Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA018495

[Submit comment/correction]

Sequence	AA018495
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA018495
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGGAAAGGTCAATCCCCCGTGGCGCTTGCTCCTCCTGCTCCACTATCCAT AGACCAGCAGCGCGCCGCAGAGTGCAGATTCAAAGCCCTGGAAGTGTAGC ACTAGCAGAGATGAGATAGTCGGTTATCAGTTCCGCTACCAGTTCCCGCA ATCCGAGTCCATGGCGCCGGCAGCGACCCCATTTTCGCCGCGTCTCCTGC TCGCCTCGTCCGCGTATCCGCCCCCTCTCCGTCTCTTCCGCCCCTTGCTG CCCGGTAGCCGCCGCGGGGGCGTGCGCCTTCGGATTCGATGCGGAGCGGC GGACGAGGAGGCCGAGGCTCGGCGGGGTGAGCAGCTGAAGGCGTCCATGG AGGAGATGGCGCCCGGTCTCGACCTCGTCACGCTTGCAGCCTGCCTAGTC GGCCTCCTCACCGGCGTCTCCGTCGTCCTCTTCAACCTCTCGGTAGCCGC TTGCTAACCAACTCTATTTTGAATCTTCCAAGTTATGAAATTGATTCACG AGTCACTTAACTGCTGCGCGAACTAGTAGGCAATGTGTTGATTGCTGAAG AGAAGAATTAGCTGACTGTTAACTGCTACACTAATGTTCCTCCTCATGCT TTTCCTTCCCCTTAAAAATGAGGGCCTGCCAAAGTTCTAGCTTGATTAGA TTTGTATTCATAGGGTTGGATGGATATTGATGTTGAATATAGAAATGCAC AAGTACTCAACATATAGGTCACTGGGTTAATTACAATAGCATAGCTATTT CTGTCACCTCAAATTTAGGATAGACCCATGATCCAGATCAACACCATGCC ATAGCTGGACATGGCACTGGCGCAGCCAGGACGTTTTCGTGAATTCGTCA CAGCAATTTGATGGCTTGCTATGGCTGGAGATGCCGTAAAATTATATGGG TTGAATTCTGAATTTGAAATTGTTAGGAAGTTGGTCAGAGTATCTGTTTA GAATGGCTCATATGTATGAGCTGGAGCTATACCAATGAATAAACCAAGCA AGATAACTCCAAACCCCTATTTCTCTGATTTCTCGTGTGCGCCCTCCATC TTGTTCCTTTTCCTACCATTCCACCTGATTGACGGTGCCTGGCCATCGTG CCTTTGGCTGAAAATTTCAGTTTATCATGGTGACTTGTTATGTCGCGGTA CAGGATGTGACATCCTATCTTTTTGGTAAGGGTCCAATTTAGGATGCTAT AGGTGTTCATCGAAATGTGGGATGGATCTAAAGCTGCATGTGTCAAGTAA TGATACAATTTGAAAAGATTGGGCATCTTGGGTGCATTTTGCTACCAATA GGAGTCAGTGTTAAATTCATATAGTTAGTTTAAGTATCTGTTATTGTTGC TTGAGATGTTAATTTGTATTCTTCTAACATAGGTTCATGAAATACGTGAC CTTCTTTGGGATGGCATACCATTGCGAGGGGCTACATGGCTGAGGGAGGA GCCCACTGGTGAAATTTGGCAGAGGGTGATACTTGTTCCAGTTAGTGGAG GCATCATAGTTGGAGGGTTGAATACGCTAAGAAGTTCTATCAAAACGAGC TCAGATGGCACTGTATCTAATATAAAGGGTGTGTTTAGGCCATTCTTGAA AGCTTTGGCGGCATCTTTCACTCTCGGAACTGGCAACTCTTTGGGGCCTG AGGGACCCAGTGTAGAGATAGGTTCTGCTATAGCGAAAGGATTTGGAAAT GTGTTTGGGTGGGAAGGCGGAAAAAAACTGTCTCTTGTGGCGGCTGGATC AGCAGCTGGCATTGCATCGGGTAGATTTGAGATCCCTTATTTTATAATTT TATATTTTGTTGCAATATATACCCGCTCTGCTCCAAAAAACAAAGCATAT ATTTGTAGTCAAAAGTCAAAGCCTTGTAAGTTTGACCAATTTTTATGGAC CAAAATATGAACATCTACAATACCAAATCAATATCAAAAATCCACCATAG AATATATTTCATAGTGTACTTATTCAATATTGTAAATGTTAATGTCTTTG TCTATTGACTAGAAGTATACACCTTGTTTTTTGAACAGAGGTAGTATGAT GGAATAACCATGGTGTAACCATGTATCATGTGATAATTTGCTTCATTTCT TCATGTTTATTTCAAATAAATTTGAACAACAGAACATCTCATCATCAGAA TTCCAGTTCACTGTAGAAAATTTCTCCACGGATTCTCATTTTGATGTTGG CCTATTATAATTAGTTAATTACCTATACTGTATAGATTTTATGTACTGAT AGCTATAACTTAGTTGCATCAGTTGGTGGAATTTATGGGACAATTTCCTA TGTCACCTAACTTCACCCAGCATCAAGTATCAGATTTACCTGTTATGGTT TCTTGAGAAAGATTCATCTGTTATGAGTACTCTGGAGTGATCAACATATC CAACAATCAAAGTAAAGAATCAGTGTCTTCTGCTTTCTGATTCCATTTTA CTTATTTCAGGTGATTTCCTTGTATTTTAGGTTTCAATGCTGCTGTTGCT GGGTGTTTTTTTGCGGTGGAGTCTGTTTTGTGGCCTTCATCTGCGGATTC TTCATCCCTTTCCAACTCAACACCTATGGTGATCCTGAGTGCAGTGATAG CATCTGTCATTTCAGAGATTGGTCTTGGTTCTGATCCTGCTTTCACTGTT CCACAATATGATTTTCGCTCTCCGACAGGTACTTTGTCTTAGCTATAATT GAGATTTTCAGCACTCTTATGAATACAGAGTACATCCTGCAGTATTTACG GTTAGGTATCATAGTTCCTTATGACAAATTATCTGCTGTTTTAACTTGTT CTCGTGAACACTTCCTGAACAACTTCATATGTCAAAATAAGATATGTCAT GCCCTCCACCAAAGTTTTTTTCGTAAAGGAAGGAAAAAAGTTTCCTTGTG GATCTGCATTCTTGGATGGAAATGGCCATTATTTATTATAAATAAATGTC ATTAAGGTAGTAAAATAGGACACCAAACGAAAAACTCTGAAACGTACCTG AAGTTTGCATTAATTGATTCGAAATGGCATAGTTTTGCTCTTGAATACGT GATGCTCCTGAAGCCATCTGCTGTTTTGTAATTTGCTATAGCCATATAGA ACACCCCTGTAAACTATGATCCTCCTGATGGTAGGTTGGTCTTAGTGACT TTTAATGCTACCTTCTTTTTACATTTTGTTTTTCATGCTCCAGAGAATGA AAGTATGAGGATATTTACATGACTTCATAAATGTCAGAACTTCCTCTATA TCTCTTGCTGGGCGTCTTTTGTGGCTTGGTGTCAATCACACTATCTAGAT GTACAGCACTAACTATGGACATAGTTGAAAGTTTACAAAAGGCAACTGGA TTACCAAGGGCTGCATCCCCTGCCTTGGGTGGCCTTATTGTTGGTCTTCT AGCTCTTATATACCCCGAAGTTCTGTACTGGGGCTTTGAGAATGTTGATG TCTTACTGGAATCACGGCCATTTACAAGTGGCCTCTCAGCATCTGTACTG GTTCAGCTCATTGGAGTAAAAATATTGGCGACATCTTTGTGCAGGGCTTT TGGATTGGTTGGAGGTTATTATGCACCATCCCTTTTTATCGGTGCAGCTA CAGGCATGGCATATGGGAAGTTCATGAGGTTTACATTTACTGGCTCTGGA GCACTGTTTCATGTCCCCTTCCTAGACGTGGCATCACCTCAAGCATATGG CCTGGTAATATGTCCATCAAATCAATCTATCTTTCTTCTGGTCAACTACT CCATCCATTGCTTTTTCGAAAGCACCAGTAGATCTCAAGAATCAAACTTT GTAAACTTTAACTAACAGTTAGTCCAACAATACGCAGGTTTAATTTGATT ACAGAAAAGTGATACAGTTCGATTCGTATTTTGAAACACTTCGATTTGAT CATGATTAATCTAGTTATCAACAAATACCTTTAAACTGTTCAATTTTGTA ACCACGCCAAGTCAAACTGCGCCTTCCATTTTGCAACAAAGGGAACACTT CGATATCTCTCTGTATGTTTGTAGTCCTAATAATACTTATATGTGGTGGC ATTTTCTTATCTTGTGATTATTTTGTAGTCACTGCTCAGCAGTTTTCTAG ATTTAACTTTTTCCCCGTTGTACTTTTATGTTCTGATACACTGATGAAGA TATTACGCAGATCAATACTACCATTGTTTATGTTTTTTCCCATCTTTGCA GGTAGGTATGGCAGCTACACTTGCTGGTGTCTGCAAGGTGCCTCTGACAT CTGTCCTCCTACTGTTTGAGCTTACACAGGACTATCGTATAGTTCTACCT TTGCTTGGTGCTGTTGGACTATCATCTTGGATTGCTTCTCCTCAAAGGTT CTCTACGAGCAGTAAGGGCAAGTTGGATTTGTTGGAGAAGAAAACAAGTG CCGTTCAAGAGGAGGAAATTGTGTCCTCTCAAACCCAACAAGTCACTTCT GTGGATAGTGCTGATTCTACTGCAGACTTATGTAAACTTGAAAGCTCACT TTGTGTCTATGATGTCAGAGATGATAACATGCTGGAAAACCTTACTGTTG CCGAGGCTATGAAAACTAGATATATTTCTGTATCATTGAAAACTCCAGTA GTTGAGGCACTAAATCTTATGCTTGCGGAGAAGCAACCCTTTGTTATAAT AACTGAGAGCAACAAATCTCTAGTATGCTTGCTAACACTCAAAGATTTCC AAGATTTCTGCAAAACTTCAAACACCACAAGGATGCAAACCGAGGTGAGA ATTGCTGCCATATTCCACTGGTTCATTTTTACCAATTTGTAGAACCTTGA TGTTTTAGTTTGTTGGAATATATTATTGTTTTATTTATGCACACTTATTT TCCATTATTTTTGGTTTCGAAGTAATAGAGCACCACCTGCCCCACTTCCA TTTCAGATAACTAGCGTATGCAGTAGTTGCTTCCATATGCCTATTCTGGA CTCAGAAACAAAGGGCATGATACTCAGTCCAACCCTTTTTTGTTGTTGTA ATCCACAGCTTTAGTAAACGGGATAGTGGTTACTGTCAGATTGAATCACA TCAGTCAGAAATCCAAGTATTACATCAAAACGAACAGGAACTAAAACGCT TAAAGGTTCTCATTACAGATAACTAGCGTATGTAGTTAGTTCCATATGCC TATTCTCGATTTCAGCACCAAAAGGGTACTGTACTCAGTCTAACCCTGTG CATCGCATTACAGTTCAGCCACATCAAAGAAACAACTCAAAAACCATCAC ATAAGATCTAATAAACTATCATCTTAGGACCTTTTGATCCTTGCCCTATA CAAAAGTGTAGAGCTAAAGAATACCCAGGCTCTAGTCCTCTATAGCACCC TAATCATTTCAATCTTGGTTGGATGAGGTCATTTATTGCTTGATTAGTGA TTACTTGGGTTGGGTCATCTATGGCCATTTGCCACAGCTCATATTATTTA GTTTACTACCTGCCCTCCTTCATTGGAAGTAGGATATCCTTGTGGACTGG AGTTTGTACAGGAGTCATTTAGTCGCACCTCTGCAAATCCTAATAGGATT GCTTTATTTTTCACATTTATCAACTCAAGTTCTGATTCATGTTTACTTCA AACTTCAAAGGTTTTACATAAACAGAGGAATAAGTTGGTTTTCTTATTTT CTTGAGAGGTCAAATGGTAATTCAGAGGATGTTAAGTTTGTCTAACTTGA TACAATGCCCGTTGTCAGTGATCCTTAATTTAGTATGTATTTCTGTTAAT GCTGAAACAGGTACAGGAAAGTCTGGTATCTCATGTTTGTGAAGCTGTAA GGTGTAAAATGTGGTCTGTGACACCTCAGATGCCACTTGGTACTGCTGAA AAGATTATGGATTCTCATGGAGTGGACCAAGTTCCTGTAGTTTCAGAATG TTTTGATCATCAAGATGGAGGACTCTTGATTGGTTTTGTAGATAGAGAGT GCATCACCATTGCTCGAAGGTAAACTTAAATATTTGGAGAACTCTATTTC CAGATTTCAACTCTTGTTAATGAGTAAAGCAACAAACTATTTGTTCCAAC TTATAATTAACATAGTGTTTTTTCCTTGTGTTCTCTATCAGAGCTTTGGC AGCAAAAGAATTTTTCAGTTTCACATCTGAGTTTAGAAAGAAAGAGAGAT GATGCGGATACACTTAGTCATTTGCTTGGCAGTCTGCAGCTTTGAGATTT CATTTCCTCATCTGGGCATGTGTGGTAAAGCTGGTCAAGAGCCCAGGAAT CATAGTTGACTCTTGACTAGCTTGGATTGGTAACTTAAGAATGTGATTCA GAAAGTGAAATTGCTGGGTGAAGGGCCTTGTATTGTCATCAAGACACCCC TCGATCTCTGAATGTGCATGCGCAAGTGCATGGCTGCATTTTTTTGCAGC AGCATTCTGCAGGTTCTCTATTCATTAGACCCCAGCAACTTGCCTAACTT GTGTATACCACAGTTTACTTTTTATTTTGCAAAACAACATCGATCATGTT CATTTAGTAATTGGACCAGTGCATTTGCACT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.