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GrainGenes Sequence Report: AA015774

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Sequence
AA015774
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA015774
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCAAATTTTATGTGTAATTATTTAGAATGTTCCATCAAGTTTCCCTCAA
AAGGAAACCAAGTCCAAAGGGCAAAGGATTGGACCCGGTTTAACTTAACC
CCTGCTGCTTAAATCCCCCTCTCCAAACCATCGTCTGTTCTAATCTCCTC
TCCTGGTCGCCTCGCCGTCTTCCCCCACACCCCAAAACCCTAGACCCGAC
CCGCCTCCGCCGTCGCCCGCCGCGGCCCGCGGCCATGGATCTCCTCCGTG
CGAACCTCCACAAGGTCCGCATCCCGGAGCCCACCAACCGCATCCACAAG
GACGAGTGCTGCGTCTCCTTCGACACCCCTGTAAATCTTCCCCCTCCCTC
TCCTGTACCTACTACCCGCTTCGATCGTGCTAGGGCTTGACGCGAATTGT
TTCCGTGCCTGTGTGTTCAGAGGTCGGAGGGTGGATTGTACGTGGACATG
AACTCGTTCCTGGCGTTCGGGAGGGATCACGTGGCCTGGAACTTCGAGAA
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TCATATAAACCACATTCCAGAATAGAGCTATGTGATGATATGAGTTGTAC
TTTTGAACAATTAGAATAGATATATTTTTCATTTGAATTTTGAAGCAATC
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TTTACTGAACAAGAACCTGAATACGATGTGACTTTTGAAATTGTTGTCTT
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TTGATAAAGTTATACTTGCTGAAAGTGCTGATAGAAAGCAACAATTGGCA
TCTTGGGTGGCTGACAAGAAAAAAATCAGTGCACATGCTATGGATCTGCA
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TCATATATGGTACTAGGTTTTCTTGTAACTTTTTGCCTTTTGGTATAAAG
TTGTTGCCCGCATACCCATTAAAGTATATACTAAAGAGTATTCTTGATAG
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GAAGATGATAGCGTTGAAGATCCACTGTTAGCTCACCACTTGTCACATTT
TGGTATCGATTTTTCTTCACTCCAAAAGGTGAGTTGCAACCTTATTTAGT
GGCACCCATCTGTGACAGTTTAGCTCTACAAAGGGATGTTTTTCACTCCT
TTTCTTTTAAAATATGGGCACATCAAATTTATTTTTCACAGCAAACATGA
TTGAACCTAGATTCTAGATTTATTGCATTAAATGTCGAGCGGGAAACAAG
ATTAGAATTAGATATTAAACTTCTAGGGTATTACATCAGTTACCAAAGAG
CATTGCATGATTGAACCTATACAAAATTCTTATGTTATGATAAGTTGCTC
TAAGAATTATTATTGTAATTGACCAGGTAAAAGATCCGAGTCTATGCTAA
TTCTGAACACAAAAACAGACATTTGCTACAATTGGCAGTGCATGGATGCA
GAATTTATTTATTGCCCTTCCTTTATACGAGGTTCTGTTTTCTTTGTTCC
TGCAGACTGAGATGACTACTGCTGAAAGAGAACTTGACCACAACACAAAT
TATGATTGGAATAGACTACAAGAAAGTGGCAAAGATGCTGAACCTTTGTA
TGGACCGGGCTATACTGGCCTTGTAAACCTGGGAAATAGGTATGGTGGCT
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CCAGGCTGATCCAACATTGGACCTAAACATGCAAATGTAAGTTATCGCGA
ATGACCTATGTGTTAGGGTCTGTTCATGGAATGTGCTACTATCTTGAGGT
AGTAGTTTCCAGATGCAGTTTACTTACCTTTTTTTGTGTGGAATGCAATA
TTAAAATAAAGGAGATGTTAGGCCGTGTAATCCTTATGTTGAAATCATCA
TTTTCTTACAGTTAGATTGCTAACGTCACAGATAACACTCCTTGATTTTG
GTTCTGGTCAGCATTTTCCAATCTTGGCTGGCACTTGTTGGCCACTTGGA
GAACACTTTATGACCACTTCATTGGGGTGTTAGTTAGTTGGTACAAATTA
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AGAAAAGGATAACTGTACACTATTAAGATTTTTTCATTAGCGTGATATCT
ATTTCTTGTTAATTTTGAAGGGTAGGGATCCATGTTGTTGTGCAAGAATT
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CGCATGGTATGCTCTCTGGTAAATATTCTGCACCCACTCAGGAGGTAATA
ATTTGATATATATACTTACATGCTGATCTTTTGTTTGTATGTACCCTTCA
GTTCTTGTGTTCATGTGGGTTAGGGGATGATGATTCAGCGCTTCATTTTA
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GGTTAAATAGGAGTTTTTTTAATTGCATGATGATGTTCATGTGTTAAATT
GGTGGGCCAGGTAAAAAGTTCTGGAAGTGCATGATAATTTAAAATCTGTC
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TCTCTTTCTTTAACTGTGCTACTCCGAGCTTCCTGATGAGCACAGCACCA
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TGTGCGATGCATGGGCGATGCTCTCGTTGAGTTCGTCATGAAGTAGGTTA
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TTGGTGGGTCCGGTAAAAAAATCTGGAATTGCATGACAGTTTAAAATCCG
TCAATTTCCTTGGATAGCAATTGCATATTTAGTGAAAGGAAGGGAGCTTT
GGGGTTTCTTTAACTGTGCTACTCCGAGCTTCCTGATGGGCACAACACCA
ATGGTAGTTCCATGCTCTCTAGCTTGAGTAATCAATGGTGAGTTTCTTTC
AGATGGTGTAGCATGCAATGTTCATGCTTCACAACCTTGTTATCGCTTTG
TTCCATATTGGGTTGGGTGGAAACAAGTGCTTCCGAGGGACAAATATTCT
GTTGACCTATCTTATACAAACATGCTTGCACGTTTGTTTATTTTCTCGTA
ATTCTATGTATGTTAGTATCTTTAGTGAAATTATGTGTTGTAACTACTCC
ATTTGTACCCTTTCCTTATTTAAGCTGTAAGCAAAGTGTTGCAGTACCCA
ACTGCCCAATACCCACCGTACTTTTGCGTTATTCTCATGATCTGGCCCGC
TGATCCGCAAATCTGGCTCTGGATTGCTGACTTTACCGTTCTTGTTATTT
TTGGTGCCAGAGCTTTTCAAATACCATCGAACCTACTTCTGTGTTGATCC
ACCCAGTGCTCTATTGTTGTTTTACAGGGACAAGAAGGAATACGTCCCCG
TATGTTTAAGTCAGTTATTGCAGCAAGCCACCCTGAATTTTCCAGTATGA
GGCAACAGGTACCTTTATGCGTATTGGAAAAACCAACCCTTTCTACCTTC
CTTAATTTCTTGATTTTCCACTGAAGTTTCTATACACTACTTTCTCTAAA
TTTTCTTATTTTTGTGATATATTTTTTAATTTCTTATTCTTTATGTTTAT
TAGTTGACTATGCCTCCACATACGAAAATCTCTGGCGTGCCATCCTAAAC
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CTGTACGATGCTGATAGTTGGTACTTGGGAGTGTGATTTTTCTGATTAGA
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TGAGTTCTTTCTTTTTGTTTTGTAGCGAGGTGCTACTCATATGGGTCTGT
TTTAATTTATTGAACCACAGTTTTAAGTACGAGTTTATTAACTTTCATTA
TCTTATTTACTTTTCCAGGATGCCCTCGACTTCTTCCTTCATCTTATCGA
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TCTTACAACAAAAGTTCTGACTACATTCTTTCTTTGAGCATACCGTTGCA
TGAAGCGACTAACAAAGGTGTTTTTTTAGAAGTTCTTAGTTCCTTTTCTG
TATATAATTCAATGTATAAGAACCTTGAGATTTGTGATTTGTGGTGCATG
CAGAGCAGCTAGAAGCGTTTCATGAGAAGAAAGCTGCAATGGACTTGGAT
GGAAAGGAAGTGTAAGTCATTCATATTTCATGCCGTGCCTACTTCCTAGC
GGGTGTATGTCTCATGACATCTGTATCATTGTGTTCCCATGACAGGTCTA
ATGAGGAGATTGTGAGGCCAAGAGTCCCACTGGAGGCATGCTTAGCAAGT
TTTTCAGGCGAAGACGAAGTTCCCGATTTTTACAGCACTGCATTAAATTC
AAAGACGACAGCAATTAAGTATGTATATCTTGAATCTTTATTCAATATTT
GCTAAAAGATGTCCTAAAAGTTCTCTTGCACATGCACAAACTGCAATACA
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GTTATTTTAGTGATAATCTGATGTAAAATGCTAAGCTTTCCTTCGAACTG
TAGCCTCTTACTAGTTCAGCGTAAACCAGTGTGATGGAAGTGTAATGCTG
GAGCAAATAAACATCTTAACTGTAACGACTTATACTTAATATTCTACTCA
GTTTAGTTCCATGTCTGCACTTCAGTATGAATTTCAGCCAATTTGTGGTC
CTCTAGTACACTTTATTGTGAGGATTTGAGAGATCCGTACTTACCTAGGA
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TCTGGATCAGAAAGAATGTATTTATCTTTTTACATGTATGTACTGAACAG
TAAAGTTGTTTGTTAAATTATATAGTTATTGTATATAGTTTTATTGAGTG
TTGTTTAGGACTGGGAGTCGCCTCCATATTTGCAAATTAATTATCAGTCA
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GCTGGCTTTAAAACTTTTCCTGATTACCTGGTGCTGCAGATGCGTAAGTT
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CTTATCATAACTTATTAGTTGGAGTCTTATGTTACTCGGCACTGTCTGGG
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TGGTTCTCACATCCCACTTTTGTTCAGTCTAGATGATTAATTTTTTTTTT
CATATTTTGATATCTGAGCCTTGACATTTTGTTTCCCTCTCAGATGTTTA
TATCGATGTGCCTGATATAATCGATATATCGCATATGCGCAGCAAAGGTG
TACAGCCTGGGGAAGAGCTACTACCTGAAGCAGGTTTGGTTGTCGCCTAT
TAGTTTTTCTTTTTCCCGCTGAACATTCTCTTTTCTTTCCCTGGAAAGAA
CCCCTTCATGTTTGATGACCTGGCAATATCATCTTTCAGCTTCTTGTGGC
AACGAAGCTGAACCTGCTCGTCCTGTTGCAAGTGAAGACATTGTGTCCCA
GCTTGCAAGCATGGGATTCAATTACTTTCATTGCCAGAAAGCTGCCATTA
ATACATCGAATACAGGTGTTGAGGAGGCGATGAATTGGCTCCTCTCACAC
ATGGATGATCCAGGTTGGTATGCAGATGCAAAAGGATCCATTATTTTATT
GCTTTCTCATCATGAAATGATTAGTACATTAGTTGTAACTGACAGATGAA
ACTGCAATGAACTTATGCAGATATTGATGATCCGATATCTCAAGATCCAA
CGTCTACTGAAGACACTATTGATGAAGCAAGTGTTCAAACTCTTGTTTCC
TTTGGATTTCAAGAAGATGTTGCCCGAATGGCCTTGAAAGCTTCCGTAAG
ATTCTTTCTATGATTACATCCAGTAATGAATTGTAATGTTCTTTAATTCA
ATTATAAAAATAATAGACAGAAATGTTGGCCGTCCTTTGGAGAGTTGGTG
TTAAATAATAGACAGAAATGTTGGCCGTCCTTTGGAAAGTTGGTGTTTTC
ATATTTCCCTCGGCATTTCCTTTTCTGCCCTTGATACTCTTGCTGCGTCA
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CCTGAAGCATCTAGCTCTGCATCTGCTGATTCTTCAACAAGCAACGTAAA
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TGCATGTATGTGCAATAGTATGGTACTTGCTCTCAAGGTGGAATTACTTT
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CTTTGTATGGTGCCAACTGGACGAGTTAATTCCCAATAGTTGTTCCTAGA
TTGTTTATAGTTGTCCTTTGAAAGTTTCACATCTGTACATGCTTAACGCA
TATCCTTCTACAGTTCTACTCCCTCTGTTTCAAATTATAAGATGTTTTAG
CCTTTTTCTAGAACACATGTATCTAAACACCTTTTAGTGTGTAAATTTGG
AGCAAACTGAGTGAACCTACACATACTAAAAGTCGTCTAGATACTTGTTG
CAGAAAAAAAAGGCTAAAACGTCTTATATTTTGGAATAGAGGGAGTAGTT
AATATAGATAGTTATCATATATATCTTTATCACACGTTAAGTGGATGCAA
AATAAGACAAGATAATCTTCCCAAAGTAGTTTCTTCGCAATATTGGAATG
CTCTCAGTTACTGTTCCATCACCTAAAATGGTGTGTCTTATATCTAAGCC
TGTCAAAACATTGGTTTTACTACTGTACTACTGTTTGTAGTTCTGTTGAT
CACATTATTTCTAAAACTCGTTAGCAGTAAGCTAACAACTGTTTATGCTG
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TTCAACGACAGTAAGGTTGCTGCCTCTGTTGACCTGCCCAAGGATATGGG
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AAATCATTATGAAGTCATGGTTCACACACACACTTATCATCAGAAGCATG
GCCGGTGGTTGCAGCGCTCTTCTGCAAATTGACTAAACGCCGCCACATCC
TTGCGTGCTAGTTTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.