Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA029952

[Submit comment/correction]

Sequence	AA029952
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA029952
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCGGATCCGACGGCTACGAAGCCCACCGGGCACCCCACGCCACGCGGCC CGCGCCGCCTCCCCCCTCTCCGTCGGTTCCCCACTTCAAATTTGCATCGC GTCGATTTCACGCGCCGGTTCCCCCAAATCGACCCCCCCAGCCTCCCACT CCCACTCCTCCCCTGACGCATAAATACAAATCCCAAATCCAAATCGAGCC CAAACCCTAACCCTAGCAACCCGGAGAGAAGAGGGAGATGGCGCGTGCAA GGGGCAAGAAGCGCGCTGCGGCTGCGGACGCCGGCGGCTCTAGCCAGACG GAGCCGGCGGCGCGGGGGCGGCCGAAGCGCGCCAAGACGGAGCCCAAGCC CAAGCCCGAGCCGGAGTACTTCCCCGAGCAGCGGAATCTGGTGAGGACAC GCCTCCTGCATATCCTGTCCGTGTTGCATTCTTCCGTTCTCTAGATCTTC GTATCGCCGAGTAGGGTCGGGCTCGATTGGGCTTTAGTTCGATTTAGCGT GCGGACTGTGCGGTGCGGGATTGGTGGCATTTGGTACGAGAATGTTTCTG CGTCTCTCATATTGGCTAAAGTGTAGGCTATGAGCTGAATGATTTGTCCT GTGCACATGTTTGACCGATGTGCCATGTATGGTTTAAAATAACGGAACAG AGATGATACAAAACGCTTGCTGGGCCAAGTTAAGTCGACTAGATAAAAAA CTCCGCTGGGTAAGCTTAGACACTAATCGATTTTTATTTCTCCTCGTTTT TGGGCTGTTGTAGTTCCCAAAATTCATGCATGTTTGCTGGTGACTTTGTA ACTTGGTCAGTATTGCTGAGCCTGACGTGTAACGGCAGTGCTAACCGACT TCTCTTTGTGTTCTAATGTCAGTTCTATTTTTTGCTAGAAATTGGATGGT CAACAGCTGCATGCATATTCACATGCACAGAAGATAGTATAGAATTTGGA CAGATGTGTTGTTGACTGCTTGATCAAAACATACTATAGGCAAAGTATTG CTTTCCTTGAATAAACAATTAAATGGGTAAATTTGTTTAGTTTACAGAAA ACCCCCTTTGGGCAAATTATACAGAGACTTAATCCTTTTGAGGGTATTTT TACCAATGGACAGTCAACTTTGGGTACATGATCTAAGGCTAGGGAACTTT TGGGCAAATAACCAATTTTCCCGTGATAAAAAGATGTTCCACTGCAACTC CACGGTTTAATTTTTCACTGGGATGCCCATTTTTTCGAAGTTGTGTTATA ATTTGGTTATTTGGCTCCACCTATTAGATTTTTCAGTTGAACCAAGGGCA TACACTTTGTGCCCTTGTTTGTAGTCTTGCTATCTCAGGGTTGGTGCTTA TTGTCTAATGGTCTATTACTGTGTTCAGGAGGATCTTTGGTTGTCGGCTT TTCCTATTGGAACTGAGGTTTGTGTGCATTCCTATCGTTGTTTTTATCAC ACTTCAATGTGCATAAAACTTTTCTTTCATGCATATTTGGCGTTACTTCA ATGTTTCCTTGTTTCTGGTCCTGTTGTTTGCAGTGGGAAAATATTGATAA GATAAAGGAGTTCAATTGGAACTTTGAGAATTTGGAGGTAGGCTGATCTT ATAATCTTCAAAGTTTTCCTTCTCTTGTGTTTTAAAAAGAGGTTTCCTTC TAAAGTTAAGTTTCCTTACAATGTGTCACGTGCTTTATTGTTGGCGAACA GAAAGCTCTAGAAGAAGGGGGGAAGCTTTATGGGAAGACAGTTTACGTAT TTGGCAGCACTGAGCGTAAGTAGTTTTATTCTTATGCCCATTGATGGTTG TATTCTCAGCCCATTTATGCATTGGTAATATTTTAGCACTGGCAGTAAAC TGGTGCCATCAGTTTTATCAACGATCATCTGGGAATTCGATAATTATACT TTATAGCTACTGTTGAACATCTATTAATACTGAAATGTTCTCTAAGCATC CTAGTAGCCCTATGGTCTTCTATTATTGGTCTAATGGGCTTATTTTTGTT GGCATGCAGCTCAACTATTGGATGTTAATGGTGAATCGAAGATAGTACTT ATCCCTATAGTAGTTGCTGTAAGTTTACATCCATTATCTTTACTCTAGAA AAAATGCAATAGTTAAATTCTCTCTGTTTTACATTGTATTGAGTTGTATA CTTTTTTTATGATTTCACATGCCATATTATATTTAATATTAATGCATTAC ATAAAACGTGTAGTATGTTCATATAATGACTAATGACCCTAGCTCATTTG TACATAATAAAGATAAAAGCGAACAACTACACTGGATGATGAATGCATGA GGATCTTCGATGATTAAAAATTTCAAGTTATATTTCTGAGAAATCAAGGA ATTAATGGTTAGGAGCTCCATTAATCTTGCCATTAATGTTACTGAGGTGA CTTTTACTAAGGGGCTAAAACCCTCACTGGTCTGGATTCTGCTATAAGGA CACCATCTACCTCTGATATGAATTTATTTTCCTATAATGCTGTTTGTGAC TCTTTTTTTGCCCAGGGTTCCCTTTTTCCTCCTACAATAGAAGCTACGAA AATGCAAAATACATGTTCTTGCCACACTATTTTGTTGATGAATTAAACCC ACATTTCATAGGGAAATTTTTCTTGGTGTATCTATAACTTCAGATTGTTT TATTGCTTTACTTGCTTAAGATCTGATAACGTTCTTGTTTATTTGCTGGT TGATGGATCTATTTGGCTCTTGAATTTCTTATTCTGTTGTACAGGTTGAC TGCCCTTTCCCTCCATCCGATAAAATTGGTATAAATTCTGTCCAAAGGGA AAGTGAAGAAATTGTACCAATGAGGGCAATGAAGATGGCATGGGTGCCCT ATGTTCCACTAGAGGACCGGTACATCCATCCTACTTATTTTAGCTATATT TCTTATTTTCTACTTTGGGCAACTATATCGATACCTCCCTCCCTCATCCT TACAAATGTAGTTTTTTGTTTCTTTGCTTTGCTCCTGCTTTGTCTACAGG CTCAGCAGGATGGAAAGTTTGAAAACTAAAATATTCACTCTTGGCTGCAC CCAACGAAGGTAACTTTTATTCCTGCTATATTAGTATATCACTAACTATT CATGCTTGAGGGCTTATAGTTCTATTGCTCCCAGTTATTTATTTGTTGGG AATGGTGCCTTCCAGTAAATGCTCCCATGTGTGGAATGTTTATTTTCCTG ACTTGTTCCAGCATCCTAATTTTTTATATATGGCAGGTCTGCGCTGAAGC ATCTCAGAACTGAGCGAGTCAAGAAGTTTGACTATTGCATGCCTTGTAAG CTCAATTGGGATTGTTTTTCATAGGCCTTATGTGTCTTCTGAAATGTCTG TTGTTGCTTTTGGATCCTGCGGTTCCATTGCTGTACATATCATCTTTGCT TGCTGCAGTCAAACAATATGTAAACAACACTGTTCAAATTTGTGCATAAT ATTAAATAGGATCACGACCATGTCTTAGTTTAATGGTTTACAATGCAGCA GTATGCCATGGGCTGAGAACCCTTTTGCTGATCTTTTTTTCTTGCGGGTA TCCTTTTTAATTTCATAGGATGGCAGTTATGAAAGTTAATTTGCTTGGTC CCAGACTGACTGTATTTAGTTTGCTGATTTTCTTTTGCTGGATGGACTGG CGTTCCATATACGAAAAAAACTCCTGTAAATGTTATCCGTGTTCTAAAAG GTGCCAGGCAGGAAATGTGCGGATCTATAGCCTAGCAGCCAATTAGTCAG GTTAGTTGGGGCCTGGCAGGGAGGGTGGACCCCAGCGCCAGCTTCCTTCA TATACCACGATAGAGTATATCAGTTTAGGCATGTGAAGGGCATCGATCAC ATGAAGATCCCAACACACCCACCAACACCTAAATGGCACACCATGTAATT AGAAATATCCGCTGTACAACTAGTTGATTAGATCGTAGATGAAAGGAAAT GTTTGATCCTATGGTTCGCGATGTGCTCATCAACCTGTTACATATATTTT CTGAGGCAAGAGGTAGGAACACTGATCTTGCAACAATTTTGCAGATTATA TGCCGCTTAGTCCCCCTGAAGATGAAGATGATACCGTTGTCAACATCATG TATCCTCTAGAACCTCCGGTAAGCTTCTTTCTGTAGGCCTATGACACCAT GTTGGAACTACTGCCTAAATAGTCACGAGCATTTATTGCCTCTCATTATT CCTTGAAGTAGGCTGTTCATGAAACTCATAATTAGCGATAGAAATATCAA CAAAGATACCATGTGTAGTACAACAGTCTCTTTAATGTAAATCAAAACTA ATCTGCATCAAAACTTCATATGGAGTTGTTTGATTTGAACTTAACTATGT TTTTGTTGGTAGCTTTAATTGACTCAATTAATATAATTAGTATGCTAGTT ATTTATGGAATGTTTGGCGACTGAACTTGGCCTATCTGGCTTATGAGAAA ATCTGCATGCCGTATCTCCAGTTGATTTAACAACTTATTTCTATATACCT TTCAATTGCTTGTGCATTGATGATCCTTTTTGCTGATGTGTCCATACCAG TGAGGTCAAAACCGATCCACATACTGCTGCTGCTAGGGTGTCAAGCGGGG CGGGTTGCGGCAGTGTTTTCTAACTAACCTTCATTAATTTTGCTAGCTTT TGGGACCTCCTTTTGTCTATATTTTCTTTTGCGGGTCGTTATGCGGGTGC CCTTGCCACCCTAGCTGCTGCCCCTTGCTAGCTGCTGATATTAGTTGTGA TGCCAGTGTTAGCTTGCAGTCACTTTCCTAGGCCCCAGTCTGTTGCGATT GGCGTAACGTATTTCTTATGTTGTTTGCCTTGTGATTGTGAATTTATTCC AGACAGCTCTCAACCATATGACATGAGCCACCTTGGGGTGATAGCTGGTT ATTAGAAAACCCAAGTTTTATCTTGGCCTACCAATTGAAATACTGGGATA GATTGTTTCCTCTTTTCGATGCCAGCCTTTGGTTTCTCTGGGGGGACAAA ATATCTGCCCATCCCATGATCCACTTTTAGCTTATGGCCTAATGCATTGC GGAAATATTTGAAGTGTAATTAAATGCTTCCTAGTTGGCCTTTTCGGCTT TTATTTCTAGTAGCTGCTAATTTGTGTTATAAACCACTGTATTTATGTTT TTTCTGCGTATTGCAGATAGTATGCGACTTTGACTGGGAAATGGATGATT ATGAGGTATGTATGGGGGATTTGTTTTTCCCTTTCTGAAGTTCTGTTGAA AGAGGCATTGTAGAATATCCGGTTTGTTTTTCCCATTGAAGGACATCTGT TGAATCATTGTATTGCGATTCAGGATTTTATTGATGAAAAAGTTAAAGAT GAGGTTCTGCCAGAGGACGAGAAAGAAAAATTTAAGGTGCACATTCAACA CTTTTTTTTGCATAACTCTGCTACAATGATTACCTAGCGTAGTCCACCAG GATTACCTTGAAAAGTTTTCTGTTCTCTTGTAATTTTCTGCCATGTTTCA TTAACAGGACTTCATAAAGGAGAGAGTTAGAGAAAGGAAGAGAGAGCTGA AACAGGTTAACAAATGCACCGAAATGTTAATTCTGTTCACCAAAGATTAT AAAATGCATCTAGTACTGAATGTTTCTCCAATATTTATGCAGGCTAAAGA GGCCAGAAAGAAAGCCATTGATGATATGGATCCTAAGTTGAAAGAGGCAT TGGAGAATATCCGGTTTTACAAGTTCTACCCTGTAAAAACCAAAGATACT CCTGACGTAAGCAGAGTACAGGTATGCAGTTGCTCGGTATTTCTTAGCCT TGACTGGACTTGTGTATTTTCTTTTTTCAAAACTGATGAATGGACTATTT GAAGTTGCCTTGGATTAAACTCTGCATATATTGCATTCTGCAGGCAAAGT ACATCAATAGATACTACCGCAACGCACATGAACTGCTGTGAGGTGCAACC TCACATATCCTTGTGAGCAAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.