Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA029342

[Submit comment/correction]

Sequence
AA029342
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA029342
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTTCTCGTGCAGTTATGCTCCACTAACGAATACTTCCGACTCGACAAA
CTGAGGTGCAGTTTTATACTTAGCAGATTATATAAATTAGTAGCCCTAAA
CTCCTGATTAAGTACCTGTACCTATTGTTGACCATTAGATAATGAGTTAT
TGATTTCGAGTTCATCTCCATCTAATTTCCATTATTTGAAGAATTGATTT
TGGTTTAGCCTCTCAAGTACCCACGAAAATATTGTCCAGTTTAACCTTAA
TATTAACTAGCCACTGATCACAATCTTATGTACCCACGATTGAATAAGTT
CAGTTATTTCCTAGCTTAGTTTAGCTGCTGAAATGATGCTCAAATGGAGC
TGTATTGACATGGTAAAGGCATTTTTTTGTCTTCCTTTGGGAATGCAATA
GCAATAAATTTGGATATGTTTGTTCAGTTCTTTCAGTTTGGCGAGTTGCT
CCACACCTATGATGAGAATAGGAAATTTGCTGCATTCTTCTTATAAAAAA
AAGGCGGATATAGCATGTCAGAACTAATTCGTATTATTGTGCTCTATTGC
AGGTGGATGTGGAGCTTGTGTAGTCCTTATAGCAAAGTATAATCCCACAA
AAGATGAAGTGACTGAGTTTTCTGCAAGTTCATGCTTGACACTAATTTAC
AATGTAAATTTCTATTCAATTATCACCACCGAAGGTCTGGGAAATATACA
AGATGGCCTTCATGCTATTCAGAAAAGGATATCCGGGTTCCATGCTTCTC
AATGTGGTTTCTGCACTCCTGGCATGTGCATGTCCATTTTCACTTCTCTT
GCCAATGCTGACAAATCCAAGAAGCCTGAACCACTAAATGGGTTCTCAAA
GTTAACTGTATCTGAAGCAGAAAGGGCCTTCTCAGGCAACTTGTGCCGAT
GTACTGGTTACCGACCAATAGTTGATGCCTGCAAAAGTTTTGCTTCAGAT
GTTGACTTGGAGGATTTGGGTCTTAATATCTTCTGGAAGAAAGGCGATAA
GCATGCTGATGTTAGCAAATTGCCAACTTATACTCTTGGTGGTGGAGTCT
GCACTTTCCCAGACTTTCTAAAATCTGAGATAAAATCTTCTCTTGATCAC
CTAAATGTTCCGAATGTTACGATCTCCGGTGAGGGATGGTATCATCCTAA
AAGTATTGAGCAATATTATGACTTACTAAACTCTGACATATTTGGTGACT
GCTGTGTCAAAGTAGTCGTTGGAAACACAGGTGCTGGTGTATACAAGGAC
CGAGACCTATATAACAAGTATATTGACATAGGTGGCATTCCAGAACTGTC
AGATATTTTAAGAAAAGATAGTGGCATTCAAATTGGAGCAGCTACACCAA
TTTCTAAGACCATCGAGATGCTTGAACAAGAAAATGGATCTATATTAGTT
CCGAATGGAAGTTTAGTTTTCAGAAAACTTGCCGAGCACATGAGCAAAGT
GGCTACACCGTTTGTCCGCAACACAGCAAGCCTTGGCGGAAACATAATTT
TAGCTCAGAAATACCCGTTTGCCTCAGATATTGCAACCATACTTCTTGGT
GCTGCTTCAACTGTTCGTCTTCAGGTTGCTTCACAAACACTAGAGGTTAC
TTTGGAAGAGTTCCTGGAGCAGCCTCCTGTTGATCCTAGTACTTTACTTC
TGAGCATATTTATTCCACATTGGACACCAGATTCTCAGACACAAATTAAT
GTGGTCTTTGAAACTTATCGAGCAGCACCACGCCCTCTTGGCAATGCTGT
TTCATATATTAATTCTGCTTTCCTGGGACTTTTCTCCTTGAATGAACCAT
CTGGTGGTCCTGTATTGAGTAACCTACACTTGGCTTTCGGTGCCTACGGG
ACAGAACATGCTATTAGAGCAAAAAAAGTTGAACAATACCTCACTGGAAA
ATTGCTCACTCCATCTGTTGTGCTTGAAGCAGTTCATTTACTTAGAGAAA
CAATTGTACCAATGGAAGGAACATCACATCCCGAATACAGAGTCAGTGTG
GCTGTTGGGTTTCTCTTCAGTTTCCTATCTTCAGTTTCTAAAGACATCAA
AGGGCCTGGAAAAGCACTGAACATTAGCTCTGTTAGTTCTGTAGATACAT
TTGATCTCCGTAACCCGCCATTGTCTTCCCGTAGAGAAGCACTTTCCAGT
GATGACTATAAACCAGTTGGTGAACCAATTAAAAAGTATGGAGTTGAGCT
TCAAGCTTCTGGTATGTTAGCTTACATCCTCAAAATTGCTAATGAGATGT
AGACCTTCTCTTTCTATCCAAATAATCATCTGTTAGTATTTTGTATAGAT
TAATAAACTTTTTTTTCTGTAATGCAGGGGAGGCAGTATATGTAGATGAT
ATTCCTGCTCCAAAGAATTGCCTCTATGGAGAGTTTATTTACAGCACAAA
ACCTCTTGCATATGTCAAGAGTATTAAATTCAAGCCTTCTTTAGCATCGG
AGAAGATCCTGACAGTTATTTCTGCGGAGGATATTCCAAGTGGGGGGCGA
AATATTGGATCATCATTCATGTTTGGGGATGAACCACTTTTTGGTGCTCC
AATTGCTGAGTTCGCTGGACAAGCTCTTGGTGTCGTGGTATTTATCTTCT
CTTCTTGATATTCAAATGAGAATAAATTATATTATATAATAATAAAATAG
TGATTTGTAAATGTTTGCTTCACTATTAGGTTTTGTAAAAATATTAGTGG
ATGTTAAGTTTGTAGTTTTGAATAACGAGGGGCCAATCTGTACAAATTAA
ATACCTTAATTTCACACAGTTGTTCATCTAGCCTTTTAGGTCTGCAAATT
GGTCACACTTAGGGCAGGTACCTCCAGCCCTATTTAGTTCAAACAAGTTC
ATTTGATTGTACTAAATTGGGTTGGTGGGTTCCCTGATGGTCATTAATGT
ACACCTCTATGTTCATGCAAAAAATACATGTATATATATCTGTATCAAGA
GTTTTTTTTGTACAATACCATAAGGTAGGGGTACTATGCGCTTATCTCTG
ATTCTCTGTTTCACGTTTTAATATAACAAGATTGTTTCAACTTTAAACAT
GGAGTAATCTTGTGAAATTAAACTATTAATTGTTAGTGAAAACTGAAGAT
TTGCCCCTGACAAGAAAGCATTAGTTGGCTTTTGCTTTACGGATCATAAA
CTTGTTACTTAGTTTTGAAATTCTGTATTTCTTAAACATACATGTCACTG
AAATTTGGACTTTACCTCAGATTGCAGAAACTCAGAGATATGCCGACTTA
GCACGAAAACAGGCTGTTATTGAATATGACACAAAAGGTCTGAAGCCACC
AATCTTAACTGTAGAACAAGCAGTACAAAACAACAGCTATTTCAATGTTC
CTCCAGAGAGGAATCCAAAACAAGTTGGTGATTTTTCCAAGGGCATGGCA
GAAGCTGATCACAAGATCCTCTCAACAGAAGTATGCTCATTTCAATTTCG
TTGAGATATTTTTGTAACGACATCTTGCATTGCTGAGAAATTATTGAAAG
TATTTATACTTTTTAACTAAGATGTATTTATACTTATCTACTTACATTTC
AATAGTCTCTATTTTGGAAGTATATATACTTAACTATAGAAACTTCTAGT
TTTTTTCGATGGTCTCTATTTTTATCTCAACCATACCTATTATTACGTTA
TATTAATATAGAAAGATAACATCATATTTGAGCAAGCAGAAGCAGATATT
GACCTATGAAAAAAAAACTCTCCTAATAAACGCCTCTTTTAATTAACTTA
TGGTCTAGTATGGAGTATGTATTCAATCGGACTATTCATTTTTCTTTGAG
AGGTACCATTTAATTTGCACACAAACATAGCAACTGTATGATAGTTTGAT
TTTTTGTGGCCAAAGTTTGCCAATATTATGTACTCCCTCCGATCCATATT
ACTTGTCACTAAAATAGATGTATCTAGACATGTTTTAGTGCTAGATACAT
CCATTTCAATGACAAGTAATATGAATCGGAGGGAGTAATAAATTTTGCTC
CCTGCAATGTGACTTCATGGAACCCCACATAGAATATGTGCCATGTGTTA
AATTAACTAATATGTATGACTCTGGTGATCGCAGGTAAAACTTGCCTCAC
AGAACTACTTCTACATGGAAACACAGACAGCGCTAGCAATTCCAGATGAA
GATAACACCATGGTTGTCTACAGTTCATCGCAGTACCCTGAGCTTGCACA
GAGTTCCATAGCTAAGTGCCTCGGCATTCCATTCAACAATGTGCGTGCCA
TTACAAGAAGGGTTGGAGGAGGCTTTGGTGGAAAGGCAACTAGATCATTC
AATGTGAGTAAGATTATACAAAATTTGAATAGGTGTCTAAGTGATTAGAC
ACATTAATTTGAAGTTGTGAGTTTACATGCATGACCTTTTGATTAGCTTT
GAGACTAGCTGTTTCAGAATGTTTTTGTGCCCATTTGCAGTTATCCAAAT
TTTGAGGACCTGTTTTGTCAGAAATCCGATGTGGTACAACTAAATGTATT
GTTACATTCATATGTTTAACTGTAATAGCTTCATATAGGTTCGTGATATA
ACCCATTGATAGTTTCAGTTTTACTTCTAGTACATGCCTATCCAGAACAC
GAGAGCGGTAAACACAGGGGTACATTCTGTTGAAACTAATCTTGTTAGTT
AGTAGTTCATCATGTTTAAGTTTTGTTCATGCATGTATTGGGTCCAAGAT
AGCACGGTAGGCTGCAGCAAGTACATACAATAGAGGGTGACCTTGTGTGT
ACATGCAAGCTGATGGTTTAGTTGATTAGCATTAAGTGCATGCAGATTAG
AGAGTAGTAGTACACGTCCATGGCAGTTTAGTCGTGCCAAGTTGTGAGTG
TTGCATTACACCATGCATGTGGAGCAGTGGCACACGTGTGGGTGTGTGTG
CGCGCCATTGGTTTAGTCTGATCTGCACAGATATGTTAAACGTTTGTGCT
AGTGCTGTTAGTGGAGTAATTAGTGGATCAAGCCGTTAGTAGCTTGACCG
TGTTTGTTGCATGCAGAAGTGGTGTGCGTGTGTGCATGCTAGGTAGGGGT
GGTTAATGGGTGTGTGTTAGCTGTTGGTCCGGCTATTTGATCCCATGTAA
TCCTATTCGATTGTTAAGAGTAAACAAGAGGGAAAGCACAAGTGTTTGTG
CAGAAACTCTGTGTGCTCTACTCCAGTGTGTGGATGTGTTTTCTTCCACC
TCATCCAGCTCCAACACATAGGGCGGGTTCATGATGCAAGATCCTGCGTT
TTATTTTCTTTAAGGGGATTAACATGAGTTTGGCCATTTTGTAACTTCCA
AGGAAGCCAAAAACATTGACAAGTTGATCTGTCTCTGCTAATTGGTCCAA
TATATGCTTTTGTAGGTAGCAACAGCAGCTGCTCTTTGTGCGTACAAGTT
ACAGCGTCCTGTTCGTATGTATCTCAATCGAAGTACTGACATGGTCATGA
TTGGGGGTCGGCACCCAGTGAAAGCATATTACTCTGTTGGTTTCAAGTCT
GATGGGAAAATTACAGCCTTACATCTAGAAATACTAATTAATGCTGGATT
TTCTCCAGATGTGAGCCCCATGATACCAGACGCTATTATATCAGGTCTGA
AGAAATACAACTGGGGTGCTCTCTCATTTGACATCAAGGTCTGTAAAACA
AATAATACATCCAAATCAATGATGCGTGCTCCTGGAAATACACAAGGCTC
TTTTATTGCTGAAGCTATCATTGAGCATGTTGCTTCAGTGCTCTCACTGG
ACGCTAACACTATCAGGCAAAATAATTTTCACACCTATGATAGTCTGGTG
TTGTTCTATCCAGAAAGCGCAGGCGAAGCCTCTGCATACACGCTACATTT
TATTTTTGATAGATTACTGTCAACATCGAGCTACCTGCATCGAGCTAAAT
CCGTCAAGCAGTTCAATAGTTGCAACAAGTGGCGGAAGCAGGGTATCTCT
TGTGTGCCCCTCATTTTGAAGGTAGCACCAAGGCCAACTCCTGGAAGAGT
TTCTGTGCTCAATGACGGTTCCATTGTGGTTGAGGTTGGAGGTATTGAAA
TTGGGCAAGGACTGTGGACAAAAGTACAGCAGATGACTGCTTTTGCCTTG
GGACAGTTGTGGCCTGATGGGTGTGAATACCTTCTTGATCGAGTGCGTGT
TCTTCAGGCTGATACTTTGAGCTTGACCCAAGGAGGAGTTACTGCTGACA
GCACTACATCAGAATCTAGTTGTGCAGCAATCCTTCAGGCCTGCAACATG
CTGATTGACAGACTGAAGCCAGTCATGGATAAGAGCAAACAACAACTAGG
TGCTGTTTCGTGGGACAACTTGATTTCTCAGGTTATTTGTTTATTACCCT
CTGGTTTTTCTTCATGCTACAGAGAGTAGAATGTTTATCCATGGAAATTG
TTATCTACTTATGTGCTCATACTTAATTTGCATATGATTCAATGTTCCCA
CATAGGCCACTAAAGACAACGTTAATTTGTCTTCAAGTGCATACTGGGTT
CCTGGCGAAGAATCCGGTACCTATCTGAACTATGGAGCTGGTATAAGTGA
GGTGCACAAAGTTCTATGCTAAATGTCAATCACACAAGTGTAGTATAATT
ACACTTAGATTTTCTATGGACGACAATGCGATACGTCTCTCATTTCTATT
CAATTCTTGTTCTGAAAAACACAGGTGGAAATTGATGTTCTTACAGGAGC
AATAACTATAGTAAGGAGTGATATTATCTATGATTCTGCGAAGAGCTTGA
ACCCTGCAGTGGACTTGGGCCAGGTTTGCATAAATATTTTCCATCATGTT
GCATTCCCATTACTGAAAGCGTTATTGGGAATTTAGCGGGAGTACATGAC
AGTCCTGACTATAGTTTCTCTAACTTGTAGTGCATGGTGGCATCATATAT
GATCCTCTCTCCTCTGTCTTGCAGATTGAAGGTTCCTTTATACAAGGAAT
TGGTTTCTTCATATATGAAGAACACGAGACAAATATCGATGGCCTTGTTG
TGAGTGACAGCACGTGGGACTATAAGATACCAAGTGTGGATACCATCCCG
AAGCATTTCAATGTCGAGTTGCTGGATACTGGATACCATAAGAACCGTGT
GCTTTCTTCAAAAGGTAGAATGTGATTTTGTTTAAGGAAAAATGGATATG
TGACTTTTTTCCCGGGTGGAAATTTGTCGTTGGTTCAAGTAACTTAACTA
CTTCTTCTGCCAGCTTCTGGGGAACCTGCCATACTTCTTGCATCATCGGT
CCATTGTGCAGTGAGAGAAGCCATCCGAGCGGCAAGACAGGAGTTCGGAA
GCTCAGGGGTCACATTCCAACTCGATGTCCCTGCACCAATGACAGTGGTG
AAGGAACTATGCGGTTTGGATATCGTGGAGAAGTACTTGGAAAATCAATC
TGTAAATCAGTATGCAGCTGGAGCATAAATAACTATATAGGAGACTCTGA
TGTTTTCAGCCTGCACACGGAGTGATGTGATCATATTGTGTTCGGTGTGA
TTATACATAAACTTAAAATGTTCGAAATGCTTACAGTATTCGGCGATGTG
CTCGCACAGTTGTCTAATAATTCTGGGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.