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GrainGenes Sequence Report: AA031399

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Sequence
AA031399
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA031399
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTGCTTTCGAACCGCCGTTCGGTCCAGCGGGACCAGCAGCAAACTCCCGT
TCCGTGCCGTGCAGATACAGACCAACCAAGCGTCGAATTTCAGACCGAAA
TTTCTCCTCTCACTTCCTCGTCGTCTCGTCCTCCTCTCCTCCAGATCCAG
GCCCCCGACACCTCCGGGCTCCGGCCATGAGCGACAGCGATGTCGACGAG
GACGAGCTCCTCCAGATGGCGCTCCAGGAGCAGGCGGCGCGGGACCTCAG
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TGCTCTGTCCAGCTTGCTCGCAGGGTTCGGGAAATGCGTGAAGCAAGGGC
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TATTCTTCCCCAGAGTTTGATCCCAAGGTTTTTCTTTCGTGGGTTCACAA
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TCCTTATCGCAGTAACATGTTCAGGGTATTGACATTCTATATAATGGATC
GCTTTGTGGTATGACAATTTTTTCTGCAGATATTGAGTCAAAACTGAGAC
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TTGTACAGGCCCAAGCTGAGAAGATCAGATCTGTTCAAGGAATGCTTCAG
AGATTCCGTACATTATTTAACCTGCCAAGCGCAATTCGTGGCAACATTAG
GAAAGGAGAGTATGATCTAGCTGTCAGAGAGTACCAAAAAGCAAAATCAA
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CTTTTATCCAACGATTAACAGTTCTGGGAATGGGCAGGGTATACATGCTT
ACTGTTCATTGCTTTCTGCACCCAATATCATTGTTAATGACATCTTTATT
TTGAAAACCTTGGGGATTTGGTGGGGGCGACAGACCGATGATCCCCATCA
TCTTCTTATGGCACTATTGTCCTAGACTACTATCTCCCCTCTATTTGTTG
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GCTTTGGTTGGGTTGCATTGATATTGCTGTTACCATAGAATTGATTTATT
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ATCCTCCCTTACCCCCCTAGTAAAATAACTTACTTCTGTACCATAATTTG
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AGTTTTCAAGGATCTGTCTCTTACAAACTGTATTAAAATGAAATGGAAAA
TTCTTTAGATTTGGTCATCTTTCCTTTTCTTTATGCTGACCTATGTTGTA
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TAACTGCAATGTTAAAATTTGCAATAACAGAGATTGGTGCATTCACACAA
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ACTCCTTGGTGAGTTGACTTGCATGTGTGTTGATAACCTGATTTTATCGT
CTTTTTATTGCTTGGTGTATGCTGGAGAATTCTTATTCTTTCAAATTTGC
CATTCTTTTTTGTGGTGCTTTCCCCCGATGTGAGGCACTACACACCACAA
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GGTAATGCATGAATTCAGGGGAATGCTTTATAAGTCGATGGAAGATCCTC
ATCTTGACCTTGCTGAGGTTAGTATGCTGCATGCCATTAAGTGTTGGTGA
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TGAACTTAGGTTTAAGGAACTTTGAGCTTGACCAGATAGTGGGGTAGTTT
TGTAAGATAGTGGATAACTGTAGAGTGCTGCTTGCTCTAATTTGATTCCT
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TGATGTTTTAGTTCTATTTGCTTACTGATTCTGTTCACAATTTTCAGCTT
GAGAATATCGTCCGGTTATTGTTGGAGTTGGAACCCGAGACTGATCCTGT
GTGGCATTATCTTAATATTCAGGTTACCACCCTTAACCAAAGTCTCTGTG
ATATAACCTGTCTGACATTTTTTCCTATTAAATCATCCATATTCTGAGTA
TATTATTCCAATATTTTCCATCAGAATGGCAGGATTCTTGGATTGTTTGA
AAAGTGCACCTTAGACCATGAAGCACGAATGGAGATTTTGCAAAATAAAA
TTCATGAGAAAATGCTCTCTCATTCAAAATGGAGGCAGTTACAACAAGAA
TCGAATAAATCAGTGAGTGTACTACTTTCTGTTGTTCAGCATGACATGTG
TCTGGTCATTCTTCTGATGACATTTTCATGTTATTCGCTACTTTTCTTTT
TGTTTACTAGTGGCCTATGTTGTTTCGTTTGCGTAGTTGGAAGTCGATTC
TGCTGCTGATTCTTTCGAAGACGATCAGTTGTCATCAAACTTCATGGCTG
AAGAGGCTGATAGTTTAAGGGCAGCCTATATTCGCAGGTTAACTGCTGTA
CTTATCCAGCATGTTCCTGCATTCTGGAGATTAGCTCTATCTGTCTTCAG
CGGAAAATTTGCAAAGGTATGGACGTGCAAAAATCTTATTAGTTACACAG
CAGTGAAAAACTGAATTCACCTTGACTGTACTGTTGTAAGTAAACGACTT
CTGATGTTTGTGAGCTGCTATATTGGGACTTGATGCAAGCATATTGTTCT
GCTTAAAACCCTTCCATCGCCCTCTTTGGTTTAACCCAAATTAGAAAGTG
CTCTGATAATGTGAGAGTGAAAATATGATGCTTGTTTCACATTGTGACAT
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TGCACTTGCTGATTCGGACATGAATGCAAAATCCGGCGCAAATAGAGCTG
ATGATAAGTACACAAACCATAGTCTTGATGAAGTTGCTAGTATGGTTCAT
GCTACTGTGTCTGCTTTTGACACCAAGGTACAGTTCTTACTGCATATTCG
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TTGTAATAGCCATTAAACGTGCTTTGACACTTAACAGGTTCAGAATAGTT
TTCGTGATTTTGAGGAATGCAACATTCTTTGTCCATATATGGGTGACACT
ATAAAAGAAATAGCTAAGGCTTGTCAGACACTTGAAGGAAAGGATTCATC
TCCAACTGCTGGTATAGTTAGTTCCATTGTCAAAAGCTGCATGCACACAG
AAATTTGCCTTGTATCCTTAATGTGTTTAACAATTGTGCCAGTTAAAATG
TTGCATGCCCTTCATTTTGAAATGACAAAGCTTTACATTCTGCGGCTTTG
TTCCTGGATGCGGGCTACGATTAAGGAGGTATCAAAATATGAGACTTGGG
TTACTTTGTCCACCCTTGAGAGAAACAAGTCTCCGTATGCAATTTCATGC
CTGCCGTTGGAGTTCCGTGAAATCACAATTTCAGCAATGGACCGGATTGA
ATTGTAAGGCTGCTTTTGTATTTCTGTTTAACACTATTCTTTATCAATTT
GTCTGTTTTCTTGCGCACTTATGAGAAGGTCTTTCCCGGGTGTATATTTT
CCTTGTTGTTGGCCCATTTGTTATGTTCACATTTGAAGGTCACATGGCTC
CTTGTTTTCTACATTAAAATAAGCACTATATATTGTTTTGCAAGCGCCAC
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ATGCTGTTCATTTCAGAATGATCTTTAATCTGAGGAATGAGAGTGCTAAG
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ATTTCTAAATTCTTTTCGTGATTTTGCAGGTATGGAGTTGATTTATATTA
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GTATATAAATGGTACTGATGGAGAAGCATCTGCTAGCATGGATGGAGACT
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GAACTTTCAGATGAATTGTATGCCAAATATAGGCATATTTGGTCGCCAGT
CAGGTACCTGACCAATTTCTCGCATTTCTGGTTGCATTGTTGAAGTACAT
TTATCTTCTCTTTAAAGAAGCGTTTGTATCTTGTGCAAAGTAGACTTTGG
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GTTGCTCGAGGTTGCCCTCACCTCTGTTCTAGCCTAGGTTGCTGGCGCAA
GCTCATCATAGTTGGCAGCGACGTGTTCATCATGTACCCTTTGCTCACAT
TGTTGTTTCATTCATTGATCTGACTTAGACCCCAAGATCCCAAGTTATCT
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AATGGATTTTTCTAGGTGTGCAGTTGTGTCTTTACATTTCTGTAGCAGGT
TTTTTTGTTTGAGCGTAGGATTCGTGGTCTTTGGTCTATCCTTATTTGGC
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AAGCAATTCCTTAACTAAAGGCACTGGGCAGGTTCTTGACTGTAGGCATA
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TTTTGGAGGCAAATATAATATAACAAAGGAGCAGCTGAGCAGCATAGCGC
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AGAGGGCTGGAGAAGGAGGAGCAGTGCTGCAGAGGGGGCGTCGGGAGAGG
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TCTGTCTCCCTCCCGCTCGATTCACTTCTGCAGCGGTCAATTCCCTCTCC
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TGGGCGGCGTTTAGGCGACGACATGAAAACAAAGGATATCATATGGGTGC
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CTGTTGTTATTGCGCTGGTTTTCGAGTTAATAGTCATTACTATGGCCATA
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CCTCTTCCTGAGAGGGACGGTGACCATTTCTGCGCATCCAACCTCTCAGC
GCTGGGAAGTTTTCTACTGCTCACCGTCCGGAAGGATGTCGTTCTCCTGC
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GGGCAGGTGCCTAGCAGGTTACTAGTGGAGGCATCAAATAACATTGTTAC
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GCCGCCAGCCCCTTTCAGAGCACCCCTTGCTTGAGGATGAACATTGTTCT
TGCCTTTTGGTGGTGCTGAGTGAGATAGGATGCTTTTCGACAGAAGTCCC
ATTTGCATCTTTTAATTCTTAGGAGGCCCATTCACTTCCTTCAGTTCAGA
GTTCTTTTTGTCAAAATTCCGGAGGTAGCACCACTCCCCTCTTTCAGTTC
ATCCGAGTTGCCAATCACATCTTTGAAATCTTAGGGTGCCATTTCCTCTT
GTTTAATCATTGCCACCAAGTTCCATAATATACCCTGCTTTGCGCTTTGT
GATTCCTTTCTATATTCTCATTATCATCATCTTCGTCATCACCAGTGTGC
TCCTCTGCTATTGTTGCCTCCATTTGCTTCCGTTGCTTGCTTGCAGCCCA
TCTAAACCGTGTGGCCCAACCCGACTGGAATGGTGTATCTAAACCGTGTG
GCCCAACCCGACTGGAATGGTGTGGGATGGGCTGGGATGGGACGGGCTTT
CGTCCCAACCCGCCAGAAACCGGCTATGAGCAGGTCTTGTTTAGAACATC
TAGCAATCTTCGTATTTACTGCAAGAACAGTGAGACCAATAATATGCTGT
GGCTACACTTCTTTGTGTTGGTTATGAACATTATCCCTGTGTGATAGCTG
AATTGTATTAATGCTTGCTGTCTTGAGAAATTACCATTTTCTTAGGTCTA
GCACACTCTTGTTACACCCTAATTCAATTCATTGTCCTTGCAGGGTATTC
GAGATGCAACTCTTGATTTACTACACATCCTTGTGGCCGTACATGCAGAG
GTTTCCACCAGTTTCTGCTCTTTTCGTTATTTTACCACGTGACACTACTG
TATTTCTAGGAATAACATGCATTAAAATTGGTAACTTCTTTTATTCTTAG
GCTCATGGGTTTGTTATGACTTCTGCTAAGCTTTCTATCACGCAAGCAGT
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TATGCCCATACTTTAGGGAATTAGTAGAGTAGTTGCCACAAGTCCATAAG
GTGGTCACTATTAAGTGCTAGACTGGGCATTTGGCAGTGGTAGGAGGACC
TGGAGTGTGGCTTGGAACTGGAGAGTTCTTGGGGAACTGGGTAACTGTGC
CTCATGTAAGTTTGCACACTGTTTCCAGTAATGGTATTATATATACTAAT
AAAGCCCAAAACACTATTTCATTTGGAGTTAATGATCTTATGGAGGTCGT
TTGTTACTTAAGCTAAAGAAACACCAATTGAACTCCAGGGCCACTTTTTT
TAGAAACCTCATTGTTGGTGATTTCTGCTGTCATTACAGTCAGTTACCAC
ATTGTATCTGCTTCTACGTATTTGTGTCTTATTTTGTAACATCTATGTAT
GAGTGCTATTGGACTCTATAATCTATACAGTGAAGATGCAATGATTAAAT
CTGCTTTAGTTCCATCTCAATTTTTTTTTTTTTATGCAGTTCTAACTTTG
TTGCCGGTTTCAGGTGTACTCGGGTGCTAGGCCTTTGTTGGAGAAGACAA
TGAAGATTTTGGTCGAGGGTTTGATCGACATCTTTCTTAGTCTTTTCTAT
GAGAATAAGGCCAACGAACTAAGAATGTTGGATGCTAATGGTTTTTGTCA
GCTCATGCTTGAGGTTGTTATATAGTTACTTCTGTCTATCGTAGGATTTT
TCTTGAGCTTTAGCTTGCAATGGTTCAACTAAGCATTGTTCTCTTTGTTA
CATGCTTGCAGCTTGAGTATTTTGAAACTGTGCTGCACACATACTTCTCA
ACTGAGGCACAGCAAGCTCTGAAATCCTTGCAAGAGAACTTGTTGGAGAA
GGCCTGTGAAAGTGTGGCTGAAGGCTTGGAGAATCCTGGACATAACCGTC
GACCAACTCGTGGCAGTGAAGATGCTGCATCGGATGATAAACAAGGGTCT
TCAATATCACCAGATGATTTGCTTGTAAGTACTCCAAAAAATGCTGCTTA
ATAAGTGCCCATACCTGTGGTTAGTAAAAAACATTCATGCTTGTCGAGAG
ATTTATGATACATGGCGAGTACATCTGGTAGGTTACCGTGGCATTAGTTT
TGTGAAATGTATATAGGTAAATCTTGATTTTATTGGTCTTTGAATTAAGT
TCAATCACATAGAATGAAGCTCCTTTTAGGGAAAGTTCCTCTTGCAATGG
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AATGTGGTAGTGATCTGCTGCAAGGGGAGCTGGAGAGAACCCGGCTAAAC
ATAGCATGCTTTATGGAGCCAACTCTTCAGTCAGCTTCTGCACCGACGGG
CTCAAAACCTTCATCTTATTCTTCTCATCAGGCATCAGCACCACATCACC
AGCCAGCTCAAGTCTCTTCCCCTAGTTTTAGAAGGCCGCAGACAAGTACA
AACTCTCCTGGAGTCTCTAGACGACGCAGATGAAGTAAAGGATGAGGAGG
CCATTTGTTTGTCGATGTGGCTTCTTCCCTAATTCTTTTCTCCCTTGTTT
ACTTTGCTCCAGCCTAGTTGTTCCCATTCATTGTAATTAGCCTCATGTTG
TGTATTATGAATTTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.