Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040597

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040597
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040597
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ACCCGTTTTCTAATTCTGGCCTGGGCTCGCTCTCGCCTTACGCGGTGCTC
ACTTTTCGTGCCCGTTGGATCGTGAGTTAATGGCGTTGATGAAGCGGCGC
TGGCATCCAAAAGAAACGCACGGACAACACGCCCCGTCTTCAGGCGTTAC
GTCGACTGTTCAAACTCGTCGAGCTATCCTCTCACCTTCCTCTTCTTCCT
CTCTCTCCCCTATCAAATCCGCCACAAAATCAACCAACGCGGCGGCAACC
TGGCCGACGGGAAGTCGCGAGGGCGGAGTAGTGGTCGAGCTCCGTCGACG
GCGGGGGACGAGCGGATCCGGAGTGACGCATTCGAGGCGGGGTGTGCGGC
TCGGCGAATCGCCCGGTAGCTGCGTGGAGTTGGCGGAGGTGATTTCCGAG
GTGGTGGCGGGGTGGCCGTGCTCGGAGGTGTCGGCAAGTCAGCATTGACG
GCGTTGTTCCGCTTCCAAACGGCGGTGCACTTCTCTCAGATTTTTCGAGC
TGGTTAGTGGTTCCCGATTCGCATTCTCTGATGTTTCGATTGTTCGTGGT
CTAGTTTGTTTACTCTGAAACGAATTCATCAAGTGCTATTGTTGTTTGGG
GGCTGGCTATTTAGATCGAAACGTCTATAGAGTAAGGACATGTTATCTCA
ATTTTCTTCGGTCACGGCGGTACTTCCCTATTGTTCTACTCTAGTAGGCA
GTGTTTTTTTTGCTGGTAATACAAAACCGTGATACTCGTCTAGTAGTCTT
TAGATTTGCTCATAGGGTTTAGTTAGCTTTTTCATAAGATAAGTGTCCTT
AGTTAATTTCTCTACTAGTCAGCAGGTTTAATATGCAAGCATCCCATGTA
TTTTTTGACTCAAAATAGGTACACATGAACCCCTAGCAACTTTTCTATAG
AAAACGTCAGCCACATTATGTTAGGTTGGCTCAAAAAACATCTGGTTATC
ATATTTTTACAGGATGTAAATTTTCTATAATTAATACAGGCTATGTTCAT
ACCGTCGTACGAAATAGGATGTATTTTTTTGACCCTTTTTACATTTGCTG
GTCAATATGATTTTTGTTAGCATGTAAATAAACGTGTTTAGCATGTAAAT
GTTCTAGGGTATGGATTGTGAAATCCTGCTAATATAAAGTAGTCAGGGGT
GGTGCTATGTTCATAGGATGTATTTTTTTGACCCTTTTTACATTTGCTGG
TCAATATGATTTTTGTTAGCATGTAAATAAACGTGTTTAGCATGTAAATG
TTCTAGGATATGGATTGTGAAATCCTGCTAATATAGGATGTAAAATTTCT
CTGTTCGTACTGTCGCAGAATAGGTCTGCAAAATTAATAGACATGTTTGT
TAGCATGTAAATGTTCTGGACATGGACTGTGAAATACTGCTAATGTAAAG
TAGAGCTCATAAAGTAGTCAGGGTGGTGCTTTGTTCAGTACTGATTGTTG
TTTTACCATGTGTTTGTATCGTGTACGTGGGGAAGGGCCGTGGAGACCAC
TTTTCTTTTTCTTTGACAATAAATATATGATAAATGGGGAGGGCATGTGA
TGTAATCATTTTGAGAGATGTACATTTTTGCATACGCATATATGGTGCTA
ATGATTTAGCACGAGATGTAAACCTTTTTCCAATAAGAACATTTTCAAAT
GGTTAAAACACATTTTCTACATGTTAGATGTACGATGACCAGAAATCAGT
ACTATTTTTTGTTTACTGGTGTTATTCAGTATGGAAACATTCAGCCTGAT
TCATGCTATGGGGGTTTGAACCCTGATTCATAAATACATGTTGTTTTTAA
AATGATTACCACACCTTTATACTTAGACAGCATGAGATGTAAATTATAGG
GGGATAATTACATGCTGCTTCTTAAATGGTGTTTAACTCATTTTTTGCCA
CTGTTTTGCAGGCTTTTTAATTCTATCTGAAGGAAATCCTTTATTTTGTT
TTCCCTCTATTATAAGATGATTCCAGCAGTAGCTACGGTATGAACACATA
TAGAATTAAAAATAGTAGTAGTTTCATTTTTGCGTACTAATAGTTCCTTT
TTTTTGTTGCTTATAGAAAGTCTCTCGCACACCCAAAATTGGACAGTCCA
AGTTAGGGAGGATGAAGCAGCGATTGCAGTACAAGGCGAATGTTACTGAA
GGAGAGCACACGGAGCCACCTGGAAATGAAGACAATGGGGATGACGACCA
AGGAGATGTGGAAGGACCATCCAGAAACAATAAAAATCAAGTAATGGACA
GTCACTTTCCTCTCTGTTTTTACTTTCTTTACTGTCATTTTTAGCTTGTT
AGTTCTGACATATTTAGTCCCCTTTTTGTTCTTCTTTTTCAGAGCAATTT
ATTCAACCGCTCATCCCCGATGAAGATTGTCAGGGTTTGCAGATCAATGA
CAGATGATCAGCGGGCTGTTATCCGCGAAGCAGAATTCACGGGCTTGTTA
GGAATGAAGGTTTCCAAGCTTATGCCAGAGTTATGCAGATATTTAATGGG
ATCCTTCAATCCTCAAACATGCGAGCTGGATTTTTGGTGATAGGGGGAAG
ATCCCTATAACCACTCAGTCTGTTGTCAGGGTTATGGGAGTACCCGGGGG
CGGCAATAAAGTTCCTTATTGTCTAGATGTGAACTCCACCGGCTTGATTC
TGGAGATGTTTGGGATCCACAATAGGAAGCAGCCAACAGTAGCATTTGTC
GAGAAGCTGCTAGGCCCAACCAACCCTCCTAATCAGGATTACTTGAGAAA
TTTGTCATCTACAGCGTGTCCTCAGTTTTCGCCCCAAACACAGGGACTCT
TGTTAGCCCTAGATGCTACCCATCTGTCATCAACGCAAACGCAATCCGTC
ATCTCAATTGGGCCAGATTCATTATCGATGTTCTAATCCAGACAGCAACT
GCTAAAGATACCAAGAATTGGTTTAAAGCATGCATGCCATATCTCATGGT
GAGTTTACATAATCCAACTCTTGTTTTTACTTTTTTACCAAGTTCTGTTT
TATGCTATGTAGGATGTATTTTTTCATGGTAAATTTGTCTGATGTAGTAT
CCACGGCGTGATTAGTAGTAGTTCATGGTAGGATGTAAATATCATGTTCA
AAGATGGACAAATATTTAATGTACTATGCCATTAGAACTAGGTTGCATGT
AAGTATTGTTCATTTTTTACATGGGAAACACTAGATAGGTGGTGCATCAT
TTTAATACCTATGATGTATATGAGCATGTTTATCTAGTTGTTTCTGATGC
ATCATTTCTTCTACATGCTCATAAAATGATTTTACATTCTGCTATGTAGG
GTAACTCATCTTTAGGATGTAATAAGCTTATCCTATCGTGTTTTTACCTG
CATTTCTGCACGTAACTTTCTGCATTTTTGTATTTTTAAAAGATATGTTC
TTGTGGATTTTTTAGTATGTGTTTTGTTTGACAAATCAGATACATATGAT
ATATATCATCTTTTTGTATTGTACAGGTTTTATATGTTGATTCTCTTGAG
ACAGATGCATTAGGTATACCCGAGGATGGAACTAGGATATGCATTTGGAC
AAACAAGATGGTGAGACTTATAGTTGACCTTGATACAAACGGCGATGGCT
CGTTTGGGAAATTACCGGTAGGTTCTCATAAAGCAGTGTTTTCTTAGGCT
TTAAGCATATCTTTCTCATGCGTTTTTCCCACTGTTTTCTGAAATGCTTA
TTCACATGATTTTTTTCGCCTACAGCTAAAGAAATGTTTTAGGATTAGGC
TCTCTCTGTTCTCAGCAGAGCCTTCTGATGTGGATATGTTCGTCAAGCGC
CATGTTCCGGGCGACCATACTGACGAGGTTTGGACCATAGTGTCTCTTTT
ATTTACATCTAGCAGTTCCTTTTTTCTCTTTCTTTTTTTGCTTATTCAAG
TGTATTTTTACTAAGCTAGCTTTTTTTGTATGTGTACTACACAGGACTTG
GCAAAATATAGGGAAGTGGTAATAGAGATGTGTAATGTGTTTGAAGATGG
GCTTGCCAAGTTTCTTACCTTGTCAAACAAAGAACACAAGGATTTCAGAC
CAGAGCAGAAGAAAATTTTTGCGGAGGAGGTGCAACGAGTCGTGCAGCAG
CCCAAACGAAGAATGCGGAGACGCCGATCAAGGCCACTGCTGGTGGAAGT
AAGTGAACAGATTGTAGATGATACAAAATCTGCGCCGACAGAAGTAGAGT
TGACGGAGCAAGTTGTTGTCAGAAATAATAACATGCAGGGAGAAAATGGG
GACTGTGCTGAAAATGGAGGCGTGCAAAAAACAGCACCTGGGATGGAAAC
ATGGAAGGATCGCGAGGATGAAATGCAGACTGGGGATGGAGAAAAAGAGA
CAGAAAAGGAGGTTATTTTGGAATGCCACTTACATGCAACTGGTAGTGGC
ACTCCAGAGATTTCAAAAGAGAGTGAGCTTAGTCTTGCAGAACCTGAACA
TGTGCCAACAGGACAACATTCGACATTGCCGCTGGACCCACTAAAGTTGC
TTCAATTATATGGGTCTGGGTCACAGTCCAGTGCAGATAACCTTGGTGGG
TCTGCCCCGCTGCTATCTCCTTTACCAGCTGCGCCTCCTTGCAAACAGCA
ACAACCTAAAGTATCATCAAGCGAGAGAAAGAAGTGTGTATCATTTGTGG
ACCAATTAAAGGAAACTGAAAAGGAAGATGAAAGTAAATGCATGCAGCCC
AACAACATCTCTGCTGAAGTGAAAGCATCTCCTGTTGAGCAACTCAAAGC
TACAACTTTAGGAGGGAGTCCAATTGGTAGACCAATCACTAGATCAATGT
CTCCTCTAAAATCATTAGTTGCCACTTCCAAAGCAAGTCCTCGGCAAAAT
AAGGGGCTGGTCCATGAAGATGTGACAGTTGTTTCACCTAGCCCAAGAAG
GTCAAGTAGGTTTGCTACAGCTGAAGCAAGGGCAAACTGTAACAACCAGA
TGGCAATAACAACAAGCTCAGGAATTGTTGCTGAAGGTTGTAAAGTTGCA
GATTCTACTATTCTATGCGATAGCATGAATAAGAGGTTGTTTGGAAGTGT
AGAAGGTATAAATGAAAGTGAACAAAAAATGAAGCGCCTAAAGCTGATAG
AAGATTGCCCCTCGTTCGATCTAGATGAATCACCTTGTGAGGATTTTGAA
GCTGCCAAAACAGAGGTACCGGTTCAGGTAGAAGGGGATCATGTTATTGC
ATGTAGCAATGATGACAGCGGAGATTCTTTGGACAAAATCTATGCCATCA
TCGATATGCCTACCAGGACACCAGTTGGCGAGGATGGTCATAAAGTCCTA
GAAGAAACAGTTTCACTTAATGCGCCCAACAGTATTACACCAATCCCTCA
AGCTCATCAGAGAAGGGTGGTGAAGCCAGGCCCAGCAAGGAAGTCGCCGT
TTGTTGATGTTGAGAGAAAGGCGTTTGCGTCAAAGTCAGCAATTGAGCTG
TACAACAAAGTTTGCGAATACACGGGAAAAGATGTAAATGACCCTAATGA
AGAACCTATCATCATCGACGACGGACGATTGTTCATCAACCTGAAAGATT
TGGCTGACTCAGTCAGGCCAGGCGGAAAGTTGAGCAACTCAACATGCGAG
ATGGCTCTTAACGCTATGTCCATGGAGATGGCGCAACAGAAGAAATTTCT
GATGCCACTTAGGATTGCGGTAAGATATACTTTTTTCTTTGCAAAAACAT
ATGCTTATGAGATGCCACTTAGCTATTTCAACCTTATATTCTTCTAAAAC
TCCTACTTACAGGGAAAGCTTAGGAGTGCCACATGCTTTATGGATAAATC
TGTCAAGAAAGCATTCGAAAACTCCCCCTCAAACCGGCTAGACCACAAGG
AGATGGTAATTTGTTTTGTACTCTTTTTTACGTCTATGTTTTAACTTTTT
CAATTCAGACCCACAATATCATGTACATATCATGTTTTACAAGTGTTTAA
GTTTTCTCCATGTACAAATCATGTTCTCTGTTCTCTAAGATCTCACACCG
GATATTGAAGCAACAACAGGGCACTATTATCTGATTGTTCTGAACCTAAA
GGCAGAGATGTTTGAAGTGATGGACTCATTGAGGAGGGAGGGGGACAAGG
GATTTCAATCAGACTACAGAGCAATTATTGGGTCTATCAAGAATATGTGG
TCGCGAAACTACAATCAGTCCAAGTTCAACATCTCAAAATACAAAACATT
GTACATTCCTACTCCAATGCAAAGCACGAAGTAAGATATCCCTTTTTGCT
CCAAAATAAGAATGTATAACTGCAACTACAGTAGCTTTCTTATAACATGT
AAATTGCTAAAAAAAATACATTTTCTTGGAACACCAGTTTTAGAATATGT
AAATTTTACCAACATGTTTACTTTACATACAGATCATGTAAATTTGTATA
TGTAAATTTTACATACAGATCATGTAATTTTTAGGTTTTTTACATTTTAT
TAACATGTCAAAAATTTATGCAGTGTACTTTTGATGCAATATACATTCAG
AACATGTAAATTTGTACATGTAAATTTTTACTCCAGCTTTTCAACTAACT
TTAATAATGCTTTTCTACACTAATGTAAATTTTGAAACTTGTTTGTTTTC
ATTCATGTACTATTCACATTCTTTTTTTACATTGCTAACCATTGTTTTGC
CACAAACAGTTTCGATTGTGGGTTTTTCATGCTGAAGTTTATTGAGTGCT
GGAACGGGAGGATGATGCTGCCTTTCAAGCAATCTGATATGCCTGTGATC
AGCAAGCTTCTCGTGAATAAATGGTTGGATCGCGAGGAGAACAAAGTAAT
CAACTGGCACGAAGTGCTTTTTCAGACATGATGTTCATTCAGGAGAACAA
AGTAATACATGTCCTGTTAGAAAGGTACAAAATGGTTCTTTTTAATTACC
GAAATTTGAATTTAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.