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GrainGenes Sequence Report: AA004696

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Sequence
AA004696
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004696
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAACAGTACAGTACTTGCCAGTAAGCTCCGCTCCGCCACTAGCCACAGCA
CGACACCACTACTATTATATTGCTCTTTTCCTTGCTCCTACCGAGTCTTT
TCTCTCCTCGGGGGCTGCTCCGTTCTCTCCTAGTCTCCTTCCTTCCCATC
CTCGCCGGCGATGCCTCCAGGGCGGCGGCGGCGGAGGCAGCAGCAGGGTT
AAGCGTGACTGGGCCGCTCGTGCGGGATGGCGGCGCCGGATAGCTCCGGC
GGCGGCGGCGGCGGCGAGGGGGAGGGGACGGCGAGGAGGAGCAAGGTGAA
CCAGGAGCTGTGGTACGCGTGCGCGGGGCCGCTGGTGGCGCTGCCGCCGG
CGGGGAGCCTCGTCGTCTACTTCCCCCAGGGGCACAGCGAGCAGGTATAC
CGCCGCCGCTGCTTTCCGGTGATTCTTGTGTTGATCAAAAAGCTGTTTCT
TTCCTTTCCCCCTTTGGACGAGGGAAAAAATTGTTCCCTTTTCTTGTTGT
TCCTCTGTCTCTCTTGTCCCTTTCTGGTCGCCTCAGCCTCGTGCTCGCGC
GCTGATTGGTTCCTCCTCGCCGTAGCCGCCGGCGTGTCGTTTTCACGGCC
GCTTCGTCTTCGTGTCCGGTTGAGCTTCAGCTGCTACTTCTTGAGCCTCT
CGGCTTCTCCACGCAGACAAATCCTCTGCTTTAGTTCTTGGGAGAGAGTG
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GTTTCAGCTTTCAATTCTGTGGATTGTGGCATGCAACTTTCTTTTTATCT
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GAACTCACCTGGTATTCCGGTTGTCTGTCTCTATCATGTTGGACCAGAAC
CATGAAAGAATCAGCTGCTTATCTTAGATGGATGCTTCTGATTTAGTGTG
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GGTGGCAGCATCTATGCGAAAGGACGCAGATGCACAGATTCCAAGCTATC
CAAATCTTCCATCAAAGCTGATATGCATCCTCCACAGCGTCACTATGCAG
GTAATCCTGACCACTTTGAACAAACACCACTAAGTGGACATCAGCTGCGC
ATTTCACTAGTGCTCGTTTATGCGGATGATCGAACCTTTTAGCTCGACAA
AACTTGACAGGCTGACCCTGACACGGATGAAGTTTATGCTCGGATGACTC
TCCAGCCAGTTAGCAATGTAGGTCACACTTCCTCAAGTTCAGTGAGATCG
TTTGATCACGTACGTGGTGTGTACTGCCCTGATTTTAGAATTCTTGACTG
AAAATTGGTTTTGGAATTGCAACTGCTAGGTGACACAGTGCGACAAGGAG
ATATTGCTGGCATCAGAGCTTGCGCTGAAACAGAACAGGCCACAGACAGA
ATTCTTCTGCAAAACATTGACGGCCAGTGATACTAGCACTCATGGAGGAT
TCTCTGTGCCACGGCGTGCTGCAGAGAGAATTTTCCCTCGTCTTGTAAGT
GTAGTTTCCTTCTCACACAAAAAGACGCGTTGATTGTATTTCACTTTGTT
CTGATTTTTTCGAGCTGTACTATGTGTAGGACTTTTCATTGCAACCTCCT
GCTCAGGAACTTCAGGCCCGGGATTTGCATGATACTATTTGGACATTCCG
TCATATATTTAGAGGCAAGTGAAATGACTGAAAGCTGATAGAAGTTAGTC
AAGAGCCTTTGATTCTAAAGTTTTATCAACCTGCTATCCATTTTACTGTT
TTAATACACTGATTTTCTTATTAAAAGGAAAAAAATTACACTAGCTTTCT
TTCAAAGGAAAAGTACACTAATTTTCTATGATTGGTCCTCTTCCTCTTCA
CCAGGCCAGCCTAAAAGGCATCTCCTGACTACTGGCTGGAGCCTATTTAT
CAGTGGAAAGAGACTTCTTGCTGGTGATTCAGTCTTATTTATTAGGTAGA
ATGTTGATAACGAATATCACTTTTTATTTGTTGGACAGTCAGATGTTTCC
TTACTTGGTAGTACTCAAGAATTGATGTAACAAATCAACCTATTTGTAAA
GGTAACCAATGTCACTAATTCCTGCTTTTGTGATTGTAGGGATACAAAAC
AGCAACTCCTCTTGGGGATCAGGCGAGCAAATAGGCAGCCTACTAACCTC
TCATCGTCCGTGTTGTCTAGTGATAGCATGCATATCGGCGTTCTTGCTGC
TGCAGCTCATGCAGCAGCAAATAACAGCCAGTTCACAATATTCTATAACC
CAAGGTAAATACCCTCCTTTGTGAGGTTTGACATATGAATAAGTGATATA
CTAAGACTTCCAATTGGGCTACTTTTTGTTTCTTCAGGGCTAGTCCTTCA
GAATTTGTGATTCCTTTTGCCAAGTACCAGAAGGCAGTCTATAGCAACCA
ATTATCACTTGGCATGAGGTTTAGAATGATGTTTGAAACTGAAGAATCTG
GAACACGAAGGTATGTATTCCATATGCTACCTAATTTGTGGATTGCATAG
TCGTCCTTCTAAATGCAGGATCACTTTAAAATCTTCTTCTCTTTTGTGTA
TGTTCTCTTTTATATAGAGTTTGATTCAGTTGAACTTGCTTCATATACTC
ATGCTTTTTGTGTGTGAAGTTTTATACAAGAAATAAATTTGTAAAAACGG
GTAAACTGCGCCTACAGGTACATGGGTACAATAACTGGCATAAGTGATCT
GGATCCTGTAAGGTGGAAAAGCTCTCAGTGGCGCAATATTCAGGTTTGGT
CTGATCCATACATACTAAACTTGCCAAACTGACTAGTCACAACTTCTATT
TTTGCTGAAGTAGATATATGTATGTGCAGGTTGCATGGGATGAAGCAGCA
CCAAGTGAAAGACGAACCAGGGTTTCCCTCTGGGACATTGAGCCTGTCAT
CGCTCCATTTTTCATCTATCCGACGCCACTATTCACAGCAAAGCGTGCAA
GACAACCTGGGATGATAGGTAATGATGGAACTGCAGCTCCACCTTCTTCA
TAAATATTACCTGTTATCTTCATTTTATCACCAAAAATTCCCAACTGCAT
ATCCTTTCTAGCAGATAACAAGATAGTAAGTCCTTTGTTACACAACTCAG
TTTTTTAATAACAATAAACTGTATCCGCAGATGATGAGACCTCTGAAATG
GATAATCTTTATAAGAGGACCATGCCATGGCTTGGTGAGGATTGCAAGAA
AGATATGAATACTCAGAACAGTATAATGCCTGGTCTAAATTTAGTTCAGT
CACTTCAGTGGATGAACATGCAGCAGAACTTGTCGCTCGCTGGCACAGTA
ATGCAACCAGAGTTGCTAAACTCATTAGCTGGCAAACATGTGCAAAATTT
GTCCCCAACTGATGTAAGGCAAATCAGCTTTCAGCCCCAATTTCTGCAAC
AAAATAATATCCAGTTCAACACCTCGCTGCTACCTCAGCAAAACCAACAC
ACCGAGCAGTTAGCGAAAGCTATAGCTACACCGAATCAACTGGGAAGTAT
TACGGTACCACAGAAGGTAGATCAAGATCGCCAATCCGACCAGAAGCAGC
ATGGGGTTACTCAATCAGTGCAAGGCAGCCAAGCAAACTTAAACATCACA
CAACCTCAACATGTGTTCCAAGCTCAGCTCCAGCAACCTCAAGTGATTCT
GCAGTCTCAGCAACAGCAACCTCTTGTCCAGAATCATTCTGTCTTTCAGG
GAGGCCTTCAGCAAATCCAGATTCTGCAGCAACAGAAACCACATCTACAG
CAACAGTTACAGCAGCAACAACCTCAACATCATCAGCAGGTTCAACACTC
AGTGCAGGAGCAGCAGCAAATGAAGATGGCACCTGTTCATGCGTCCAGTG
ATGCAAACATGAATACGCAGCTATCTGATTATCAAATGAAACTTCAACTA
TTAAAGGCTCTAGAGCCACAGCAACATCTGACCTTCGAGCAGCAGAAAAT
GCTTTTCGATTTGCAGCAGCAGATGGTAAATTCTCAGTCAAATCCTCAGC
ACTGTATGCAAGGAGCTACCCAAACTGTTGGTTTACATAATGGCATCACT
ATGCAATGCCCAACACAACAAAGGGCTCAACCTCACCAACCAGTTCAAGA
TTCGCCTGGGAGTACCATTCATGTTGCAAAATCAGATATTGTTACCTCCA
TGGGTGCTAGCTCTTTGAATGTGGCTGATGGAGTGCAGTCACTGAAGACT
GATAATGTTCACTCTTCGTCAACATCACCATCCACTAACACTAATGGTGT
TCTCCGGCAATCCATTCCATGTAGCTCCAAGAACCAGAGTTTACTAACTG
CAGCAAAAACATCTCAAGCATCTGTCGTGCTGGGCTCCACAATTGAACAG
GAAAAGCCTTACCAGAGTGTGAAGCCAACAATAACGATTCCCAAGATAAC
TGAACAAGGGCCAGCTGCTGGACGAGACTATGTAAACAACAACCCCCATA
TGGATTACTTGGACACATCCTCTTCAGCTACTTCGGTTTGCCTTTCCCAG
GCTGATGGATCATTGCAACAAAACTTTCAACCTTCATCATTTGATCAGCA
TCACCTGTTGAGGGACACAGCTCCGGATAGTGAGTTTGAGGTTACAGATC
CAACAAATAACCTTTTGTTTGGGGTGAACATTGACGGTCAACTGGGCTTA
CCACTTAATGCAGATGCGTTGCTTGCAAATAGCATTGAAAATGATAAATT
CATGGATCAAATGGCTGGAAATGGCATTTCTAACTACATTTCAACGAAGG
ATTCTCAACAAGAATTATCATCTTCAATGATTTCGCATTCATTTGGAGTT
GCTGATATGGGATTCAGTTCTATAGATTCTGCAATCAATGATCCCACATT
GTTAAATAGAAATTCCCGGGCACCAGCTCCTGCACAACAACGCATGCGAA
CCTACACCAAGGTTTGTTATTTTTGCTCCGATATGTCATCTCATTCACAC
CAGGAGTTTTCTTAGATAATGGAAGAGATTTCTCTCCCAGACTCTGCATC
AATTGATGCACACAGCCATAGGCCCATAGCTTTGTTACAAAGTCTAGGCC
AAATGGCCAAAAAGAGATGTAGCAAGCAACATAGATAAACAAGAGATAAA
AATTCACATAGCCTGTTGCAATACTGCCACACAAATTTGGACATAAATCC
GTGGCTACCAACTCCAGCTTCATACACCCTTAGTCAAAGGCCCTTATTCC
TCCTCATAGCATGCGGCTAGGGAATACTTCAGTATGGAGAAGAAATGAAC
TTCACCTTGTAGAATGTAATTACACAATTATTTCGATTTTAAAATACATG
TATAGAATTTGGGTCTGCCTAGTGCTCGGGCGACCGAGAATTAACTATTT
CTCGTTCGATTCCTCAAGCGATCACGTTTCCCGGTTGATGCTTTCGTAGA
GCAATCGTGTAATTTCCTCGAGGCATGGACTCTATATATGTACGTACAAC
TTTCCATGGAGGATGGGCCTGAGTTTATGGGCTTGCTAACTGCTATTATT
TCCTTGTTATAATTTATTTATGGGCTTTAAAAAAAAAAATACTCCCTTCG
ACCCATATTAGTTGACTCAAGTTGTCTAGATTAGATGAATCTAGACACTA
TTTAGTATATAGGTTCATCCAAATTTTGACAAATTCAAGCCAAATAATAT
GGGTCGGAGGGAGTACTACAATCTTAGACGCTCACAACACGTACATGCAC
CCACCCCTACACCCCTATGAACACACATGCGTACCCTAACCCTATGAGCA
CATCCGAGAGACTGAGCCAACAAATCAGGTCTTGAGATTGACGAAGTCAC
CATGGACGCCTCGCTGTCGTGGACTAGGGTACAACCAGCCACCTAGCCAC
CCAACCACATGTTGGTTTGGCTTGCATGGGTCTTTTCTCCCGTAATGCAC
AAAAGCTAGCTGCACAAAAGCTAGCTATGTGATCATATATACCAAGAAAA
AAATACTATATCATGTAAAAGAGTTTTATATTATTAAAAATAATTGGGTG
CAACTTGTTCTCGCCTCACAGACAAATAGCTTAATTATCAATCATATGAT
ATCACCAAATCTTGCAACCCACTTATACTCGCGTTAGAGGGATGAATGCT
TAATATTTTCTCTCTCAATTGCAGCCCACTTGCAAATGAAAAATTTTAGT
TGCAAACCACTTACATCTCAACTGTAACTGGAGAAAAAATCAGTTGCAAC
TCACTTGCAATTCAACAATCTGACTTACAACTCACTAGTAACTGAAAAAA
TCTCAGTTTCAAACCACTTGTAACCAGAAAAGATTAATTGCAATACACCT
GTAACTAGGAAAATAAACCAGTTGCAACCCGCTTGTAAGTGGAAATTTGA
GTTCCAACCTACTTTCAATTGAAAAAAACACCCAATTGCAACTCACTTGA
AACTGGAAAATCTAAGTTGCAACATACTTGCAACCTAAAAAAAACTAAGT
TTAACCAAACTGCAATGTGAAAAAACCAAGTTCCAATTATTAATAGATCG
GTGAAATTTCGAGAAAAAAAAAACAATTGTAACACGCATTCATATACTCC
ATCCGATCCAAATTAATTGACTTGGATTTGTCTAGATTCGGATTTATCTA
ATACTAAAACATATCTATATACATTCTAATCTAGACAAATCTGAGTCAAT
TAATTTGGATCGAAGGAAGCATATGTTTTGATGGTAAGTACTCATTCATC
ATCAGCAACCTATCAACTACAGACCAAACAAATAAACAAGCAGCAAATAA
GGCCCATGAAAAGGGTATAATGAAATGATAGAAACAACAGCCCAACACAA
AAAGGCCCGACAAGAAACAACACGACATAGAAGAGAACGGGGTGTCTATG
CGTGACCGTACCGAGCGCTAATGTTGATCTCGGTCAGCCGAGCGTTAGCA
AATCCGATAGAATTTGCTATGCCTAACTTCCTTGCCAAAAAGATTACCTG
AGAATTTTAAATGTTTAACTTACTATGTGCAGAAAGGTAAAAGTTGTTAG
GAATAAGCAACTTGTATTCCAGAGGGGCCAAAGGCCACAATGTATAGTAC
ATGTACATGTGTAAATATGCAGGAAGCCCCCTAACTAGTAGGGAAAATAC
AATATACAAACATCTCTAACAAAAGTCACCACTCTAGCATTAAGCTCTTA
CTATATTTGTTTCTGTATTTCTAGCATTATTTACATTTGAGTGCACAGTG
TCACTCCTGCAGTAAGCTCTTTGCTGACAAAAGTATCACATACAGGTGCA
CAAACGTGGTGCTGTTGGGAGATCTATCGACATGAACAGATATTCTGGAT
ATGATGAACTGAAGCACGACATTGCGCGAATGTTTGGTATTGAGGGGCAG
CTTGGTGATCAAAGTAGAGTTGGCTGGAAACTAGTATATGAGGATCACGA
GAAGGATGTTCTACTAGTTGGTGATGACCCATGGGAGTAAGTAAAACTCC
ATAAGCTTGTTTTGCATTTGCCCATACGAAACTAGCTATGATGGCTTTCT
TGAAATGTGAAGACATTACTAAGAGATAAAACTGATGGATGGCTTTAGGC
AATTTGAGTGCACATGACCTTGGGGAGGACTTGACACTTCATCTGTTGGT
TGCCAAGTTAATTTGATGAGCATTTTCTAACTTCAACTGAATATTCATCT
GTAAAAGAGAACCCAGAGAATCTATGCAATCAAATTCAATTGCATTGATT
CACCTGATTGACAATAAAAAAAGGGGATAATTTTGCCTTTAATTTAATGT
TTGTTCATTTTCAGTATTATTAATCTGCATATTTAAGCTACTCTGATGGA
CGAAGAATTGCATGTGCAGGGATTTCCTGAATTGCGTACGGTGCATCAGG
ATTCTTTCTCCACAGGAAGAAATGCAAATGAGATTGGTTGGTGACTTTGG
AGATGGCTTTTTACCCAACCAAGCCTGCAGCAGCTCAGATGGGGGTCAAC
CTTGGTAACTGTAAACTTGAATGACCCATGTAGTGTCTGGTGCTGCGAGA
CCGACATTTTTCGCTGTCAGTCTAGTGAATACAGATGCCGATGATGATAT
TGACGATAATTTAGGCTCTGAAATTCCGAGATTGAGTGAACATGAAGAAC
GGTTCATACTCTTGTCACATATTTTTTGTCGACCTTGCGATCTATATATA
TGGCCAACCCATATTTTCTGCTCCCATGTACATGTTATTGCTGTTAGATG
TAACAGTTTGTCACATACCCAGATGTATGTCACTACGTGTAACTTGCTAC
ACATTCTAAATGAAGAAGCCATATTTTCCCTTGCTCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.