Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA004090

[Submit comment/correction]

Sequence	AA004090
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA004090
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCGACCCCGCGTGTCGGCCTCCTGCGTAGGATTCCCATGGCCGCTTTGC GGGTGTTTTAAGTCTGGCGGGGGCAGCGCCCACCCACCCCGCCGGCACAT CCCCCGCCCATCTGTCGTCGTTAGTTCGTTGCCGCCCACCTCTAACCTCC CGCGCTCGCACCCCCTTCCTTCTCCTCTCGCGTGCGGCGGCGGACCGATT CACGCCCCAATCCCGCGACCTCCTCCTCCTTTACCTATCCCCTCACGCCG CCTTTACTCAGTCTGCCGTTCCTCTCTCGTGGTGCTGCCGCCACCACTTC TTACTCGGGTCGAGCTCCATCGCGGGGAGCGGCGGCACAGCCACCGTGCA CCTTGCGGTAGGATGGTGGGGGCGGTCGGAGGGCACAGGGATGATAGCCG GCGTGAAGAGGAGGCGGGTCGTCACCCTCCTGTCCTCCTCCCCGCTCCAT ATCCACAAGAGGCGGTGCCGAGGAGGCGGGTGGAGGAATCACATCACGGG GGCCGAAGCCGAGGAGGCGGATGGAGGCATCACATCGCGGGGGCCGAAGC CGTGCCGAGGAAGAGGGGGACGGAGGTAGCGCAGCAGCAACGTGGCCGCG GGTGGGAGGTCGCGGCGACTCAGGTATGGTGCGACGAGGACCGAGATGGT TCGTTTGTCTTTGCCCCCTTCCCTCTTGATCCCCAAAGTTGAAGATGCGA TCATATATAATCTGTAGTTTGGGTTCTTGCGCAGCTTCCCCTTTCTCCCC TCAAGACCACCAGGGGTATCCCATGGTACGATCACAACGGCTAGGTCTGC CTTTGGTTTTGGTTTTGTTCTTCTGATGTTAGCTCTAATCAGGTTAATTT TTGGTCGCCTTTTTTGTGTTGTTCTAGCTCGGCTCAAGAAAGGAGAGACC TACAATGGTCACTTGGTGAACTGCGACATGTGGATGAACATCCACATCCG GAAGGTTATTTGCACCTCAAAGGTGAATCTCCCCCTCCCGGTCTCCCTCC TCTGGTTGATTTTAATATGGAAGCACGAGGCACCCTATGCACAATGTGGG GTGTTGATGAGGGACAGTAGTGAGAATAAAACAGAAATAAAATCCAGTAC TAGTTTCTACACACTTCTACTATATTCTAGGTACTTTGGTCCTTTAGTCA TATGTGTTGTAGTAGTTTCTGGAGTGTTCTACTGTGAGTTGTAACCATGT TGTTTGTGTTTACTTCCTAGTTTTAAGTAGTATTCTCTAGAGCCTTCTAG CTATAAGTAGAACTAAGAAGTGGAGGCTCATGAGGCCTATAAATAGAGGT CCTCACCTCTATCTATGGAACTCGGACTATGTACCCACTACTATCAAATA AATGGAACCTTGTGTTCTTGTTTTAGATCTTGGATTAGATCTAGTATGTT GAGAGTTTTGGATTAAACTCTTGACAGCCCCGCCCCTAGAGCGATATCTA GCACACCGCCCCCCTAGAGCGATATCTAGCCCAGCACGTTGGAGTGGTTC CTTCAACATTTGTGCTGTCTTTATTATAGCAGCAAGGTGGAGTTGTTCCT CCACAACCCTTGTGCTGCTTCAGGTGGTATCAGAGCCTTGCTGATCCATT CCAGTTCTTGGTGTTCTATTGGAGACAAAGCTGCAGCCAACAATGGAAGG ATTGGAAAAGAGAATGGATGCTGCAGAACAACAGAGCCAAGCGCTGCGTG AAGATCCAACACATTCCATGTGGCAGACTTAGCTCTTCAACATCCATAAC AAGCACTCTATGAAGATAACTCGAGGTCAAGTTCTAAACAACCAGGGGAG GATGATGAGGGACAGTAGTGAGAATAAAACAGAAATAAAATCCAGTACTA GTTTCTACACACTTCTACTATATTCTAGGTACTTTGGTCCTTGAGTCATA TGTGTTGTAGTAGTTTCTGGAGTGTTCTACTGTGAGTTGTAACCATGTTG TTTGTGTTTACTTCCTAGTTTTAAGTAGTATTCTCTAGAGCCTTCTAGCT ATAAGTAGAACTAAGAAGTGGAGGCTCATGAGGCCTATAAATAGAGGTCC TCACCTCTATCTATGGAACTCGGACTATGTACCCACTACTATCAAATAAA TGGAACCTTGTGTTCTTGTTTTAGATCTTGGATTAGATCTAGTATGTTGA GAGTTTTGGATTAAACTCTTGACAGGCCCCGCCCCTAGAGCGATATCTAG CCCACGCCTCTAGAGCGATATCTAGCCCAGCACGTTGGAGTGGTTCCTTC AACATTTGTGCTGTCTTTATTATAGCAGCATGGTGGAGTTGTTCCTCCAC AACCCTTGTGCTGCATCAGGTGTTCTATGGTATTCCGTCATTTTCATCTT CTTGTTTTATGGTATTTGTCCAGAATAATTTATAGGTTATAAAACACCAC TGATTCTATGAATTTGTAGACTTGGGTTACAACAGGCTAGCCTGCTATTG GCTATATGCCTACTTCCCCTTGATTTCTCAATCACCAAGTTTCATCTGGT TTAATATGTGTCCTTTTTCAGGTCTGATTGTTGCTGTGGTGAGTTGGTTA CACAGGTCCTTACACCCCACGTTCAATATGATCCGGTTGATAAAACCGTC CTAGAGCTTAATTTGTCTTAAATGTGTGTAATGCTAAGAGTGGTACACTG ATCTGATTTTTCTCCCGTTATGAATCTTGCGATCAGATGTTGGAGCTGAG GTTATTGTCAAGCGTGGACGCCATGGAGGTCAAGGAATGTCCTTTTCTAG GTAATGATCCAAAGGTATCATATTTAAAACAACGGTTTTATCTTGATGAC AATGGAATAACTTTTGTTCATGATATTAATCTATAATTAAATTCTAAATA TATTTTAAAGGTCATTTTATTTGTTTGTTAATGAGTTCTGTTTGGGCTTG CTTTGTAAACTTACGGCTTAGTAACTGTTTTAGTGGCAGTTATAGTTCTA TGTTATTTCTATAGGATTTTTTAGGATATTTAATATGTTCTGTACTGTGT AAAGCAGAAATGTAAGATTCTACTTTAACCCTATATCTTCTCTTTTTGGA GAATTTGTGTATTGCTGCATAACCTGAAGAAATTGTGGTTTGTGCAGTTA TATGCTGGAATGTGTAGAGCATTTCATCATGTGGTTTGTAATCTTTAGCA AATTTCTCATTGAAGCATCAAGACCCAGAAGAAAGTCTGGCATACACGCA CTATGTTTGCTTCATGTTGCTCTGGATAAATCCAAAGGTCTCCTTAAGAT TTGTGCAGATTACAGCAGGTTTTACTTGGTAAGTTGTTGCATCCTTCCCC TCCATAATTCTCTTGATATGTAATGAGGTTGCAAAACTGTCATCAGGCAT TGGCAGCATTTCCATTAAATATTTTTGTTGTTAGAATTGTTATAATTTTA AACTCTTACATTAATAATATTCACTTCTAGGCCATCACTGCATAAACTGT GCGTCTGAAGTTTAAAAAAATCAAGAAATCAACTTTAGAAAAGTCTTAGG CCTGTCAAAAGCATAGTAACAGAAGATGTTGGGCACAAGGTATGCTATGC CAAATTCTAATTAGCCTAACTAAATTGTTCTTTTGTTTTCTTTGGTTGGA CTGCAAATCGCACGTTATGCGACAATATTTGTTAGCATACCCTTATAATG AAGAAATAGTTGTTTGGTACATGTTTTTCAACGATCTTCTATGTATTAAT TATTACTTAGCTACACAAATGGTGTTTGTTTTCTATTCTGAATTCACTCT TCTGTCTGTAAGATTCTAAGGAAGGGTGGAAAGGGGAAGCTGCAATTTCT GTAGGATTACAACTTACCAGATTGTAAAAGAACCTGGCGGTGGCATGATG CTGGCAGGAGGAAAGGAGAGCTGCAATTTATAAAGGTTTATATTTACTGT TTTGTTGTCGCCATGATTCTCCTCCTTCCTTTCGCGGCCGCTGCTATGGA AGAGGGGTTGGTTGACCCCTCATCGAATAGGTCGTCAGGGGGCGAACATG GAGAATGACAAGATGGAGCTGCTAAACGCCGAGGCACACTTCGCGAGCTT CGTCCGATGGTTCGGTAAGACGTACAGGTACGCCGACACCCCCTATCTGT GTTCACGGCCAACCTCCATCGCGTGCAGCCACCAGACGAGATGCCTAGAG GATCTAAGAAAATAAAAAAGCACAACGACAAGGTATAAATTTGGTAAGAT GCTCTCTTCTTACTTTATAACCTTGGACATGTTATGAGGCACTTATTGCT GGTTGTAAATGATTCCCTCTTCTCTGTATTTTTATTGAATGCTCTCACCG ATGGTGCTTAGTTAAGTCTGTTTTGTTGTCCTAGAAAAACAGTATGTTGA GCCATAAATAGCACGATTGGATTCACGTTAGAACTTAGTAATTAGCATCC ATCTGCTTTGTTCCTCTTTCTGCTTATTTATATGTCTATTGACTAATGAT TCTTCCTCATATTTTTTATACTAATTTCATCTATTAGGGATGCTACTTTT ATATTTCTGTATAATTATAGTATTTGTTGCCTTGGCATTGCAAGATTGTT GTTTTGGAATTCTTTAACTTTGAGAATAGTGAATTCCTCGATATCTTGAA ACAATTTCCTATCTAACATCTTCGTTAGTTTGAGCCTTATTTATTTGTAA AAGCTAACACCCATAATTCCATGGGATCGTGTGCCAAGGCGCACCCCTAC ATCTTTGAAAGTTCCGGTTTTGGTGCAGCTATGCATGCAAACACTGTTGC TGGTCAACCACTAAAACTGGTCATTGTTTCCATTCAGACTTGGTTATGTG ATTAGGATTAAGTGATAGAAATCAAATCTGAGGGAAGGGGCAAAGTACTC TTAGCTATAGCTTAAAAATGGATTGTTCACAGAATAAATCAGTATTCATG TCTATGAAGCACTGTTGTTGTCTCTCTTTCAATAGTTATATGGCCCAACC ATGCACCATAGGTTGGATAATTTGTTGTTGTGGATATTGTGAAATGTTGG GTGTTGGATGTTGCATCATTAACTTTCAGATTTCTTAAAGAAATAATCTA CAAGCTTAAATACAATAAGAATGCCCTCAAATTATGTTTTTATCCATAAG GAACAATTGGGTTCCATTTGTCTCCATAGTCTACACTTGCATTCTTCGCG CTTCAGCTAGCTAAGTTAGTCTTCTTTTTGTTCATTAATTAATTTAGAGG GTGCAACTTTCGGCCTACTTTTGTGTTGGCTCGCATGTATGCAGGTTTTA TTCAGATCTTGCGGGGTCATACTTTTAACCACCTATGTTCATTTTCTTTC AAACTTGCGGACATTTTAGAAGCAAATGCTAATATTAATGCAATCATGCT TGCTGCACTTAACCTCTTATAATCATATACTTAAAGTTGGTAATATATGG ACTGCAAAGAGCGGCTTACTTCTTTCACATCTTGCCATGTTTACATACGA CTGCTACTACTTTGTTTCTTTATCATATGGTATAAAGAATTAGGGCACAT TCAGGTTGATTTGTGTCAAGTTGACTGGAACTCTAGAATCACTCACCCCT CAGTCATTACATGGTCGATGAGTGCATTCTCCTTTGTCAAATTCCATATT GTTTGTTTAATATGGATCTATGTTTTCTTTTCATCTGCCGTAATGCTGCA TTATCCCCCCATGCTTCATGTCTGTACGATCTGAATTGTATCAGTTACTG AAACAGGTGCATTTTTCTAAGATGGAAATATGTACTGTACATATTATCTT TTGACATTTCTAATTGGACGTCTTAAACATAAGTGCTCATGTTGGTTCTA TGCCCTTCACTTATTTGGGGCTTCCTATAGGAACAACTCAGATCTTATGC ATGTTGTCGATAATATTGAAAGAAGAATGACCGGTACCATAGGGATGCTA TCATATGCAGGGAAGCTTTCTCATATAAATGATGTCATCACTGCTATAGC CATGTATGCTATGGGTACTCTCGAGCTGCATCCAAAAGTAATTAAATATG TGGACAAATTAAGAAGATGTCTCTGGAGAAAGAAAATAGAAGATGGTGAA AAGAGCAACTCTTGAGCTGTATGGGGCATGGTCTGTAAGCCGAAGAAAAA AGGTGGTTTGGGAGTTCTAGACCTCAAAGTGCAAAACTAGGCGTTATTGC TCAAATTTATGGATAAATTTTATAACAAAAAAGACAATACATTGGGTTAA ATTAATATGGGAAGCTTAATATAAAAATTCAGTGCCTCATGCTTCAGATT CCATGGGGTATTTTTGTTAGAAAGCAGTCATGAATTTAGCTCCTGTTTTT TGAGGTATTGCCAAATGTAAAGTAGGATCTCCAGCTCAAAAAAAAAATGT AAAGTAGGATCTCCCCAGACTATTCTGTTTTGGAAAGATTCGTGGGGTAC ATAAATACTGAAAGATGATTGTGCAACCTTTACTCATATGTGCTGAATGA TTTTGTAATGCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.