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GrainGenes Sequence Report: AA038080

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Sequence
AA038080
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA038080
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTCTGTGCGCAAGTTGGCGAGGTTCTTGAGCTTGGCGAGTAGTCACTG
TTGGAGAGGTCGCCCTGTGAGTGTTGCAGAAGTCGGCCTCGAGCTATATG
GCGCGATGTTTCTTGTTGTCACGAAAGAGGTTCTCCATGGCGTCCCATAT
GGTGCATGCGGTGGAGTCGGGGCGCATGTGCCGAGGAGGTCGGCGGAGAT
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AGGTGAGGGTCATGGCAGAGGGAGTGGCATCGCTGGTGACGTGACTGGTG
AGGCCATAGAGGTCGAGGGCAATGAGGAAGAGCTCCCTCCAACTGGTGTA
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AGACCCATGCTTGAGGTATTGGCTGCCAATGTTAGTAAGGTGGTATCCAC
GAAGCCTCCCTCTAATGATTTCTTAGGGAATTTCTTTCAGAGTGAGAATC
TTATTTGATGTGAGTAAGCAAAATGTTGTGTTTATGATCAGAGCAACAAA
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TTGTTTTATGTTATAATTGTATTAGTTTTGAATAATGAGTATTTGGAGGA
AAGCCCCTAATATATATGTGGAATTATAAACACCCTTAAAAATTAAAATG
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CCGTGGCTCCCTTTTGCCACAAAATTGTAAAAAACGTGGCAAAACCTTGG
TCGGTTGTGGTAGATGTCAGATTTTGGTTTCTCGAGCGATTTTGACTCTG
ATCGATGCCACTAGCGTTTTCTTCACTCGTGTCCGCTTTTTTGAATTTGA
TAATATTGCACGATGCATCAGGTCGGTGATGTCAACTTTTGTATAAAGAA
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AAGCTACATAAAATGACAAAAGTGTAGATCCGAGCATAAGAAACAATGCA
CATATTCAAATCTCCAAAAAAGATCAAATTTTGTTATTTTTATATAGTTC
ATAATAAAAAGAGACCCGCATTATGATTTTGCATACTTGTAGGATATACT
ACTGTAACATATGGAACAATTTTTATTTCTAAATCTTATAAATATGATTT
TCTTTATTTTTTAAATATACAGAGATCACGGTGCTTGGTATGCAACGAGA
GTTTCCAATATCAATGAGCTTACTCCCTCCGTTATTAAAAAAGTGTACTC
AGGTTTTGATCTAAGTCAAACACTTATAAATTTGACCAACATTTTTTGAA
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AAAAAAAAAGTAACCCGGTCAAATCCGACTTGTGAGAATTAATGACTCGT
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TCCCCACCTCGCCGGGCGCAACTTGCTCCCAGCACACCAAAGAAAACCCT
TTTCTCCCTTTTCCTTTTCCCCAGATTTCCTCTCACCTCCGCTCCTCTCG
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CAGTCGCGGAGCTACCGCCGCCGCCCAATCGCCGAACTACTTCCCCGCCT
CCGTCACCGCGACCGTCTCCGCTCAAGCTCCCGCGCCGGCCAGCTCCGTC
CCGCCCCTCGTCGCCAACTACCGCTCCGTCTCAGCAGGCAGTAAGAAGGT
AAGAGTCGCAGAGGCCCACCTCCGACCTCTGTCTCCACCCCTCTATCCTT
GTTCGGTTCTTGTTTCGTCGCCAGGAAGTAGGTAGCGCACATAAGGTGGA
TTTTCAAGGCAGATCTGTTGTGATTTTCCGTATGTTAAGGTGGATCTGAT
GCATACGCGGATCTGATGGATACGTTGAAATTGTAAAACGTAGAATTAGT
TGACGGCTCTTTTTTTTTGCTCTATTTTAGTGCAGTATTGACTGTCAGCT
AGGGGAAATCTATCTCTGTTTTTGTGCAGTAGCACATATGCCTGAACGAT
CTAGATAAAGGAAGACATGGCTCCTTCAACGATAGAAGGAAATAGTGCTA
CCAATGAAATAGTGTTTCTTGTTAGTAGATGCTTTCGGTATTACTCATGG
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CAGATTTTTGTGTCCTTCCTGATCTAAGGAAAAAAGTGGTCTATCAATCA
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ACTGTTCGCTTTCTTTGCTGACAAGGTTGCATTTCCTCTGTTTAGTTTGT
TATGTAGATGTGTCCATGCAATTTAACTGTTTACAGAATTCTGTGTAAGG
AACAGTTGCCTCATTGTAGAAAGATTAGCAATCTGCTTCAGTGCTTAAAG
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AAATAAAAGAGGACTTCACCGTGTCTTGTCAAATTTACATATGAGAGGAG
TTATATATCTTTGATGATTCATGGATTCTTCATAACATGAAGCTATATCT
GACCTCTCTTTTATGGTGTTACACAGTCAACATGTCGTTGGATGTTACTC
AAATACTTTTGAACGCACAGTCTGCTGACGGATCGGTTAGGAAGCATGCT
GAAGAAAGCCTCAAGCAGTTTCAGGAGCAAAATCTCCCTGGTTTTTTGCT
CTCCCTTTCAAGCGAGTTGGCCAACAATGAAAAACCTGAGGAGAGCCGTA
GGTTGGCTGGTTTGATCCTCAAGAATGCACTGGATGCAAAGGAGCAGCAC
AGGAAGAGTGAACTTTTCCAGAGATGGCTGGCACTGGATGCTGGTGTCAA
AGCACAGATTAAATCAATGCTGCTGCAAACCCTGTCATCTCCTGTTGCAA
GTGCCAGATCTACATCTTCTCAAGTCATCGCGAAAATTGCTGGCATTGAG
ATCCCTCAGAAGCTATGGCCCGAGCTTATAGCATCATTGCTCTCCAACAT
ACATCAGGTCCAGCCAAACGTCAAGCAGGCGACACTAGAGACGCTTGGCT
ATTTATGTGAGGAAGTTTCTCCAGAAGCTGTTGACCAAGACCAGGTCAAC
AAGATACTGACTGCTGTTGTTCAGGGCATGAACGCTTCTGAAGGGAACTC
TGAAGTGAGGCTTGCAGCCACACGAGCATTGTATAATGCATTGGGCTTTG
CTCAGGTTAACTTCTCCAATGATATGGAGCGTGATTATATCATGAGAGTT
GTTTGTGAAGCAACACAGTCACCGGAGGTGAAGATAAGACAGGCCGCTTT
TGAGTGTTTGGTGGCTATTTCGTCTACTTATTACGATAAGCTGGCCACAT
ACATGCAGGACATATTTAATATTACTGCAAAGGCTGTGAGGGGAGATGAG
GAGTCGGTTGCACTTCAGGCTATCGAATTCTGGAGTTCCATATGTGATGA
AGAAATCGACATATTGGATGAGTACAGTAGCGAGTTTACAGCTGACTCTG
ATGTTCCTTGCTACTATTTTATCAAGCAAGCTCTTCCTGCCTTAGTGCCC
ATGCTGCTGGAGACTCTCCTCAAGCAGGAGGACGACCAAGACTTGGATGA
AGGTGCTTGGAATCTTGCAATGGCTGGGGGTACTTGTCTAGGCCTGGTGG
CAAGGACTGTTGGGGATGATATTGTTCCTCTTGTGATGCCTTTTGTTGAG
GAGAACATAACGAAACCTGAATGGAGGCATAGAGAGGCTGCAACATATGC
TTTTGGATCCATCTTGGAAGGTCCGTCAGCTGATAAACTGACTCCTCTAG
TTAATGTTGCCTTGAATTTTATGCTGTCTGCGTTGGTAAAGGACCCAAAT
AACCATGTGAAGGACACAACTGCTTGGACCCTCGGAAGAATATTCGAGTT
TCTTCATGGTTCTGCACTTGAAACAGCTCCTGTCATTACAGCTGAGAATT
GCCAGCAAATACTTACTGTGCTACTTCAAAGCATGAAGGATGTCCCAAAT
GTGGCAGAAAAGGCATGTGGGGCACTCTATTTCCTTGCTCAAGGCTATGT
GGACGCTGGATCGGCATCACCATTATCCCCTTTCTTTCAAGATATTGTCC
AGGCCCTTCTGGTGACCAGTCACAGAGAGGATGCTGGAGAATCCCGCCTG
CGTACTGCCGCTTATGAGACTTTAAACGAAGTCGTCAGGTGTTCCACTGA
GGAGACAGCTCCTATTGTTATGCAGCTGGTACCTGTGATTATGATGGAAC
TGCATCAAACACTTGAAGCAGGAAAGCTGTCAACTGATGAGAGGGAGAAG
CGGAGCGATCTGCAGGGCCTTCTCTGTGGTTGCTTGCAGGTCATTATTCA
GAAGTTGGGAGGGATGGAGTCAACAAAGTTTTCCTTCTTACAGTATGCGG
ATCAGATGATGGATTTGTTTTTGAGAGTTTTTGCCTGTCGAAATGCCACT
GTGCATGAGGAGGCTATGCTTGCTATTGGTGCATTGGCATATGCAGCCGG
TTCAAACTTCGCAAAGTACATGGCACAGTTCTATCAGTATTTGGAAATGG
GACTTCAGAACTTTGAAGAGTATCAGGTATGCGCCATTACGGTGGGTGTT
GTCGGTGACCTGTGCAGAGCACTGGAGGACAAAATTTTGCCCTACTGTGA
CGGCATCATGACCCAGCTACTGAAGGATCTATCCAGCAATCAGTTGCACA
GATCTGTAAAACCACCTATATTCTCATGCTTTGGTGATATTGCACTGGCA
ATTGGGGAAAACTTTGAGAAGTATTTGATCTATGCCATGCCCATGCTACA
AAGTGCAGCAGATTTGTCGGCACACACAACTGCAGCTGATGATGAAATGC
TTGACTACACCAATCAACTAAGGAATGGCATCTTGGAGGCCTACTCTGGT
ATTCTTCAAGGATTCAAAAGTTCCCCAAAGACACAATTACTGATGCCGTA
TGCTCCACATATTCTGCAGTTCCTTGACGCTCTTCATAATGGCAAGGATA
TGTAAGTCATAAGAATACTTTCTGTTTCCTTCATTGTATACTTTTTTATA
TGAGGTGTATTTCTTGCTTTCTGGATGCTCATAATCTAGGAACTGGTCAT
GCAAACATATAAATAGCTGATAGTTGACCTGTTTCCTTGTATGGTAGGCA
AATGGCTAGCTGTAGCTTAAATAATATACAGGGTCCAAAGCACCGAAAAA
TTGACAATTATGGCAAAATTAATTTGATCAATATTCCCTGAAGGCAATTT
CTGGAAATAGACAATTGCTTATATGCTAGTCCCTCCGTCCCGTAATATAA
GATGCTATTATAACTAATTGATATATTGGTTTTAGTAACATCTTATATTG
TTGGGATGGAAGAAGTACTAGATAACATCTTATATTGTGGGATGGAAGAA
GTACTAGATAACTGCCAGTTTCATTTGTACCACTCATTTCCATAACTCCA
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TAAGCACATATCAGCTCTTAATTGCCCAATTGGCCATGAGTCAACTTGGA
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CAGTGAAGTATTATTGTAACAATGAAGCAATATTTCAGGGCAATGCAACT
CATAGTTTGCACAATAATTTTCTAATGTTATCTCTACTGTTTCAGGGATG
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TTGGGTGTTCATGCTGGTCCTTTGATAAATCAATCCACCTCAAGCAAGCA
ATTTTTGGATGAGTGCTTATCATCCGATGATCCATTGGTCAAAGAATCAG
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ATTGGTCTTTAGTCTGCACATGCATCCATCCACGTGTCGAGTCCAGGTCT
TTGGTTGCATCATGTCTAGACCTGCTCCTTGGAGAAGTCCACAATCCTCA
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CTATTGTCGCCTGCCACGCCAATGGTCCCTCGGTGTGGTGTGCATGCTTA
CGGTCTGGGTGCTCTTGCTTTCCCTTGCATTCATTGCATGCATCGAACTT
TGGTCGTATTGTCAGTCTCTATAAGGCCCCATTGCGTCTGGATCCATTAT
GCAAAATGGGGCTTGCATGCATTGTCACAGGATTATTTTGTACTGCTCAG
GGGCTCCAAGTTCATTATGTTGGACATGTTCCTCCTGAGCTGGTAGTTTG
TTTAATTCCTTTTTTTTTGTTTCACACTTGCATTGTCCTGCATTCATTCT
GGACTGTTTTGTAAGGGTTCCTCTTGGTACAAACTGAGACGGCGTGCCGT
TGCGTCGGTGTATTTCAAGGTGTTGTTGGAGCAGTGCTCTTTTTTGTTAC
CTGTGCTGCTGTTCCATTTCAGCTTGTGCTGGCGGGAAAAAAAGAACAAT
TATAGGTCTTGGACTGGTTTTGTTCGGGCCAAGAGCTGTCGAGTCTTATT
TGTTGTTTACAGGAGTTGTATTATTATGTGGAACTCCGCCACTAGACGGG
TCATATCATTGTCTGTGTATATGAGAATATGATGATGAATGCGTTCAATG
ATATGGAATTTTGCCTTTTTTTTATCCTGCTCTGCCCTTTCACACGAGGA
TGAATGATCGATAATAATTGAGGATTTTGCTAAAGCTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.