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GrainGenes Sequence Report: AA008038

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Sequence
AA008038
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008038
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCCTGCTCCCCGCCGGCCAACGTCCTCCCTCCACGTCATCGTACCCCT
ATCCCACCCGCCGCTGGCCTCCCGCTCCGCCAAGCTCTCCCACTGCGACC
GCCTGCGCCTCCGCCTCGCCTCGCAGTAAGCCGGCGAACCGCTCCCAATT
TACTCCCCCCGCAGCCCTGTTTCTCTCTCTCTCACGTATCCACGGCGTGC
CCCTCGCATAGCGTCTGTGCTGATGGTGATGCGTGCGCTGCCGCTTCAGT
GCCTGGTCATGGGTGGCTCGGAGCGCCAGCGAGCTGTTCCACGGAATGTT
TCTTCATACTGTTCTCACCGGCTGGCTGGGAGTACAGTCGCCCGGCCCGG
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CGCGCAAGGGATGCTCGACAGTGTGCAAGGCAAGGACATCCAGAGCGCGG
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GATGTCCTTGATGAGCTGGACTACTTCCGCATCCAGGACGCGCTCGACGG
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TCCTCAATGCTCGACACACTGCCAGGGCTGCTGCCAATAAACTCAAGCCC
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TATCGGTAAACACTTTCCATGCTACTCTTTACCGTCTGTCCAAGAAGATG
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TGGTGGAAATAGTAGAGCAGCTGAAACCTCTGTGTGCTATGGTCTCCACC
ATTCTCAGTCTAGAACTATTGGGCTCCAGGCGCAACCCTACCCAAGACAT
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GAGTGGAAAAAACTATTAGCTCATTTAAGATATAATAATGGGGGAGAAAA
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TTACTACGACTAATTCTTCAATTGATGTGGAACGTCTAGGTCATGAAGAT
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AAACCATACTGAACTACGTGATGTTGGGAAAAAAATTGTAGACAATTTGA
AGGGTTTCCCTCTTGCAGCAAAAACAGTAGGTAGATTGCTAAGAAACCAG
CTTACACTAGACCACTGGACAAGAGTTGCAGAAAGTAAAGAATGGGAATT
ACAGACCAGCGATAATGACATTATGCCAGCTCTAAAGCTTAGCTATGATT
ATCTCCTTTTTCATCTGCAACAATGTTTTTCCAATTGTTCATTGTTTCCA
GAAGATTATGAATTTGGTAGCATGGAGTTGGTTCACTTCTGGATAGGACT
GGATATTGTACATTCACGTGATCAGGGCAAAAGAACCAAAGATGTTGCAC
TATATTATTTAGATGAGTTGGTTAATCATGGATTTTTTAAAAAGAATGAA
ACAAAAAATGGTCCTCATTATGTTATCCATGACCTACTGCATGACTTGGC
AGTGAAGATTTCATCATATGAATGCCTTAGCATATGTAGTTCTAACGTGA
GGTCCATACAAATTCCTGCATCCATACGTCACATGTCCATCATTGTAGAT
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GAGCGCATTAGGTAAAAGACTGAAAGTGCAGAGCTTACGTACATTGATGT
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AAGGAAGCTAGAGCCTTACGCTCTATCCTTTTGTCTGGAGCATCCTATTC
GGTGGATGATGTGTTGCTGAATTTTTCAGAACTTGTCCATCTCCGCTACC
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TGGTGCCCAAATATTGTGATGTACTTCACTCTAGCATATCTGAGGTGGGG
AAACTAAAATTCCTACAGGAACTTAGGATGTTTGAAGTGGGAAAAGAAGC
TAAGGGTTTTGAACTAAGTCAACTAGGAGAACTGAGTGAGCTCGGAGGAT
CACTTGGCATTTTTTGTCTTGAAAAGGTGCAAAAAGAAGACGAGGCAAAT
ATACTAAAACTGATACACAAAAACAACTTACACAAGTTAACATTAGAGTG
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AAAGTCTTGTGCCACATAAAAATCTTAAAGACTTATGCATTGAAGGGCAC
AGAGGTTCTAAATGTCCATCATGGCTTGGTAGGGACCTCTCGGTTGAAAA
TTTAGAATCTCTTTCACTGCGTGATGTATCTTGGAACAAACTTCCACCAC
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AGCTCAACTCTTAGCTTCCAATGTTTGAAAAGATTACAATTAGTTAAGAT
ACCAGGTCTGAAAAAATGGGTTGGGAATGGCACTTGCCATTTGTTCTCTC
ATCTAGAGGTGATAGGCATTGAAGATTGCCCTGAACTTGTGGAGTTACCA
TTTTCACATCTTGCCTGTTATCAAGCAAAGCAAGAGGAAAACATGATTTG
GTTTCCAAAGCTACGAGACCTCATGATTACAGGTTGCCCAAAACTGTCAT
CGTTGCCTCCTATCCCTTGGACTCCTTCTCCCTGCTCCGCTGAGATACGA
GATGTAGGATGTGGGTTTGAGAATCTTTCTTACTCACGAAACTACATGGA
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GTAATGTGTTAAATTTCCATAATCTGGCTGATCTGAAAGAGCTGTATATG
AACAATTGCCCTCCTATGCCGCTGATTCTCCTCCAAAGGCTAAAATCTCT
GAGGTCCATCACTATAACCAGTATGAGTACTTTCTTGTTGCTGTTTGAAG
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TACGATTGTGATGCTAACGGGGAGGAATTGACACAGCTGCTGTCTTATTT
CCCGAAGCTCACGGAGTTGCATATAAGACGGTGTAAAAAGATAACAGGGC
TGGGTGTGGTGGAGCACCAGCCGACTGTTGTTACAGCGATACCAGCACCA
TCGCCATCATCTTCAGCTAATAAATGTGAGCACGCACAAGATGGACACAA
TCAGCAGCAGACAAGAGGAGAGGACGAAATAGCACCAGCAACACAAGGAC
TCCTGCTCTTGCCTCCCCAACTACAGGTTTTGACCATCCGATTTTCCCCA
GAGCTGCGCGTACTCTCCAATTCACTGTGCAACGACAGTGCAAGAGACGG
GCTCCAGTTCTCCTTTTCGTCCTCCGACTCCTCTTGTTTCCCCTTCCCGG
CCTCCCTGCAAAAGCTCACTCTGAGTAGGGTGAAGACGTTGGCTTGCCTC
TCTAATCTCATCTCCCTCACTGAATTAAACATATTTGATTGTCAGGATCT
AAGATGCGAGGGCTTATGGCCTCTCATTGAACAGGGCCGCCTCACAGAAT
TAAACATCACCAGAACCCCCAAATTCTTCACCGATTCAGAGCTCTTGCTG
CCGCATGACGAAGAGCGCCGTTCCTATTCCTCCAAACTGAAATATCTGTG
GACAGATGACCTAACTGCGGTACTTACTCTGCCCATGTGCAGTCTCCTCT
CTTCCTCTCTCACCAAATTAACCTTTTCTTGGGACAATTTGGTGGAACGC
CTCACAGAGGAGCAAGAGGAGGCCCTTCACCTCCTCAAATCCCTCCAGGA
ACTCGAGTTTCGGTATTGTGAGAAGCTGCAGCGCCTCCCTGCAGGGATAA
CGAAGCTTACCAACCTCAAGAGATTACGGATCTGGGATTCTCCTGCCATC
CAGTTGCTGCCCAAGGACGGTATCCCAAATTCTCTTCAAGACTTAGAGAT
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CAACAACTAATACAAGGTAACACACATTTGCTGGTTTTCGCTTATTTCAG
TTCTCACACATAAATTTAAATCATTTTTTCCTAATGTGTCTCATAAGCGT
CAGAGTAGTTGTCTTTTTGTTTGCTTCAGGGCAGTTAGTGTCCTTCCATC
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GATGCTACCAATGCAAGCGTGAAGGTCTCAGATTACACCTCCCATCCCTT
ACAAAATTGGTTAGTATAATTGTCCCGCCATCCAGTCCCTGCCCAAGGAT
CGACTCCCAAGTTGTCTGCAAAAACTAGAGATCTACAATTGTCCGGCCAT
CAAATCCCTGCCCAATAACGGCCTGCCAAGTTCTCTGCAAAAATTAGTGA
TCTACTATTGTCCGGCCATCAAATCTCTGCCCAAGGATGCCCTTCCAAGT
TCACTACGAGAATTACATGTTTGTGGTGACAGCAGCGAGGAGCTAAAAAG
ACAGTGCCGCAAATTAGAAGGAACCATCCCAATAGTCGCAGACTAGGTAA
CAAAGAACTCCTTATCTGTACTCATTCCCAATTTCTACCCATAATTTTGC
ATTGCTTTTCCTAATTAACACGGAAGTGACGGAATCATTCTCTTTTTGTT
TGCTTCACTGCAGCTGTTGTTGCTTCATCTCTAAATAACCCACTTGTTTT
ATTATTCTGTATGTGCAGGGCGCCTCTTGGATTTGTACATTATTCGAGCC
TTAGCATTTTAGACTTCTATGTGTCCAAGCACAGTTCAAGGAGTTGCCAA
GGCAAGCTTGAGGGCCTCAACCCATCCCGTACATAAAATAAAATGGTCAG
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GTAATCTTAACGATCTGTGGTGCCTACTATGCAGGTTTCTTCCGTGGAGT
TGTAAATTCTTCAGTAGAATTCTCCGCATTCAAGGCAGACTTTGTGCCTC
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ATGTAAGATCGCACTTAAGCCTTCGTATAATGAATCTTGCTATTTACCTT
GTTTTTTCCAAAGCCACATTGCAATTCATTGTGTTTCTGTTGAATTTTTT
TATTGCAGCAAAATATAAAGTGTTTCTTGCCTTGTTTCAATCTACTCGCA
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AAAGAAGAGGAGAAAAAGAGAAAAGGGAAAAAAGAAACAGTAGTAGAAGA
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TGGATTTGGAGGTAATACATGTATGTTCTATTTATAAATCGTAGAACCCC
TTAAGATTGGACTGAAAACCTATTCATAATTTACACTACCTTATTTTGTA
GATCAATCTCCTTGGAAGCAAAATTATTGGCAAATATTGCAGTTGCCTCA
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TTACATATCGACTGGTGTACAGAAAGCAGGTCGCTCCACAAGGACATCCG
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TACTTCACCACAGTTAGTGCCCCTCTATCCAAAAAAAAACACTTGTTCTA
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ATTCTTGTATCCACCCCAAATGCATTGCATGTCAAACCTTATCATTTTGT
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ATGCAGGTCTCTGCCATGGAGTTGTCTCTGTATGCGTTCACACAGTTCGG
ACGCCATGGCCTTTGGTGGTATCTCCTCCTTGTCCATAAACAAGGTATGT
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TTTGCCTCTTCACGTCAAGTCATTTCGGTTTAGTTTGGATCACTTGTTTC
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GGTAGTTGTCTAGCTTCCAGCAAATGAAAAGATCTATATCCGTTATGTGA
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TCAGATGCATGATTCAAAAATCTATTAGTAATCCACACTATGTTATTTTG
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TGGGCAATCTTCTGCGACTGCGACAGACATATCATATGGTACTGTCTGGT
GGATGCAGTCTTTTCTGTTCCATGTGGCTCACCACCAACATCAGGATTAT
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GTTTATCTTGGATATCCCTCGCCATGTGTTGCATACTTAATGACTTCTTT
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GAGTCTGGCCACTCCCTCGCATTCATGTGGTGTTTGATGTACGTTGGCCC
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GACCCCTCCCTCGTCCACCGAACCCCCGACGGATTCATGTCGTGGCGGTG
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CATAGAGAACATATCTGTTTGGTCTGTGTCCGGGTGTGTTTGATGTCTTG
TCTGCCATCCTTGAAGAATCAACATCCCTCACCTGCATCTGATGACATGT
GCTTCAGATAGTAGTCCTGCTCCATGGAAGACTCATTCAATCTGGGCTCC
TCAAGCAGCATTGGTTACTAGACGTGAATAGAAAGTCCATGTCGAGGGAG
TCTATGGACCTGGAGCTTCTGGTCAGTTCATTGCAGGTCCGTTCAAGGTG
GTGGCAATCCATGATGCTAGCTTCTGGTCAGTTGGCTGCAGCTAGAAGCA
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CTGAAAACCGACTGCAAGCTCCGGCAAACCTATCGGTGATGCGTCGAGAT
ACATACACAAGATTATTTGTCTCCTTCACCAAGTCAGGTGCTCAGCTCTT
ATTTTCTTAATGTTAGACTTTTTTTGTTGCATGGAACAGTCTAGCAGCAA
AAACATTGCCTGTTTATGGTCAGGCTTGTCAGTATGATTGTTTCCTTTCA
AGTGGTATACAAGATGATTGTAACTAGATTGTTGATGATGAACACCGCAA
TCATCTGCCTGATTCTAAAAAGCAGATGCAACTGTCACTGCTCACTCTTT
AATTAAACTGCATGCTGTAGTACCTACCTTATTGGTTGTACTTTCACATC
TTGCTACCTGACTCTCATGGCAATGAAGCTGTTGCATATATACTGGCCAA
GGTACTTGAAGTAGATTAGCAATTGCTACAGCTACAGTGCAGGAAAAATA
TCGGAAACAGATTTGCTGTTCCATGGTACCTGCATCCAATGGATCACAAA
CACCAAGCGAGAGCATCTATCAAATAACCAAGAAAACTAATCCCTAAAAC
ACACATATATGTAACCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.