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GrainGenes Sequence Report: AA026454

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Sequence
AA026454
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA026454
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAGGCTCCGTACGCGTCAAAGGAATACGTCTCCCTCCGTGACGCCTTCGT
GCATCTAAGACGTATCGCCATCGCGCGTGACGTACTGCTCCTCCGCTACA
TGTAGTGTATACACGCCTCCAATGCCCGCGCATTCTCCACTCACTCCAAG
GCTCCCACACTCACGAGGGACGCACAGCTAGCCACCACCACCCAGGAGCG
CGCGCGTGCGGCCGTCCGCGCGTCGTCCATGGCTCCATCCCGCGCCGGTG
CCACGGCGCTGGCGGTGGCGCTGCTCGCCGTCGTCGCGACCGTGGCCGCC
GCCGGCGGTGGCCATTACCGGACGACGGCGTCCCACGGCGAGGTACGTAT
CCCCACACCAATAATACATCCGTCTACAGTACTAATCTATCGCCAACTTG
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TTGAACGGTATTGGTAGTATCGTTGGAAGCTCCAAATCCACCACTCATAG
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CCACCTGGAGGTGCTCCCATGCCACCATAGCCATCCAAAGTAGCTCACAT
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AGAGTTTATACCTTGCCGTCATTGGGCCAAACATGTTGGGCGCAACATAC
AACGCAATCTCCTCCGCGGTCTCTAGCGACTGGGGTGGCGGCACTGGTTG
TAATTGGCTGGCCGCATGCGCTGTGAAGGTTGGCCACGCTGACCCGCACC
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TTCGCTTGGGCATGACGTTCCTTTTCTTCAAGGCAAGCTGAGGCGGTGGG
ACAACACCCTGTGCATTGGCCAGCTGTGGCGGTGCGAAGAGGCCGCAGAC
GATGCTGACGCTAGGGTTGGATGCGGTGGTGGTGGCGGGTGTTGCGACCG
ACGGCGGAACGTACGCCACCGTCAGCGGTAGATGGGCTGGAGAAATAGGG
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GGCGCCCTATTTTTGGACGTCTTCAGGAGCGCTGTTTCTAGCCTCTCTTG
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CCGACTTGACCTGTTCACTTTTCTTAGGTCGTAATGTTATTATAAGATGT
ACTGTATATTTTATTTTCTTGGGGCAACCACAAGGAACTCTATGTTTTTA
GAACTAGCTAGTATAAGGAACTCTGGCTATTCATTAACATGAATGGATGG
ATAACCGTAGTGTCTACTGATATCTTTCTCAACAAGAAAAATGTCTATGG
ATAATCAAATTTGTGAAAATTGTACCGGTTGAGATTTGTAGGTTATTTTT
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TTAGACTGAATAATGTGTAATTTTAGGGGAAATAAATTTAGTCATCTTTC
AATAAAAAAATCAGGGAACTAAGCATAACATTTTTTAGGGAAATTAAGCA
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TGTAGCATGATGATTTTAGAGATCCAATGGTATCAACCATGAAGCTGCTT
CAAGTACTCCATCCGTCCTCAAATAGATGTCCTATAATTGAGTAAAAAAG
TCAATGATTTCTAAGTTTTACCGAGTATATATATAAAAAAAGAAAAATGA
ATATTTACAATATCAATAGATCCAATATAAGATATATTTTTAAATATTGT
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CGCCAGGTCGTAGGCCTCCCATGCCTCGTAGATGCGTGGCATGCGGCCTC
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CAGTGCGGTGCTTGTTGAGAACCATCGACAACATAACATTGCTAAAAAAC
ACCCACCCCGCGAGGTTGCCGCCAGTGTTCGATCCGCCATAGCCATGCAG
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TGGGATTTCTCGTCGGAGCTCGTGCAATGGTGCGATAGAGGAGTGAGTAA
TGCGACAAAGGGGAGGGCGTGGGGGTGTCATGGAATGAAACCTTATACCC
CCTCCGACTCAGGTATATAGCGGTAGGGTGGGTAGATTTCGGGTACCCTG
GATAAATTAGACCAGGCCTTTTAGTGGATCTGTTCAAGGCACACACAAAA
AAGGCAAAACCGGAAACCGGGTATCCTCTAGGGATGCTCAATAGCTCCTT
TAGCGTCTAGGTACAAACAGATCTTCAAATGAACATGTGATTTTCCTCCT
TGAAAAAATGGGACATACTCAAACTTTGTTTACTAACAGTACCCGTTTAG
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CCTCGTGGCCTGCACCTTCTCCGGCTCGGTGGGCATCGCCGTCGCCGTCT
CCGCGCCTACCCGCTTCCTCGTGCTCAACGCCGCCGACCTCTCCATCGAC
CGAGCCTCCATCCGCTTCCAGGTAATAAGAAACATAGACTATGAGGGCTC
TCTCGAAGCTTTGCCCTGTTAATTCCTCGCGCCACAGACAATTTCATCAT
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CACGGAGGTGGTCTTCTTCAAGGAGGACGATGTATTGGTGCTCGGGTTTG
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TTCTGTAATGTACAGGTACATCATCACCAACGAACCCCAGCATTTGTTGT
GGCCATCGATACTACCAAATCATGTCATGATTTGTTCTAGAAAATAATAC
AGAGATTATGGTGATGTTGACAAAATGGGAAAAACTGAACTATTGTTTTA
CACAAGAATCAGTTGATCACTAGTACTACCTCTGTTCCATAATGTAAGCC
TTTCTAGTAATTCAATTTGAACTGCTAAAAAGGCTTATATTTTGGAACGG
AGGTAGTATGTGGTCGGGGAGTTCATTATGAATGCGTTCTACTATATTGT
TTTTTCTAAATTAAGAAAATGTTTGAGTAATTTGTGCAGAGCGATTGCTA
TGAATTTCTTTCTTTTTGTTTATGCTGTTGCGATTCTGTTTGGTTGCAGC
AAGTATCAGTATAAAGGGAAGACGAGAAACATGGCGGTGACTCAGTTTGA
GTCTGTAGATGCGCGGCGGTGCTTCCCCTGCTGGGACGAGCCTGCATTCA
AGGTAATTATGATAGCAGGATGGTGTGTTCAATGATCAGATTTTATCCAC
CCGACCTGTTTCATAAATTAATTTGGTGCCGTTAAGTGACATTTTTAGTC
TGTTTGTAAGGTTAGTATGTTTACACATGTGAAGAATATTCTTCTTGGTC
AACACATGACTTTCTGTTCTTGCCTCATATGTGCGCATAGACCATCCGTA
AGGGCAGATATGTTTTCTAACATTTCTCGTATTTCAATTTCCATTTTCCA
GGCTAAGTTTAAGCTAACACTTGAAGTTCCATCTGAGCTGGTAGCACTTT
CCAACATGCCCATAGCTAGCACTGCAGTCGCTGGTCCTATCAAGACTCTC
CGTTACCAGGAATCACCACTTATGTCAACTTATTTAGTGGCCATAGTTGT
TGGTATGTTTGAATACATAGAGGGTGTGACATCAAACGGTACCAGCTCTG
TTTCTCTCTTTGCTTTCACATTATCCATTCAAATAGTTGCACGCGTCATT
TCATTTCTTTATTTATTTATTCAGGCACGAGAGTTCGTGTGTACACTCAA
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GTGGTTTTTGCTGAAACAGTATTATTAACAAAAAGTTCATTTCATCGATT
AATCAGTTACTTTGACACTCCTTATCCACTTCCCAAGTTGGATATGGTTG
CTATCCCTGATTTTGCTGCTGGAGCCATGGAGAACTACGGATTGGTCACT
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CATTTGCTTTTCACTTCTTAACTACGCATTGTCACCATACATAAATTGGC
TTGGCGAAAAAATTGCACTATCTTATGATCATCTATAATTCGCTATCGTT
TATAATGGTTCTTTTGTAATTTAACCATTTTATGTGTAAATAGTTTTTAT
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ATCAGTGGTTCGGCAATCTTGTAACCATGGAATGGTGGACTCACTTGTGG
TTAAATGAGGGATTTGCTACATGGGTAAATCAATTCGATTGCTCAAAATC
TGAAAATGACATATCATTGTTACCAACATATACTGAATGAATAGACTTTC
TGTTTTCACAGATGAGCCATCTAGCTGTAGATTCCTTTTTTCCGGAATGG
AATATGTGGACGCAGTTTCTCGATAGCACAACTACTGCTCTCAGATTGGA
TTCATTAGAGGAGTCTCATCCTATTGAGGTAATCTCATCGTTTACTACTG
GGCCATAGCCTTGTCTGGTGCTTCGATATGTTGTGCAGTACTTCCACCAA
AACAATAGATTTCATGCACAACTATCGTAGAACTACAAGAATCTATTTAA
ATCGTAAATTTTGACTATGGAAAGTTTAAGTAATGATGCTGCATACTTTT
TATTTATTACCAACACATTATCATGCTTTGACTTGTAAACACCAGCACCA
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GCCCACCCAACAGAAACTTATGAAAACCAAATAGAGAATGAAGAAAAAAG
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CATGCAGTCCTGCCAAGAGCCAAATAGCACATGTAAAGTGTCTAGAATAT
TGAAATTGATAAAATCTTTTTCGTCTGACATCTTACTTCGAAGGTCAACT
TGATTAGATGCATCAACACATATTCAGCTTGTGGTGTTAATATTTTGACT
TCTCATGCTGACTTGTCATTCATTTCACACTTTTCACTATTTGATTTCCT
GGACGCTCAGGTTGAAATACACCATGCCAGTGAAATTGATCAGATTTTTG
ATGCTATTAGCTATGAGAAGGGTGCTTCTATTATTCGCATGCTACAAAGT
TACCTTGGAGCAGATCGTTTTCAGGTACGATACTGTCTTTTCCATAAACT
CTATCAGATTTCTTTCTTCGTAATGTTGCTTAAAAGAGTACGGAATCAGT
CTCAAGCTGTTTCTTCTGTTCTTCGAGGAAACGGTGATACTTTGGCATGT
ACTAGTTGGTAGATTTGTTTTTTGTAAGCAGTGTTTTAGGTAGAGAGTGT
TGTTTTCCGAAGGCATGTTCTAATAGCAAGATAGCCATTTCTTCCAAATT
GTCCTGCCCTTGTTTACATGCAAATATCATATCAGATTATTTATACTTCC
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CATGCATTTATCGTCACATGAACAACCAAGTACACATTTTTTCTGCATAA
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CTTTTTAGGGTGCACCACATTAGAGGTAAGAAGAGGTTTAAATCAGAGTC
ATTGATGGATGAAGGTTTAAAAGTTAGTTTTAGTTCTAATGCAAATATGC
TAATATGGAAACCTACAATTAATTTTGTATGATAAGATATGTACAAACTT
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CATAATTAATGTGTATTAAGTCAGTCTGGCTTCATTTCCTTATATATGTT
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GCAAACTTTTGGACTAAGTTGAATATAAATGGAACAGGATTTTACAGAGT
TAAATATGATGATGAACTTGCAGTTGCACTGCAAAATGCATTGGAGGCCA
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GTTTACTTGCAATATCTTGGTGGCAGGTACTACAACATTTGCATTGCAGG
CATTGTGGACGATTCCCACGCGCTTTCTATGGCCCGCCAGCAAACATTGG
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GTTCTTTCACACATAAACTCTGTATGTAAATCTTGTAGTCCAGTTGATTC
CATCATGTTCAATTTTATTGAAGATAAATCACCTATGTCCTTTTCTTTTG
CTTGGCAGGTAACTACAAGTATTGCTAAAATATCGGTTGATGCTACTCCT
GGCTTGGCTGGTGACATTAAACAACTTTTCATCAAGATTCTTCAGTCACC
TGCAGAGTATGCTCAACCTGTTGTATATAATTTCTTATGAGTCTCTTAAG
GTGATTAAAATATATCATCTCCTTTTTTTCCCAAAGAGGAAAAGAAAATA
TAAATAAAATAAATCTCTACTTACTCATGTTGCTTGGACATGCCTTCTTT
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GCACAAATTTGTATGTGCCTTCTTTTTATGACAAGAGTCCTTATGCTCTA
ATCTTTCAGAAAGTTAGGCTGGGACCCCAAGAAAGGTGAGAGCCACCTGG
ATGTAATGCTTAGACCATTGCTCTTGACTGCACTTGTCCAACTTGGACAT
GGTAAGACCATTAACGAAGGAGTTAGGCGCTTTAACATCTTCACACATGA
CCGCAACACTTCTCTTCTTCCTCCGGATACTAGAAAGGTCCTACCTGATG
CTTTTACTTCAAGTATTCCTATAATTACTGTTTCCATTTGTAACTTTCGT
TGTTCTGCAGGCTGCATACCTCGCTGTGATGCAGAATGTTAGTAGCTCAA
ACAGATCAGGTTATGATGCTCTTAGAAAAGTCTACAGGCAGTCAGCTGAA
GGGGAAGAAAGGTTACGTGTCTTAGGTATGTTGGCCTTTGACCATATTAA
ACTAACAGAGCTTGCTCATGTTCTTGGTTCTGAAAGCCTTTTCTTGATAT
TTCTAGGCATATTGTGTTCTTGCCGGGATAAGGGTATTGTCCTTGAGTCG
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CTACGATTATAGTGTAATGTCTCTATGAGCTTGTACCTTAACTACTTGCA
AGTTGTACTAGATCTCTATGCCTCTCTCGCTTGTCAGGTCCGCAATCAAG
ATGCATATGTTGTCCTTAGAGGTGTTCAAATAGAGGCACGTGAAATTGCG
TGGAACTGGTTGAAGGTACGATCTCTTATAACTGTGATGGATTACCCATT
TATCTGCGGATAAAGTCAGTGATTTCTGGGCCCTGTTTGGCACATCAATT
TTTGTGGGAATTCTGAACAAAATGGATCTAATCGCTGGATGTTTCTCTTT
CTACGAACTTCATTTGGGATTACATGCAATCATTGGATGTGTTGTCTGAC
AAACTTCTTGATATTTCTGCATTACAAAGAGGACCCAGGTGTTTTTGTAT
TTGTCAACAAGAGCCGTGGCATATTTTTTTAAGTAAACACGTGAACCATA
TTTACGAATTTGTTTTCTGATCCTGATCCCTTTATACGTATTTTATTTCT
ATATCTTCTTTAAGTAGAGTGAATTTGAGGCACCAATTATTTTTGTGTTT
TCTTCATCTGATAACCTGTGAAATGATTGATTGTTCATGTTACTGTTAGT
GTACTGAAAATACAGTGCTAACGTGTGTCCCATTTTGCCTGTCTGCAGGA
AAACTGGGAGCGTATCTGGAAAACATTTTCAGGGAGCTCGTTAGTTACAT
CTTTTGTTAATGCCATTGTCCCATTGGTAAATTTAATCACTGATCTTTTA
CCGAGTCTTGCCTATTTCTGCATTCATCTCCCTAACGTTGCAGGTATTAT
TTCCATCAGGCTATAGCTAATGTGCACTTCCTTGTTTCTTGTCAGTTTTC
CTCCAATGAGAAGGCATCAGAGATTTCCAAGTTCTTTGCGACCCGCACGA
CACCGGGATTTGAGAGGACGCTGAAGCAGTGCCTTGAAAACGTGCGGATC
AGTGCGAGATGGGTTGAGGGCATCAAGAGTGAGCCCAGGCTTGCAGAGAC
GGTGCGTGAGCTTCTGGGCAAGCCCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.