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GrainGenes Sequence Report: AA049251

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Sequence
AA049251
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA049251
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGCATGCCCGTCAAGATTGGGGCATGGGGTGGGCCTGGTGGCGGCGAGAG
GAATGTGCAGGTAACACCTGGCCGTCTAAACAGCGTGACCATCCATAGTG
GACGTACCATCGACGCGATTTCCTTCACCTACGTAGGCATCGATTACATC
GAGCACTCTGAGGGCCCCTGGGGACGCCCTCTCAACTCAAAGACCACGGT
GCGCGTGGTCTGAGATTTCCTTTTTTCTTTCTCTCTTCCTATTCCTACTT
AGACATGTATCTTTCTCTTATTGCATTGATGCAGATTACTCTTGATCCTA
CGGATTATGTGACGGAGATCTCAGGGACGTTTGGTACAGCTTTTGACAAT
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ATGGAGGCAAGATTATTGGCTTCTTTGGACGCTCTGGCGACATGTTGGAC
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TAGGACGTAATAAAGACTTATGAAGACTTGATGTTCCTGAAGGCGATGGG
AGAATATCATCTCCTAATTTCATAGGGGCTCCACCACATCTCTTTGTGGG
CCAATAGGATAATGCTTTTGTGCTATTTTGGTTATTTTGTAGAAGATCAA
GTATAATTAACGAGATTAAGTATAATTAGTGTTAAAAATGAGAGATGTGG
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TGGGGCAACCGGGACTAAAGGTTAGGGCTTTAGTCCCGATTGCCCCGTCC
CGGTTGGGCAACCGGGACTAAAGGCCCATACGAACCGGGATGCATGGAGC
TCTTTGCACTAGTGGTACTAAACAATTGAGTAAAATATATCAGCTAACTC
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AACAACTATGCCAAACATGTATATGAGTCGGTATAGTCTACATATTTCTC
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GCAGGCAGGGGAGGATTCATGATCGTCGTCACCAACACCATAGAAATGCA
GGAACAAGTCACTGTCCTCGTCATGCTCGGCGTTGATGGTGTTGTGATAG
TCAGGATGTGGTGGTCGCTTGAGTCTGCAGAGAGCCAGTGGCATGGTCGC
GGCTAGGCGCAACGCGGCGAAGTGGATCATGATGAGGCAACATCTCGGAA
GGCGGGGAAGGCGATGTGGCGCTCTCGTCGGAGACAATGGTCAACACGAT
GACATGCCAGCAAATACAGGGCTCTACATGCCCCGGTGACCCTGTGATAC
TTATGCGTGTATTCGGTAACCTTAAATTGCGTATAGCGATGTACGGTGAG
CACGGCAAGTAACAGCCTCAAGTCCAGTGATTGATCTTTAATGTATTTTA
CTCAATTTAAAATGAAATGAACATAATTTTTTTAAGGCTCAAGTCCAAAC
TATTTTCTAAAAATTCTATGAAATTTTACGAAATGAAAATAACTATATAG
GTCTTAAAAACTAGCTTTGAACCCAAAAGTTAATTTCTAATAATCATTTT
ATATAAAACGGCTAAACTGGTTACTAAGATTTATTAAAGCCTATATTATA
TATAAAGGTCCCGTTGTAAAATGAACTAGATGTAAAAATGGTGACATTAT
CCGGTGGACACCACATGTAGGCCGGTCATGCTGCTGTGTCGACGCCCCAC
GTCTCGTATGGATTTGTGTGGTGCATAAAGGTGTATGTGTGTGTTGTTTC
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CGGCATAGCTCAATACCGTCGGCGTTGGTTCGGCCCTCGGCGTAGTGCCT
TGTGCCGACGGTTTATGCCGCCCCTCGGCGTAGTCCGGCCGTCAGCTCAG
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AACGCTCGGCATAGGTTGCCACGTGGAGTGCGCTGGACGCCAGGGTGAGT
GGGGTCTGTGCCGAGAGGGAAACGCTCGTCGTTGGTTGCGCTGTGCCGAG
GGGATCACACTCGGCGTTGATATCCACCATCCTCTGTTTAGACCAATGCC
GAGGGGATCAACCCCGGCGTTGATGTCCGCCAGGCCTCTGTTCAGAGCAA
TGCCGAGGGTTAAACCCTCAGCGTTAACGTCCACTGGTTTTTTTTCGCAA
TTTTGTGCCTCGCAGCAGAATATATATATGAATTGGTTGTAATAATGCAA
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GTCTTCGAGAGAATCATCACTACAAGTTCATTACACATAGTCATGGGATA
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GTTTAGCATGGCAAATTGTGTAAGTCAAATTTTATGCATGACAAGTTGAG
CATGGCAAATTGTGAAAGAACACACCCGGTTAGCATGGAAAATTGTGTAA
GTCAAACTTCATGCATGACAAGTTGAGCATGGAAATTTTATGAAGTCAAA
GTTATTGCTTGGAACTAACCGGGGTCGAAGAGTGTCGACGCGAATAGTAT
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TCATGCATATGTGAAGGACCTTAGCTAGCTATCTATAAATGTATAGAAAC
TTGCATTGCTAGGCTAAATTAGCACTACCACAAATAAATATTAGTTGCAC
ATTTCAGTACTCTATATACATCATTTTATAAGAGATGCTAGAAAAAAAAG
GATGGGCTTGTGCTTACAACGCTACTAGCAATCAATAACATCAAGAGGAG
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AAATTTGTGTTCCTATAAAATCTGGAATTTAAATGATCCTATAAAATATT
TTCGAAGTGCAGACATGGCCCATATCATCGCATCTATTCTGCAAGGAAAA
TGATTAATAGTTCACCTAAGAGACGGCGTCTCTCAATATATTAGCAATTC
GGTGGTAAATTAGAAAGGCATGGCCCATCTCCATTGAACAAAAACTACTT
ACTAGTAAATACATATCGTCCAGCCATCACAGCAAAGGTATCAGCAGTAA
TGCGAAGATAAAAAAATGTACAATTGACATAGCATTTTCTGTACGAGGGT
TGACCAATGTACTTTTTTGTTGGTTTAGGTTTGTTCAATTCATATCTACA
TGGAAAAAAAGGGTTGGGACACATATTCCACCGGTAGCCCTCCATTTGAT
CCGTAGCGGGAGTTTCCTCTAGCACATCTAGTACTTTTCTAAGTGTTATC
GCATGCAAGTGAACATGCTCGCACCCATGAGCTAGTAATTGCATCTATGG
ACCTTCCACCACACTTGTACATGTTTGTAGGGACACTTTCAAGTTTTCAC
GTGATTCCGACGCTCCAGCGGTCTTTTTCCACCGAAACCCTAGTCTGTAG
GACCCACAGGTCTACCCTTGTAAAATTTTCCGTACGAGGGTTGATCAATG
TACTTTTCTATTGGTTTAGGTTTGTTTAGGTCACATCTACACTAAAAACC
AAGGTTTGGACCAAAATTCCACCAGTAGCCCTCCTTTTGATCTGTAGCGG
GAGTTTCCTCCGACACATCAAGCACTTTTCTAAGTGTTATCGCATGAAAC
TAAATATGCTCGCACCAGGGAACTAGGAATTACATCCATGGACCTTCCAC
CAACCTGTACATGTTTGCTAGGGCCACTTGAAAGTTTCCGCGTGATTCCG
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GCACCCGAGAGCTAGGAATTGCATCTATGGACCTTACACCATAGTTATAC
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GTGTTTTTCCATCGAAAACCTAGTCTATGGAACCCGCAGGTCTACCCCCA
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TTTCTTTAGGTCACATCTACATTAAAAACCAAGGTTGGGACCAAGATTCC
ATCGGTAGCCCTCCATTTGATCCGTAGCGGGAGTTTCCTTCGGCACATCC
AACACTTTTCTTAGTGTTTTCGCATGGAAGTGAACATGCTCACACCCGGG
ATCTAGGAATTGCATCTATGGACCTTCCACCGCACTTGTACATGCATGCT
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TCCCTCCCAAGTCGGAGAGATATACTTCGGGCCCACTCGGTAATCGATAT
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GTATTACGGAACGAGTAAAGTACTTGCTGTGAACGAGATTGAACTAGGTA
TGACGGTACCGACGATCGAATCTCGGGCAAGTAAAATATCGCGAGACGAA
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TATGATCATCGATGAATGTGTGGGAGTCAATATGGGTGCCCAGACCCTGC
TGTTGATTATTGATAGAAGATCATGTCTGCATATTCTCGAACCCGCAGGG
TCACACACTTAACGTGTCTTGACGCTAGGATAGATTGGATAATTGGTTTA
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GTTCGGAATTGTTCCGGGTTAATCGGTATTGTACCGGAAGCTTCTAGAAC
CTTCCGGAAGGGGACCAACGTGGCCCCACCTTCCGGGAGGGGGCATGGGC
CTATGAGGGAGTATCCTGGCCGCATTGGGCCAGGGGCACAAGGCCCCATA
GGGCCCAGCCGATTCTAGAGAAATTTGACTCGTTTAAATATCGGGATAGA
ATTTCTAGATAAGGGAGAGTTTAAATCGTTTAAACTAGAGATAGGATTTC
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GGGCAAGGGCTGGCCGCCCCCCCCTCTATATATAGAGGGGTGGTGCGCCC
CCTCCCCCCTACTACACACCTTCCTCCAAGCCCTAGCAGCCTTGCTACCT
TCCTCTCTCCCTCCCGACTGTTTGTAGGCGAAGCCCTGCAGCAGAAATTC
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GCATCTCACGGAGGCACCGCCACTTGTGGTGCTTGATCGGATCGGATCGC
GAGGAGGAGAAGCGAGTACGACTACATCACCCACGTTCCGACGAACGTTC
CGCTGTGCGAATCTTCAAGGGTATGAAGATCTAATCCAATCTCTCTCGTT
GTTTGCATCTCCTAGATTAGATCTTGGCTTTCCCTCTGTTCGCTCCGTAG
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GTGGGAGTTTCGTGTGACACATCCAGCACTTTCTAAGTGTTATCACAGGC
AAGTGAAAATGCTCGCACCCGGGAGCTAGGAATTTCATCTATCGACCTTC
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CAGGTCTACCCCCATACCATTCTCCGTACGAGGGTTGACAAATGTACTTT
TCTATAGGTTTAGGTTTTTTTTATGTCACATCTACACTAAAAACAAAGGT
TGGGACCAAGATTCCACCGGTAGACCTCCGTTTGATACGCAGCGGGAGTT
TCCGCCGACAAATCCATCACTTTTTTAAGTGTTATCGCATGCAAGTGAAC
ATGCTCGGACCCGGGAGCTAAGAATTGCATCTGTGGACCTTCCACCATAC
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TCCGGCGGTCTTTTTTCCACCGAAACCCTAGTCTATGGGACCCGCAGGTC
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CATATCCAGCACTTCTCTGTGTTAACGCATGCAAGTGAATGTGCTCGCAT
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CCATGGTTTATATGGAGACATGTAGTTCTTAATTTCTAACCTGTAAACAA
CATACGATCATGCATCTGAGTTCAGTCAGGTTGACATGGTCACTACTTGT
CGTCAGGGCGGCATCTATAGCTAGTTGCATAGCACGTGCTGTTGCTACCT
TGCTAATAGCAATGCTGAGGGGATTTCCCTTGGCGTAGGTCCTGCCAAGT
GTATGCTTGCTCCACATGCTAATTGCAATGCTGAGGGGATTCCCCTCGGC
ATAGGTCCTGTCAGGTGTATGCCCGTTCCACACGCTAATAGCAATGCTTA
GGGGATTCCCCTCGGCGTAGGTATGGCAATGCTGAGGGGATTCCCCTCGG
CATAGGTCCTGCCAATTTCTAATATATGCTCGTTACAACGCCGACGGTCA
GCCCCTCGGCTTTGCTATGCGCCGTTAGCTATCACTGCGCAGAGCTACGC
CAACGGTAAGCCCCTCGGCACCGTCATACACCGTGAACTGTCCGTTCGCA
CCGCATGAACGTGATCCATTCTCAGCCTGCGCCGACGGTGCCCCTCGGCG
TTGCTACATCTATGCTGAGGGTATACCTACGCCGAGGGTCCCTCTCGGCA
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CACGGCACTGCGCGAGCTATGCCGAGCGCCCCCGACCTTTTCCACTCAGC
GTTGAAATCCCCCTCGGCATCTACGTTTGTTCCCGTAGTGGCTCGCCCAT
GTGTGGTTGCCATTTGTTTCTGCAGGTCCGGTTCAGAGTGTTTCTATTTG
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TTACATGCAGGAGTATACACTGGTATGCTCCATGTGTGTCACGTGTGCAT
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TACAATAACTCTTAGGAGGGGTGGGCGGGTGGGCTGGAGGGGCTATATAT
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CCTTCTTCTACACGCTTTTTGTTGGAGTTAGAGAGAGCCGAGGCCAAAAT
GGTACCTGTTCGATCTTCTCATGGATGGTGTAATTCTTTGTTTTTTCCGG
TTATATTCAGCCAGTAATTAAGTTCATTCATGTTATTCTTGTGTTAATTA
ATTCAGAGCATGCCCGTCAAGATTGGGGCATGGGGTGGGCCTGGTGGCGG
CGAGAGGAATGTGCAGGTAACTCCCGGCCGGCTAAACAGCGTGACCATCC
ATAGCGGAGGTACCATCGACGCAATTTCCTTCACCTACGTAGGCACCGAT
TACATCGAGCACTCCGAGGGCCCCTGGGGACGCCCTCTCAACACAAAGAG
CACGGTGCGTGTATGTTCGCGGTTGTTTTTTATTCCTTATCTGTCTCTAT
GGTTACTTAGACATATATGTTTATCCTATTGCATTGATGCAGATTACTCT
TGACCCTACGGACTACGTGACGGAGATCTCAGGGACTTTTGGTACAACTT
TTGACAATGATTGTGTCGTTACGTCTCTTAAAATTTCCACCTTCAAGGAG
AAAGATAGCAAGATATATGGCAAACCTAACGGGACTCCTTTCCACATCCC
GGTGCGTGATGGAGGCAAGATTGTTGGCTTTTTTGGACGCTCTGGAGACA
TGCTAGACGCCATTGGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.