Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA012411

[Submit comment/correction]

Sequence
AA012411
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA012411
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAGAATCATGGCGATTTGTTCGACAGACCGAGGAACCACGCACCACAGCG
ACCAACTCCTTAATATAGTAGGGCATCCAGAAAAATTCTCTCCGTAAGCG
TTGTGTGTGGCCGCGTCTCTCTCTCTCTCGCTCGCTCTGGTGGGATTAAT
TAGGATTGGAGTCACACGGCCGGTTGCAATTTCGGATCAACTGAGGAGAG
AATTGAACCGAGGGAGAGACCAATCGACCGATCGATCGATCTATCGAGGA
TGCAGCAGCAGATGGCGGCGACGGTGGAGGAGCAGATGATGGTGAAGGCC
ATCCGGGAGGAGTGCCCCTGGGAGTCCCTCCCCAAGCGCATCCAGGCCGC
CGTCGTCTCCAAGGAGGAGTGGCACCGCAGGTAATTAACGCCCCCATTTC
ATGATCCCACCCTGATGGTCTGTCTTCTCATTTGCGAAACAAATCGATGG
CAGGGTCGTAGACTACTGCGTACGCAAACGATTGCCATGGAATGCCTGCT
TCTCACGAAAAGTATGCAAAGAGGGGGAGTACTACGAGGATCTGATGCGC
TACCTCCGCGTAAATCTCGCGGTATATATGTCGTCTCGATTCTCTCATTC
TGTATGTATCTTTTGCTGTTACAGATATATACTGTCCTGCTAATAGTATC
TCGTTAGAGCCATTTCAGTAGTACCCTGATAGCATTACTTCTGAACTTCT
ATAGCTCTTGCAATTTGTGTTTACGGTTTTCTCTTTTTCTTAGTATGTTC
AACTAATTACACATTCCTAACATTCTATGGACTTGAATATGTTTTCATGA
CTGCTACTTTGATTTGCAGTTATACCCGTACCATCTCGCAGACCACATCT
GTCGAGTAATGAGGATATCACCCTTCAAATATTATTGTGACGTCCTTTTC
GAAGCTATGAAGAACGGTACGCACTTGCATAAGTAGAACGGAATCCATTT
TCTGCCATCACATTCTACCTTTTGCTGACCGGTCTCATGCCCAGCAACCT
TAATGTCTCCATCAAATATTTCCTGCCAGGAATCAAGAGCTTCGATTCTT
TATCATTTACTACTATATGAATCACTCGTTGGGTTAATACTTAATAATTT
GAATTTATTGCAAATATTATCAACTTCTATTTCACTCTCATTTTGGTCTG
TTCCTAATTGACAGTTCTGTTAATGAAAACCTTGCCGTTTGAGTGGTCGG
AAAAAAATCATTTGAAGATTACACGCTCTTTGGTCCATGCGCATAGCTAG
GGTAGTTGGACTAATGTTGTGGAATGGGAGAATCATTTTTAATAGCAAAA
TTGAGATTATTCAATGTGCTAATAGTTCTTTATATGGATCTAACTTGGTG
AAAACCTCACAGAGCAACCATATGACAGTATTCCAAACTTCACTGCTGCT
GATGCCGTGAGGATTACAGGTGTTGGAAGAAATGAATTTATTGATATTAT
GAATAGGTGCAGATCAAAGGTATTATTGGCATACTCTAGCATTAATTCCT
GTCCCCTAGAAACAAAGATCAAATTGACATAACTAGTGGGAGTTAAGTTA
GACTGCTGAGGATTTGTAAAGTACCGTCAACACAACATAAATTAAATGTC
AGAGAATGTCTGAATTTTGTATCAGGATTTTAAATTTTACAACTTCGGAG
GAACAACTATTGCTCAGTCACCACATGGGCGTGAAACGTGGGCCCACTAT
CAAAAGGGGGTTTGATATCAAATAATGCAAATTGTGGAATAAAATTCTTA
AATCGGGTAACTCGGGGAAATTTCATTGAACGGGGCAATTGCTATCACTC
GAAACAAATAGAGAGCAGAAGTTGGAATTTACTTGAGTGTTATTGTGGTG
CTGCATGATTGGACTTCTAGATTATCAATCCAACAATGTTGATTTTTCAT
ATATTCATCAAAGTGAACATACACCAATCAGTGTACTCTTTTCCTCATGT
TATAACAATCCCTTCTCTTCATTATTTGTCATTTCAGAAGATAATGTGGA
AGCTGAGTAAATCAATTGCGAAAGAGTTGCTGCCTGCACAACCCGCAGAC
TTAGTGATAGAACCTTGGTGGGGAGTTCGTTTTGTCAACTTTACACTAGA
GGAGTTTAAGGTAAGAATTATGGGGGTGATGGTTCTTGTTAATTGTTTAA
GGATGTTGTAATTTCTACAGAAGAAGAATGATGAAAATATTGTGTGTTCT
CATTCTTATTGTGAAATTTTGCATAGATTTGACTAGACCTTGTTTCTCCA
TAAGATAGATAATTATACAAGAGCACTCTTTATTTGTAGGAATTGATGTT
CCTATTTTACTGTAGAAGCTATCTGAAGAAGAAACATTAGCAATAGACAA
AATATGTAAGGAAGAGGTCAATTCATATGTTCTATTTGATCCAGAGGTTA
TAAATGGTCTTTATAGAAGAGGATGGGTATACTTCGATGTGCCAGTTTAT
GCAGAGGACCGTTTCAGAGGTATGGATTCAGCGCAAGTCATGCTATTGTT
TAACTATATATGATTCGTCAATGGGCTCATAATTAAGATTCTATTGTGGG
AATCAATCCATAACTAATTGGTGTGGTTGCCTCATGTCATCTCCTTTGTG
CTGACAAAGCCATTGTATGGTACAAGCTTGTAGCTTCCACATTGGCACCA
ATTGTGTTGTCAATGTCATTTCAATTTTGTTGCATGAAGTTCCAACCTAA
ATTACCCAAATTGTAAGATTTATGCATATAAACCTTGCACCTAGTGATGC
TTAGTTCTAAACTTGTACCACTAATCCAGTTTCGAGACTTGAAGGTTTTG
TTTCAAACAAGGATCAGTCCTATGAAGATCCAATTGAAGAGTGAGTAATT
CCCTTCATCAATCTTGTTCATAATGAGAATCACCACTTAGTGAAATGCAT
TGCTAGCTTTGTCTATTGCTGTTAAATTCATTTTGTATTTTCTTGACTGC
AGGCTACTATATGCTGTATTTGTTGTATCAAGTGAAAATGCCACAGTTGC
TGAATTGGCTAAAACTTTACAGGCTGACCTTTATCAACTTCAGGCAGCTG
CATCGTTTGCTTGTAGACTCGGATGGGCTGTAAAGCTTTTGGATCCAGAA
TCCGCTCTTAGAGATTCAAGTGCACCCGCATTGCCAAACAATATTCTTTG
TAGTGATGATGAAGGTTCACGTTCGAGCATCAACTCGGAATATCAAGCAT
TACTTAACAATGATTTTGATGGACCCAGAAAAATCTCTGGAACTGCTTAT
GTCGGATTCGTTGTGGATGCAAATGTAACTTCATATTTGATGATGGGTTC
TCTATCTCCAGGTTAGATCCCCTTACTACCCGATTTATACATTTTTTTAA
CTTGTAAGCAAAAATATGTAACATCTTTGACGCTGAAGGAGCTATACTCC
CTATAATTTGTTCTCGAATTGGCACCCTACATTTAAGATGCAACCTTGTT
TGGATTAGCAGAGTGTACTAATCATTCTTCACCAACTTATTACAGGACTG
AAGACTCATGCCGTAACGTTGTATGAGGCTGGAAAACTTGGCTATTCTTG
CATTGCTGATCTATGCAATGATTTAGCTAGTTTAGAAGGAAAGAAGTTTG
AGGGCGTGCTCCAGGAATTTGCAAATCACGCATTTAGCCTGAGATGCTTC
CTGGAGTGTTTGCTGTCGGGTGGAACTTCACCAAATGAATATACTAAAGA
AAACTCTTTGCAAGATGATATATCCTCCCCCTTAAGCAAGGGAAGTGGCG
TTGAAGGTGTTGATAATGTTGTCGAGAATAACAAAATTTCACTTCAGACT
ACAGACCCAGCCGGTGATTGTCAAGACAGTGACTTACCACATCGACAAGA
CCCAACGGTTGATTCAGATGCATCATCACCTTCGACTAGTATATCCAGAA
GTAAGGAAAACATGGTTAATGAAGATGACATTAGCCATATAGAACTAGAT
GGGTCAACTGGTAACAACCCCTTGCTGAAGACCAAACGAAATTACCGAGT
CAACATTCTTCGCTGTGAGAGCTTAGCTTCACTCACGCAATCAACGCTGG
AAAGATTACTTCTCAGGGACTATGACCTTGTGGTATCTATGAATCCCCTT
CCATATTCATCGGTTCTACCCAGCACTGCAGGCCCTGTACATTTCGGTCC
GCCTTGTTACTCCTCAATGACACCTTGGATGAAGCTTGCGTTGTATACTT
CTGGTGGTTGTGGCCCGATATCAACAGTTTTCATGAAAGGACAGCGTCTC
CGGATGCTTCCTGAGCCATTGAACAATTGCGAAAAGGCGTTGATATGGTC
TTGGGATCACTCTGCGGTGGGTGGACTAGGAGGAGAGTTTGAAGGGAACT
TGGTAAGGGGAAGCCTTCTGCTGCATTACTTGAACTGGATGACAAAACAT
TCTGCTGTGATAGTTCAACCACTAAGCATGAATGATCTCGATGAATCGGG
AAACCTTGTGACCATGGATGTCCCATTGCCCCTGAAAAATGCCGATGGAT
CAGTCCCATCCACGTTAGCCGGCGGTGATTTGCCTGAGGAGCAGAGGTCG
AATTTGATTTCTTTGTTGGAAGACCTGTCTAATAAAATTGAGCTAAGCAC
AGTTGGTTACCTTCGTATAGTAAGGCTTCACAAGGTGAGTGAAGTTCTAG
AGAAAGAAGGTTACGAGTGGATACCTTTGAGCTTGGAATTTGGAATTCCC
TTGTTCAATCCCAAGCTATGTGAGAAAATATGTGAAAGGGTCGTCGATTC
AAATATGCTTCAGAAAAATGATCTCGCCGAACACTACGAGTCGATGCAGA
ACGTGAGGAAGAGGCTGCGCGAGCTTTGCACCGAGTACCATGCGACCGGC
TCAACCGCAAGGCTACTAAATCAGCGTGGAGGAGCAAAGAACTCTCCGCA
CCAGCTCGTGAACATTGTCAGTGGAAGATGGAGCCCGTTTAATGATCCGC
CGTCGCCTGAACAAGGAGGGACGTCGCCGCGCGAACATGTGAGGCTGAAG
CTCGGGAGACGGCCGAAATGCTTCACTGAAGTTCTAAGCTTCGATGGGAG
CATCCTCAGGTATTTTCTAATCTAAAGAAACTTGACAAGAACATGGGTCA
TGTGTCACATACTAACTAGATGATAATACTACTCTTTTGTCGACGGCTCA
TCACCGTGTTCTGGATTTCCGACAGGTCTCACGCGCTCACTCCGGTGTAT
GAGGCTGCCACAAGATCTGTGAATGAAGAAACGCCATCCCCGACTGCCAC
GAAAGCCGAGTTGGAAGATTCGGATACCAAGGACGTGGTCTTACCTGGAG
TCAATCTTATATTTGATGGCGCTGAGCTGCACCCATTTGACATAGCAGCC
TGCCTCCATGCTCGTCAGCCTCTCTCATTGATAGCCGAGGCATCAGCCGC
ATCATTGGCGATAAAATGATGGGTCCTCATGTTGCCATCACAAACTTTGT
TTTGTTAACGTTATGTGCAGAATTGATTATTGTGTAGGATGATCCTCAGA
ATCAGGCTTTTTTTAGAGGGAATCAGGCTTGTCTTAAAGCTTGGTGGAAG
ATTTTGTTATGCCAGGGTAATTTTTTTCTCCTACCGACAACTTGCCCAAT
AAGTGATGAATGGTAGGTGAGCTTTCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.