGCAACTTAAAGCTTCATATTTAAAAGAGCTTGACAAGTTG
CCCTCACCTCTTGCTAATAATAATGATGCTTGTGCTACTAACTCTATTTC
TTGTGAAGCATCTATTTTGAAGGAGAATGTTGACCTAAAGGCTCAACTTG
CTTTGCTAACTAGCAACTATGGGAAATTAGAAGAAAGTCATGATAAGCTC
TCGAGCTCGCATGAGAATCTTCTAGTCTCCCATGGTAGGCTAAAGTTAGC
TCATGAGGCCATCGTGTCAAAGGTTACATCTAGTGGGCCTCATGTGGACA
TTAGCACTAAATCTACTCCAAATGTTATATTTCCATGTGCTAGTCCTTGT
AATTCATCCTCTCACAACCATGTTATATCTCGTGATGAATTACATTTTGT
GCCTTGTTGCTCTAACAATGTAGCACCTACTTCCTTTAGTACTTTTGTTG
AAACTAACCATGTAGAGGAAATCAAAGAGCTCAAGGATCAAGTCACTTCT
TCGAAGAATGACTTGAAAAAGGGTCATCAAGGGAAGGTCACACTCAACAA
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AAGAAGAATGGCCAAGATCAAGTCAAGAATCCGGCCAACATTGTTTGCTT
CAAGTGCAAAGAAGAAGGGCACCATGTTAGATCTTGCCCATTGAAGAAAA
AACCTCTTAGTGTGAAGCAACAAGGGAAGCGGACTCAAGCTCCACCTCAA
GTCATTAATGGGCCTCTTCCTAAGAGGACTACTCGAGCTCTTCCTCAAGT
TGTGGATTCTCCTAAGAAGAAAGATGGCAAGAGTAGAACTTGCTACATAT
GTCGTGAGAAGGGGCATATTTCTTCCTCATGCACTCTCGGTATCTCCTCA
TCCAACCCTATCATTATTGATGATGCTTATTCTCTTTGGAAGGATGAGGT
TGGCAATGTGTTTGCCAAATTTGTTGGTGCCCAATGTGGTGTCAAGAAAA
GATCCATTTGGGTTGCCAAGCCTATTGTGACTAACTTCTTAGGACCCAAC
TTGGTTGGGGACCAACAAGCCAAAAATTGATCAATAGGTGTGTTTTGGAG
GGCATTGGAGACTTGGCTACATCATGAAGAATTAAGGGATCTTCATTATT
ATATTTGTCAAGCCAAGTCATGTGGTTTATATTGCTCCTATTATTATTAT
ATTTCCAATGTTCCTCCTTGCGGTAACATATGCTAAACTCTTTACATTGA
AAGTTACTCGCCCCCTTGTGCATGCGTTGGTTTTATATCTTCCATGTTTT
TGTACATGTTGTGATATCCACTTAATTATCTTGAAATCAAGATTATTTGT
GTATGATTAAGTGGCACACCATGTATGTATGTTTCTTGTGTTTGAGCCTT
GCTTGGTTATATTTGGTATCCTATTTGGCTCTTGTGAGAAATTAATGGAT
TATCCCATTTTGGGGGAGTGTTATGCTTGGGCATTCCACAATCCTAAAAA
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TTAATTATCTCTATTTGTATCATTTTGCCTCGTGTTGGTTTTATGGTAGT
ATCACATTATGGGGGAGTCATATGATTAGTGCATATTACAATCCTAGAAA
ATGTGAATATTCGAGGTTGTGTCACTTAGAATTGATATTGATAATTATCT
AGCACCTATGTGACACATTTGCTCATACAAGTTCCAATTTGCTTGAATGT
TGTTGTTGATCATATTTTGGATCTTGTATACGAGAGTGTTTCTTGGTATG
TGTTTCCTCATATTTAGATCTCTATATTCTCATGGAAACCATTTACTTCA
AGTCACTCTAATCACTATGATTGTGTGACTATTGGAAGCTACCAAGAATC
TCTTTCGAAGCATCAAACTTAATACGTATACTTTGTTACATGCTTCTTTG
TGTGAATACGATCTTGGATATCCGTATGAACTACCTAGGGAAGATTATTC
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ATTGATCATATTCACTTTGGCCTTTGCTTAATATTGTCCTATCTTTGGCC
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ATGATCTCATTTGTGTGCATTTTGCATTCAAAAGAAAAATTCTATATAAT
GTACTACTTATGGGTGAACTCTCCTATATTATCTAGAACAATCCTTTTAT
GCTTCTTTGTTTGATCCATATCGAGTTTTATATGCTTGGATGCTCAATCT
TTTCGTTTTGGTACTTCGTGCCATCATGAAAAGTTTGGGGACTTTGGTTT
CTTGTTGGAACCTTGCTCTTTTTGGGAGTTGGTTTTGTCTCATACCTTGT
TTCTTGATTTGACCATTTTAGAATGAGATAAATCCTTGAGCATTTTTATT
TCTATCTATTTTTGCTCTTTTGGCCTTAGCCTAGTTCATTTGTTGAACTT
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TGTCTTGTCACACTCTTGTGTGTGCCATCTCGGTTTACTTGGTGTTTTTG
TTCAAATTGTATCTCATTTTTGGTTCTTGAAAGCCTTGTGTATGCATATT
TACTACATATCTATATTATGGCATGCTTGCTTTCTTTGATCCAATATATA
GGGGAAACTCCACCAAATCCCATCGGCTAAGTTGTGCATGAAATTCAATT
TCATATCAATATGCACATATTTATGTGGAGTATCTCCTATGTATTGTAGT
TGCACTAACTACTTTGGTCCCAATAAGTTTGGAGACCATTTTGTACTTAA
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GAAGAAGTGGTGCGTTAATGAAAATTGGAGGCATGCTATAGGATGTTCAT
TGATTTCATATCCTCTACATCCTACCAATTATATCTTGGTAACAAGTATC
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TGGTACTATAAAAAATCATGCATATGATCCTCCAATCCCAAATAGGTCAA
TCTAGCAATTTTATTGCCTATCTTTTCCTCAACTTCTCTCATGTGTAATA
GTGAGATTTTGCTAGTTAAATTTTTCTTGTGATACTTGTTGCCTTTCTCC
GTATATTCCAACTTTCTCCTCTTCCCTTGGTGAAAGTTGTAATATATGTA
GTGTGTTGGTGTTTGAAGTCCATTAATGTACAATAAGACATATGTGAGCC
TTTGGCCATGCTTTGAAGCAAAAAATCTTATTGATATATGTTATGACTTC
ATTTTTGCCTTTCATGTGTTTTCTTGTATAATCTTCTTTATGTGTGCATA
TTTCTTTTTTGGAATATGTCTTTGTGATATTTTCCACTTAGAGACATATA
CACATATGAGAAGATAATTTTAGTTGATTTTTAATCCTTGGAGACCACCT
TTCTATTCCTTTTGATTCTTTGGTGGCTTCCTAATTTAATTGCCTATGAG
TGCTTGTTCCTGTTGTTTGCACATTTTGGCACTCATATTTGTTCTCTCAT
GCCTTGTATTGTTAAATGAACTTGGATGAGTGAGGATTCCATGATTATGC
ACCTTGTTCCCAAATGCAATTATCATAATTGGTGCATTATCTTTGGGGAG
CTCATCCATTTCAGTTAATAATGCTCATTTGTCTTCTTTTTTCATTTGTT
GTGTCTTAAATGATCATGGGGGAGCGAGGATTCCATATTTGTGCAATATG
CATTCTAATGCATTTATTTTGAATTGTGCACAAATCTTGGGGAGCTTCTC
TATTTGTTATTTAAAACACTCTTTTGCTCATATCAAAATATCTTGTTGTT
TCCTTTTGGACTCATTTGTTGTTTTCAATTGATTTGTCGGATCTTGTGAT
TGCTTGCGTCATTTGTGATGCGTCGGTTTATTTTATTTCTTTTGGCAATC
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GGGTTTAAGGGAAATAGTTTATTCTTTGAGTTTGTTCTTAAGCATTTGCC
TTTCATGCTCTTGCATCGTTGTTGTTGCTTAGCATGTGGTATATAGTGGA
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ATCACACATGCATAGATTGTGGGGGAGTTTGCTCTATATATGGTGGTCGT
ACCAATATCACATACTTATGTAGTATTTGATATTGGTGTTACCATTTTAT
TCGTTAAAATTCCTTATATAAACCCTCTTAAAGGTATTGTCATCAATTAC
CAAAATGGGGGAGATTGAAAGAACATATGGGCCCCCATGTGTGGTTTTGG
TAATTAATGACAATCTTTATGGACTAATGTGTGTATTAAGTTTCACTTGT
AGGATTTGTCCATTGGCCTCGCTTGGAGCATGTGTTGGCTTCAAGTTCGA
TGATATGAGGAGAAGATGTGTTGTGCAAGCTCAATATGCGCCATCTCTAG
AACATCTCATGTTTGATGCTTGTCATCCTCGGTGATCATGGATCGATGAT
GAGGAATCAAGAAAGGTGTTCCATCTTGAGAAGTTCAAGTTCGTCTACAT
CGAGCTCAAGTGGAATGCTCAAGGCAAAGGTATAATCTTGATAGGTTTTC
CCTTTTGCCGGTCTCATGTTGTGTGTGGGAGACCGGGTTTAGGATAGATA
ACCGTACTATCAAGAGGGGCTCTCAAATGAGTAACTCGGTCACATCGTTC
GGAGAGAGCTCAAACCTTTGCACACTTGCATCATCGTATTTGGTTGTTAT
TTGGTCTTGTCCATGTGAGGATATAGAGCTTGTTGTAATGTTCATAACAA
GCTCTTGTTCATCAAAATCGGATTTCCCTTTTATATCTTATTGCATTTTG
ATCTTGGAGGTTTTACCGGTTTGTATTTTAGAGATAGGTAAAACCTTACA
TTATTTGGTTCTTACTCATGTGAGGATTTAGAGCTTGTGTTAATCTCCAT
GACAAGCTCTAGTTCATCGAAAACGGATTTCATATGCATTTTCTATTACG
TTTTTTATGTTGGAGGTTTTATCGGTTCGTCTTTTTGAGAGAGGTTAAAC
ATTTCGTCATTTGGATCTATCCTCCCTTTCTGTACTATGATGTTTCTTTG
CATGATCTTTTAGAGCTTGTTTTCCTCTTCGAAACGAGCCCAAGATCATC
AAAATCGGAGTCCGGATGCAAAAGTTATGGCCGTTTTCGTTCAGGGGTGA
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CCCCTTAGTACCGGTTGGTACTGAATAAGGTGTGTTTGGCGTCCTGGGAT
CCCCCAGGGAATGTCCGGTAGTACCGGGAATGTCCGGTAGTACCGGGAAA
AAGTCCGGTAGTACCGGGATTCGCGTTTTTGGGCTTCAACAGTTGGATTT
TGGGGGGACCTATTTAAGGGGCCTTCTTCCCCAATGTATCCCCAACCATT
CTTGCAAGTTTTCTCCTCCATTGTTGAACTTCCAAATCTTGCTATCTCTC
AATCCCTCCAATGATTCTTGCCCATATTTGAGTGGAAGAGAGAGGACATC
TAGATCCACGTTTTGACCAAACCAAAACATCTCTTTGTGAGTGTATCCTT
GGGATCTAGATTTTGGGGGATTTTGGGTTCCTCTTTGATTCCTCCTCTCT
TGTTCCCCCAATAGATTTAGTATCTTTGTTGGAACTTGAGAGTGAGGGAT
TCGAGCACCTTTGTGGTGTTCTTGCCATTTGCATTCGGTGCATCGGTTTG
AGTTCTCCCCGAAGGATTTGGTGAGTGAAAGTTGAGAAGCTTTTTACTCT
TGGTTTCTTGGAACCCTAGACGGTTTGTTGTGTTGCAGGCTGAGGCCTTG
GTGGCGTTTGTTGGGAGCCTCCAATTAAGTTGTGGAGAAGTGTCCCAACC
TTGTGGCCTTTTGTGGCATTTGTTGGGAGCCTCCAATTAAGTTGTGGAGA
AGTGCCCCAACGTTGCGAGAGGTTCTGGTTGCCACCGACAAGTGCATCGA
TAGTGGAAGCGTAGATCGATCCCGTTGGGGTGAGATTCACCGGATAATAA
GGGAGGACTTTTGTGGTGTTGGTGGTTTGATACCACCCCCTCTCCAAACG
AGACGTACTCCATGTTGGGAGGAACTCGGTAAAATATCGGTGTCCCCGCG
TGCCTCGTTTATCTCTATACCCGAGCTCTTTACTTATGCACTTTACATTG
TGATAGCCTTCGTGCTTGAAGTAATATAATCTTGCTATCACTTTTTTGCT
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CTAGGTTGTGCTTAACAAAGTAAACACTAGTTTTATTCCGCCTTTGTTGA
TCCACTATAGGAGAAGTTTTAATCGCCTATTCACCCCCCTCTAGGCGACA
TTTCTGTCCTTTTAGTTGGGTTCCATGTGATGGAACCAACCCACCCAGGT
TTAAGTCCTAGACTTGGCATGGACGTTTGTATTTACCTGGATTTATTCCA
GGATTATCCGGCGCCACCTTGTACAAAACATGGTTGCGAGCTGTGGCAGT
GTCTATGCAAGAGCAACGTCGATCTGGTGACGGCGCTCTACGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.