Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040438

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040438
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040438
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCATTAATAGGTTCTAAGTATATGTATCGACGAATCTCTTGCTAACAGC
TTGTATGATTAACTTGGATGCAGCGGGAGACATGGCGGTTGTCCTGGATG
CTCTGGCGCCCTATGTGAAGAAGATGATCGCCGGCATGGCCGAAGAAGAA
TTGAGCATGCTGCTGGGCGTTGAAGCCGAGATCCAAAAGCTGAACGACAA
CGTCATACACCTTCAGAACTACCTCACCGACGCCGAGAGGAGACGCATCA
CCGACGAGAACGTCAAGGCGTGGGTGGGGAAGCTCAAGGACGTCATGTAT
GAGGCCATCGACATCCTTGAGCTCTGCCAGCTCGAGGCCATGGAGAGACC
AGAGAAGAGTGACGAAGTTGGCGGTGCCTCATCCTCCCGCCGTCCAACTT
CTGTTGGAGGGAAAATGAAGAAGAAGCTACAAGGCTGCTTCCAGCCGTTG
GTGTTCTGCATGAGGAACCCCGTGTTCGCCCACGAGACAGGCAGCCGCAT
CAAGAAGCTCAACGAGGATCTGGACAACATCCGCAAGAATGCCAAAAGGC
TCAACTTCATCAACCTCGGCTCCTATGAGGAACAGAGGAAGCTCACAGAT
CCAGCTCATATTAAGAGCAAAAAGATGACGGCGGGGTTCAATGCGTCGGA
AGTTGTGGGGGAGAACATCGAGAAGGATGCAGAGCAGCTTGTGCAGAAGC
TGATTGCCCCGGATGGCAGAGACCTTAAGGTGTTGGCCATCGTTGGGCAG
GGTGGCATGGGCAAGAGCCTCCTTGCCAAGAAGATCTTCGCAACCGAGGT
CATTAAGGACGAGTTCAAAACCAAGATATGGCTGAGCGTCACTCAGCACT
TCGACAAGGTGGAGCTACTAAGGTCCGCTATCACCCATGCCGGGGGGAAG
CACAACAAAGAGAATGATGAGTCCATCCTCGAGCGGACCCTCATAGAAGC
TCTATCAGTGAAAAAGTTCCTGCTAGTCTTGGATGATGTTTGGAGCGACA
TAGCATGGAAAGACATACTCCATGTCCCCACTGCTAACGCAAGTTGTACA
CAACCGGGCAGCCGTGTCCTGGTCACCTCAAGACTGGAAGATGTTGTTCA
GAGGATGGGAGCCTCCAGCGGCGACATACTCCGTGTCAGGAAACTAAACG
ATGATGATGCTTGGTCATTGCTCAAGAAACAGGTGCCGGAGCAAGAGGTC
AGTATCTCAGTACTAATATACGTAGTCAAACTAATTAATTTACTCTTCAC
TGCATGTTAATTTGAAGTGCTCCCTATGCTTTATGGTTGTACAATAGTTT
TAAGATTTTTCCAAGTTAAATGTTAAGCTTGTTTGAAGTTTGACTAGAAC
GACGTTTGTAATACTACTACAACACATATTTTTATGATGAACTTAATAAA
ATCAATTTGGTATTTTAACCATAATATTTTCTATAAAATTGACCAAACTT
GAAGTAATTTTAACTTAGGCAAACCTGAAACTATTACAATTCCGAAACAT
AGTTGCTAATTTGCAACATGCTTGCAAGTGCCTAACGTATAATAAGGTAT
ATGTTTCAGAAGTAATTCTACGATTTGGCACTAATCCTTAGAGTCTCCAC
TCAGGGGCCCTAAGGCTCCCCTAAAGGGCTATCGGGTGCCCCAACAACAC
TATGACCTGGACTGCCTTCTTCGCCAATCGACGAAAATGAGAGCTTCCCA
GGTACGAGGACGACTGCCCTCCTCTGGTGAATCACAACGAAGCCGGCTGG
CGTCTTTGGTGGGCGAAATGGACCCTCGCTAGTTTGATGTGCCACATCGT
CGACGGAGATCACCCTCGCCTACGGTACTCGCACTTTCAGCCACCGTGGA
GTCCAAGTAAGGGCAGTAGAGGGCGCGGGTGCGACGACATTGCCGACCGG
GGGCACCCCACCTCCGGACGTCTTTCCTCCGAAGCTGGAGTGGCAGGTGC
CTCTAGAATACGTTATGGACGCGCGCCAGCTCGGATGCACCGGCGACCCG
GAGGAGTTCCCGGTGCAGCGTGCGGCCATGAGCGTCTCCTTGTACCACGC
TGAGGACGACATAGTAGGCTACTGCAGCGGCTGCGGCTGTCAGTCCCCGC
AGCCCGCACTGATCGACGATCTCCTCTACCCACATCAAACCGCGGAAGGA
CACATATTCTAGCCGAGCGCGCCAAGCGACAACGACGACCCCGAAACCGT
GTACTATAGGACTAGGCAAGATTATGACTAATTTCATTTTTCAAGCATGT
AATAAAATTGCCAAATAATTAAAGTACGCATTTTTTATGGGCATACGACT
GGGCGCTAGCGCCCCCCAAATCATTAACCAATCCCTCCCTCCATCCGGCC
CAAAATCAGGCTGCACCGGACGCCGTATTGGGGGGGGCGATTGGAGATGC
TCTTACCCCAAGAATGCACATATATATATAGAGAGAGAGAGGGAGGAAGG
GAGATGTTGTGTGTGAATGCGGTGTGGCTACCATGGGGATCAGCGGTAAC
GTTATTTTGGGTCCGTCAACAAAATTATCGCACCAAGTGCATAATTATTG
GACTTTCAAAGTACATGTTTCTAGCCGAAGGAACCCTCCTCTCGTAACCC
TCCCGTGGCGACCCCCAGGCGCCGCCGGAGGGCCCCCAAATTCTGCTGCC
GCCGACCTCCCTCCAAGCTCCCTCCTCCAGATCGCCTCCCTCCGCCGCTG
CCGGCGGCGGCCCCCTAGTACCTAAGGTGCTAGGGGTGGCGGCTGCGGCG
GTCTTCTTCAATGGGGTGGCTGGGGCTGCGCTATTTCAAGAAGGCACCGG
CGGTGGTCGGGACGGCGCTTCCTAGCCAGGCGGCGGCTGCAGCCGTACTC
CCCTCCCTCAGCGGTTGCGGGTGTTGGTGTTGTGGCTGCGGGTTCCTCAT
GGCGGCGCGGTGGGACTCGGGGCGCCGTGCCGGTCACTGGACAGTTGGTT
ACCTGAGGGATCAAGTGGAGAGCGAAGCGCCAATGCGGTCGCGAGTTCGG
CCTCAGATCTGGGACAGGCTATGTTGCGGAAGCACGCTGGTGACGTTTCG
CGATGGCTTTATGGTCTGTCGTCTTCTCCACATGCTCGGCTTGAATAAAA
GGTGGTGGTCCTAGGGTTCCTACTCGTCGCCAAGGTGAAGATCTATCAGT
TTCCTATCGTCATCGATCTGGCTGAAGCGTCGTGTTCCGGAAGGCTCCGC
CGGTGAACTCCACAGTGCGCATATGCCGAGACTGAATCTGGTGGGATTCG
GTCGTGCGCACCCATATTTTTACTCTGTCTGTTTAGGTTCATAGCGAGCG
CTTCGAGGTTCTATTGGTTGTTAATATCATGAGGCATGTTCTCGTCCCAT
GGTGCCGACGGAGAATGTCATGAAGACCGAGATCTGAGGACTAACAGTGG
GGTTCGAGTCCGGGTGGTGACGAGGAATTGGCTTGGTGACTCATGACTTG
GAGAAGTGGTATGCAAGCGGGGGCGACGGTACATGAGAAGCTCATAGTCC
TATCTTTCAGGGTAAAAACTCAGGGTCTGGCCTTAATTGGTTGTGTCTAG
CAATGACCTTGTTGAAGGTATTGTTTTGAGAGCGTGGACTTTTCTTCAGG
ATGAAAACCCAAATCTTTAATCGAGCGATGACAATGTTTATGCACCGTTC
TCTTCTTGAAGGCGTCGTCTTTGGAGAAGATAGACTTCCGGTGCTATCTT
GGTGGTGGTAGTACTGTTATTTCAATGAATGAGGTACTGTAGCGGAACTT
TTCTTGTTTTTGTAGTTCTTCTTTCTTTTTTGGTTGTGTGCATCTGTATG
GTCGCTAGGGCAATGCGTTGTTGCAGAGGTTGGGTATAATTGGTATCCTC
TGATATTAATATATGCTCCTTTCCAAAAAAAAGTGCATAATTATTACACG
ACAGGTTAATTAAATAATTAAATAAAAAATGAAAACATAATTCACAAGCC
TTTAATCTGATTGATGAATATAGTATGAGTTTTCTAAAAACCCAACTTGA
ACATTTTCTTGCGCTAGAGAAATATAACTTTCAAAAACAATTATGTGTCA
TTTTTAGCTCTAAAGTTTTGTAAATATTTTATATGTTCATTTAAATTTAT
TTTACCTTGTTTTCTATGTTTGTGGGTTATTATTTCTAGTGATTTCCCTA
TATTTGGTGGTAGCATAAAGTTTTTAGGGAAGTCAGTTTTTTTTAATCTC
GAACCACACTTTAATGTGTTCAGCAATTTTATTATATCTATGGATACCAC
ACATTATTCTTTTTCTCCGAAGTCAACTCTATTAGAAGTGTTGTTATCAT
AGTTCACTACATTAGTAATACATGGTGTTAGGTTACCTTTGTTTAGTTTT
AAACTAATGTACTCAGAAAATATGAATATGTGCATGTGCAACTATAGAAA
TCTTGCCTTAATTAAGTACTCTATATTGTTGGTAGGTTATCGGTGAGAGT
GCTTTTGATCATCTCAAAGATATCGGGATGCATATTATTAGAAAATGTGA
TGGTTTACCACTTGCTATTAAAGTGATGGGAGGACTTCTAAGCACAAGGC
GCCCAAGCAAACTTGGGTGGGAAAATATTATGAAAAAAATTATTGCATGG
AAAGAAAATGGGTTGCATGAGGAACTGAACTCCTCGGTACACTTGAGCTA
TGATGATTTATCTCCAGAGTTGAAGCAATGCTTTCTATATTACTCACTTT
TTACCAAGGGTTCAGCACCTAGCGATAAAACAATTATTAGCATGTGGATA
AGTGAAGGGTTTATTCAAGGTGACCAGAGGTCAGAATCAGACCAACATGG
TCTAGAAGAAATAGGAACTGAGTACCACCAAGAGTTGGTCAATAGGAATC
TTTTGGAGCTTGATTCATATGACAACCCGTACAACTATAGCATGCACGAT
GTTGTTTGTTCCTTTGCTCAGTTTGTGGCCAGGGAAGAAGCGCTTGTGAT
TCAGAAGGACCAAACTGACATTAGAAATCTTCTATTGTCAACCCAAAATG
TCCGTCGTCTGTCTATAACATTAGAAGATTCAATACTGGAGTGGAGAATC
CTAGAAAATCTACAATCACTGAGAACATTAATGCTAAAATGTAGCATTAA
GCCTAGTGGTCTATTGGCTAGTTTTGCTGGTTTACGGGTACTGAGTATAG
AATCTGCCAATTCTGATAGGATCCTTGATTCTTTGTGTCAGTTGAGGCAC
CTAAGGTTCCTGAGACTCAAAGGGTTAGATATATCTAGACTGCCAGAAGA
CATCCATAAGATGAAGCTCCTTGAGCACATAGCGCTCCTCCACTGTATGA
GTCTCAACAAGCTTCCTGACAGCATTACAAAGCTAGAGCGCTTAAGATAT
TTGGCATTAGATGGGTCCAATGTTGATGATGTACCAATGGGGTTCAGTTC
CTTGAAAAAACTGACGGCAATCTTTTGGTTCCCAGCAAAGATGCATGGGG
ATTGGTGCAGTCTAGAAGAGTTAGGACCTCTTTGTGAACTGAGGAATCTT
TCAATACATTATCTAAAAAATGTGCCTGATAGTTCAACAGCTGCAAGGGC
CATGATCAGTAACAAGAAGAGTCTAGTATATCTGGACTTGAACTGTTACA
GAGTTGATGAGAATGTGGGGATGAGACAAGAGGAACAGACTACAGAGGAG
GAGGGGCAACGAATTGAGGAAGTATTCAATGGGTTGTGCCCTCCACCTTC
CTTGGAGGATTTATTCTTGTCAGGATACTTTGGCCATCGACCACCAATTT
GGATGCAAGCTCCATCAGCTGCTGCCTTTAAGAGCTTGAGGTTTATTGAA
CTATTTGGCCTGCCCAAATGCAACCAACTACCTAATGGTTTGTGTGTGAT
GCTCAACTTGGAAGATATATGGATCAGGCATGCTCCATCCATCGAGGTTG
TCGGCCCTGACTTTCAGAGCCTGGCCAGTGGAGATGGAAGCGCCGTTGTT
ACTAGACCGTTCCCAAAACTGAAAAAATTGGTGTTTGCCTACTTGCCTAG
ATGGAAGGAGTGGGACTGGGTAGAGGAGCAGGGCAAAGGCATGGCCATGC
CTGCCCTTGAGGAACTCCGGATTTCAAACTGCAAGCTGAGCCGTCTTCCC
CAAGGACTTGCTAGCCACAACAGGTGCAACTTGAGAACCCTGTGCCTGTA
CCGTCTCAGCATCCTAGAATCTGTGGAGAATTTCCCTTCCGTTGTGCAAT
TCGATGTGCTCTACTGCCCCGAGCTCAAGAAGATCAGTGGCTTCTCCAAG
TTGCGGAAGATCTCCATCGACGGTTGTCCCAAACTGGAGTCGCTGGAAGG
TTTCCCCGTGCTCTGTAGCATGGTGCTGGATGATGAGCCATGGGAGATCA
TCGGAACACCTGCAGTGTGCACACCCAAGGTATATCAAGTTGGAGTGGAG
CCTGAGCTTACAAACTTCACTGTTACCAGATAGGAGCTCTGCCTTCTCAG
AGGATATTACAAGTTTACAACCTGTGTTATGCTTCTGTTCACATGCTAAA
GATTGTAATACAAGTCTGTAATGTCTCCTTCTTGTGTATTACAAAATGGA
TGGGAGCCTCAGGTTCCTGAGAACTTCACTGTTACAAAATGGATGGGAGC
TCTGACCTCTGCTGCTGTTCACGTGCTAAAGATTGTAATACAAGTCTGTA
ATGTCTCCTTCCTGTGTATTTCTCCTGTTAGTATCTGTTTTGCTGGTCAT
GTATATAAATAAATATTGTTGTGGCTGAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.