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GrainGenes Sequence Report: AA032851

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Sequence
AA032851
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA032851
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCGCACCAAAACGGCAAAACCCCGTAGGCTCCTCCACTGCCACCCTCCC
GCTTCCGCTGCGGCGACCACCACCGACCAAATGGCCAGGGCAAAACCCCA
CTTTGCACCGCACGCCGCTTACGCCGCCTCGACCCCGGCCCCGGCCCCGG
CGTCCGCCTCCGCCTCTGATTTCATCTCTTCCAACTCCGCCGCAAGCGCC
GACGCTGACGTCATCGTCTTCCGCCTCCTCCTTCCCCGGGCATTTGGGGA
CGAAGACGCCTTTCACCTCTACGCCGCCATCGCCCCGCTCCGCCGCCACG
CCGCCGCGCTCCAGGTCCGCGTAGATGCCCTCGAAGGTTACCCCGAAGAC
TCCGCCAGCCGCGTCGCAGTCGTCCTTGGCCCCACCTCTCCCAGCCGCCG
CGTCGAGGCCTCCTACTCCTCCGGCGAGCCCCTCCAGCTCTCGCCCGTGC
AGGAGGCCCTCGTCTCCCTCGTCGACGTCGGCCGAGTCCTACACCGCGTT
GTGGGCCGGGGCCCCGAGTTGGTGACATGCCTGGTCCTGGTCGAGGCCGC
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CTGCATTCTCCCGACGAGGTCGTTGAGGTATAAAGCTCTCGCTGTTAGCC
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CTGCTTTCGGACAATGGATATCCCCACTAGGCCACTATGATTACTGTTCA
GTGTTCACATGCCTTCCGTTTAAGTTCTGATTTGCTAAGCAAATTCCAGG
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AATTTGTTGTAGGAGTATTTGTTATGGTGCATGTCTTACTATCAGAAATT
AGATGAATATAGTGCATTTTTGTTTCACTACTGAGTATATGCATCACAAG
CATGTTCATCGTTCTCACCAGAACAATAGAGCAATTAATTTCTTTCTAGA
TTTTGTTTTCTGATATGCTGTTGTCCTTTTTTGTGGTGCATGTATTATCT
TCTCGAAAGTAAATGGCGAGTGCTTTTTTCAGTTATGTGTACTCCCTCCG
TTTGGGATTATAGGTCACGCACGGTTAACTAGGTTGCCAATGTGACCAAC
AAAATATAAATAGAATACCACAAAAATTATACCATTAGAAACTTTAGATG
CTATATTTTCTAATGGTATAATTTTTATGCTATATAACTTATATTTTATT
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AACAATAAGCTAATCCAAGTAGTGTTATGTGAACCAGGGCAAGTTTTGTA
AAATTCATGTAACAGAACCTCATGGTATTGTGGTGTGCAAAGCAGAGAGC
AACTTGTGGTTTCTCAAGTTTCATTTATTTTAGAAAGATAAAGTTGTCTA
GGAAGATATAGACAATATATGCTTGATTAGTGTCTCCTCTCCCAAGTCAG
CTGAAGTTCTTAGGAAGAAATCTATGTATCCGCTCCTGAATTGTTTATAG
AGATTAAGCAATAGTTATACCAAGTTCCTGGTCTATCTTGCTCCCTCCAT
GCCTATCGTGCAGCTGCCTCATGGTGCCATAGGGCTACTTCAGTTCGCAG
CCAATTATCAGTATTTTCCGAAATATAAGATGTTATCTATTTTATATCTG
CCTCTCTGTTTCTATGTTATTATTCTTATATTAAGGAGTGGAGGGAGTAG
TTCACAATAAGTCATATGTGCATCTCTATTTCTATGTTATCATCCGAAAT
GTGAAATAATTGGAATACACTCTCAGGGGTCTCTAAGATGAATACAGGGT
CTGGAAGACCTTACATTATTCTTAACTTTCACCATATTTTTATAGGATAA
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GTATTAATTATCTTTCTCCTTGTCCTGTGCACTTTCTAAATCATCCTATG
TTTTTTTTAATATTTCATGTCTTTTGAAAATTTCAGATAACTGGAGACAG
AATCACCATAAGGAAAGCTATTGTTGCTTTGTCTAGCTATGTTCAAGGTG
ATTTACATGCTGGTAGCGTGACAACTTCTGTTACGACAGCAAGCCCAGAG
CTCCCGAGGACAACTTTGGAAGTGGCGAATTTCAGAGCTTTGCACGCAGA
GGAATCCACTCAGTATGCAAACAGCACTATCCTTAGGATTGATAGTAAAG
ATCAACAGCAGATTTCGTTTAGACTTCTCTGTCATGTCAATCTTGCTGGG
GGTTTGATTGGCACGAAGGGCATGCGTATCAAAAGCTTTGAATCTGAAAC
TGGAGCTTCGATTGACGTCGGTAATCCTTACAGTGGGTGCATGGAACGTG
TGATAACAATCTCCGCCCTAGAGGTTTGAACATTAAAATTAGCACCTCCC
ATTGTTTGTTATATATCTCTCTTCAGAGTCTAGGAAACTTTTGCTTGTAA
TTTTTCATCTTAGGTGTTTTATTTTGAGATTCGTAACCACATGCGTGCTT
ATATTTTGATTAAACATATTATGCAGCTCATCCATTATATTTTTTGTTTC
TATTGCCTTATGTAGAGTCCAGGACCGTACTCCACAGTGCAGAGGGCAAT
CCTTCTTATCTTCAAAAGAATGGAGGAGATTGAAAGAAATGGGCGCTCGA
CATTCAGCAAGCCAGGATGCTCAGCCAGGGTGCTTGTGCCCAAAAGCCAA
TTTTGTTGGTTAGTTGGTTTAGGTGGTTCTGTAATCAAGGAAATGGTGAA
GTCAACAGGAGCAGGAATTGAGATAATGGATGAGACAGATGTTCCAGCTT
GTGCCTCACACTGTGAACGTGTTCTGCAGGCAAGTATTTTTCTTTAATGA
AAAGGCATCATAAACTGTACGATTTGTATATTCTCTTGGTGCATGTTTCT
GTTTTGATGCATAGTCCGTTGATCTTCAAAGAAACAGCAGTCTCAAACCA
GTATTAACCTGATCCGTGTGAACCTAACCTTTTGTTTACTGTTTACTTGT
GCTGTTGTTACTCTGCATTCCTAAGCAGTGATATATAGAAGTCGTTCTTG
TTTTTGTTTTCCATTTCATTAGATAACAAATGCCTTGCATCTTATGTAGC
TATTCTCATAATAGCCCTGGATTCTTCTCTCGGATTTCAAGAGCAATATT
ACTGCCAGAGTACTTGGTCCACTCTATGCTTCATGTTTAACCCCTAGTTA
TCTTTTACCCATGATTGCTGTTGTTTTCAGATGCCGCTCTTCTCATGGTT
GTGCTGGATAGCTCCATGCTTATTTTAATTATCTTCTTACCTTACAGATC
ACTGGGGAATTAGTGGATGTCAGAAATGCTTTATTACTTCTTTGCGACAA
ACTTCGTAATTATGCTTTCTCTTCTAAGAGCACCAAGTACGATGATGCTA
TTGCTACATCTTCAGATATTACTGAATCAACTCCAAGCAGACAGGTCGAA
TTTTCTTCAACTGGCTACAATTCAACTGAGAATTTCCCAATGATTGATCA
TGAACCCTCTTTAAATCAGATGGACTCAGTAGAGAACTCCTTCTATGCCT
TCCACTTGGGATCTCCTGGTTCTTCAGAACTTGAGGTCATGTATTACCCA
ATGTTATGCCTATCCGATTATCTAACAGTTTAACTATTGCTTGCACCATG
TTTGGAATTTTCGTCCTTTATGAGTTTGTTTGAGACAATAGATGCATATT
GATATTCCTACTGTTTTGAGAGGAACATAGTTGTGGAATGGTAAGTGTAC
TGATTGCACTGAATGCAAGAAGTCAATTTAGTAAAATGGTGTATTTAGAA
TTTGTGTTAAAGGATCATAATATTTCATTTGGCAAACTTCCTAGGATTAA
TTTTATTTAATCCTCATAGAATACCTGTGAAATTATCTATTCATCGCAAA
TAAGCGTTAAACATAGCGGTGAAAGATTCTCAGAAGTTTAGCTTTAAACC
AGGCCCATACTCCGATATTACAAAACTTATTTAAGAATCATCCCATAGAA
GACGCTGCAAGCACTTATAGTTCACTATTACTTTTTTAATGTGGAGCAGG
GTTCATAAATAGATGTCCCTGTACTTCTTTCTAAAATTTATGGGAAGTAA
TAATTTTTTATTTCTCTATAAGATGCGTCAAAAGTCCTGCCAATTATTTG
CCAAATAAAAAAAAACAGTCCTTTTGGACATTATCTATCATCTCTTTTCA
GCATTAATTTCTGATCCACATTTCCTCTTTTGTGGTACTAAATAAGTATT
TGGATGCAGGAACCTGCTAAGGCGGATGTCGTTGGAATCATGAAATCAAA
AAATGAGGTACAGAATTCTGCTAGCAGGAGTGGTGCTGTTACTATCACTA
GGGTGCAGAAACCTGCTGATGGTAGTGACAACGGAATTAACAATTCATGT
ATCGGGATTACATCTCCAGAGGAAAACAAAATTTCGAGGTGATAGTTTAA
CTGTTTCTTTACTACCCAGTAGTAGTATCCCTCAGCCTTTAGAATTTGAT
CTTTGCAAGGATGATAAGATTATTTAATTTCAGAAATGGGTCTTTGCTAC
TTCAATATTGCCTATAAGTCGGAAATCATCTGGGATTGCATTCTACTCCC
GCCATTATGGGACAGGGGGAGTAGTTAGTAACAATCTATGGTATCCAGCT
GCGGCTGCCTGCCAAACACTCTAGCAGCATAGAAAAACCTACAGCAGTTA
GTAATTGCTCTTTTCAAACATTTCGTAGCTCTCTTATTTGAACTGTATTA
GAAATCCGTGTCATTTATTCTCTTGGTAAGTGTTGTCGAGTAAACATGAG
GCGTTGAACTTTGAAAAAATCATCAAGCATTTTCCAAATGAGATATACCC
GGGTAAAATTGGAAAGAACAGCATTCACTTAGCGTTTTGGTAACCTTATG
GTGGTGACCAAATTTAACTATTGAATGTGCTATCTATGTTTATGTCAACT
TTACTACTTTATCATTTAATGTCAAAGATTTTTGAAAAAAGAAACTTCTT
ACTACAGTGATGAATTTGCAGCCATGAGCCAATTTACTCATCCTTTGCCT
TTTAATAGGGTACATATCTTTTCATGTTGGTAGATCTTGTAATTAGGCAG
CTCATGTTCTAGCTCGTGAGGCTGAACATGTTTCCGTGGCTGTATGGGTT
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ATACTTATACCTTAGCTAATGATCGGAACTGATCTACAAACCACCAATCG
CATCAGTGCTCGGAGTCCCTATCCTTTGGTTTTCTGTGCACGTTTTGTAT
GTGACTAACATGCACAAATTAATTCTCCATCTGACATCTCACTGATATAA
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ACGTACGAGGTTGCTGCTTGTCAGAGGGTTTTATGTATTCTCTATGGAGA
TGACGGATACTACCTGGCCCAGCTCAGACAGGTCTTGCTACTGAAATGTG
TAACTTTGTATATTTATCATCATCGCATTATGTTGGTTCTGGGGGAAAAT
TTCTGGATGGGTTAGTCCTTGGACCTCCACACCCTCTAATATATATAGCT
GAACTTAGGTACATCTTAACTAGTACACCAGAATACTCTAGAATCTAGTA
GGACACTAACTTAGACTCCAACATTCATTGGAATGTTCCAGGCACTCCTA
GGGCAGCACTACTATACTAACACTTACTGGAATATTCCAGGCTCTCCTAT
GACAGTTTCCAGCACTCCCCTCAAGATGGGTGATAGATATCTATCATTTC
CATCTTGTTACAAGCTGAACTACACTCTTTATTTCCTAATCCTTTAGTTA
AACAGTCTGTAATTTGCTCGAGGTTACATGATTTATCCTAATTATACTGT
CATCCAACTTCTCCTTTATGAAGAAGCGATCAATCTCCACATGCTTGATT
CGATCTTGTTGAACAGGGTTGTTTGCGATGTTGATCGCCGACTTGTTGTC
ACACCACAAATTTAAAGGGCCTTTCCTCAACACTTTCAGTTCTGAAAGAA
GATTCCTCATCCATAAGGCCATAACATCTCACTCAAACCTTGCGACATAG
CACTATATTTAGCTTCAGCTGTTGACTTTGAAACCACCAGCTGCTTCTTA
CTTCGACATGCCACTAAATTTCCCCCGACAAATACACAATAACTAGATGT
TGATCTCCTATCATCCAAGCAACTTGCCCAGTCAGCATCACAATACCCAT
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CCCTTCAAGTATCGGAGGATTTGATTGACCGCATCCAAGTGTCCGCTCCT
AGGATCATGCATGTACCTGCTCACTACACTCACTGCATATGAAATATCAA
GTCTTGTGTGACATAGATAGATGAGCCTTCCAACAAGCTTCTGGTACTTC
TCCTTATCCACTGGTTCCCCGGATTCAACACATAATTTGTGGTTTTGATC
GATAGGTGTTGATGCAACCCGACACCCAAGCATGCTTGTGTCACTAAGCA
AGTCCAATACGTACTTCCGCTAGGAGACAACAATCCCTTTGGGAGATCTA
GCAATTTCTATGCCAAGAAAGTACTTGAGTTGGCCAAGGTCCTTTACCTC
AAATTCCTTACGTAGGCTGTCTTTCAATCGTGATATCTCCACCTAATCAT
CTTCGGTGATTATGATATCATCAACATATACGACAAGGATTGTAATCTGG
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TCCCATACCGCATACAACTCGTCTAAATCTATCAAACCATGCCCGCGGAG
ATTGCTTGAGGCCGTATAAAGATTTTCTCAACCTGCATACCTTTCCTGAT
GTTCTAGGAGTAGAGAAACCAGGTGGGATCTCCATGTATACCTCCTCGTG
TAAATCTCCATGCAAGAATGCATTCTTGACATCTAAATGATGTAAAGGCC
ACTCGAAGTTAGTTGCACATGAGATTAGGATCCTCACTGTGTTCATCTTT
GCCACCGACGCAAATGTCTCATCATAGTCAATCCCATATATTTGACTATA
TCCTCTCGTAACTAGTGTTTCCTTGTACCTTTCGACTTTCCCGTCTGGAT
TCTGTTTCATGGTGTAGATCCATTTACACCCAACAACTCTCTTTCCTATT
GGAAGATGTACAAGTTCCCAAGTTTTATTCCTTTCGAGAGCATTTAACTC
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GATAGGGATGTATATGATACATAATTAGCTATGTCATGCTCCTTCCGATA
CCAATCGAGCTCCAGCTCGGGTTCCTTTTCTTAAGGCAATGGGTAGATCC
AATGAGTCATCAGTGTTCGTAGATAGGGATGTATATGATACATAATTAGC
TATGTCATGCTCCTCCCGATACCAATTTGGAGGTTTTCTAGCTCTAGCTC
AGGTTCCTCTTCTGAAGGCAATGGGTAGATCCAATGAGTCATCAGTGACG
CATGACACACTCTCAGATGAGTCAACTTCATCGACCCATGGAATTTGTTG
TTGATGTTGCTCCCCCTGCAGCTGGATCTCACCATTTGTTTGACCCTGTT
GTTGATACGGTTGCCTCCTTGTATACACCCTTAAATTTTCTTCCTCATTT
GGTTTTCTCTCTCTTTATCCATAGGTTGTCTTCTTGTATACACCCTCAAA
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GTTCACTCTCCCCCTCTCGACTAGCATTACTTGTGCTAGGAGAGTCAAAG
TCAAATAATGAGCTGAGATCCATCTTCTCTCCATAGAACGGCTCCTCTCT
AAATGTCTTATCCATGCTCACAAATGTTCTCCGTTCACTAGGACTCCAAC
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ACACGTGGATCTAATTGTCCCACTGAAGGTCTGTGGTCCCTAACAAAGCA
TGTACATCCAAATACTTTTGAGGAAACAATGAACTCATTTTCCCCATAGA
TCATTTCGTACGGAGTCTTCATCCCAAGAACTTTTGATGGCATCCGATTG
ATTAGATAAGTAGCAGTTTGATTAGATAAGTAGCAGTCATAACTGCTTCA
CTCCATAAGAATTTAGGCACATTCATAGTAAACATAAGTGATCGAGCTAC
CTCTAGCAGATGTCGATTCTTCCTCTCAGCTACTTCGTTTTGTGGAGAAG
TATCAGGGCACAAAGTTTGATGAAGTACTCCTTTTTCTGAAAGAAAATTG
CCAAATTCATGGTTCACATACTCTGTCCCATTATCAGTCCTAATAATTTG
AACACCAATGTTGAAATGATTTTGGATATATGCATAGAAGTCCCTGAAAC
ATGCAAACACCTCACTTTTTTGTTTCATGAGGTTTCCAAGTCATCCGAGA
GTAACAATCAATGAAGGTGACAAAATACTTCATTCCACTAATAGAGACCA
CATGAGACGTCCAGACATTAGAGTGAATCAACATAAAGGGCGATGTGCTC
CGAAGTCCACGACTCACATATGATGTCCTTGTGTGTTTTCCATACTCACA
TGCATCACGCACAAGCTTGTCTTTATCCACCTTCATCTCTTCAGGAAATA
CCTTACTCATCGTATCAAAGGACATATGGCCCAATCAACATGTTGGAGTA
TCAACCTTGCCTCATCATTACTTGCAACTGTCAGAGCGGTGCACAATGCT
CCATCACTTTCTTGTCTATCTAAGTACCATAGTCCCTCTCACACCGATCC
CAAGCCTCCTTCTGGTCTTCCTCTCCTCAATTATGCAATTGTATCGATCA
ATGATGATTCAACAATCAATATCATCAACAAAGGAGCTCATAGACACCAA
ACTCACCGGAAATGATGGAGCATATAAGACCGAAGACAATATAATTGAAG
GAGTGCATTTCACTGTGCCGACACCTTTGACAGGTTGATAAGTTTCATCG
GCTGTTTGGATGGTCTCTTTATGCATGGGTGGATGTGGAGCATATGATGC
AAACTCACTCCACCTACCCGTGACATATGTATTTGCTCTAGTATCCAATT
TGAACGAGAAGTTTCATCTAACGTAGGAGGCTGATTTGAGATATCTTCAA
TTTGTGCAAGATTGATAAAATTGCCAAGAACTGTTGTTTTCCACTTTGAT
TGGCTCTTTCCGCACTCCTATTTGATTTTCTCAACGTCTCCAAATCTTTG
GTCGAGAATTCAAGCACCTCCCCTATCCCTTGCCAGTCAAAATCAACGTG
TCCTTGTCTTTTGCCTTGAACAATTTAGCCAATTTGTCGAGATATCTTGA
TTCTCTCCCATTCTTGGAGCACCACTATGCCCTCTTGTTCTCCCTTTCTT
ATGTGTCTTGCTGCATGAACTCTGCTTCTCCTTAGCACGAACTCGTTTGG
ACTGCTTTGTGAGCCTCTAGTCCACTCCTTGCAAATGCTGCTAAACTATC
TACAGCTGCTCTGGCTCCTTCTCTCTTCCCTACTGCAGCAGCAACTCTCT
CTGCAACACCAAGTCAACCACGTACAAGGGCAGGGTTTACTTCTCTGCAC
CAAGCCACCAAGCCGCCGCTGGCTTCCATTGTGTCCTCCTCACTAATCCG
CTGCTGTTTCCAACTTGCTGCAGCACCGCTAGTTCTCCTCGCCGCACGCG
CACTGCTGGCCACCGGTCTAGCCTATTCTTCTTCCTAGAGTCACCACTGA
GCCTCACCTATAGCTCGCCACCCTGCTCCACCGCCGTGTCTCCTGCAGGG
CACCTCCACACACGCGAGCTCCAGCATTTGGTGATTCACCATCGGCCACT
TTCAGGAACCAGCAGCACCTCCACCTTGTGCTCTGATACTATGTTGGTTC
TGGGGGGAAATTTCTGGATGGGCTAGTCCCTTGGACCTCCACACCCTCTA
ATATATATAGCTGAACTTAGGTACATTTTAACTAGTACACCAGAATACTC
GAGAATCTAGTAGGACACTAACTTGGACTCCAAAATTTACTGGAATGTTC
CAGGCACTCCTAGGATAGCACTACTATACTAATACTTACTGGAATATTCC
AGGCTCTCCTATGACAGTCTCCAACACATTAGATTCAGTTCATCAATTTG
TCTGAGATCTTGATTGGTGTTCATTAGTTTAGTTCTTAAACTAACGAAAA
CACGGCTCATTTTTCTTGTTTCAAATTCATATTTGGCATCTATGATATTT
CTTCATTTCAACTTGTGGAACTTTTTGAACTACTCCCTAGAAGTTTTTTT
TTCTAAAAAAAACCGGAGGGAGTATATGATGCTTTGGGTTTTTCCTAGGC
TTACTACATGTAGACCCAGGCCCGGGTAGGTATACAAAATAAACATGTAA
AGTTGTATAACTCTTACTAAAAGTTGTGACCACTTGGAATTTGGAATAAC
ATTGTTAGCCAGTTATTAATACTGTCTTCTCTATTACGAAAAGGCTTACT
GCAAGTACCCTTTAATACTATTGTCAAATTTATTAGTATTTGTTTTCTAT
CCTACCTATATCATTATTATAGGGTTTCTTCATGCTGTCCTGTATGAAAC
CATAAGAACTCACGTTACCATCATAAAAGTAACAATTGTTGGATCTCAGC
ATTTATTTTTTCTGAATATTCAGATCTCTGGTGCAAACATTACGGTTTAT
GATCCACCTCCAGGGACCAGTGACGGTAGCATTATTGTAATATCTGGAAC
TCCAGATCAGGCGCAATTAGCCTTGGCCGGACTCATTGACCTGACCAAGA
AGATGACGTGATCGTCATCAGATCCCCACGATTGAGCATGGAGTCTTCTA
ACTTTGTCATCATAATTTTTGAGAAATGAATCTGCAAAATTTGTGTGACG
CCAATAGATGTTGCTGGTGTAAACTTGACATCTGGAATCACGTGGCATAG
TGGTCTCTGGCATGCGTAGCCGCATATTATGTGAGGACTGGATATTTGAC
GACGACGATATCTTGTCTCATCACCTGGCGTACTTTTGCATGCAGAGCTT
GCGACGTTCAAACTGTTTATTTTTGTGGTCTAGAGTTTTTGGTGTCCTTG
CACAGTTGCACTTCATCTGTTCGTATGTTGATTTGGCATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.